藜麥GRF轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定及表達(dá)分析

時(shí)丕彪 何 冰 費(fèi)月躍 王 軍 王偉義 魏福友 呂遠(yuǎn)大 顧閩峰,*

藜麥GRF轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定及表達(dá)分析

時(shí)丕彪1何 冰2費(fèi)月躍1王 軍1王偉義1魏福友1呂遠(yuǎn)大2顧閩峰1,*

1鹽城市新洋農(nóng)業(yè)試驗(yàn)站, 江蘇鹽城 224049;2江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院種質(zhì)資源與生物技術(shù)研究所, 江蘇南京 210014

生長調(diào)控因子(growth-regulating factor, GRF)是植物特有的一類轉(zhuǎn)錄因子, 對植物的生長發(fā)育起重要的調(diào)控作用。藜麥?zhǔn)且环N單體植物即可滿足人體基本營養(yǎng)需求的食物, 也是未來最具潛力的農(nóng)作物之一。但是關(guān)于藜麥GRF基因家族的研究至今尚缺乏報(bào)道。因此, 本研究利用生物信息學(xué)方法, 對藜麥GRF基因進(jìn)行全基因組鑒定, 并對其理化性質(zhì)、基因結(jié)構(gòu)、保守結(jié)構(gòu)域、系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系及組織表達(dá)進(jìn)行分析。結(jié)果表明, 藜麥中共有18個(gè)GRF轉(zhuǎn)錄因子, 蛋白長度77~621 aa, 分子量8.81~67.38 kD, 等電點(diǎn)5.23~9.37; 每個(gè)成員含有1~4個(gè)內(nèi)含子及2~5個(gè)外顯子, 這些GRF蛋白都具有由31~35個(gè)氨基酸組成的QLQ保守結(jié)構(gòu)域或由25~43個(gè)氨基酸組成的WRC保守結(jié)構(gòu)域。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明, 藜麥與擬南芥的GRF轉(zhuǎn)錄因子親緣關(guān)系比水稻更近。表達(dá)圖譜顯示, 藜麥GRF基因具有明顯的組織表達(dá)特異性, 總體在種子中的表達(dá)量較高, 其次是在花序和根中, 在其他組織中的表達(dá)量相對較低。

藜麥; GRF轉(zhuǎn)錄因子; 進(jìn)化分析; 表達(dá)分析

轉(zhuǎn)錄因子是植物中最重要的一類調(diào)節(jié)基因, 參與植物生長、發(fā)育、代謝、繁殖、分化等多種生物學(xué)過程[1-3]。目前在植物中已發(fā)現(xiàn)60多個(gè)轉(zhuǎn)錄因子家族[4], 其中生長調(diào)控因子(growth-regulating factor, GRF)是植物特有的一類蛋白, 對植物的生長發(fā)育起重要的調(diào)控作用[5-7]。……