高文庚,于慧瑛,李 新*
(運(yùn)城學(xué)院 生命科學(xué)系,山西 運(yùn)城 044000)
類胡蘿卜素是廣泛分布于動(dòng)植物體內(nèi)的天然色素,具有抗氧化、抗癌、增強(qiáng)免疫力、控制前列腺疾病和退行性黃斑衰退癥等功能,被廣泛應(yīng)用于藥品、保健食品、營(yíng)養(yǎng)強(qiáng)化劑等領(lǐng)域[1-4]。多數(shù)鹽盒菌呈不同程度的紅色,研究發(fā)現(xiàn),鹽盒菌菌體內(nèi)富含C45或C50高碳類胡蘿卜素,且結(jié)構(gòu)中具有更多共軛雙鍵,在抗氧化活性研究方面更具科學(xué)研究?jī)r(jià)值和開發(fā)利用價(jià)值[5]。此外,該類微生物所產(chǎn)色素主要包括菌紅素及其衍生物、類胡蘿卜素、番茄紅素等[6-7]。
鹽盒菌屬是一類只能在高鹽環(huán)境中生存的極端環(huán)境微生物,其最適生長(zhǎng)鹽濃度為2.5~5.2 mol/L,多生存于鹽湖、鹽田、腌制食品等鹽域環(huán)境中,具有獨(dú)特的種群分布與群落結(jié)構(gòu)[8]。由于生存環(huán)境特殊,嗜鹽古菌形成了獨(dú)特的代謝機(jī)制,可產(chǎn)生胞外淀粉酶、蛋白酶、纖維素酶、脂肪酶等多種嗜鹽酶類[9-10],其中一些酶具有良好的穩(wěn)定性,可以耐受較為苛刻的外界條件[11]。另外,一些嗜鹽菌對(duì)大腸桿菌、金黃色葡萄球菌及辣椒疫霉菌等具有拮抗作用[12-13]。由于鹽盒菌代謝方式及產(chǎn)物的特殊性,近年來(lái)備受關(guān)注,成為研究的熱點(diǎn)[14]。目前,對(duì)于鹽盒菌研究,主要集中在菌種分離篩選、色素組分分析及菌紅素生物學(xué)特性研究方面[5-7],而對(duì)于產(chǎn)類胡蘿卜素鹽盒菌的報(bào)道相對(duì)較少,研究鹽盒菌生長(zhǎng)及發(fā)酵特性對(duì)于天然類胡蘿卜素工業(yè)化生產(chǎn)顯得尤為重要。
本研究從運(yùn)城鹽湖中分離獲得一株發(fā)酵液呈橘紅色的鹽盒菌菌株G14,擬采用16S rRNA基因序列分析,結(jié)合形態(tài)學(xué)觀察與生理生化特性分析等,對(duì)其進(jìn)行分類鑒定,并對(duì)其進(jìn)行培養(yǎng)條件優(yōu)化,以期通過(guò)最佳條件進(jìn)行菌株擴(kuò)大培養(yǎng),為后續(xù)利用該菌進(jìn)行類胡蘿卜素發(fā)酵生產(chǎn)等研究奠定基礎(chǔ)。
菌株G14:分離自運(yùn)城鹽湖的黑泥樣本,分離純化后4℃保存。
酸水解酪蛋白、酵母浸粉、蛋白胨等常規(guī)生化試劑:北京奧博星生物技術(shù)有限責(zé)任公司;DNA提取純化試劑盒:北京索萊寶公司;DNAMarker、EXTaqDNA聚合酶(5U/μL)、引物合成(正向引物:5'-ATTCCGGTTGATCCTGC-3',反向引物:5'-AGGAGGTGATCCAGCCGCAG-3)'、pMD18-T載體:大連TaKaRa公司。
高鹽培養(yǎng)基:酸水解酪蛋白6 g/L,檸檬酸鈉3 g/L,酵母浸粉10g/L,蛋白胨5g/L,無(wú)水MgSO49.76g/L,KCl2g/L,NaCl 210~290 g/L,蒸餾水 1 000 mL,pH 7.5~8.0,121 ℃滅菌20 min后備用。固態(tài)培養(yǎng)基添加瓊脂2 g/100 mL。
Tanon-1600凝膠成像系統(tǒng):上海天能科技有限公司;T100聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)擴(kuò)增儀:美國(guó)Bio-Rad公司;TGL-16M高速臺(tái)式冷凍離心機(jī):湖南湘儀實(shí)驗(yàn)室儀器開發(fā)有限公司;LDZX-50K立式壓力蒸氣滅菌器:上海申安醫(yī)療器械廠;HZP-150型全溫振蕩培養(yǎng)箱:上海精宏實(shí)驗(yàn)設(shè)備有限公司;DYY-6C電泳儀:北京市六一儀器廠;UV-6000PC紫外可見分光光度計(jì):上海元析儀器有限公司;SHP-250生化培養(yǎng)箱:上海飛龍儀表電器有限公司。
