王 杰,盧瑩瑩,錢景榮,呂博文,李文輝
(哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院檢驗科,黑龍江哈爾濱 150081)
艱難梭菌是一種革蘭陽性、厭氧、產(chǎn)毒的芽孢桿菌,它反映了該物種在分類學(xué)上與梭狀芽孢桿菌屬其他成員之間的差異[1-2]。艱難梭菌的孢子通過糞-口途徑傳播,病原體廣泛存在于環(huán)境中。大約5%的成年人和15%~70%的嬰兒存在艱難梭菌定植,在住院患者或療養(yǎng)院居民的定植患病率高出數(shù)倍[3]。1935年研究者首次從健康新生兒的糞便中將艱難梭菌分離出來,直到20世紀(jì)70年代,它仍被認(rèn)為是一種罕見的微生物,但存在于正常的腸道微生物群中。抗菌藥物使用后,艱難梭菌在腸道疾病中有更高的發(fā)病率[4-5]。1974年有研究發(fā)現(xiàn),接受克林霉素治療的患者中有21%出現(xiàn)腹瀉,經(jīng)進(jìn)一步內(nèi)窺鏡檢查,50%的病例可見假膜[4]。在20世紀(jì)末,艱難梭菌感染(CDI)的發(fā)生率明顯增加[6]。目前,CDI已成為嚴(yán)重的醫(yī)院內(nèi)病原菌感染之一。
CDI的危險因素主要包括近一段時間使用抗菌藥物、高齡、應(yīng)用質(zhì)子泵抑制劑、長時間住院、基礎(chǔ)疾病及免疫功能受損[7]。CDI是大型醫(yī)院爆發(fā)疫情的一個常見原因,治療費用昂貴,造成醫(yī)療系統(tǒng)財政負(fù)擔(dān)沉重[8-9]。國內(nèi)對艱難梭菌引起相關(guān)疾病的報道不多,檢出的陽性率存在差異。盡早識別與檢測艱難梭菌,了解其危險因素,有針對性地防治,對減輕臨床診療和疾病負(fù)擔(dān)具有重要意義。因此,為了解哈爾濱地區(qū)CDI情況,對臨床資料進(jìn)行回顧性分析,對預(yù)防和控制CDI提供可靠依據(jù)。
1.1標(biāo)本來源 收集2018年1-12月哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院住院腹瀉患者的糞便標(biāo)本共67份,入組患者住院期間均應(yīng)用抗菌藥物治療,抗菌藥物使用時間最短1 d,最長25 d,且住院期間發(fā)生腹瀉,即24 h內(nèi)有3次或3次以上未成形大便。將糞便標(biāo)本放置在無菌容器內(nèi),-80 ℃條件下儲存待檢。
1.2儀器與試劑
1.2.1細(xì)菌培養(yǎng)及鑒定試劑 環(huán)絲氨酸、頭孢西丁、果糖瓊脂選擇培養(yǎng)基、肉湯、厭氧袋;甘油、無水乙醇、蒸餾水;0.5 mL、1.5 mL eppedorf(EP)管。
1.2.2儀器設(shè)備 系統(tǒng)顯微鏡;梅里埃質(zhì)譜儀、離心機(jī)、純水器、-80 ℃、-20 ℃冰箱、CO2恒溫培養(yǎng)箱、生物安全柜;振蕩器、高溫滅菌鍋;超凈工作臺;凝膠成像系統(tǒng)分析儀;微量移液器,核酸電泳儀。
1.3方法
1.3.1細(xì)菌培養(yǎng) 挑取約0.5 g糞便標(biāo)本,將其置于EP管,等量添加無水乙醇,混合均勻,基于3 000 r/min展開離心處理,10 min后,棄去上清,取糞便標(biāo)本沉淀物接種到環(huán)絲氨酸、頭孢西丁、果糖瓊脂培養(yǎng)基,在37 ℃條件下進(jìn)行厭氧培養(yǎng)48 h后挑選出表面粗糙、凸起、灰白色、邊緣不齊、有馬糞味的可疑菌落,革蘭染色,篩選后接種到血平板培養(yǎng)基,在37 ℃條件下厭氧培養(yǎng)、48 h進(jìn)行分離純化。使用飛行時間質(zhì)譜儀對分離純化后的細(xì)菌鑒定。
1.3.2菌株保存 分離純化得到的菌株洗脫到含20%甘油肉湯培養(yǎng)基中,-80 ℃冰箱儲存?zhèn)溆谩?/p>
