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從化學鍵的角度解讀與DNA有關的幾種酶

2018-11-14 12:49:12范秋平
新課程·下旬 2018年9期

范秋平

摘 要:以追根溯源的方式解讀了與DNA有關的七種酶,重點從兩種化學鍵(磷酸二酯鍵和氫鍵)的角度對這幾種酶進行比較與分析,旨在引導教師在教學過程中把握問題的關鍵與實質,以達到好的教學效果。

關鍵詞:DNA;酶;磷酸二酯鍵;氫鍵

在DNA復制、轉錄以及基因工程等過程的學習中涉及了多種與DNA有關的酶:解旋酶、DNA聚合酶、RNA聚合酶、限制性核酸內切酶、DNA連接酶、DNA酶和Taq酶。由于種類繁多,學生對于每種酶的作用極易混淆。在本文中,我力圖從DNA分子結構的角度對這幾種酶進行比較,希望對此難點的解決有一定的借鑒價值。

一、DNA分子的結構

DNA分子的基本組成單位是四種脫氧核苷酸,從DNA分子整體的雙螺旋結構來看,包括兩種重要的化學鍵:磷酸二酯鍵和氫鍵。(如下圖)

二、對于七種酶的歸納與總結

從化學鍵的種類以及合成與破壞化學鍵的角度出發,我把這七種酶進行了“檢索式”的歸納與總結。(見下圖)

三、詳細解讀每種酶

1.①解旋酶

DNA分子在細胞內復制時首先要用解旋酶將兩條螺旋的雙鏈解開,實質上就是破壞DNA分子堿基對中的氫鍵。

小結:這是幾種酶中唯一作用于氫鍵的酶。

2.②限制性核酸內切酶和③DNA酶

在基因工程中②被稱為“分子手術刀”,它主要是從原核生物中分離純化出來的,一種限制酶只能識別一種特定的核苷酸序列,并且使每一條鏈中特定部位的兩個核苷酸之間的磷酸二酯鍵斷開,從而把DNA分子切成小的片段。在獲取目的基因與構建基因表達載體時必須用此酶來切割DNA分子。

“艾弗里的肺炎雙球菌轉化實驗”中提到,在DNA酶的作用下S型菌的DNA水解為單個核苷酸。DNA酶的作用是破壞掉DNA分子中的每個磷酸二酯鍵,作用的最終結果是生成單個脫氧核苷酸。

小結:②和③的作用都是破壞DNA分子中的磷酸二酯鍵。不同點是前者“有選擇”地“部分破壞”,而后者是“無選擇”地“全破壞”。

3.④DNA連接酶、⑤DNA聚合酶和⑥Taq酶

④能催化末端堿基互補配對的不同DNA分子片段連接起來,即“縫合”脫氧核糖和磷酸交替連接而構成的DNA骨架上的“缺口”(磷酸二酯鍵)。在基因工程中被稱為“分子縫合針”,構建基因表達載體時,目的基因與運載體結合要通過此酶進行連接。根據酶的來源不同,可以將DNA連接酶分為E.coliDNA連接酶和T4DNA連接酶。在DNA分子復制的過程中也會用到DNA連接酶,只是這一點在中學教材中沒有涉及。

⑤通過連接單個脫氧核苷酸而形成DNA分子中的磷酸二酯鍵。DNA分子復制時,在DNA聚合酶的作用下,利用細胞中游離的四種脫氧核苷酸為原料,以解開的每一段母鏈為模板,按照堿基互補配對原則,各自合成與母鏈互補的一段子鏈,其中子鏈中脫氧核苷酸之間的磷酸二酯鍵就是在DNA聚合酶的作用下形成的。

⑥應用在DNA聚合酶鏈式反應(PCR)中。此酶是從嗜熱菌Thermus Aquaticus(Taq)中分離出的具有熱穩定性的DNA聚合酶,在體外擴增DNA分子時,作用與DNA聚合酶基本上是一樣的,可以說是一種耐熱性的DNA聚合酶。

小結:④⑤⑥三種酶的作用都能合成DNA分子中的磷酸二酯鍵,不同點在于④“粘合”的是“DNA分子片段”,⑤和⑥“粘合”的“單個脫氧核苷酸”。⑤和⑥的不同又在發揮活性時對溫度的要求不同,所以應用場所也不同。

由此可見,②的產物可由④連接,③的產物可由⑤⑥連接成DNA分子。

4.⑦RNA聚合酶

⑦是在以DNA分子的一條鏈為模板合成RNA(即轉錄)過程中用到的一種酶,在RNA聚合酶的作用下,細胞中四種游離的核糖核苷酸與供轉錄用的DNA的一條鏈上的堿基互補配對,以磷酸二酯鍵相連接,形成一個mRNA分子。

小結:⑦的作用與RNA的形成有關,實質上是合成RNA中的磷酸二酯鍵。

四、用實例強化理解

下圖為DNA分子在不同酶的作用下所發生的變化模式圖,圖中依次表示限制性核酸內切酶、DNA聚合酶、DNA連接酶、解旋酶作用的正確順序是( )

A.①②③④ B.①②④③ C.①④②③ D.①④③②

【答案】C

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