靳亞軍,石雨鷺,邳瑞雪,王 荃,孔曉聰,梁閃閃,張泗舉,欒維江
(1.天津師范大學生命科學學院,天津 300387;2.天津師范大學天津市動植物抗性重點實驗室,天津 300387)
水稻從營養生長向生殖生長轉變,即水稻的成花轉變對其開花結實至關重要,直接決定水稻的產量.水稻的開花結實受到內源基因和外界環境的共同作用,溫度和光照是決定開花的2個外界環境因子.光照促使植物形態結構的建成,并且促進植物開花[1-2].水稻是典型的短日照、長夜植物,延長黑暗時間會加速水稻的抽穗開花.當植物葉片接收到光信號時,會產生成花素物質,通過莖韌皮部運輸到莖頂端分生組織,從而誘導植物開花[3].研究表明,水稻的成花素基因Heading date 3a(Hd3a)在葉片接受光信號時表達上調,移動到莖頂端分生組織,首先進入莖頂端分生組織細胞質中,與成花素受體14-3-3蛋白相互作用形成Hd3a-14-3-3復合物,該復合物進一步轉移至細胞核中,與含有bZIP結構域的轉錄因子OsFD1相互作用形成成花素三元復合物,調控下游成花特性基因OsMADS14 and OsMADS15的表達,從而促進開花[4].Hd3a是擬南芥Flowering Locus T(FT)的同源基因,可編碼成花素,白天表達量較高,黎明時表達量達到最高峰.OsMADS14和OsMADS15是擬南芥APETALA1(AP1)的同源基因,對花器官的正常發育至關重要[4-5].
在水稻開花時間的調控上,短日照條件下(Short day,SD),Heading date 1(Hd1)正向調控成花素Hd3a的表達,從而促進水稻開花;長日照條件下(Long day,LD),Hd1抑制Hd3a的表達,從而抑制水稻開花.因此成花素上游調節因子Hd1具有雙重功能[6],在SD和LD條件下功能相反.另一條關鍵的調控通路是水稻中獨有的,Early heading date 1(Ehd1)編碼B型應答效應因子,受藍光誘導表達,SD條件下能夠促進Hd3a的表達,從而促進水稻開花.LD條件下,由于上游基因Grain number、Plantheight和Headingdate7(Ghd7)抑制Ehd1的表達,從而下調Hd3a的表達,最終抑制水稻開花,延遲抽穗[7].
水稻基因組中,預測的成花轉變基因至少有19個,它們屬于磷脂酰乙醇胺結合蛋白基因家族(Phosphatidyl ethanolamine-bindingprotein,PEBP),該基因家族又分為Terminalflower1(TFL1)-like、Floweringlocus T(FT)-like、和Mother of FT and TFL1(MFT)-like 3個亞家族[8].在預測的19個成花轉變基因中,除Hd3a、RFT1、RCN1和RCN2的功能已知外[7-10],其他基因的功能尚不明確.為了探究成花轉變基因OsDTH11的功能,本研究利用反向遺傳學方法,構建OsDTH11的過表達載體并轉化水稻,獲得了過表達轉基因植株.通過對轉基因植株和野生型植株表型的比較,揭示過量表達OsDTH11對水稻開花的影響.
粳稻品種中花11(Oryza sativaL.ssp.Japonicacv.Zhonghua11)及其轉基因植株均種植于天津師范大學試驗田,田間常規管理.
儀器:梯度PCR儀(9902)和實時定量PCR儀(7500),美國Applied Biosystem公司;水平電泳槽(BG-power-600),北京百晶生物技術有限公司;凝膠成像儀(Molecular Imager?Gel DocTM XR),美國BIO-RAD公司.