1.3.1 菌株G14的形態(tài)學(xué)觀察及生理生化特性
將分離純化的G14菌株劃線接種于固體培養(yǎng)基,37℃培養(yǎng)7 d,觀察單菌落形態(tài)特征。革蘭氏染色觀察個(gè)體形態(tài),并參照文獻(xiàn)[15]對(duì)其生理生化特征進(jìn)行研究。
1.3.2 菌株G14的16S rRNA基因序列分析
DNA提取及擴(kuò)增體系參照文獻(xiàn)[16]的方法。采用通用基因組DNA提取試劑盒,提取菌株G14基因組,以總DNA為模板,采用極端嗜鹽古菌特異性引物進(jìn)行16SrRNA基因的PCR擴(kuò)增。正向引物:5'-ATTCCGGTTGATCCTGC-3',反向引物:5'-AGGAGGTGATCCAGCCGCAG-3'。PCR反應(yīng)體系(20μL):無(wú)菌水13.2μL,10×PCRExTaqbuffer2.0μL,脫氧核糖核苷三磷酸(deoxy-ribonucleoside triphosphate,dNTP)Mixtures 1.6 μL,ExTaq 聚合酶 0.2 μL。PCR反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性 1 min;95℃變性 30 s,52℃退火 1 min,72℃延伸1.5 min,30個(gè)循環(huán);72℃再延伸10 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)電泳檢測(cè)后回收純化,送北京三博遠(yuǎn)志公司測(cè)序。測(cè)序結(jié)果在GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行BLAST比對(duì),選擇同源性較高的相關(guān)序列,利用Clustal W1.8、MEGA 5.0軟件進(jìn)行多重序列比對(duì)及分析,構(gòu)建菌株G14的系統(tǒng)進(jìn)化樹,確定其分類學(xué)地位。
1.3.3 菌株G14的培養(yǎng)條件單因素試驗(yàn)
分別測(cè)定光照處理、高鹽培養(yǎng)基中NaCl質(zhì)量濃度、初始pH及培養(yǎng)溫度對(duì)菌株G14生長(zhǎng)的影響。
在裝有150 mL液體培養(yǎng)基的錐形瓶中,分別接入經(jīng)37℃、160 r/min振蕩培養(yǎng)7 d的種子液2%(V/V),一定溫度條件下160 r/min振蕩培養(yǎng)7 d,定時(shí)取樣測(cè)定培養(yǎng)液OD600nm值,比較不同培養(yǎng)條件對(duì)菌株G14生長(zhǎng)的影響。單因素試驗(yàn)設(shè)定分別為遮光黑暗培養(yǎng)、光照培養(yǎng)(光照強(qiáng)度1833lx),NaCl質(zhì)量濃度分別為0.21 g/mL、0.23 g/mL、0.25 g/mL、0.27 g/mL、0.29 g/mL,初始pH分別為6.0、7.0、8.0、9.0、10.0,培養(yǎng)溫度分別為30℃、35℃、40℃、45℃。
1.3.4 菌株G14培養(yǎng)條件優(yōu)化正交試驗(yàn)
根據(jù)單因素試驗(yàn)結(jié)果,選取培養(yǎng)溫度(A)、初始pH值(B)、培養(yǎng)基NaCl質(zhì)量濃度(C),采用3因素3水平L9(33)正交試驗(yàn)對(duì)G14菌株培養(yǎng)條件進(jìn)行優(yōu)化,因素與水平見表1。

