南農大完成植物重復基因數據庫

近日，南京農業大學張紹鈴教授團隊系統鑒定了梨等141種植物基因組的不同類型重復基因，構建了植物重復基因數據庫，揭示了重復基因進化的普遍規律。相關成果近日在線發表于國際知名學術期刊《基因組生物學》。

重復基因即基因復制產生的兩個同源基因，植物通過復制基因，能夠豐富自身基因庫，抵御外界復雜多變的環境，還能增加進化變異的機會，實現物種分化和多樣性。隨著近年來測序技術的升級，測序成本大幅降低，越來越多的植物基因組被破譯，目前已完成全基因組測序的植物超過200種，包括單細胞綠藻、苔蘚類植物、蕨類植物、裸子植物以及被子植物，但對于鑒定不同種類植物的重復基因，仍缺乏一個通用方法。

南農大張紹鈴教授團隊此前系統鑒定了梨基因組中的重復基因，以此為基礎，團隊開發了一個具有普遍適用性的生物信息學方法，并深入分析了141種植物的基因組。團隊利用141種植物基因組中包含的所有蛋白序列，構建了大規模的植物直系同源基因家族，包含大豆、水稻、小麥、玉米等大宗糧食作物，以及梨、桃、葡萄、蔬菜、花卉等園藝作物，今后將陸續拓展其他植物類別。

（新華網）