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全國人間狂犬病疫情的時間序列分析

2018-04-13 03:34:13,,,,,
中國人獸共患病學報 2018年3期
關鍵詞:高峰模型

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狂犬病是狂犬病病毒感染引起的人獸共患病。除南極洲外全球各大陸均有病例報告,每年約有6萬例狂犬病死亡,其中超過95%的死亡在亞洲和非洲[1]。WHO估計約99%的人狂犬病感染來源為犬。此病目前無特異療法,病死率幾乎100%。為了解我國狂犬病疫情時間分布特征及流行趨勢,現用全國疫情資料進行分析研究。

ARIMA模型即Box-Jenkins模型。一般形式:ARIMA(p,d,q)×(P,D,Q)s,其中d 和D分別為差分和季節性差分次數;p和P分別是自回歸(AR)模型和季節性AR模型的參數個數;q和Q分別是移動平均 (MA)模型和季節性MA模型的參數個數;S是季節性期數。對有季節性變化的時間序列應建立ARIMA(p,d,q)× (P,D,Q)s 模型。

1 資料與方法

1.1資料來源2004年1月至2016年11月全國狂犬病月發病數來自國家衛計委(http:// www.nhfpc.gov.cn/zhuz/index.shtml),2004-2015年全國人口數據來自國家統計局(http://www.stats.gov.cn/)。

1.2分析方法① 序列建立及特征分析:據月發病數及人口數計算月發病率,并建立2004年1月至2016年12月發病率時間序列。用LOESS光滑對序列做季節性分解,同時計算各月的季節指數,據季節指數確定發病高峰。② 序列的平穩化:用自相關圖、偏自相關圖及單位根檢驗對序列進行平穩性檢驗;對非平穩序列用差分法平穩化。平穩序列用Liung-Box檢驗是否為白噪聲;對白噪聲序列選擇合適的分析方法;對非白噪聲序列建立模型。③ 模型的識別及建立:據平穩時間序列的自相關圖(ACF)和偏自相關圖(PACF),初步估計模型階數。按AIC值最小原則選擇最優模型。④ 模型擬合及評價:根據建立的模型擬合模型參數、繪制殘差的QQ圖,檢驗是否滿足正態分布。用Liung-Box檢驗殘差是否滿足獨立性要求。⑤ 預測:用平均絕對標準化誤差(mean absolute error,MASE)衡量模型的擬合優度,MASE<1時模型擬合較好。用建立的模型預測2016年1-11月全國狂犬病月發病率,計算預測值和實際值間的相對誤差以判斷模型的預測精度。

2 結 果

2.1疫情概況2004年1月至2016年11月的月發病率時間序列(圖1A)。用LOESS光滑對序列進行季節性分解結果顯示,疫情存在明顯的季節性,其中8~10月為高峰(32.4%),季節指數分別為1.277、1.285、1.224(圖1B);自2007年后發病率呈逐年下降趨勢(圖1C)。

圖1-A:月發病率時間分布;圖1-B:季節效應;圖1-C:年度趨勢分布;圖1-D:殘差隨機波動Fig.1-A:temporal distribution graph;Fig.1-B:seasonality effect graph;Fig.1-C:annual trend;Fig.1-D:residual distribution圖1 全國狂犬病月發病率序列季節性分解Fig.1 The seasonality decomposition diagram of monthly rabies incidence time series of China

2.2模型識別及建立用2004-2015年月發病率數據建立模型。其自相關圖(ACF)顯示為非平穩序列,需進行差分(圖2)。對序列進行1階差分后,顯示為平穩序列(Dickey-Fuller=-9.352,P<0.01);進行Box-Liung檢驗顯示為非白噪聲序列(C2=4.906,P=0.0268)。由于有季節性高峰,故用ARIMA(p,d,q)(P,D,Q)12模型,因此d=1,D=0。據1階差分序列的ACF圖和PACF圖的圖形類別,逐步選擇合適的p、q、P及D值,以AIC值最小者為最優模型,結果顯示最優模型為ARIMA(2,1,1)(2,0,0)12,AIC=-57.07。

圖2 全國狂犬病2004-2015年月發病率時間序列自相關圖ACF (左)和偏自相關圖PACF(右)Fig.2 The autocorrelation function (ACF,left) and the partial autocorrelation function (PACF,right) of the monthly rabies incidences in China (2004-2015)

