唐亞萍,楊濤,楊生保,李寧,許娟,帕提古麗,王柏柯,張貴仁,Ann Powell,余慶輝
(1.新疆農業科學院園藝作物研究所,烏魯木齊 830091;2.美國加州大學戴維斯分校,戴維斯,美國加利福尼亞州 95616)
Heirlooms番茄果實葉綠素和可溶性固形物含量的聚類分析
唐亞萍1,楊濤1,楊生保1,李寧1,許娟1,帕提古麗1,王柏柯1,張貴仁1,Ann Powell2,余慶輝1
(1.新疆農業科學院園藝作物研究所,烏魯木齊 830091;2.美國加州大學戴維斯分校,戴維斯,美國加利福尼亞州 95616)
【目的】對25個栽培番茄Heirlooms和3個野生番茄品種進行田間表型多樣性分析,對果實不同部位葉綠素含量和成熟果實可溶性固形物含量進行檢測及聚類分析。【方法】分別在小果期和中果期利用分光光度法,檢測番茄果實上部和下部葉綠素含量的差異,運用折光儀檢測番茄果實3個發育時期的可溶性固形物的含量并進行聚類分析。【結果】3個野生番茄與栽培番茄Heirlooms品系在葉綠素和可溶性固形物方面具有明顯的差異,并通過聚類分析與Heirloom品系區分。在Heirloom品系中,葉綠素含量在含有果肩的部分明顯高于遠離果肩的底部,果實品質相關的可溶性固形物的含量與番茄果實果肩部分葉綠素含量表現基本一致。可溶性固形物含量最高為7.07%的Heirloom品系中的櫻桃番茄Yellow Vernissage。【結論】具有正常果型的Bali可溶性固形物含量為6.76%,以及具有6.13%可溶性固形物的大果型Big Zebra,均可以用于滿足不同果形的番茄品質提高的育種研究應用。
Heirloom品系;果實葉綠素;可溶性固形物;聚類分析
【研究意義】番茄(Solanumlycopersicum)屬于茄科(Solanaceae)茄屬,為一種草本的多年生植物[1],原產于中美洲和南美洲,隨著人類遷移和馴化逐漸傳到中美洲和墨西哥一代,16世紀傳到歐洲,在隨后的幾百年中番茄被傳播到世界各地,在這一過程中受到不同的人工選擇,產生了豐富的變異類型[2]。然而,我國資源分布較少,而優異種質資源的缺乏已成為我國品種改良和資源挖掘的瓶頸[3]。隨著番茄種植面積擴大和種植技術的提升,以及消費者對番茄品質的不斷重視,具有優良品質的番茄品種的需求日益緊迫。雖然,野生種是較豐富的資源,但卻無法直接拿來使用,并且其改良所花費的時間較長。【前人研究進展】栽培番茄Heirloom品系開放授粉的特征,使Heirlooms果實表型多樣性特征廣泛存在,因其獨特的顏色、形狀和風味而著名[4]。番茄果實在大小、形狀及顏色方面具有多樣性,這種多樣性源于在自然選擇和人工馴化的過程中等位基因產生多個基因座的結果[5]。番茄果實品質研究表明:GLK轉錄因子通過調控葉綠體的形成而決定植物葉片及果實光合所用的能力,未成熟番茄果實的深綠色果肩主要受Golden2-like(GLK)基因的調控而綠果期果實葉綠素含量的增加可有效改善番茄果實中的可溶性固形物含量及番茄紅素含量[6]。【本研究切入點】利用Heirloom品系為研究材料進行的相關研究鮮有報道。種質資源的表型性狀聚類分析可有效避免人為選擇評價因子主觀性,在番茄[7-9]上也被廣泛的應用。研究Heirlooms番茄果實葉綠素和可溶性固形物含量,對果實不同部位葉綠素含量和成熟果實可溶性固形物含量進行檢測及聚類分析。【擬解決的關鍵問題】以25份Heirloom農家品系和3份野生番茄種,合計28份材料為研究對象,測定Heirloom品系果實不同發育階段、不同部位的綠果期果實葉綠素含量和可溶性固形物含量,利用聚類分析,分析Heirloom品系番茄果實品質相關特性的遺傳多樣性,挖掘優異種質資源,為后期番茄品質改良奠定基礎。
1.1 材 料
研究采用的番茄資源材料均來自美國加州大學戴維斯分校(UC Davis),由Ann Powell實驗室免費提供,其中包括主要的25份美國Heirloom農家品系和3份野生番茄資源,種子由加州大學戴維斯分校繁育。表1
表1 供試材料及來源
Table 1 List of materials

編號Code品種名稱Nameoflines編號Code品種名稱Nameoflines編號Code品種名稱Nameoflines編號Code品種名稱Nameoflines1S.lycopersicum8PomaAmorisMinorLute15BlackMauri22PurpleRussian2AGrappoliD-Inverno9CostolutoGenovese16Lydia23YellowVernissage3GreenMoldovan10BigZebra17Carbon24GreenDoctors4ScharzRussian11Bali18FantomeduLaos25S.pimpenelifolium5SubArcticPlenty12OrangeFleshedPurple19GreenSausage26CuoreDiBue6BigWhitePinkStripes13RougeD-Irak20BlackGiant27VioletJasper7WhiteZebra14RoseDeBerne21Brandy28S.pennellii
