王荻瀟, 鐘 敏, 雷曉凌, 聶芳紅, 鄧義佳, 姚遠(yuǎn)蓓
(廣東海洋大學(xué)食品科技學(xué)院 廣東省水產(chǎn)品加工與安全重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 水產(chǎn)品深加工廣東普通高等學(xué)校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 ,廣東 湛江 524088)
珊瑚作為一類無脊椎動物存在于海洋環(huán)境中,種類繁多,被稱為海洋的“熱帶雨林”。珊瑚與周圍水環(huán)境及其附生的藻類、微生物群體形成穩(wěn)定的生態(tài)系統(tǒng),與其共附生微生物協(xié)同進(jìn)化,形成了良好的互惠關(guān)系[1-2]。微生物作為珊瑚生態(tài)系統(tǒng)中重要組成部分,對維持該生態(tài)系統(tǒng)的平衡起著及其重要的作用[3-4]。有研究表明珊瑚共附生微生物可為其化學(xué)防御提供武器[5],對抵御外來物種侵害以及環(huán)境變化方面具有重要意義。 海洋微生物資源與陸地資源相比較豐富,研究潛力大但開發(fā)率低[6]。海洋真菌作為海洋共附生微生物重要的組成部分,已成為國內(nèi)外研究的熱點(diǎn)。目前有關(guān)海洋真菌的研究主要集中于抗菌、抗腫瘤等活性物質(zhì)的開發(fā)[7-9],如Li等[10]從中國三亞國家珊瑚礁保護(hù)區(qū)的珊瑚Sarcophytontortuosum中分離出1株真菌Chondrostereumsp.,能產(chǎn)生一種對人鼻咽癌細(xì)胞具有細(xì)胞毒性的倍半萜類化合物,但對海洋真菌的鑒定及生理學(xué)特性報道較少,目前研究較多的珊瑚共附生真菌主要有子囊菌和半知菌[11-12]。除常見種屬外,還發(fā)現(xiàn)一些較罕見菌,如Koh等[13]從新加坡地區(qū)柳珊瑚分離出粘鞭霉Gliomastixsp.和齒梗孢Scolecobasidiumsp.。Wangt等[14]從中國南海海域柳珊瑚上分離得到鏈格孢Alternariasp.、黑孢霉Nigrosporasp.及叢赤殼Nectriasp.,但均未對其進(jìn)行生理學(xué)特性研究。雖然罕見菌的分離豐富了海洋真菌基因和形態(tài)多樣性,但對生理特性研究的缺乏嚴(yán)重阻礙對其活性物質(zhì)的進(jìn)一步開發(fā)。因此,對罕見菌種生理學(xué)特性的研究,可為后期活性物質(zhì)的開發(fā)奠定基礎(chǔ)。本課題組通過對叢生盔形珊瑚中分離的菌株XWC14-13進(jìn)行形態(tài)學(xué)特征、rDNA ITS基因序列分析鑒定,并研究不同溫度、pH和鹽度對該菌株生長的影響,篩選出最優(yōu)培養(yǎng)條件,為進(jìn)一步研究該珊瑚真菌潛在的生物活性提供參考。
1.1.1 菌種來源 本研究所用菌株XWC14-13分離自湛江市徐聞縣叢生盔形珊瑚,現(xiàn)保存于廣東省微生物菌種保藏中心,編號為GDMCC 60006。
1.1.2 培養(yǎng)基 查氏瓊脂培養(yǎng)基(CA),馬鈴薯葡萄糖瓊脂培養(yǎng)基(PDA)。以上培養(yǎng)基均采用人工海水進(jìn)行配制,海水配比為3%[15]。
1.1.3 試劑和儀器 SK8259試劑盒(真菌基因組DNA抽提試劑盒)、dNTP、DNA Ladder Mix maker、引物,購自上海生工生物工程股份有限公司;Taq-Tm DNA聚合酶,購自北京金石百優(yōu)科技有限公司(MBI品牌);瓊脂糖,購自生工生物工程(上海)股份有限公司(BBI品牌)。DYCP-31DN DNA電泳槽(北京六一儀器廠);FR980凝膠成像儀(上海復(fù)日科技儀器有限公司);2720 thermal cycler PCR儀(Applied Biosystems);HC-2518R冷凍高速離心機(jī)(BBI);DM4B數(shù)字顯微鏡(徠卡顯微系統(tǒng)(上海)貿(mào)易有限公司)。