2.3模型擬合及評價對建立的ARIMA(2,1,1)(2,0,0)12進行擬合,所有系數均有統計學意義(表1)。繪制模型殘差的QQ圖顯示滿足正態分布(圖3)。模型殘差ACF圖及PACF圖顯示無明顯的相關性(圖4);Box-Liung檢驗結果也顯示模型殘差無明顯的相關性(C2=0.339,P=0.560)、是白噪聲序列。

表1ARIMA(2,1,1)(2,0,0)12模型參數擬合值
Tab.1The fitting values of parameters in ARIMA(2,1,1)(2,0,0)12

  指標indexAR1aAR2bMA1cSAR1dSAR2e系數coefficient0.6650.202-0.9850.4520.372標準誤standarderror0.0960.0980.0310.0800.086t值tvalue6.927??2.061?3.177??5.65??4.326??

注釋:a和b分別為AR模型的第1和第2個參數,c為MA模型的第1個參數,d和e分別是季節性AR模型的第1和第2個參數;*P<0.05;**P<0.01。

圖3 ARIMA(2,1,1)(2,0,0)12模型的殘差QQ圖Fig.3 Residual QQ plot of ARIMA(2,1,1)(2,0,0)12

圖4 模型殘差的自相關圖ACF(左)和偏自相關圖PACF(右)Fig.4 The autocorrelation function (ACF,left) and the partial autocorrelation function (PACF,right) of the model residual

2.4預測 R軟件分析結果顯示模型ARIMA(2,1,1)(2,0,0)12的MASE=0.755,此值<1表明擬合效果較好。用此模型預測2016年1-11月發病率,結果相對誤差-17.25%~62.48%,平均相對誤差為15.61%(表2)。

表2全國狂犬病2016年1-11月份月發病率預測結果
Tab.2The predicted incidences of rabies in China,from Jan.to Nov.,2016

月份Month實際值actualvalue預測值(95%CI)predictedvalue(95%CI)絕對誤差absoluteerror相對誤差relativeerror10.4000.511(0.146~0.875)0.1110.27620.3350.355(0~0.795)0.01990.05930.2330.378(0~0.882)0.1450.62540.2110.309(0~0.858)0.0980.46550.4730.391(0~0.975)-0.082-0.17360.3930.501(0~1.112)0.1080.27470.4290.498(0~1.132)0.0690.16080.4580.570(0~1.222)0.1120.24490.5530.543(0~1.211)-0.010-0.018100.5600.537(0~1.217)-0.023-0.041110.3780.521(0~1.212)0.1430.377

3 討 論

全球除印度外中國年報告狂犬病死亡最多[1]。50年代以來,我國人間狂犬病出現3次高峰[2-3]。第1個高峰50年代中期年死亡最高達1 900多例。第2次高峰為80年代初期,1981年死亡7 037例是最高年份,80年代年均死亡5 537例。第3次高峰在21世紀初期,疫情重現快速增長趨勢。主要宿主動物是犬,調查顯示93.74%病例的感染來源是犬[4]。廣西、貴州、廣東、湖南和四川是近年來高發省份。此病潛伏期數天至≥1年,但多為20~90 d[2]。可在每年高峰季節到來前的3~4個月,對<15歲兒童、農民及流動人口等高危人群及高危地區,加強健康教育,提高暴露后的規范處置率,以減少發病。

時間序列分析據該觀察值歷史數據來預測其發展趨勢,探索其時間分布特征及影響因素。ARIMA模型應用于經濟、工程、氣象、水利等眾多領域。醫學衛生領域也用于預測疾病發病率、人群壽命、醫療衛生費用和食物中毒等,還用于研究氣候及環境因素對人群健康的影響[5-11]。

本研究用2004年1月至2016年11月全國狂犬病月發病率數據進行時間序列分析。顯示2007年以來發病率呈下降趨勢,疫情有明顯季節性(8~10月高峰),與既往報道的時間分布特征類似[2,4]。

建立ARIMA模型至少要有50 個時間點或7~8 個周期的數據。本研究用了144個數據。通過數據差分、模型識別,建立最優模型ARIMA(2,1,1)(2,0,0)12。已知該模型的MASE=0.755,擬合效果較好。對2016年1-11月發病率預測顯示效果較好,平均相對誤差15.61%。由于ARIMA模型預測時是假定事件影響因素無明顯變化,因此ARIMA模型常用于時間序列數據的短期預測。

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