1.2 方 法
田間試驗于2015年4~10月在加州大學戴維斯分校試驗農場進行,每份材料按田間隨機區組試驗設計,四次重復,分別于三個果實發育階段進行果實樣品的采摘,并及時測定各品系各發育階段果實中葉綠素含量和可溶性固形物含量。各發育時期的記錄方法為,于每個品系的花剛坐果時掛標簽標記,當各品系果實達1 cm左右時記錄為小果期(SSP, Small Size Period),當達到綠熟果最大尺寸的70%時,記錄為果實發育中期(MSP, Medium Size Period),當達到完全成熟時,記錄為紅果期(RRP, Red Ripe Period)。各品系各發育時期果實樣品的處理方法為,于小果期(SSP, Small Size Period)縱切幼果3等份,去掉中間部分及果實內的橫隔、種子和果膠物質,僅保留小果期頂部即與果梗連接的部分和尾部果實樣品;于果實發育中期縱切果實5等份,僅保留頂部、中間和尾部果實樣品,去掉其余部分及果實內的橫隔、種子和果膠物質。分別于小果期和果實發育中期測定各品系各果實部位果實葉綠素含量,測定方法見Ann Powell等[6]。分別于小果期、果實發育中期和紅果期利用數顯折光儀測定各品系可溶性固形物含量。始熟期的記錄為從田間移栽后至整個區域50%的植株第一個果實成熟轉色的時期。
1.3 數據處理
利用Excel進行數據錄入,用R軟件進行數據的方差分析(ANOVA)并作圖,關聯分析采用Pearson雙尾法,及OriginPro 7.0進行制圖,系統聚類利用DPS7.05軟件,采用歐式距離類平均法(UPGMA)。
2.1 參試材料田間性狀
研究表明,Heirloom品系的成熟期從60~95 d不等,呈現了早、晚熟多樣性的差異。在生長類型方面,除了A Grappoli D-Inverno為半有限生長類型,Sub Arctic Plenty和Green Sausage為有限生長類型外,其它的Heirloom農家品系均為無限生長類型。在未成熟果是否具有果肩方面,參試的所有品種均有果肩,并且有四個品系的果面上分布著綠色條斑,分別為Big Zebra、Violet Jasper、White Zebra和Green Sausage。而在果實成熟后是否繼續帶有果肩方面,不同的品系呈現了不同的差異。參試材料的果實類型比較多樣化,主要呈現出櫻桃、大圓果、扁圓果、長圓果和小櫻桃類型等。表2
表2 供試材料及來源
Table 2 List of materials

品種名稱NameofLines始熟期DaystoRipe(d)生長類型Determinant果肩Shoulders成熟時是否有果肩Retainshoulderswhenripe果實類型FruitTypeGreenMoldovan80無限有有正常ScharzRussian75無限有沒有正常SubArcticPlenty42有限有沒有正常BigWhitePinkStripes95無限有有正常CostolutoGenovese78無限有沒有大果BigZebra85無限有且有條紋沒有大果VioletJasper73無限有且有條紋沒有櫻桃番茄RougeD-Irak75無限有沒有正常OrangeFleshedPurple85無限有沒有正常RoseDeBerne75無限有沒有大果Carbon76無限有有大果GreenDoctors75無限有有櫻桃番茄FantomeduLaos80無限有沒有正常CuoreDiBue85無限有沒有大果AGrappoliD-Inverno65半有限有沒有櫻桃番茄YellowVernissage75無限有沒有櫻桃番茄WhiteZebra70無限有且有條紋沒有正常BlackGiant75無限有有大果Bali75無限有沒有正常GreenSausage77有限有且有條紋沒有長果PurpleRussian80無限有有正常BlackMauri60無限有有櫻桃番茄PomaAmorisMinorLute75無限有沒有櫻桃番茄Brandywine90無限有有正常Lydia70無限有沒有正常S.lycopersicum-野生有沒有正常S.pimpenelifolium-野生有沒有櫻桃番茄S.pennellii-野生有沒有櫻桃番茄
2.2 小果期各參試材料不同部位的果實葉綠素含量差異
由于野生種S.lycopersicum果實中葉綠素的含量果實頂端為6.60 μg-1mL-150 mL-1± 0.35,尾部為3.71 μg-1mL-150 mL-1± 0.42 均遠高于其他品種,因此,在利用R進行數據分析和作圖時先將該野生種與其他品種分開進行分析,以保證數據分析的精確性。剩余參試的24個品種小果期果實頂端葉綠素含量從1.12 μg-1mL-150 mL-1± 0.55至4.30 μg-1mL-150 mL-1±0.42不等,其中最低和最高的分別為S.pennellii和Violet Jasper差異顯著。研究表明,小果期果實尾部葉綠素含量含量從0.3 μg-1mL-150 mL-1± 0.18至1.45 μg-1mL-150 mL-1± 0.20不等,其中最低和最高的分別為White Zebra和Violet Jasper。通過Pearson雙尾法關聯分析,結果表明,小果期果實頂端和尾部葉綠素含量呈現了極顯著正相關,相關系數為0.676**。在小果期野生種S.lycopersicum不論果實頂端和尾部的葉綠素含量均是最高的,這與該品系果實大田試驗實際果面的綠色覆蓋程度相吻合。圖2

