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廣親和基因S5—n在水稻核心種質(zhì)資源中的分布研究

2017-11-21 19:21:26徐華山周雷蔣醫(yī)蔚
現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技 2017年21期
關(guān)鍵詞:水稻

徐華山 周雷 蔣醫(yī)蔚

摘要 為了更好地發(fā)揮水稻廣親和基因S5-n在水稻育種中的作用,本研究分析了S5-n在264份水稻核心種質(zhì)中的分布情況。結(jié)果表明,共檢測(cè)到含有S5-n基因的材料26份,檢出頻率9.8%。其中,國(guó)內(nèi)材料10份,國(guó)外材料16份。含有S5-n基因的26份材料中秈稻、粳稻各為13份。S5-n基因在核心種質(zhì)資源中的分布沒有表現(xiàn)出秈、粳偏好。

關(guān)鍵詞 水稻;廣親和基因S5-n;水稻核心種質(zhì)資源;分布

中圖分類號(hào) S511 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A 文章編號(hào) 1007-5739(2017)21-0033-01

水稻是重要的糧食作物,我國(guó)有半數(shù)以上的人口以稻米為主食。秈粳遠(yuǎn)緣雜交具有較強(qiáng)的雜種優(yōu)勢(shì),在雜交稻育種中發(fā)揮著重要作用。但是秈粳遠(yuǎn)緣雜交往往存在育性障礙,雜交結(jié)實(shí)率低,限制了秈粳雜種優(yōu)勢(shì)的利用。S5-n是控制水稻亞種間雜種育性的廣親和基因,楊 杰等[1]根據(jù)等位基因序列設(shè)計(jì)并開發(fā)了相關(guān)的功能標(biāo)記,通過鑒定水稻材料中的S5-n基因可以大幅提高秈粳雜種優(yōu)勢(shì)的利用效率。胡標(biāo)林等[2]認(rèn)為,水稻核心種質(zhì)資源中含有豐富的遺傳變異,對(duì)水稻核心種質(zhì)資源材料的利用可以改變目前育種中由于骨干親本相同、遺傳基礎(chǔ)狹窄造成的抗性下降、產(chǎn)量水平難以突破的問題。明確S5-n基因在水稻核心種質(zhì)資源中的分布,可以有效提高核心種質(zhì)資源在秈粳雜種優(yōu)勢(shì)利用中的效率,更好地發(fā)揮水稻核心種質(zhì)資源在水稻育種的作用[3-5]。

1 材料與方法

1.1 供試材料

水稻核心種質(zhì)資源共264份(秈稻141份,粳稻123份),由本課題組2016年夏季種植于湖北省農(nóng)業(yè)科學(xué)院糧食作物研究所武漢南湖試驗(yàn)基地。其中,包括國(guó)內(nèi)材料175份、國(guó)外材料89份。國(guó)外材料分別為亞洲54份、大洋洲10份、歐洲9份、非洲8份、美洲8份。

廣親和基因S5-n功能性標(biāo)記S5136引物由武漢昆泰銳生物科技有限公司合成,其引物序列為S5136-F:5′-ATCA ACCCATTTCCTTTCCT-3′;S5136-R:5′-ATACGCTCGATCGG ATTAAC-3′。含有S5-n的材料可以擴(kuò)增出441 bp的片段,不含S5-n的材料擴(kuò)增出577 bp的片段。

1.2 樣品DNA提取及PCR擴(kuò)增

以葉片為材料,采取CTAB法提取水稻基因組DNA(黃瑞等,2015)。PCR反應(yīng)體系為15 μL,含1.5 μL 10×Buffer、1.0 μL dNTPs(2.5 mmol/L),前后引物各為0.1 μmol/L,Taq酶0.2 μL(5 U/μL),2.0 μL模板DNA(50 ng/μL),其余用ddH2O補(bǔ)齊;PCR反應(yīng)程序:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性30 s,50 ℃退火30 s,72 ℃延伸40 s,共35個(gè)循環(huán);72 ℃延伸5 min,擴(kuò)增產(chǎn)物在1.5%瓊脂糖凝膠中電泳,用凝膠成像儀掃描并記錄結(jié)果[6-7]。

