巴巧瑞,王弋博,焦成瑾
(天水師范學院 生物工程與技術學院,甘肅 天水 741001)
YchF是E.coli中的一種普遍保守的ATP酶,由ychF基因編碼。[1]比較基因組研究發(fā)現,YchF同源物存在于所有測序的基因組中,且廣泛分布于原核生物、真核生物以及古菌中。這表明活細胞中YchF樣蛋白可能具有基本且重要的功能。[2]大腸桿菌基因組中,ychF與Pth(肽酰tRNA水解酶)共轉錄,Pth是水解肽酰tRNA的酶,它可催化釋放tRNA。[3]實驗證明YchF水解ATP的效率遠高于GTP。但根據結構,其被歸為TRAFAC(翻譯因子相關)家族,這一家族成員為普遍保守的GTP酶,功能均與核糖體合成蛋白質相關,表明YchF可能也參與蛋白質生物合成過程,且由于特殊的水解活性,很可能在一些特殊的情況下行使自身功能,例如氧化應激等。在人體中,核糖體異常通常可導致多種疾病的發(fā)生,且ATP酶是非常具有吸引力的藥物靶點。[4]因此,揭示YchF與核糖體的相互作用能補充核糖體生物學相關研究,并有助于開發(fā)治療因核糖體異常所導致疾病的藥物。
YchF同源物之間的序列十分相似,例如,大腸桿菌YchF與人源類似Obg家族G蛋白的ATP水解酶1(human Obg-like ATPase 1,hOLA1)蛋白在組成上,45%的氨基酸完全相同并且一半以上的氨基酸具有相似性,強烈暗示了這兩種蛋白質在功能上具有保守性。[5]據報道敲除hOLA1能抑制乳腺癌細胞遷移與增殖,[6]同時細胞對活性氧(ROS)的抵抗力更強。此外,在許多腫瘤細胞中發(fā)現hOLA1表達上調,這也表明靶向YchF/OLA1可能對腫瘤有潛在的治療作用。然而,YchF/OLA1在細胞內的生物學作用仍待進一步研究。[7]
YchF/OLA1的普遍保守性表明了該蛋白質在細胞中可能具有非?;A且重要的功能,[2]但ychF的缺失對人類、枯草芽孢桿菌或大腸桿菌都有一定但并不致命的影響。……