圖1 不同Heirloom品種小果期葉綠素的含量
Fig.1 Chlorophyll content of Heriloom variety-small size
2.3 果實發育中期各參試材料不同部位的果實葉綠素含量差異
野生型S.lycopersicum與小果期結果表現一致,果實頂端、中部和尾部葉綠素含量分為5.47 μg-1mL-150 mL-1± 0.79、4.42 μg-1mL-150 mL-1± 0.42、3.38 μg-1mL-150 mL-1± 0.15,數據分析方法同上。研究表明,參試另外24個品系果實發育中期果實頂端葉綠素含量從0.77 μg-1mL-150 mL-1± 0.38至4.49 μg-1mL-150 mL-1± 0.57不等,其中最低和最高的分別為Rouge D-Irak和S.pimpenelifolium。在2015年果實中部葉綠素含量在檢測時缺少了另外兩種野生型的檢測結果,因此葉綠素的含量從0.15 μg-1mL-150 mL-1± 0.03至1.34 μg-1mL-150 mL-1± 0.25不等,其中最低和最高的分別為Costoluto Genovese和Schwarz Russian。經過2016年部分實驗的補充,S.pimpenelifolium在果實中部的葉綠素含量高于Schwarz Russian為3.21 μg-1mL-150 mL-1± 0.22)。果實尾部葉綠素含量從0.03 μg-1mL-150 mL-1±0.16至1.15 μg-1mL-150 mL-1± 0.49不等,其中最低和最高的分別為Costoluto Genovese和S.pimpenelifolium。通過Pearson雙尾法關聯分析,結果表明,果實發育中期果實頂端、中部和尾部葉綠素含量相互之間呈現了顯著正相關,在此時期果實頂端和中部與尾部葉綠素含量的相關系數分別為0.670**、0.790**,果實中部和果實尾部葉綠素含量相關系數為0.829**。在此時期野生種S.lycopersicum不論果實頂端、中部還是尾部的葉綠素含量均是參試品系中最高的。圖3

圖2 不同Heirloom品種在果實發育中期葉綠素含量
Fig.2 Chlorophyll content of Heriloom variety-medium size
2.4 不同發育時期參試材料的果實可溶性固形物含量差異
由于野生種S.lycopersicumz在各個時期的可溶性固形物含量均明顯低于其余參試品種,在各個果實發育時期可溶性固形物的含量均低于4.0%,因此將其與其他品種分開進行可溶性固形物含量的分析。研究表明,參試所有品系小果期(SSP)果實可溶性固形物含量從4.47% ± 0.35至8.43% ± 0.44不等,其中最低和最高的分別為Green Moldovan和S.pennellii。果實發育中期(MSP)果實可溶性固形物含量從4.33% ± 0.03至8.50% ± 1.45不等,其中最低和最高的分別為Scharz Russian和S.pimpenelifolium。紅果期(RRP)果實可溶性固形物含量從5.00% ± 0.47至9.86% ± 0.64不等,其中最低和最高的分別為Scharz Russian和S.pimpenelifolium。通過Pearson雙尾法關聯分析,三個時期果實可溶性固形物含量分別呈現了極顯著正相關,小果期分別與果實發育中期和紅果期果實可溶性固形物含量的相關系數分為0.938**和0.697**,果實發育中期和紅果期果實可溶性固形物含量的相關系數為0.754**。圖1

圖3 Heirloom品系不同時期果實可溶性固形物含量分布
Fig.3 Fruit soluble solid content of different development for Heirloom variety
2.5 基于不同發育期不同部位果實可溶性固形物含量和葉綠素含量的聚類分析
利用DPS7.05軟件,采用歐氏距離,類平均法(UPGMA)對28份參試材料不同果實發育期和不同果實部位的可溶性固形物含量和葉綠素含量進行系統聚類分析。研究表明,28份參試材料在歐氏距離D=3.98的水平上可劃分為4大類群。
