天然及人工紅樹林土壤微生物群落結(jié)構(gòu)分析

殷萌清, 馮建祥, 黃小芳, 蔡中華, 林光輝,*, 周進(jìn),*

1.清華大學(xué), 地球系統(tǒng)科學(xué)研究中心, 北京100084 2.清華大學(xué)深圳研究生院, 海洋科學(xué)與技術(shù)學(xué)部, 深圳518055

天然及人工紅樹林土壤微生物群落結(jié)構(gòu)分析

殷萌清1,2, 馮建祥2, 黃小芳2, 蔡中華2, 林光輝1,2,*, 周進(jìn)2,*

1.清華大學(xué), 地球系統(tǒng)科學(xué)研究中心, 北京100084 2.清華大學(xué)深圳研究生院, 海洋科學(xué)與技術(shù)學(xué)部, 深圳518055

應(yīng)用高通量測(cè)序和OTU分析法比較了紅樹植物人工修復(fù)區(qū)(Transplant-, TP)與天然區(qū)(Natural-, NA)土壤微生物的群落結(jié)構(gòu)差異。結(jié)果顯示: 從群落組成來看, 細(xì)菌在天然林和人工林主要由27個(gè)門類的菌群組成, 優(yōu)勢(shì)菌群包括變形桿菌(Proteobacteria)、擬桿菌(Bacteroidetes)、綠彎菌(Chloroflexi)、酸桿菌(Acidobacteria)、浮霉菌(Planctomycetales)。古菌的組成在綱的水平上主要以鹽桿菌(Halobacteria)、熱原體(Thermoplasmata)和甲烷菌(甲烷微菌Methanomicrobia、甲烷桿菌 Methanobacteria、甲烷球菌 Methanococci)為主, 其中鹽桿菌占的比重最大(約 19%—37%)。從結(jié)構(gòu)來看, 多樣性指數(shù)(H)和豐富度指數(shù)(Schao)表明: 天然林和人工林細(xì)菌的多樣性和豐度均高于古菌, 天然林多樣性及豐度均高于人工林(NA＞TP)。此外, 對(duì)采集的樣本進(jìn)行主成分分析(PCA)顯示細(xì)菌聚成兩大類: 源自外周土壤的菌群聚成一類, 源自根際土壤的菌群聚成另一類; 古菌則按生境聚成三類: 分別是天然林、人工林和采自非紅樹區(qū)的基圍魚塘。對(duì)細(xì)菌來說, 經(jīng)長(zhǎng)時(shí)間修復(fù)的人工林與天然林的外周土壤群落結(jié)構(gòu)差異不大, 顯示出了趨同性; 但同一環(huán)境下的根際與外周土壤群落結(jié)構(gòu)差異較大, 體現(xiàn)了明顯的根際效應(yīng)。古菌結(jié)構(gòu)受根際效應(yīng)的影響較小, 受環(huán)境因素影響較大。……