1.2.1 菌株形態(tài)學(xué)鑒定 ①菌落觀察:采用點(diǎn)植法將菌株接種于CA和PDA培養(yǎng)基上,28 ℃培養(yǎng)6 d,觀察菌落大小、形態(tài)和色澤等,采用十字交叉法測量菌落直徑。②個體形態(tài)觀察:選取適宜培養(yǎng)基,對菌株進(jìn)行插片法培養(yǎng)[16],每隔12 h進(jìn)行形態(tài)觀察。
1.2.2 分子學(xué)鑒定及系統(tǒng)發(fā)育樹的建立 ①分子學(xué)鑒定:將菌株XWC14-13在PDA培養(yǎng)基上28 ℃培養(yǎng)7 d,取50 mg新鮮菌體,采用SK8259試劑盒提取DNA。PCR擴(kuò)增引物為ITS1:5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′,ITS4: 5′-TCCTC-CGCTTATTGATATGC-3′。25 μL反應(yīng)體系:模板0.5 μL,10×Buffer 2.5 μL,dNTP 1 μL,酶0.2 μL,正向引物和反向引物均為0.5 μL,ddH2O 19.8 μL。PCR循環(huán)條件:94 ℃ 4 min;94 ℃ 45 s, 55 ℃ 45 s, 72 ℃ 1 min,30個循環(huán);72 ℃10 min。對PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行DNA測序,由生工(上海)生物工程股份有限公司完成。②系統(tǒng)發(fā)育樹的建立:將測得的ITS序列上傳到GenBank數(shù)據(jù)庫中,根據(jù)菌株登錄號在NCBI網(wǎng)站通過對比引擎BLAST進(jìn)行在線對比分析,獲取親源關(guān)系較近菌株的基因序列,使用MEGA6.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,從而確定菌株的親緣關(guān)系。
1.2.3 菌株XWC14-13生理學(xué)特性研究 ①溫度對菌株生長的影響:采用點(diǎn)植法將菌株接種在PDA培養(yǎng)基中心上,分別置于0、5、10、15、20、25、30、35、40、45、50 ℃ 10個溫度梯度下培養(yǎng)5 d,每天用游標(biāo)卡尺測量菌落直徑,試驗(yàn)設(shè)3組平行。②酸堿度對菌株生長的影響:將PDA的pH值分別調(diào)至2.0、3.0、4.0、6.0、6.5、7.0、7.5、8.0、8.5、10.0、11.0、12.0,采用直徑7.2 mm無菌打孔器將菌餅接種到平板中心,28 ℃培養(yǎng)5 d,每天用游標(biāo)卡尺測量菌落直徑,試驗(yàn)設(shè)3組平行。③鹽濃度(體積分?jǐn)?shù))對菌株生長的影響:用海水晶將PDA的鹽濃度分別配制成0%、1%、2%、3%、4%、5%、6%、10%、15%、20%,采用點(diǎn)植法接種,28 ℃培養(yǎng)5 d,每天用游標(biāo)卡尺測量菌落直徑,試驗(yàn)設(shè)3組平行。
1.2.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析 利用SPSS 19.0統(tǒng)計軟件對實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行方差分析和顯著性測定。
菌株XWC14-13在CA和PDA培養(yǎng)基上培養(yǎng)6 d后均能顯著生長,且在6 d內(nèi)均能長成明顯菌落。但在6 d內(nèi),PDA培養(yǎng)基上的菌落直徑顯著大于CA培養(yǎng)基(P<0.05)。在第1天時CA培養(yǎng)基的菌株直徑為(2.81±0.65) mm,顯著低于在PDA上生長的菌落直徑(P<0.05)。第6天在CA上的菌株大小僅為在PDA上菌株大小的41%,表明PDA比CA更適宜此菌株生長(表1)。