試劑:G418、卡那霉素、利福平、羧芐青霉素、頭孢霉素等抗生素,上海生物工程有限公司;質粒小提取試劑盒(D6943-01),天根生物科技(北京)有限公司;PCR凝膠純化試劑盒,美國OMEGA Bio-Tek公司;普通DNA聚合酶、高保真DNA聚合酶、T4 DNA連接酶、DNA Marker、Real-time PCR相關試劑及反轉錄酶,南京諾維贊生物科技有限公司.所有引物均由中美泰和生物技術有限公司與通用生物系統(安徽)有限公司合成,測序由中美泰和生物技術有限公司完成.
從短日照條件處理60 d的水稻中提取葉片總RNA,用M-MLV反轉錄酶反轉錄獲得cDNA作為擴增OsDTH11目的基因的模板.設計特異性引物進行PCR擴增,獲得OsDTH11的全長ORF(開放閱讀框)片段.PCR擴增程序為:95℃,1 min;95℃30 s,58℃30 s,72℃30 s,運行35個循環;72℃,7 min.對產物進行凝膠電泳,切膠回收,純化PCR擴增的目的片段.用相應的限制性內切酶SmaI和PstI對目的片段和pCAMBIA2300載體分別進行酶切,純化回收.將目的片段連入pCAMBIA2300載體,構建成重組載體,并對其進行測序確認.
對目的基因的組織特異性表達進行分析.田間收集野生型植株的不同組織器官,包括分生組織、葉、根和穗,提取總RNA,反轉錄獲得cDNA.利用OsDTH11基因的特異性引物進行半定量PCR擴增,分析目的基因在不同組織器官中的特異性表達.
取移栽后34 d的對照植株和轉基因植株葉片,采用Trizol試劑提取葉片總RNA,用M-MLV反轉錄酶進行反轉錄得到cDNA作為半定量PCR擴增的模板,檢測目的基因OsDTH11的表達.擴增程序為:95℃,1 min;95℃30 s,58℃30 s,72℃30 s,運行30個循環;72℃,7 min.以OsActin基因作為內參進行相對定量分析.
使用去基因組酶(Primer ScriptTMRT reagent kit with gRNA Eraser)反轉錄對照植株和轉基因植株各個株系的總RNA,獲得的cDNA作為模板,用OsDTH11特異性檢測引物進行實時定量PCR擴增.反應程序為:95℃1min;95℃20 s,58℃1min,運行40個循環;95℃15 s;60℃60 s;95℃15 s.按照Livak等[11]的2-ΔΔCt方法進行數據處理,以OsActin基因作為內參進行定量分析.
采用碘染法進行花粉育性鑒定.從開花前1~2 d或即將開花的過表達植株中收集所調查的穎花,從不同獨立株系主莖穗的上、中、下部共取得20~30朵穎花,分別固定于75%(體積分數)乙醇溶液中,4℃冰箱保存.鏡檢時,用解剖針將同一朵穎花的6枚花藥取出放置于載玻片上,滴1滴1%(質量分數)的I2-KI,用鑷子將花藥夾碎,釋放出成熟花粉,小心去除花藥壁殘渣,蓋上蓋玻片置于光學顯微鏡下觀察,根據花粉染色狀況判斷花粉育性.可育花粉呈圓形,大而飽滿,著色深且均勻.不育花粉包括染敗型、圓敗型和典敗型3類:染敗型花粉小,染色不正常,有不同程度著色;圓敗型花粉仍為圓形,部分染色;典敗型花粉形狀皺縮不規則或呈圓形,無內含物,對I2-KI無染色反應.每個穎花觀察3個視野,保證花粉粒數量超過200粒,計算花粉育性.花粉育性(%)=可育花粉粒數/總花粉粒數×100.最終花粉育性為3個視野育性的平均值.