表1 培養(yǎng)條件優(yōu)化正交試驗(yàn)因素與水平Table 1 Factors and levels of orthogonal experiments for culture conditions optimization
1.3.5 菌株生長(zhǎng)量及類胡蘿卜素含量測(cè)定
生長(zhǎng)量測(cè)定:培養(yǎng)過(guò)程中1d取樣3次,每次5mL,利用分光光度計(jì)在波長(zhǎng)600 nm條件下測(cè)定菌液的OD600nm值[17],共培養(yǎng)7 d。
類胡蘿卜素含量測(cè)定:參照文獻(xiàn)[5]方法將培養(yǎng)7 d菌液100 mL離心收集菌體后,10%滅菌NaCl溶液懸洗3遍。加5 mL丙酮充分振蕩提取后離心,取上清液在波長(zhǎng)475 nm處測(cè)定OD475nm值,類胡蘿卜素含量計(jì)算公式如下:

式中:X為類胡蘿卜素含量,μg/mL;A為最大吸收波長(zhǎng)處的吸光度值;D為浸提液稀釋倍數(shù);V1為丙酮添加量,mL;V2為發(fā)酵液體積,mL;E為類胡蘿卜素的消光系數(shù)。
1.3.6 數(shù)據(jù)處理
每個(gè)實(shí)驗(yàn)均重復(fù)3次,運(yùn)用數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)(data processing system,DPS)統(tǒng)計(jì)軟件對(duì)試驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。
2.1.1 菌株G14形態(tài)學(xué)及生理生化特征鑒定結(jié)果
菌株G14在高鹽培養(yǎng)基上生長(zhǎng)良好,菌落呈橘紅色、極具光澤,中央突起、邊緣平整,革蘭氏染色呈陽(yáng)性,菌體細(xì)胞呈球狀。菌株G14生理生化特征見表2。
由表2可知,菌株G14能產(chǎn)生淀粉水解酶、纖維素酶、明膠水解酶、脲酶、過(guò)氧化氫酶及苯丙氨酸脫氫酶等;不能產(chǎn)生氧化酶、蛋白酶及吲哚等;能夠還原硝酸鹽,產(chǎn)生H2S,甲基紅和V-P實(shí)驗(yàn)的結(jié)果為陰性;菌株G14能夠利用葡萄糖、蔗糖、D-半乳糖、D-木糖作為碳源,在鹽質(zhì)量濃度0.1~0.3 g/mL、pH4~10范圍內(nèi)均能生長(zhǎng)。
2.1.2 16S rRNA基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物及系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
16S rRNA基因序列PCR擴(kuò)增后的產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠檢測(cè),凝膠成像結(jié)果見圖1。
由圖1可知,擴(kuò)增得到基因片段凝膠電泳條帶單一,均有明顯亮帶,與Marker條帶比較發(fā)現(xiàn),目的基因片段大小約為1 500 bp左右。測(cè)序結(jié)果表明,菌株G14的16S rRNA基因序列為1 420 bp,兩者相符。
由于16S rRNA基因序列分析及系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系推斷在嗜鹽古菌種級(jí)以上分類單元的界定中具有較強(qiáng)的分辨力[18],將基因序列提交GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中,序列號(hào)為JN112004。采用鄰接法(neighbor-joining,NJ)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)果見圖2。

圖2 基于16S rRNA基因序列采用鄰接法構(gòu)建的菌株G14的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2 Phylogenetic tree of strain G14 constructed by neighborjoining method based on 16S rRNA gene sequences
由圖2可知,與菌株G14同源性最高的是Haloarcula argentinensisJCM 9737,相似度最高達(dá)97.3%,具有較近的親緣關(guān)系,結(jié)合形態(tài)學(xué)觀察結(jié)果和生理生化特征,鑒定其為鹽盒菌屬(Haloarculasp.)。
2.2.1 光照對(duì)菌株G14生長(zhǎng)的影響