1.3.3煮沸法提取DNA 艱難梭菌在血平板中進(jìn)行接種,在37 ℃條件下進(jìn)行厭氧培養(yǎng)48 h后,使用無菌棉簽洗脫到含有1 mL的蒸餾水EP管中。在沸水中處理10 min,基于12 000 r/min展開離心處理,10 min后在上清液中提取細(xì)菌DNA,并儲存于-20 ℃冰箱中。
1.3.4PCR檢測艱難梭菌毒素基因 檢測艱難梭菌毒素基因tcdA、tcdB,擴(kuò)增目的基因為1 265 bp及203 bp。檢測艱難梭菌二元毒素cdtA、cdtB,擴(kuò)增目的基因為375 bp及510 bp。PCR反應(yīng)體系25 μL,依次加入0.2 μL上下游引物;緩沖液10×2.5 μL;dNTPs 2 μL;DNA模板2 μL;Tap酶1.5 μL;無菌ddH2O 18.45 μL。所有擴(kuò)增產(chǎn)物展開1.5%瓊脂糖凝膠電泳,電泳條件為200 V、90 mA,10 min后將膠塊放置在凝膠成像系統(tǒng)觀察結(jié)果。
1.3.5多位點序列分型(MLST) 選取adk、atpA、dxr、glyA、recA、sodA、tpi7個管家基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR反應(yīng)體系50 μL,依次加入上下游引物各0.5 μL;緩沖液10×5 μL;dNTPs 4 μL;DNA模板3 μL;Tap酶0.25 μL;無菌ddH2O 36.75 μL。將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物送北京康普森生物技術(shù)有限公司進(jìn)行雙向測序。擴(kuò)增位點序列與數(shù)據(jù)庫(http://pubmlst.org/cdifficile)比對,在每個位點獲得特異的等位基因數(shù),形成對應(yīng)的等位基因譜,確定相應(yīng)的序列類型。
1.4統(tǒng)計學(xué)處理 采用SPSS22.0統(tǒng)計學(xué)軟件進(jìn)行分析。計數(shù)資料組間比較采用χ2檢驗;計量資料中正態(tài)分布采用t檢驗,非正態(tài)分布采用秩和檢驗;CDI危險因素分析采用Logistic回歸;P<0.05表示差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.1艱難梭菌菌株分離、毒素檢測結(jié)果 67例糞便標(biāo)本通過厭氧培養(yǎng)共獲得10株艱難梭菌,艱難梭菌陽性率14.9%。產(chǎn)毒菌株共有10株,毒素A基因和毒素B基因全部為陽性的共8株,檢出率為80.0%,1株為二元毒素基因陽性;10株中,2株僅有毒素B基因陽性,檢出率為20.0%。

表1 患者基本資料分析

表2 CDI危險因素分析
2.2艱難梭菌MLST分型結(jié)果 MLST分型:共有5個ST型,5株ST2型,2株ST3型,1株ST102型,1株54型,1株201型。基因分型結(jié)果顯示,本地區(qū)艱難梭菌基因型別較為分散,但是ST2型為主要的基因型別(50%)。
2.3CDI危險因素 67例患者中,CDI組12例,非艱難梭菌院內(nèi)腹瀉組(CDN組)55例。兩組患者平均年齡分別為(59.1±15.05)歲和(64.67±13.8)歲,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),見表1。分析兩組患者的危險因素表明,使用氟喹諾酮類抗菌藥物是CDI的獨立危險因素(OR值=3.12,P=0.036),患者性別、基礎(chǔ)疾病、胃腸道手術(shù)、侵入性檢查、化療藥物、質(zhì)子泵抑制劑的使用等均與CDI發(fā)生無關(guān)(P>0.05)。CDN、CDI兩組患者血紅細(xì)胞、血紅蛋白、白細(xì)胞、清蛋白、血清肌酐、尿素氮等實驗室檢查結(jié)果比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),見表2。
