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XPO1共價抑制劑的虛擬篩選及皮膚損傷治療分析

2020-02-28 15:01:26康黔莉
臨床醫藥文獻雜志(電子版) 2020年30期
關鍵詞:數據庫

康黔莉

(貴航貴陽醫院藥劑科,貴州 貴陽 550000)

1 虛擬篩選

近年來,更多的XPO1抑制劑逐漸被發現,從特異性強、典型的LMB,到毒性小的SINE類化合物,至今沒有應用于臨床的藥物,LMB化合物為選擇性抑制劑,因存在毒性,不可應用于臨床研究,而部分SINE類化合物可開展研究,因此低毒性XPO1共價抑制劑受到臨床的關注。很多XPOI抑制劑作用機制為NSE序列中活性氨基酸結合,進而產生邁克爾加成反應。CYS為共價化合物和靶蛋白間共價結合重要氨基酸,因此,靶向XPO1中NES序列結合口袋中發現部分XPO1共價結合小分子化合物。

1.1 以Pubchem數據庫為基礎的虛擬篩選

Pubchem為NCBI旗下有機小分子生物活性數據庫,屬于開放性數據庫,是美國健康研究院所開發,啟動于2004年,以小分子數據資源的提供為目的,以便研究者能夠實施小分子高通量篩選,對活性小分子探針進行鑒定與發展,促使化學生物研究與藥物開發研究不斷加快。Pubchem是由三個數據庫交叉相連組成分別為BioAssay、Substanse與Compound,其中BioAssay數據庫是對生化實驗有關數據進行儲存;BioAssay數據庫是個人或者機構單位上傳化合物的原始數據;Compound數據庫是對化合物的化學結構數據進行儲存。

1.2 共價對接虛擬篩選

共價對接數據庫是Nir London等學者研發所得,為高通量的共價虛擬在線服務數據庫,其目的在于發現不同靶向蛋白的活性親核基因可逆共價小分子,比如MSK1、JAK2激酶中Cys等。共價對接數據庫庫中存在65000個親電化合物,主要是合成化合物組成的母核數據庫,如醛類、醛銅類、硼酸類等。對于不同配體,其共價化合物、質子化態、立體異構體等均為使用計算方法或者然健方法準備好,以便研究者快速對接親核活性基團。對于配體而言,其目的在于發現與靶點親核殘基共價可結合的小分子化合物。共價對接虛擬篩選首先分析與模擬配對可能構象。對接過程中,存在于小分子化合物中的親電部分為固定的,使用程序設定親電集團、親核原子,形成虛擬鍵。

2 皮膚損傷治療分析

皮膚為生理性屏障,具有面授病原體、化學性刺激、物理性刺激損傷預防作用,其中紫外線為危害性最強的環境刺激,而UV輻射引發皮膚急性炎癥反應,例如曬斑、紅斑、皮膚癌等。UV輻射中,VB的細胞毒性與誘變效應最強。DNA可對入射光子直接吸收,進而引發DNA損傷,尤其是6-4剛產物與環丁烷嘧啶二聚體,極易誘發皮膚細胞的DNA突變,進而產生皮膚癌。紫外輻射也可誘發皮膚的氧化應激反應,促使皮膚細胞活性自由基水平增加,活性自由基將細胞表面有關受體激活,使得UVR有關信號通路啟動,并將特定轉錄因子激活,對靶蛋白基因表達進行調節,最終引發真皮層、膠質層細胞的蛋白、細胞脂質、核酸損傷,以及癌變與光老化。

大量具有UV保護作用的抗氧化劑的研究中,例如維生素E、維生素C、阿魏酸等均存在UV保護作用。有研究指出,UV與NRF2引發的皮膚氧化應激中,存在重要作用。以NRF2細胞防御機制為基礎,對皮膚進行保護,預防UV損傷的研究較多,其中姜黃素、槲皮素、白藜蘆醇、EGGG等天然氧化劑為當前最終的一項NRF2氧化劑。研究指出,以上激活劑均具有UV保護作用。其中,NRF2激活劑將NRF2信號通路激活,使得細胞核中有NR進入,使得去毒酶與抗氧化酶等多種細胞保護基因表達被激動,產生饑餓昂ROS。還有眼睛指出,NRF2被激活以后,且在細胞核中進入達8小時,便存在XRO1核輸出蛋白作用下,輸出核,因此,使用XPO1小分子抑制劑,介導NRF2核輸出被視為UV引發氧化應激損傷的治療手段之一。

3 總 結

以XPO1介導的炎癥相關蛋白如IKB、N也等的核輸出機制,用第二章通過計算機模擬篩選得到的xPol小分子共價抑制劑CAPE和PEITc,以uV照射引起的紅斑定性半定量地分析uV照射引起的皮膚損傷程度,建立UVB照射引起的皮膚損傷動物模型,來驗證xP01小分子共價抑制劑cAPE和PEITc保護皮膚免受紫外損傷的作用。通過虛擬篩選結果得到CAPE能夠與XP01發生弱的共價相互作用,動物模型實驗結果可以得到CAPE具有一定的UV保護作用。

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