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環(huán)狀RNA用于肝細胞癌診斷的Meta分析

2019-12-02 01:13:58田忠昌褚志杰楊天保劉偉峰楊延輝孫君軍
醫(yī)學研究雜志 2019年10期
關(guān)鍵詞:分析檢測研究

田忠昌 褚志杰 楊天保 劉偉峰 楊延輝 孫君軍

肝癌是最常見的消化系統(tǒng)惡性腫瘤之一,病死率位居所有腫瘤的第2位[1]。國內(nèi)最新癌癥統(tǒng)計顯示,肝癌在男性中的發(fā)生率居第3位、病死率居第2位[2]。肝細胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)是肝癌最常見的病理類型,占肝癌發(fā)病人群的80%以上。早期診治仍然是提高HCC患者生存預(yù)后的重要途徑。然而,因臨床中缺乏肝癌早期診斷的標志物,大部分HCC患者確診時已處于中晚期,預(yù)后極差[3]。因此,臨床中亟待開發(fā)新型的腫瘤標志物用于HCC的早期診斷。環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)是一類來源于內(nèi)含子和(或)外顯子,通過反向剪接產(chǎn)生、序列保守、具有穩(wěn)定結(jié)構(gòu)的特殊RNA[4,5]。近年來越來越多的研究證實,circRNA在HCC的發(fā)生、進展中發(fā)揮重要的生物學功能,提示這些circRNA分子有望成為HCC早期診斷的新型腫瘤標志物[6~14]。本研究擬通過定量的Meta分析,系統(tǒng)性評價circRNA對HCC的綜合診斷效能。

資料與方法

1.資料檢索策略:檢索PubMed、EMBASE、知網(wǎng)(CNKI)、萬方、維普等在線期刊數(shù)據(jù)庫,檢索時間為建庫至2018年12月的中英文文獻。檢索主題詞為 “肝癌”、“肝細胞癌”、 “環(huán)狀RNA”、“環(huán)形RNA”、“診斷”、“circRNA”、“circular RNA”、“hepatocellular carcinoma”、“hepatocellular cancer”、“l(fā)iver caner”、“diagnosis”等,以單個或組合形式進行檢索。

2.納入與排除標準:①關(guān)于circRNA和HCC的相關(guān)研究,研究對象為Ⅰ~Ⅳ期的肝細胞癌初診患者,需經(jīng)病理確診;②研究對病例、對照組的類型界定明確,包括具體例數(shù),且病例數(shù)不低于20例;③研究的數(shù)據(jù)可用于直接或間接構(gòu)建2×2診斷四格表。排除標準:①提供的數(shù)據(jù)不能構(gòu)建2×2診斷四格表,且聯(lián)系作者獲取原始數(shù)據(jù)失敗;②評價后的低質(zhì)量文獻;③非臨床診斷研究,如基礎(chǔ)研究、綜述、病例報告、信件、評論、會議摘要、重復(fù)發(fā)表的論文等。

3.數(shù)據(jù)提取:兩位作者獨立提取文獻數(shù)據(jù)資料,包括論文標題、第一作者姓名、發(fā)表年份、研究人群、對照組和病例組樣本例數(shù)、樣本類型、circRNA 類型、Cut-off值、內(nèi)參基因類型、檢測方法。提取的數(shù)據(jù)進行相互核對,不一致之處經(jīng)討論解決。

4.文獻質(zhì)量評價:采用QUADAS-2量表工具評價納入文獻質(zhì)量[15]。分別從“病例選擇”、“待評價試驗”、“金標準”和“病例流程和進展”等方面進行評價。根據(jù)每部分納入的相關(guān)性問題,對應(yīng)偏倚風險等級判定為 “低(評分1分)”,“高(評分0分)”或“不確定(評分0分)”。

5.統(tǒng)計學方法:通過Meta-Disc 1.4、Stata 12.0軟件對數(shù)據(jù)進行分析。合并的診斷相關(guān)統(tǒng)計量包括敏感度、特異性、陽性似然比(PLR)、陰性似然比(NLR),診斷比值比(DOR)、曲線下面積(AUC)曲線及對應(yīng)的95%CI。采用Spearman相關(guān)系數(shù)評估閾值效應(yīng)引起的異質(zhì)性,同時經(jīng)Cochran′Q和I2檢驗評價非閾值效應(yīng)來源的異質(zhì)性大小,P<0.05或I2>50%提示研究間有顯著異質(zhì)性。研究間存在顯著異質(zhì)性時,采用隨機效應(yīng)模型合并統(tǒng)計量,否則采用固定效應(yīng)模型。通過亞組分析和敏感度分析引起異質(zhì)性的原因。通過Deek′s定量漏斗圖評估發(fā)表間偏倚,以P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。