第1類群僅包括1個參試材料,為野生種S.lycopersicum,從田間的表型上觀察,S.lycopersicum未成熟果實果面通體遍布深綠色,同時不同發育階段不同部位未成熟果實葉綠素含量測定是所有材料中最高的,與田間實際表型觀察結果一致,但該材料果實中可溶性固形物含量不高,是所有參試材料中最低的,說明該野生種材料的獨特性。第2類群僅包括1個參試材料,為野生種S.pennellii,利用該材料構建的ILs(Introgression Lines)被廣泛應用于番茄數量性狀的QTLs定位[10-13],說明該材料的獨特性。第3類群僅包括1個參試材料,為野生種S.pimpenelifolium,該野生種被廣泛的應用于番茄種質資源的遺傳改良[14,15],說明該材料的獨特性。第4類群主要包括25個參試材料,該類群果實可溶性固形物含量和未成熟果實果面葉綠素含量差異呈現了多樣性分布。圖4

圖4 主要果實性狀系統聚類
Fig.4 Dendrogram of cluster analysis of the main fruit character
種質資源是育種工作的基礎,提高番茄品質的種質資源。從成熟期可以看出櫻桃番茄的成熟期較短,但除櫻桃番茄外其余Heirloom品種的成熟期與果實大小并不成正相關。關于番茄果實成熟相關因子的研究中表明乙烯合成及其信號傳導途徑是決定番茄果實成熟時間的主要因素[16]。因此番茄果實的大小與其成熟的時間沒有直接的關聯。野生種S.lycopersicumz在綠果期的果實不同部位葉綠素含量及不同果實生長時期的可溶性固形物含量方面表現出完全相反的結果,其原因一方面可能是通過觀察在該野生種中果實比普通的櫻桃番茄小并且果皮較厚而果肉和果膠質較少,從而導致能夠檢測到的果實的可溶性固形物含量低于其他參試品種;另一方面可能由于番茄果實可溶性固形物含量是質量性狀,由多基因調控,在番茄果實中可溶性固形物受到外界環境、光合成及基因調控等多方面的影響[17]。在含有果肩的綠果期,果實內葉綠體合成的葉綠素將隨著果實的成熟轉化為類胡蘿卜素和番茄紅素從而提高果實的品質[18]。Violet Jasper在小果期表現出了最高的葉綠素含量,但是在果實發育中期卻不是。在果實發育中期野生種S.lycopersicumz含有最高的葉綠素含量,在野生種之外的Heirloom品系中含有果肩的櫻桃番茄Yellow Vernissage含有最高的葉綠素含量與可溶性固形物的表現一致。從一定程度上再次證明,果實中葉綠素的含量能夠影響果實的品質[6]。在聚類分析中三個野生種材料S.lycopersicum、S.pennellii和S.pimpenelifolium分別被單獨劃分到三個獨立的類群中,其余的25份Heirloom農家品系被劃分到一個獨立的大群體中,這個分類結果和實際觀察結果一致。
在果實的發育不同時期中Heirloom品系的果實固形物含量表現出了基本一致的增長趨勢。除野生種外,櫻桃番茄與果型較大的番茄相比普遍具有較高的可溶性固形物含量,Yellow Vernissage作為櫻桃番茄含有較高的可溶性固形物含量,同時Lydia、Brandywine和Bali也含有較高的可溶性固形物含量,這些含有較高可溶性固形物含量的品種可用于改良番茄品質提高的育種中。可溶性固形物含量較高的Green Sausage不僅僅含有果肩同時在果實表面含有深綠色條紋,這些條紋在某種程度可能對果實內的可溶性固形物有一定的貢獻,仍需進一步深入研究果實表面條紋與果實品質之間的關系。對28份材料的果實不同發育期和不同部位可溶性固形物含量和葉綠素含量的系統聚類分析,為該套材料在番茄品種改良和育種研究應用提供參考。
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Cluster Analysis Based on the Contents of Chlorophyll and Soluble Solids in the Tomato Fruits of Heirlooms
TANG Ya-ping1,YANG Tao1,YANG Sheng-bao1,LI Ning1,XU Juan1,Patiguli1,WANG Bai-ke1,ZHANG Gui-ren1,Ann Powell2,YU Qing-hui1
(1.InstituteofHorticulturalCrops,XinjiangAcademyofAgriculturalSciences,UrumqiXinjiang830091,China; 2.UniversityofCaliforniaDavis,California, 95616,USA)