為了研究OsDTH11的功能,首先構建其過表達載體,利用2個串聯的35S強啟動子驅動目的基因的表達.過表達載體的結構如圖1(a)所示,LB為T-DNA左邊界,NPTⅡ為新霉素磷酸轉移酶抗性的篩選標記,p2×35S為2個串聯的花椰菜花葉病毒(CaMV)35S啟動子,RB為T-DNA的右邊界.提取短日照條件下水稻葉片的總RNA,經反轉錄獲得cDNA,用OsDTH11特異性引物通過RT-PCR擴增獲得目的基因片段,經瓊脂糖凝膠電泳檢測,證實獲得的片段大小與預期設計相符,如圖1(b)所示.將目的片段和pCAMBIA2300空載體連接,轉化后獲得重組載體,取重組質粒進行酶切鑒定,可以切出目的條帶,如圖1(c)所示,說明目的片段已成功連入空載體中.進一步對重組質粒進行測序分析,結果表明其序列與參考序列一致,沒有突變,可以進行后續轉基因實驗.

圖1 過表達載體的構建Fig.1 Construction of overexpression vector
為了探究OsDTH11基因的功能,分別提取水稻分生組織、葉、根和穗的總RNA,反轉錄合成cDNA,利用半定量PCR分析目的基因在水稻不同器官中的表達情況,結果如圖2所示.由圖2可以看出,OsDTH11在各個組織中均有表達,在穗中表達量很高,在分生組織、葉片和根中表達較弱.這一結果暗示OsDTH11可能在水稻穗的生長發育過程中具有重要作用.

圖2 OsDTH11基因的組織特異性表達分析Fig.2 Tissue-specific expression of OsDTH11 gene
分析OsDTH11基因在野生型水稻植株中的表達情況,結果表明,該基因在水稻中的表達豐度很低.由于OsDTH11基因屬于PEBP基因家族,在水稻基因組中成員較多,單個目的基因的敲除或功能缺失突變體較難獲得預期表型,因此本研究采用過量表達方法對OsDTH11基因的功能進行探索.通過農桿菌介導的遺傳轉化,經愈傷組織誘導、繼代、農桿菌侵染、抗性愈傷的篩選、分化、生根過程,最終獲得15個獨立株系的113株T0代過表達轉基因植株.轉基因植株移栽大田生長健壯后,收集葉片提取總RNA進行表達分析.分別從每個株系隨機抽取3~5個單株進行表達分析,以空載體轉基因植株作為對照,結果如圖3所示.

圖3 OsDTH 11過表達轉基因植株的表達分析Fig.3 Expression analysis of transgenic plants overexpressing OsDTH11
從圖3(a)可以看出,和空載體轉基因對照植株(CK1和CK2)相比,46株過表達轉基因植株中,有45株有不同程度的過量表達.其中,L1、L4、L5、L6、L7、L8、L9、L11、L12和L13株系過表達程度很強,L2、L3、L10、L14及L15株系過表達程度較弱,但均高于空載體轉基因對照植株.為了更精確地分析轉基因植株中OsDTH11的表達,根據半定量RT-PCR結果,選取了部分有代表性的轉基因株系進行實時定量PCR分析,結果如圖3(b)所示.與對照植株相比,L1和L4的過表達程度是對照植株的上萬倍,L5、L7過表達程度是對照植株的6 000倍;L2的過表達程度較弱,是對照植株的356倍.這些結果與半定量PCR結果相吻合,說明過表達載體正常工作,起到了過量表達的作用.
對獲得的轉基因植株表型進行田間觀察,發現同導入pCAMBIA2300空載體的轉基因對照植株相比,OsDTH11過表達轉基因植株結實率降低,空癟粒數較多,如圖4(a)和圖4(b)所示.15個獨立株系中,有2個株系表現為不同程度的穗發育不良,小花出現退化現象,如圖4(c)和圖4(d)所示.對照植株花粉染色正常,如圖4(e)所示.在不育花粉中,典敗型花粉居多,圓敗型花粉次之,染敗型花粉最少,如圖4(f)所示.調查花粉育性發現,對照植株花粉幾乎全部可育,而過表達轉基因植株的花粉育性明顯下降,其中L5的育性為98%,L6的育性為51%,L12的育性為58%,如圖4(g)所示.

