南京市第三十九中學辦學六十載,以“和諧共生”為辦學目標,以“明理求真”為校訓,弘揚“勤學上進、文明守紀”的校風、“治學嚴謹、誨人不倦”的教風和“求學刻苦、做人求真”的學風。學校獲得全國初中教育改革創(chuàng)新示范校、江蘇省素質(zhì)教育示范初中、南京市體育傳統(tǒng)項目學校等稱號。
學校心理健康輔導中心成立于2010 年,依托于南京市“陶老師”工作站,秉承“成長比成績更重要,成人比成功更重要”的工作理念。中心建有團輔教室、個別輔導室、接待室、閱讀等候室、悅納室、音樂放松室等,整合多方資源,努力為學生、教師、家長提供心理健康輔導,促進學生健康成長。學校的心理健康教育工作堅持以發(fā)展性為重點,有計劃地開展心理健康知識講座、學生心理健康團體輔導,定期為家長提供家庭教育咨詢,還對個別學生進行成長訓練,幫助其解決學習、生活、人際交往等方面的心理問題。學校被評為全國中小學心理健康教育特色學校、江蘇省中小學心理健康教育特色學校,并建有鼓樓區(qū)教師心理健康云中心。