2 結(jié)果與分析

2.1 廣親和基因S5-n在264份水稻核心種質(zhì)資源中的分布

利用功能性標(biāo)記S5136檢測(cè)廣親和基因S5-n的分布情況,結(jié)果顯示在264份水稻核心種質(zhì)資源材料中有26份材料含有S5-n,該基因的攜帶頻率為9.8%(表1)。部分?jǐn)U增結(jié)果見圖1。

2.2 廣親和基因S5-n在秈粳亞種間及不同地域間的分布

在264份水稻核心種質(zhì)資源材料中,秈稻占53.4%,粳稻占46.6%。在26份含有S5-n的材料中,秈稻與粳稻分別占50%,沒有表現(xiàn)出明顯的亞種間偏好。26份含有S5-n的材料中有10份來源于國(guó)內(nèi),16份來源于國(guó)外。國(guó)外材料在264份水稻核心種質(zhì)資源材料中占33.7%,在26份含有S5-n的材料中占61.5%,國(guó)外材料中含有S5-n的比例顯著高于國(guó)內(nèi)材料。含有S5-n的國(guó)內(nèi)材料主要集中于湖南和云南(表2)。

3 結(jié)論與討論

廣親和基因S5-n是控制水稻亞種間雜種育性的主效基因,確定S5-n在水稻核心種質(zhì)資源中的分布對(duì)于秈粳雜種優(yōu)勢(shì)利用有著重要意義。本研究利用S5-n的功能性標(biāo)記對(duì)水稻核心種質(zhì)資源進(jìn)行鑒定,發(fā)現(xiàn)26份材料含有S5-n,其中國(guó)外材料16份,所占比例顯著高于國(guó)內(nèi)材料。攜帶S5-n基因的國(guó)內(nèi)材料主要來源于湖南和云南,與楊 杰等[1]人的結(jié)果一致。攜帶S5-n基因的國(guó)外材料主要來源于印度和澳大利亞。今后應(yīng)加強(qiáng)國(guó)外種質(zhì)資源材料在秈粳雜種優(yōu)勢(shì)中的利用。

4 參考文獻(xiàn)

[1] 楊杰,王軍,曹卿,等.水稻廣親和基因S5-n的功能標(biāo)記開發(fā)及其應(yīng)用[J].作物學(xué)報(bào),2009,35(11):2000-2007.

[2] 胡標(biāo)林,萬勇,李霞,等.水稻核心種質(zhì)表型遺傳多樣性分析及綜合評(píng)價(jià)[J].作物學(xué)報(bào),2012,38(5):829-839.

[3] 夏士健,張啟軍,楊杰,等.水稻不育系的廣親和基因檢測(cè)及秈粳型分析[C]//第1屆中國(guó)雜交水稻大會(huì)論文集,2010:112-117.

[4] 張愛偉,楊杰,夏士健,等.利用廣親和基因S5-n的功能標(biāo)記鑒定水稻資源和檢測(cè)雜交種純度[J].江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào),2010,26(6):1133-1138.

[5] 葉凌鳳,徐啟來,王立廣,等.國(guó)外水稻種質(zhì)資源抗稻瘟病基因Pi-ta和Pi-b的分布和基因型分析[J].分子植物育種,2017,15(3):785-791.

[6] 姚國(guó)新,盛繼群,李長(zhǎng)春,等.利用InDel標(biāo)記量化中國(guó)栽培水稻微核心種質(zhì)的秈粳成分[J].湖北農(nóng)業(yè)科學(xué),2014,53(16):3741-3745.

[7] 黃瑞,周雷,何衛(wèi),等.非洲水稻種質(zhì)資源SSR指紋圖譜的構(gòu)建及遺傳多樣性分析[J].分子植物育種,2015,13(7):1476-1486.endprint

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