圖3 光照對(duì)菌株G14生長(zhǎng)的影響Fig.3 Effect of light on the growth of strain G14
由圖3可知,光照對(duì)于菌株生長(zhǎng)的延滯期、對(duì)數(shù)期均有較大的影響。在相同的培養(yǎng)條件下,光照可明顯縮短菌株G14的延滯期,由40 h縮短至20 h;培養(yǎng)40 h后兩種處理均進(jìn)入對(duì)數(shù)期,但處于光照環(huán)境中菌株G14的菌體生長(zhǎng)量顯著高于黑暗環(huán)境(P<0.05);培養(yǎng)114 h后進(jìn)入穩(wěn)定期,短于黑暗培養(yǎng)的138 h,并且在70 h后菌液有淡紅色出現(xiàn),而后者培養(yǎng)液始終呈黃色。進(jìn)入穩(wěn)定期后兩種處理菌液的OD600nm值沒有顯著性差異(P>0.05),說(shuō)明光照對(duì)菌體生長(zhǎng)繁殖速度及類胡蘿卜素產(chǎn)生非常重要,但卻對(duì)最終的總菌體量沒有顯著影響(P>0.05)。
2.2.2 NaCl質(zhì)量濃度對(duì)菌株G14生長(zhǎng)的影響

圖4 不同的NaCl質(zhì)量濃度對(duì)菌株G14生長(zhǎng)的影響Fig.4 Effects of different NaCl mass concentration on the growth of strain G14
由圖4可知,培養(yǎng)基NaCl質(zhì)量濃度對(duì)菌株G14的生長(zhǎng)影響較大。NaCl質(zhì)量濃度為0.21~0.25g/mL時(shí),隨著培養(yǎng)時(shí)間的變化,培養(yǎng)液OD600nm值的變化趨勢(shì)基本一致,其中NaCl質(zhì)量濃度為0.23g/mL時(shí),對(duì)數(shù)期菌體生長(zhǎng)速率最大,進(jìn)入穩(wěn)定期后菌液的OD600nm值相比較于其他質(zhì)量濃度大,且差異顯著(P<0.05)。而NaCl質(zhì)量濃度為0.21 g/mL和0.25 g/mL的條件下,培養(yǎng)液OD600nm值無(wú)顯著差異(P>0.05)。NaCl質(zhì)量濃度為0.23 g/mL時(shí)菌株G14生長(zhǎng)效果最好。當(dāng)培養(yǎng)基NaCl質(zhì)量濃度繼續(xù)升高,菌體生長(zhǎng)受到抑制,菌體對(duì)數(shù)期生長(zhǎng)速率越低,進(jìn)入穩(wěn)定期越遲,并且穩(wěn)定期培養(yǎng)液中菌體濃度越低。因此,NaCl質(zhì)量濃度0.23 g/mL時(shí)為宜。
2.2.3 初始pH值對(duì)菌株G14生長(zhǎng)的影響

圖5 不同的初始pH值對(duì)菌株G14生長(zhǎng)的影響Fig.5 Effects of the different initial pH values on the growth of strain G14
由圖5可知,初始pH值為7.0的培養(yǎng)液中對(duì)數(shù)期菌體生長(zhǎng)速率最大,穩(wěn)定期菌液OD600nm值極顯著高于其他水平(P<0.01)。當(dāng)pH過(guò)高或過(guò)低,菌體生長(zhǎng)都會(huì)受到抑制。初始pH值為6.0時(shí)延滯期明顯延長(zhǎng),穩(wěn)定期開始時(shí)間和穩(wěn)定期菌體濃度與pH 8.0時(shí)幾乎一致,無(wú)顯著差異(P>0.05)。pH 8.0與pH 7.0條件下菌體生長(zhǎng)量變化趨勢(shì)基本一致,但各階段生物量均低于后者。隨著pH升高,菌株G14生長(zhǎng)各階段均受到影響,至初始pH為10.0時(shí)生長(zhǎng)幾乎完全限制。因此初始值pH7.0時(shí)為宜。
2.2.4 培養(yǎng)溫度對(duì)菌株G14生長(zhǎng)的影響