圖4 OsDTH11過表達轉基因植株的表型Fig.4 Phenotype of transgenic p lants overexpressing OsDTH11
田間測量統計13個獨立過表達轉基因株系的抽穗期(Heading date)、株高(Plant height)、穗長(Panicle length)和結實率(Seed setting rate),結果如圖5所示.同空載體轉基因對照植株相比,13個獨立過表達株系的結實率均有不同程度的降低,L1和L7的結實率最低,分別為43%和29%,如圖5(a)所示;多數株系的抽穗期與對照植株相近,如圖5(b)所示;大部分轉基因株系的株高與對照植株相比沒有明顯差異,但L7的株高明顯變矮,如圖5(c)所示;除L10株系的穗長大于對照植株外,其他過表達轉基因株系的穗長均明顯小于對照植株,如圖5(d)所示.這些結果表明,過量表達OsDTH11導致水稻小穗及花發育不良,造成穗長變短,結實率下降,但并不影響水稻的抽穗開花時間.

圖5 OsDTH 11過表達轉基因植株農藝性狀分析Fig.5 Agronom ic traits of transgenic plants overexpressing OsDTH11
水稻成花基因家族中,Hd3a和RFT1參與不同的光周期調控通路,過量表達這2個基因都會加速水稻的抽穗開花時間.不同的是,Hd3aRNAi轉基因植株在短日照條件下推遲開花,而RFT1RNAi轉基因植株在長日照條件下推遲開花,Hd3a和RFT1同時進行RNAi干擾后植株表現為不開花.這些結果表明,Hd3a和RFT1與水稻抽穗期有關,二者會調節水稻的抽穗開花時間[9-10].同一家族的OsDTH11在過量表達后,抽穗期與對照植株沒有明顯差別,但結實率明顯降低,穗及花的發育受到了影響.因此推測OsDTH11基因參與了生殖細胞的發育過程:一方面,它可能與生殖細胞的形成和育性有關:另一方面,可能和授粉后胚的發育有關,過表達會產生不正常的胚結構,導致癟粒和空粒較多.
組織特異性表達分析結果表明,OsDTH11基因在幼穗中高表達,但在葉片中表達較低,這與開花時間基因的表達有所不同.與開花時間相關的基因在葉片中有較高的表達,因為這些基因首先要在葉片中感受光的刺激,識別光暗變化,這也說明OsDTH11可能與開花時間關系不大.此外,本研究對OsDTH11的啟動子序列進行分析,發現其啟動子序列中含有花粉特異表達元件和花粉調控元件,推測OsDTH11可能與花粉的發育相關.水稻雄配子體(花藥)的發育過程可分為2個階段:第一個階段是花藥的形態建成,包括孢原細胞經過造孢細胞發育為孢母細胞(花粉母細胞)的過程和花粉母細胞的減數分裂過程;第二個階段是花粉的形成,包括小孢子的有絲分裂、花粉粒的成熟與釋放等[12].在這些發育進程中,有許多基因參與調控:GEM1編碼微管結合蛋白MOR1,在細胞質中通過結合微管參與成膜體的形成[13];TDR編碼1個具有螺旋-環-螺旋結構的轉錄因子,主要在絨氈層細胞中表達[14];RA68編碼一個N末端有22個氨基酸殘基和幾個翻譯后修飾位點而C末端序列相對保守的蛋白,它參與減數分裂后的小孢子的發育[15].本研究結果表明,過量表達OsDTH11降低了花粉育性,因此,OsDTH11可能與這些基因間存在直接或間接的相互作用,從而控制花粉的育性,具體和哪個基因相互作用,還有待進一步實驗驗證.
不正常的胚胎發育也會導致籽粒發育不良,降低結實率.本課題組后期將對過表達轉基因植株不同時間段發育的胚進行縱切,觀察其是否與野生型有差異.同時,為了更明確揭示OsDTH11基因的功能,將構建其CRISPR基因編輯載體,獲得OsDTH11-CRISPR編輯突變體,觀察OsDTH11被敲除后的表型特征及功能.