吳忠蘭,關光玉,尹 婷,趙偉明,曹 愍,楊東智,馬學旻
·論 著·
寧夏地區艾滋病患者感染HIV病毒pol區基因變異性研究
吳忠蘭1,關光玉1,尹 婷2,趙偉明2,曹 愍1,楊東智1,馬學旻1
目的通過巢式聚合酶鏈式反應檢測寧夏地區艾滋病患者感染HIV-1病毒的pol基因片段分析其變異情況,為艾滋病防治提供參考依據。方法采集艾滋病患者全血標本,提取病毒RNA,針對HIV-1病毒pol區設計引物,進行巢式PCR擴增,凝膠電泳鑒定后送測序。結果巢式PCR檢測47份,成功擴增35分樣本和獲得pol區序列,長1 060 bp。寧夏地區HIV-1感染者中存在四種基因亞型,即CRF07-BC占65.7%、CRF08-BC占17.1%、CRF01-AE占11.4%、B亞型占5.7%,基因離散率為B亞型最大。結論HIV-1基因型別趨于多樣化,CRF07-BC重組亞型為主要流行毒株,B亞型在寧夏地區流行時間最長;吸毒人群和性活躍人群仍是艾滋病防治的重點人群。
基因序列;進化樹;亞型特征
HIV屬逆轉錄病毒科慢病毒屬,為逆轉錄RNA病毒,基因組為兩條相同的RNA單鏈,每條單鏈9.2~9.8 kb,由結構基因和調節基因組成。其結構基因中的pol基因編碼逆轉錄酶、整合酶和蛋白水解酶,對于HIV病毒的復制、前病毒的整合和增殖都具有重要作用[1-2]。HIV感染類型可以分為1型和2型,中國主要流行HIV-1型,由于HIV-1生存能力弱、抵抗力低,但變異性很強。寧夏在2007年之前是以靜脈吸毒傳播為主,現以性傳播為主。本研究對寧夏地區HIV-1基因亞型展開調查,通過對HIV感染者HIV-1病毒pol區核酸序列進行分析,掌握本地區基因亞型分布情況,為艾滋病的防治提供可靠依據。
1.1 一般資料:2015年6-12月,采用方便抽樣的方法,在寧夏進行調查。……