圖6 不同培養(yǎng)溫度對(duì)菌株G14生長(zhǎng)的影響Fig.6 Effects of the different culture temperature on the growth of strain G14
由圖6可知,培養(yǎng)溫度對(duì)于菌株生長(zhǎng)的對(duì)數(shù)期影響較大。在30~45℃溫度范圍內(nèi),隨著培養(yǎng)溫度的上升,菌體培養(yǎng)的延滯期縮短,對(duì)數(shù)期菌體生長(zhǎng)速率增大,進(jìn)入穩(wěn)定期的時(shí)間提前,但進(jìn)入穩(wěn)定期后40℃培養(yǎng)OD600nm值較高,與30℃有顯著差異(P<0.05),其他3個(gè)溫度水平基本一致,未出現(xiàn)顯著差異(P>0.05)。因此,培養(yǎng)溫度40℃為宜。
在單因素試驗(yàn)的基礎(chǔ)上,綜合考慮各因素對(duì)菌體生長(zhǎng)的影響,采取光照培養(yǎng),以O(shè)D600nm值為評(píng)價(jià)指標(biāo),選取培養(yǎng)溫度(A)、初始pH值(B)以及NaCl質(zhì)量濃度(C)為評(píng)價(jià)因素,應(yīng)用3因素3水平L9(33)進(jìn)行正交試驗(yàn),培養(yǎng)140 h測(cè)定OD600nm值,從而進(jìn)一步確定最佳培養(yǎng)條件。正交試驗(yàn)結(jié)果與分析見表3,方差分析見表4。

表3 培養(yǎng)條件優(yōu)化正交試驗(yàn)結(jié)果與分析Table 3 Results and analysis of orthogonal experiments for culture conditions optimization
由表3可知,對(duì)菌株生長(zhǎng)影響因素由大到小的順序依次為B>A>C,即初始pH對(duì)菌體生長(zhǎng)影響最大,培養(yǎng)溫度次之,NaCl質(zhì)量濃度影響最小。由正交試驗(yàn)結(jié)果與極差分析可以得出菌株G14生長(zhǎng)的最優(yōu)培養(yǎng)條件組合為A3B2C2,即培養(yǎng)溫度43℃、初始pH 7.0、NaCl質(zhì)量濃度0.23 g/mL。在此優(yōu)化培養(yǎng)條件下,經(jīng)過(guò)驗(yàn)證試驗(yàn)檢測(cè)培養(yǎng)液OD600nm值達(dá)到2.24。測(cè)定此時(shí)培養(yǎng)液類胡蘿卜素產(chǎn)生量為0.65 mg/L。

表4 正交試驗(yàn)結(jié)果方差分析Table 4 Variance analysis of orthogonal experiments results
由表4可知,初始pH值對(duì)菌體生長(zhǎng)有極顯著影響(P<0.01),而培養(yǎng)溫度及NaCl質(zhì)量濃度在試驗(yàn)設(shè)定水平范圍內(nèi)對(duì)菌體生長(zhǎng)沒有顯著影響(P>0.05)。
試驗(yàn)對(duì)分離自運(yùn)城鹽湖黑泥樣品中的一株產(chǎn)生類胡蘿卜素菌株G14進(jìn)行形態(tài)觀察、生理生化特性及16S rRNA基因序列分析,發(fā)現(xiàn)該菌屬于鹽盒菌屬(Haloarculasp.),為極端嗜鹽古菌。并采用單因素分析及正交試驗(yàn)對(duì)菌株培養(yǎng)條件進(jìn)行優(yōu)化,得出菌株G14的最佳培養(yǎng)條件為培養(yǎng)溫度43℃,NaCl質(zhì)量濃度為0.23 g/mL,初始pH值為7.0。在該優(yōu)化條件下,培養(yǎng)液OD600nm值達(dá)到2.24,類胡蘿卜素產(chǎn)量為0.65 mg/L。該研究結(jié)果對(duì)菌株G14的菌體大規(guī)模培養(yǎng)及高鹽發(fā)酵代謝產(chǎn)物開發(fā)利用提供了理論依據(jù)。
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