趙 晶 李旭彤 梁學忠 王志城 崔 靜 陳 斌 吳立強 王省芬 張桂寅 馬峙英 張 艷
陸地棉漆酶基因家族鑒定及在黃萎病菌脅迫下的表達分析*
趙 晶**李旭彤**梁學忠 王志城 崔 靜 陳 斌 吳立強 王省芬 張桂寅 馬峙英 張 艷*
河北農業大學 / 華北作物種質資源研究與利用重點實驗室 / 河北省棉花產業協同創新中心, 河北保定 071001
黃萎病是降低棉花產量和品質較為嚴重的維管束病害。棉花在抵抗病原菌的過程中, 抗病基因起著尤為重要的作用。漆酶是一種多功能氧化酶, 在植物木質素合成和提高植株抗逆性等方面發揮著重要作用。高質量版本的基因組是提升基因家族分析準確性的必要條件。本研究以目前最新的陸地棉TM-1高質量版本基因組為參考, 通過生物信息學分析鑒定了陸地棉基因組中的()基因家族, 并對其進行了理化性質、基因結構、染色體定位以及在黃萎病脅迫下的表達模式分析。結果表明, 陸地棉TM-1基因組中共包含83個家族成員, 分布在24條染色體上, 所有GhirLAC蛋白均定位在胞外, 且具有相同/相似的保守基序。系統發育樹分析顯示,基因家族成員可分為7個亞組。結合黃萎病脅迫下棉花轉錄組數據, 將基因家族各成員的表達分為3種模式, 其中第1類和第2類基因在黃萎病菌脅迫下分別呈現有規律的表達量升高和降低, 推測這些基因在棉花抗黃萎病反應中發揮重要功能。熒光定量PCR結果表明,()、()和() 3個候選基因均受黃萎病菌誘導表達, 其表達趨勢與轉錄組數據相吻合。……