表1 菌株XWC14-13在CA和PDA培養(yǎng)基上不同培養(yǎng)時間的菌落直徑(N=3,mm)
注:同一列平均數(shù)中標(biāo)有不同字母,表示在0.05水平上差異顯著,下表同
菌株XWC14-13在CA培養(yǎng)基上生長緩慢,第6天觀察菌落正面為白色、中心緊實(shí),四周質(zhì)地呈薄而半透明狀,絨毛疏松,反面無褶皺,且正、反兩面無明顯差異。菌株在PDA培養(yǎng)基上生長速度較快,菌落大且厚實(shí)、生長初期呈白色,第6天呈乳白色。正面平展,毛氈狀,邊緣較稀疏,菌落反面呈淡黃色,有向心褶皺及半透明螺紋(圖1)。

圖1 菌株XWC14-13在CA和PDA上培養(yǎng)第6天的菌落特征Fig.1 Morphological characteristics of strain XWC14-13 developed on CA and PDA at 6th day A、B分別為菌株XWC14-13在CA和PDA培養(yǎng)基上的菌落正面特征;a、b分別為菌株XWC14-13在CA和PDA培養(yǎng)基上的菌落反面特征 A,B: Surface colony of XWC14-13 grew in CA and PDA; a,b: Back colony of XWC14-13 grew in CA and PDA
在PDA上培養(yǎng)24 h,菌株XWC14-13菌絲呈半透明狀,產(chǎn)生少量小而光滑、透明圓形孢子囊;36 h孢子囊數(shù)量增多,部分從半透明變?yōu)楹稚斏?cè)生或著生于短的突起,或生于長柄或側(cè)分枝上;48 h菌絲變粗糙,并產(chǎn)生少量半透明膈膜;60~72 h,孢子囊數(shù)量增多,變大且呈深褐色,呈現(xiàn)出圓形、卵圓形、燒瓶狀,部分成熟脫落,此時囊托基本形成,膈膜顏色變深;84 h時,部分孢子囊破裂,釋放大量孢子,孢囊孢子表面光滑,呈短小、細(xì)長、透明狀,囊托形態(tài)明顯(圖2)。

圖2 菌株XWC14-13在PDA上的形態(tài)特征(28 ℃)Fig.2 Microstructure character of strain XWC14-13 on PDAA:幼齡菌絲(24 h);B:孢子囊(36 h);C:膈膜(48 h);D:孢囊孢子(84 h);E:孢子囊(72 h);F:孢子囊(84 h);G:對比菌株Gongronella butleri(KP055605)生長后期, 箭頭指向橫隔A: Young hyphae(24 h); B: Sporangium(36 h); C:Septate(48 h); D: Sporangiospore(84 h); E: Sporangium(72 h);F: Sporangium(84 h); G: The late growth stage of compared strain of KP055605, arrows to septate
整個生長過程中,菌株XWC14-13菌絲大小為3.62~8.09 μm,孢囊梗大小為4.88~6.76 μm,囊托大小為5.13~9.56 μm,孢子囊大小為(5.15~7.57) μm×(23.53~25.74) μm,孢囊孢子大小為(2.02~3.03)μm×(2.01~1.52)μm。菌株XWC14-13與Babu等[17]報道的菌株Gongronellabutleri(KP055605)形態(tài)大體相似,均有膈膜與孢子囊,但與對比菌株相比孢子囊較大,孢子較小,不產(chǎn)厚垣孢子。
將所得ITS序列提交至GenBank數(shù)據(jù)庫進(jìn)行BLAST同源性比對,結(jié)果顯示,菌株XWC14-13(KX911872)與球托霉屬(Gongronellasp.)同源性最高,從GenBank中找出與XWC14-13同源性較高的7株菌株的基因序列,用MEGA6.0軟件,NJ法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖3),從圖3可以看出,菌株XWC14-13與菌株Gongronellabutleri(KP055605)聚為一支,結(jié)合形態(tài)鑒定結(jié)果,將菌株XWC14-13鑒定為Gongronellabutleri。

圖3 基于ITS序列的NJ系統(tǒng)發(fā)育樹
菌株XWC14-13在15~35 ℃范圍內(nèi)均能生長,且生長速度差異較顯著(P<0.05)(表2)。在30 ℃條件下生長速度最快,菌落直徑最大;在15 ℃條件下生長速度極其緩慢,培養(yǎng)至第4天才有生長跡象;在35 ℃仍具有良好的生長狀態(tài),但在40 ℃不生長(表2)。菌落最適宜生長溫度依次為30、35、25、20、15 ℃。

表2 不同溫度對菌株XWC14-13菌絲生長的影響
注:“-”代表不生長,下表同
菌株XWC14-13在pH 3.0~11.0之間均能生長,pH為2.0和12.0不生長。pH為3.0時PDA培養(yǎng)基呈液狀,菌株可呈膜塊狀生長;pH為4.0~11.0條件下,菌株培養(yǎng)5 d內(nèi)生長直徑變化顯著(P<0.05)。培養(yǎng)初期生長直徑范圍為8.90~10.52 mm,5 d時菌株直徑均達(dá)到40 mm且最大值為45.84 mm(pH=8.5)(表3)。

