沙棘H3K9乙酰化修飾全基因組分析

高國日，張　彤，陳道國，何彩云,2*

(1 中國林業(yè)科學(xué)研究院林業(yè)研究所 國家林業(yè)局林木培育重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，北京 100091；2 南京林業(yè)大學(xué)南方現(xiàn)代林業(yè)協(xié)同創(chuàng)新中心，南京 210037)

沙棘(Hippophaerhamnoides)是一種多用途、耐寒和耐旱的落葉灌木植物，也是一種理想的防治水土流失的樹種，能夠有效改良荒漠化土地，增加野生動(dòng)物棲息地和保護(hù)農(nóng)莊等[1]。沙棘的果肉可以被制成沙棘汁，是一種具有很高營養(yǎng)價(jià)值的飲料，含有豐富的維生素C～E和胡蘿卜素等生物活性成分。沙棘油提取于沙棘的種子，富含不飽和脂肪酸[2]。沙棘果實(shí)中豐富的營養(yǎng)物質(zhì)能夠調(diào)節(jié)人體免疫力、保護(hù)肝臟、抗輻射、預(yù)防動(dòng)脈硬化、抗腫瘤以及促進(jìn)組織再生等。因其生態(tài)價(jià)值、藥用價(jià)值和經(jīng)濟(jì)價(jià)值，沙棘被認(rèn)為是一種重要的植物[3]。近年來，對(duì)沙棘分子生物學(xué)的研究，不僅獲得了可用于沙棘基因組分析、分子繁殖和群體遺傳分析的大量簡單重復(fù)序列(SSR)[4]及表達(dá)序列標(biāo)簽(EST)[5]，還獲得了響應(yīng)冷凍[6-7]和干旱脅迫[8]的大量基因和蛋白質(zhì)表達(dá)[9]信息，確定了其在響應(yīng)低溫和干旱中的生物學(xué)功能，在沙棘發(fā)育不同時(shí)期代謝組和蛋白組聯(lián)合分析中，深入了解了沙棘果實(shí)獨(dú)特營養(yǎng)成分形成機(jī)理[10-11]。雖然不同沙棘果色的lncRNA研究[12]為研究表觀遺傳對(duì)沙棘基因的表達(dá)調(diào)控提供了思路，但是表觀遺傳學(xué)中組蛋白修飾因其修飾類型和位點(diǎn)的復(fù)雜性，對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控同樣具有重要的作用[13]。許多研究已經(jīng)表明組蛋白乙酰化修飾廣泛參與植物的生長發(fā)育過程[14]及應(yīng)對(duì)外界環(huán)境變化[15]。……