結(jié) 果

1.文獻納入:文獻的納入與排除流程如圖1所示,根據(jù)檢索策略剔除重復(fù)文獻后,共檢索得到相關(guān)文獻237篇。通過閱讀標題和摘要排除205篇,剩余32篇文獻進行全文評估,進一步剔除不符合文獻22篇(包括綜述5篇,預(yù)后相關(guān)文獻10篇及其他非診斷相關(guān)文獻7篇),最終納入關(guān)于circRNA與HCC的診斷性文獻共10篇。

圖1 文獻的納入與排除流程圖

2. 納入文獻資料特點和質(zhì)量評估:納入文獻的特征如表1所示。本研究共納入HCC病例858例,非癌對照組885例,包含慢性肝炎/肝硬化164例,健康對照88例,匹配癌旁對照412例。所有HCC患者均經(jīng)過組織病理學檢查確診。所有circRNA分子均經(jīng)qRT-PCR方法檢測,以GAPDH或β-actin 為參照基因。HCC中表達上調(diào)的circRNA包括hsa_circ_0091582、hsa_circ_0128298、hsa_circ_000224、hsa_circ_0005075、hsa_circ_16245-1和hsa_circ_0091579等,表達下調(diào)的包括hsa_circ_0003570、hsa_circ_0004018、hsa_circ_001565、hsa_circ_000520、Hsa_circ_0001649、circZKSCAN1和hsa_circ_0001445等。采用QUADAS-2條目對納入文獻進行質(zhì)量評估,納入的10篇文獻評分均≥4分,提示納入研究的質(zhì)量相對較高。納入研究的偏移比例分布情況詳見圖2。

3.異質(zhì)性分析:分別通過Spearman相關(guān)系數(shù)、Cochran-Q值和I2檢驗評估研究間異質(zhì)性。整體合并效應(yīng)量結(jié)果顯示,Spearman相關(guān)系數(shù)=-0.084,P=0.741, 表明研究間不存在閾值效應(yīng)來源的異質(zhì)性;Cochran′Q=81.24,P=0.000,I2=79.1%。

表1 納入診斷文獻的資料特征

圖2 QUADAS-2評價納入文獻的偏移分布

4.診斷性能:如圖3所示,circRNA用于診斷HCC的合并敏感度、特異性、PLR、NLR和DOR分別為78%(95%CI:76%~80%)、78%(95%CI:75%~80%)、3.60 (95%CI:2.73~4.75)、0.24(95%CI:0.17~0.34)和17.29(95%CI:10.28~29.07),受試者工作特征曲線(SROC)曲線下面積(AUC)為0.877。

圖3 合并的受試者工作特征曲線(SROC)

5.亞組分析:本研究將不同標本類型、對照類型、circRNA表達狀態(tài)、內(nèi)參基因類型和研究人群分別做亞組分析。表2結(jié)果顯示,以血清為檢測基質(zhì)的circRNA檢測診斷HCC的效能優(yōu)于血漿和組織(敏感度:89% vs 79% vs 74%;特異性:88% vs 65% vs 79%;AUC:0.929 vs 0.724 vs 0.859);circRNA在區(qū)分HCC和健康對照時效能最高(AUC=0.929),其次為區(qū)分HCC和癌旁對照(AUC=0.824),circRNA用于區(qū)分HCC和肝炎/肝硬化時效能最低(AUC=0.730)。基于circRNA表達狀態(tài)結(jié)果顯示,表達上調(diào)的circRNA表達譜診斷HCC的能力高于下調(diào)的表達譜(AUC:0.863 vs 0.836);在人群分析中,circRNA診斷HCC在非洲人群中的合并AUC為0.929,敏感度為89%,特異性為88%,明顯高于亞洲人群。此外,基于GAPDH為內(nèi)參照的circRNA診斷HCC的效能高于β-actin(AUC:0.859 vs 0.762)。