近年來,艱難梭菌已成為引起院內(nèi)感染性腹瀉和腸炎的主要病原體。由于抗菌藥物濫用,造成腸道菌群紊亂,艱難梭菌大量增殖,同時釋放毒素,導(dǎo)致感染性疾病的出現(xiàn),其主要的表現(xiàn)就是腸道病理性損傷[10-11]。我國CDI患病率不斷上升,2009年我國上海市一家醫(yī)院研究發(fā)現(xiàn)中國住院患者CDI患病率僅為1.7/10 000住院患者。在一篇薈萃分析中顯示,我國2009—2015年CDI引起的住院患者腹瀉率是19%,高于歐美國家報道。本研究中CDI患病率是14.9%,與國外研究報道接近[12]。
CDI危險因素較多,可分為宿主因素如年齡、基礎(chǔ)性疾病、長期住院、免疫抑制使用等和醫(yī)源性因素如使用抗菌藥物、胃腸道手術(shù)、使用質(zhì)子泵抑制劑、腫瘤化療等[13]。高齡、長時間住院和應(yīng)用抗菌藥物是CDI主要危險因素[13]。盡管本研究未發(fā)現(xiàn)高齡與CDI有關(guān),但研究表明,艱難梭菌在老年人群中易受感染。相比于年齡<65歲的患者,患者年齡大于或等于65歲發(fā)生CDI的風(fēng)險增加5~10倍,年齡大于或等于65歲不僅是CDI本身的重要危險因素,也是包括CDI嚴(yán)重程度和病死率在內(nèi)不良臨床結(jié)局的重要危險因素[8]。
住院患者艱難梭菌定植的比例因國家、患者年齡和住院時間的不同而不同[14-15]。本研究中未發(fā)現(xiàn)住院時間與CDI有關(guān)。研究發(fā)現(xiàn)在住院的第1天,艱難梭菌的患病率在2.1%~20.0%,并且隨著住院時間的延長而增加,例如HUANG等[16]的一項研究表明,CDI患病率上升到20.0%~45.4%。PONNADA等[17]的一項研究表明,住院1個月后CDI患病率從2.1%增加到50.0%。在KHANNA等[18]的一項研究中,住院時間超過1個月CDI患病率在1%~50%。
幾乎每一種抗菌藥物都與CDI有關(guān),包括用于治療CDI的藥物甲硝唑和萬古霉素。與其他抗菌藥物對比,碳青霉烯類、頭孢菌素類、克林霉素及氟喹諾酮類抗菌藥物誘發(fā)CDI的可能性要更高一些[19-20]。該研究發(fā)現(xiàn)氟喹諾酮類藥物通常被認(rèn)為是CDI的危險因素,優(yōu)勢比(OR值)為5.651 4[20]。降低住院患者氟喹諾酮類藥物用量,4年內(nèi)CDI患病率下降了17.45%[20]。在抗菌治療期間和治療4周后,發(fā)生CDI的風(fēng)險是治療前的8~10倍,在接下來的2個月會增加3倍[4]。正如BROWNE等[21]的一項研究,在過去30 d中,近期使用抗菌藥物的患者CDI患病率高出2.41倍,抗菌藥物使用的增加與抗菌藥物相關(guān)性腹瀉的流行具有一致性[12,21]。在本研究中僅發(fā)現(xiàn)氟喹諾酮類藥物與CDI有關(guān),因此抗菌藥物使用在本次研究中未能全面體現(xiàn)出來。
現(xiàn)階段,艱難梭菌醫(yī)院感染患病率不斷增加,CDI問題獲得社會廣泛關(guān)注。本研究中發(fā)現(xiàn)氟喹諾酮類藥物的使用是CDI獨立危險因素,住院患者中存在部分CDI情況。研究當(dāng)?shù)亓餍胁W(xué)情況和危險因素,對后續(xù)針對性治療提供依據(jù)。在實際工作當(dāng)中,應(yīng)合理使用抗菌藥物,控制醫(yī)療機(jī)構(gòu)內(nèi)艱難梭菌傳播。