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基于多數據庫分析ANK3 在腎透明細胞癌中的作用

2020-08-13 07:00:46張大軍葉向東
醫藥前沿 2020年12期
關鍵詞:數據庫差異分析

張大軍 葉向東

(順德和平外科醫院泌尿外科 廣東 佛山 528300)

腎透明細胞癌(Clear cell renal cell carcinoma, ccRCC)是腎癌的最常見類型,起源于腎小管上皮細胞[1],部分ccRCC 患者早期起病隱匿,錯過手術時機,且ccRCC 對放化療不敏感[2],靶向治療非常重要,因此ccRCC 的早期診斷和治療靶點的研究非常重要。

錨蛋白重復序列3(ANK3),又被稱為MRT37。目前ANK3 的研究集中在精神疾病[3]。其與前列腺癌[4]、膀胱癌[5]有關,在腎癌中尚無報道。本研究通過數據分析,探索ANK3 在ccRCC 中的表達及對臨床、預后的影響。

1.資料與方法

1.1 在Oncomine 數據庫中分析ANK3 在ccRCC 中的表達差異。從TCGA 數據庫下載ccRCC 患者臨床、預后及轉錄組數據,以 ANK3 表達中位數分為高低表達組,比較組間臨床指標差異,并進行生存分析。

1.2 統計學方法

使用R 軟件進行分析。組間比較采用χ2檢驗,生存分析采用KM 法。P<0.05 為差異存在統計學意義。

2.結果

2.1 Oncomine 數據庫有9 項關于ANK3 在ccRCC 中表達差異的研究(表1)。薈萃分析這9 項研究,提示ANK3 在ccRCC 中表達量下降(P=2.59×10-7)。

表1 ANK3 在ccRCC 中的表達差異研究

2.2 TCGA 數據庫有537 例ccRCC 樣本,比較臨床指標的組間差異(表2)。提示ANK3 表達量與淋巴侵犯無關,但低表達與患者男性、年齡大、分期晚、遠處轉移、低分化及血小板升高有關。

表2 ANK3 與ccRCC 臨床信息關系

2.3 生存分析結果提示,ANK3表達量可影響患者總體生存率,高表達患者總體生存率更高(n=537, Logrank P=5.7×10-11)。

3.討論

ccRCC 是腎實質來源的惡性腫瘤,缺乏早期診斷標志,從基因層面研究有助于發現早期診斷指標、治療靶點。關于ANK3 的研究集中在精神疾病領域。有研究報道ANK3 與肺、結腸、乳腺、膀胱及前列腺腫瘤有關,但在腎癌中尚未見報道。

ANK3 在ccRCC 中表達量更低,這種表達下調與患者年齡大、分期晚、低分化、合并遠處轉移以及血小板升高等惡性表現有關,低表達組患者總體生存期更短。總之,ANK3 在ccRCC 中表達下調,這種下調與多種惡性表型相關,低表達患者的預后更差。我們認為ANK3 可能是ccRCC 的抑癌基因中的一種,這需要更多研究來證實。

ANK3 對細胞生物學影響及其分子機制尚不清楚,我們需要更多的研究來明確ANK3 在腫瘤中扮演的角色,為造福更多的腎癌患者提供依據。

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