【Objective】 To study and carry out cluster analysis of the phenotypic diversity, the chlorophyll content of different parts of fruit and the soluble solids content of mature fruits of 25 tomato cultivars heirlooms and 3 wild tomato varieties.【Method】Chlorophyll of small and mid-development fruit was detected by spectrophotometry and the soluble solids was checked by using refractometer. Also, cluster analysis of the Heirlooms was carried out. 【Result】3 wild tomato and tomato heirlooms strains had obvious difference in chlorophyll and soluble solids, and through cluster analysis, it was differentiated from heirloom strain. In the Heirloom strain, the content of chlorophyll in the fruit bearing part was higher than that of the bottom parts. The content of soluble solids related to fruit quality was basically consistent with that of tomato fruit. The highest soluble solid content was 7.07%, which was found in cherry tomato: Yellow Vernissage.【Conclusion】The Bali which is regular shape has 6.76% of soluble solids and the big fruit of Big Zebra has the soluble solids of 6.13%. These species could be used f to meet the different breeding researches to improve the quality of the tomato fruit shape.
Heirlooms; fruit chlorophyll; soluble solids; cluster analysis
YU Qing-hui(1970-), male, native place: Dapu, Guangdong. Professor, research field: Breeding and cultivation of new tomato varieties
10.6048/j.issn.1001-4330.2017.06.006
2017-04-11
新疆維吾爾自治區國際科技合作項目“利用GLKs轉錄因子提高番茄品質的研究”(20146013);公益性行業(農業)科研專項經費“加工用番茄產業技術研究與示范”(201303115);農業部產業技術體系“大宗蔬菜產業技術體系烏魯木齊綜合試驗站”(CARS-25-G-51);新疆農業科學院青年基金項目“加工番茄基因功能快速驗證體系研究”(xjnkq-2016001)
唐亞萍(1986-),女,新疆哈密人,助理研究員,研究方向為加工番茄育種,(E-mail)tangyaping624@sina.com
余慶輝(1970-),男,廣東大浦人,研究員,研究方向為加工番茄新品種選育和栽培,(E-mail)yuqinghui98@sina.com
S641.2
A
1001-4330(2017)06-1021-08
Supported by: Xinjiang International Science and Technology Cooperation Project "Improving the Tomato Fruit Quality by Using GLKs transcription factors"(20146013);Special Fund for Scientific Research of Public Welfare Industry (Agriculture) "Research and Demonstration of Processing Tomato Industry" (201303115);Industrial Technology System in Ministry of Agriculture "Large scale Vege
Table Industry Technology System In Urumqi Experimental Station"(CARS-25-G-51);the Youth Funds of Xinjiang Academy of Agricultural Sciences "Study on the Rapid Verification System of Gene Function in Processing Tomato " (xjnkq-2016001)