表3 不同pH對菌株XWC14-13生長的影響
注:“+”代表液體生長

圖4 菌株XWC14-13在不同pH時第4天與第5天生長比較Fig.4 Growth comparison of strain XWC14-13 in different pH on day 4th and 5th
從圖4可看出,第4天時,菌株生長直徑較大的pH范圍為7.5~8.5,第5天的最適pH為8.0~10.0,綜合分析可篩選出菌株最適宜生長的pH范圍為8.0~8.5。
菌株XWC14-13在鹽濃度為0~10%(體積分?jǐn)?shù))范圍內(nèi)均能生長,15%不生長(表4)。在鹽度為1%時生長最好,鹽質(zhì)量濃度為2%~4%生長較好,第5天的菌落直徑均達(dá)到30 mm以上。隨鹽質(zhì)量濃度增加,生長速率逐漸降低,鹽質(zhì)量濃度為10%時生長顯著減緩(P<0.05)(表4)。在無鹽環(huán)境下,菌株仍能生長,但速率較低。

表4 不同鹽度對菌株XWC14-13菌絲生長的影響
本研究對珊瑚共附生真菌中分離的菌株XWC14-13進(jìn)行形態(tài)學(xué)和ITS1-ITS4分子鑒定,表明該菌株與報道菌株Gongronellabutleri(KP055605)[17]極為相似,因此鑒定菌株XWC14-13為卵形球托霉Gongronellabutleri,但該菌未產(chǎn)厚垣孢子,且孢囊孢子顯著小于對比菌株。生理學(xué)特性研究結(jié)果表明,菌株XWC14-13在PDA培養(yǎng)基上生長迅速,最適溫度為30 ℃,pH為8.0~8.5,鹽度1%,但其在pH 3.0~11.0范圍內(nèi)均能生長良好,具有廣泛的酸堿耐受性。 Nguyen等[18]研究的1株來自森林土壤的Gongronellasp.在PDA培養(yǎng)基上生長最好,李桂舫等[19]研究了分離自黃海和渤海海域漂流木上的4株海生毛殼菌,與菌株XWC14-13均具有相似特征,海水偏堿性且具有一定鹽度,此菌株最適生長條件偏堿性,并有耐鹽能力,因此可初步判斷其符合海洋真菌的生理特性。巴斯洛[20]在1985年提出兼性海洋微生物的概念。Sakayaroj等[21]表明植物內(nèi)生真菌同樣存在于海洋,并具有在海洋環(huán)境中生長和繁殖的能力。目前已有大量研究表明兼性物種在基因組成、生態(tài)功能及生理活性方面具有多樣性[22-24]。王軍等[25]從南海紅樹內(nèi)生真菌中分離出的異香豆素 avicennin-A,是一種陸生真菌代謝產(chǎn)物中未見報道的化合物。與本研究菌株相似的球托霉菌屬多從土壤中分離[26-28],目前并未在其他環(huán)境中發(fā)現(xiàn)。菌株XWC14-13分離自海洋環(huán)境,最適宜生長條件與海洋環(huán)境條件相符,具有一定的耐鹽性,但在無鹽環(huán)境下也可生長,屬于兼性海洋微生物,比在土壤中分離得到的同種菌具有更強(qiáng)的環(huán)境適應(yīng)性與抗逆性,具有更大的開發(fā)潛力。目前本團(tuán)隊前期研究發(fā)現(xiàn)菌株XWC14-13具有一定的抗菌活性,其他性質(zhì)有待進(jìn)一步研究。
目前關(guān)于Gongronellabutleri的應(yīng)用研究較少,主要通過酶解細(xì)胞壁或紫外誘變方法制備高純度殼聚糖和殼聚糖-葡聚糖復(fù)合物[29-30]。殼聚糖和葡聚糖作為重要的真菌骨骼多糖,主要存在于接合菌綱的細(xì)胞壁中,對其結(jié)構(gòu)組成起到重要作用[31-32]。Nwe等[33]在強(qiáng)堿條件下,使用熱穩(wěn)定α-淀粉酶對生長在紅薯片上的Gongronellabutleri菌株進(jìn)行酶解細(xì)胞壁(95 ℃、5 h),獲得高純度的殼聚糖與殼聚糖-葡聚糖復(fù)合物,其穩(wěn)定的三維網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有廣泛的應(yīng)用前景[34-35]。