表2 cirRNA用于HCC診斷時基于不同變量的亞組分析結(jié)果

6.敏感度分析:未檢測到研究間存在超過上限或下限的離群數(shù)據(jù),提示研究間的同質(zhì)性較高,合并結(jié)果較可靠(圖4)。

圖4 敏感度分析顯示研究間的同質(zhì)性

7.發(fā)表偏倚:本研究經(jīng)Deek′s定量漏斗圖評估納入文獻的潛在發(fā)表偏倚,P=0.286,說明研究間不存在發(fā)表偏倚(圖5)。

圖5 Deek′s定量漏斗圖檢測研究發(fā)表偏倚

討 論

肝細胞癌 (hepatocellular carcinoma,HCC)已成為引起死亡的最常見惡性消化系統(tǒng)腫瘤之一[1]。我國是HCC的高發(fā)國家,且其發(fā)生率呈一定的上升趨勢[2]。HCC具有發(fā)展迅速、轉(zhuǎn)移快、預(yù)后差的特點,因此早期診斷治療是提高患者預(yù)后的重要手段之一[3]。近年來,一些研究證實環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)在HCC的診斷中具有潛在的應(yīng)用價值,但因研究間的樣本量、人群等差異,其診斷價值尚存爭議。本研究系統(tǒng)性評估了circRNA對HCC的綜合診斷效能,為circRNA更好地用于HCC臨床診斷提供循證醫(yī)學證據(jù)。

本研究對目前已經(jīng)報道的circRNA分子進行Meta分析。共納入診斷性研究共10篇,包含HCC病例858例,非癌對照組885例。通過系統(tǒng)性分析,對HCC中表達上調(diào)的circRNA包括hsa_circ_0091582、hsa_circ_0128298、hsa_circ_000224、hsa_circ_0005075、hsa_circ_16245-1和hsa_circ_0091579等,以及表達下調(diào)的circRNA分析包括hsa_circ_0003570、hsa_circ_0004018、hsa_circ_001565、hsa_circ_000520、Hsa_circ_0001649、circZKSCAN1和hsa_circ_0001445等進行統(tǒng)計量合并,得到總體circRNA表達譜的效應(yīng)模型。結(jié)果顯示,circRNA用于診斷HCC的合并敏感度和特異性均為78%,受試者工作特征曲線(SROC)曲線下面積(AUC)為0.877,提示整體的診斷效能較高。此外,陽性似然比PLR為3.60提示HCC患者中circRNA表達異常改變的概率是對照組的3.6倍;陰性似然比為0.24,提示假陰性的概率較低。診斷的比值比(DOR)是評價一項診斷實驗檢驗效能的重要指標之一,其值越大,提示診斷的診斷效能越高,當DOR的值<1時,提示一項檢測的診斷效能很低[16]。本研究中獲得的DOR為17.29,提示整體的診斷效能很高。以上數(shù)據(jù)充分顯示,異常表達的circRNA可很好應(yīng)用于HCC診斷。

本研究進一步將不同標本類型、對照類型、circRNA表達狀態(tài)、內(nèi)參基因類型和研究人群分別做亞組分析,也得到很多有意義的結(jié)果。以血清為檢測基質(zhì)的circRNA檢測AUC可達0.929,效能明顯優(yōu)于血漿和組織,提示血清可作為circRNA表達檢測的很好的樣本類型。目前已有證據(jù)證實不同樣本類型來源的游離核酸對腫瘤診斷的差異[17,18]。本研究另外發(fā)現(xiàn)circRNA在區(qū)分HCC和健康對照時效能最高(AUC=0.929),其次為區(qū)分HCC和癌旁對照(AUC=0.824),circRNA用于區(qū)分HCC和肝炎/肝硬化時效能最低(AUC=0.730)。此外,筆者發(fā)現(xiàn)表達上調(diào)的circRNA表達譜診斷HCC的能力稍高于下調(diào)的表達譜(AUC:0.863 vs 0.836)。在人群分析中,circRNA診斷HCC在非洲人群中的診斷效能明顯高于亞洲人群。此外,基于不同內(nèi)參基因的亞組分析GAPDH較β-actin可能更利于診斷性的circRNA檢測分析。

本項Meta分析仍存在一定局限性:(1)納入分析的10項研究大部分來自中國,得到的結(jié)論可能存在一定的地域人群差異性,且納入的非洲人群僅為埃及人群,缺乏一定代表性。(2)研究間存在一定的異質(zhì)性,因此本結(jié)果不能完全準確反映circRNA在HCC中的綜合診斷價值。(3)亞組分析盡管得到一些新的結(jié)論,但因分組后樣本量減小,再次合并后可能導(dǎo)致有些偏移增大。因此,還有待于開展大樣本、高質(zhì)量的研究進一步證實。

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