曾青華
摘 要:為探討寧鄉豬遺傳多樣性,本研究以外來豬種大白豬為對照,研究了寧鄉豬GLP2R基因的多態性。通過限制性片段長度多態性聚合酶鏈式反應(Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism,PCR-RFLP)分析檢測了該基因A/G位點。結果表明,寧鄉豬全部為GG型,大圍子豬和黔邵花豬的優勢等位基因都為G;而外來品種(大白豬)的優勢等位基因為A,其基因頻率為0.6433,中外品種的差異較大。本研究為寧鄉豬的保種和選育提供了有益的資料。
關鍵詞:豬;GLP2R基因;遺傳多態性
寧鄉豬是我國著名的四大地方豬品種之一,原產于湖南省寧鄉縣的流沙河及草沖一帶,其特征是“絲頸葫蘆肚,耳薄嘴筒齊,稀毛現薄皮,魚尾后腳直,奶子一斬齊,四腳要撒蹄”、“烏云蓋雪銀頸圈”。其體型中等,體質疏松細致,體軀呈圓筒狀,毛色為黑白花,四肢、肋腹及頸下部為白色,頭和臀部呈黑色。GLP2R屬于G蛋白偶聯受體家族[1]。GLP2R為GLP2的特異性受體,GLP2與其受體結合從而發揮作 用[2-3]。Luo等[4]認為GLP2R基因與豬肌內脂肪含量有關。
本研究首次檢測了寧鄉豬GLP2R基因的多態性,旨在為揭示豬GLP2R基因的分子遺傳機制奠定基礎,并為寧鄉豬保種和選育提供理論依據。
1 材料與方法
1.1 樣品采集
以4個地方豬種(大圍子豬、寧鄉豬、沙子嶺豬、黔邵花豬)和1個外來豬種(大白豬)為試驗材料,共計523頭,分別采取豬耳組織樣品,于-20 ℃保存。
1.2 基因組DNA提取
基因組DNA提取按常規酚-氯仿法進行。
1.3 引物合成及聚合酶鏈反應擴增
用Primer Premier 5.0軟件設計引物,其中正向引物:5'-ATG AGG CCG GAA CGG AGC CG-3';反向引物:5'-CTA ATC TCA CTC TCC TCG AG-3',由華大基因公司合成。聚合酶鏈式反應(Polymerase Chain Reaction,PCR)體系:2×PCR Master·Mix 10 μL,雙蒸水8.0 μL,引物1.0 μL,基因組DNA 1.0 μL。PCR擴增程序:94 ℃預變性5 min;94 ℃變性30 s;55 ℃復性30 s;72 ℃延伸30 s,共35個循環;72 ℃延伸 5 min;4℃保存。
2 結果與分析
2.1 基因型分型
在擴增的746 bp的片段中,709 bp處A/G突變位點導致了限制性內切酶BstE Ⅱ的變化。GLP2R基因的A/G位點存在3種基因型,分別為GG基因型(506 bp、240 bp)、AG基因型(746 bp、506 bp、240 bp)和AA基因型 (746 bp)(圖1)。
2.2 豬GLP2R基因的多態性分析
GLP2R基因A/G突變位點PCR-RFLP-BstEⅡ的基因和基因型頻率見表1。大圍子豬和黔邵花豬這兩個地方品種的優勢等位基因都為G;而外來品種(大白豬)的優勢等位基因為A,基因頻率為0.6433。從基因型分布頻率看,GG型占優勢,AA型個體較少,只在沙子嶺豬中發現1個,在黔邵花豬中發現4個,在桃源黑豬中檢出15個;但大白豬中GG型較少(41個),而AA型和AG型分別有125個和127個。
3 討論與結論
寧鄉豬GLP2R基因A/G位點基因型全部為GG型,可能的原因是該品種經過長期高度近交的人工選育,此位點已全部純合,這也反映了該品種比較純。大圍子豬在該位點也是全部為GG型。沙子嶺豬和黔邵花豬G等位基因為優勢等位基因,而在外來品種(大白豬)中A等位基因為優勢等位基因,這也反映了中外品種的遺傳背景差異大。在該位點上的差異有望作為品種標記的一種手段,應用于標記輔助選擇。□□
參考文獻:(4篇,略)