長(zhǎng)足大竹象取食脅迫下慈竹WRKY轉(zhuǎn)錄因子的鑒定及生物信息學(xué)分析

唐 昊，鄭 莉,張 羽，李沅秋，羅朝兵

(1.樂(lè)山師范學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院，四川樂(lè)山 614000；2.竹類(lèi)病蟲(chóng)防控與資源開(kāi)發(fā)四川省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，四川樂(lè)山 614000)

0 引言

WRKY轉(zhuǎn)錄因子是植物中的調(diào)節(jié)蛋白中的一個(gè)大家庭，WRKY轉(zhuǎn)錄因子約有60個(gè)高度保守的氨基酸，其特征為N端WRKYGQK基序和C端CCHC- (C2HC)或CCHH- (C2H2)型鋅指基序，WRKY蛋白通過(guò)與基因啟動(dòng)子中的W-BOX motif (TTGACC/T)結(jié)合來(lái)調(diào)控基因表達(dá)[1-4].同時(shí)根據(jù)WRKY結(jié)構(gòu)域的數(shù)量和鋅指基序的特征，可以劃分為三個(gè)主要的家族[1-3]，其中家族Ⅰ具有兩個(gè)典型的WRKY結(jié)構(gòu)域和一個(gè)C2H2-型鋅指基序，而其他大多數(shù)的WRKY蛋白只含有一個(gè)WRKY結(jié)構(gòu)域，歸屬于家族II或家族Ⅲ，家族II的鋅指基序與家族Ⅰ相同，家族Ⅲ的鋅指基序?yàn)镃2HC.此外，家族II中的WRKY蛋白可以進(jìn)一步分為IIa 、 IIb、IIc、IId 和IIe五個(gè)亞族，而家族III中WRKY蛋白分為IIIa和IIIb亞族[3,5].大量的WRKY轉(zhuǎn)錄因子在多種植物的基因組中被發(fā)現(xiàn)并鑒定，例如擬南芥[1]，水稻[6]，玉米[7]和小麥[8]等.同時(shí)遺傳和分子生物學(xué)研究表明，WRKY轉(zhuǎn)錄因子在植物中一方面參與抵御諸如細(xì)菌[9-11]、真菌[12-13]、病毒病原體[14]及病毒[15]各種生物脅迫的調(diào)控中起著關(guān)鍵作用；另一方面也在響應(yīng)如干旱脅迫[8,16-18]、水脅迫[19]、鹽脅迫[20]和寒冷脅迫[21-22]等非生物脅迫時(shí)的植物體內(nèi)的調(diào)控.此外，WRKY轉(zhuǎn)錄因子還能參與植物自身的生長(zhǎng)發(fā)育調(diào)控，如葉片的衰老調(diào)控[23-24]、開(kāi)花調(diào)控[25-27]、細(xì)胞內(nèi)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)[28]、植物種子的發(fā)育及毛狀體起始和衰老[3,29].

慈竹(Bambusaemeiensis)屬于叢生竹類(lèi)，廣泛分布于我國(guó)南方地區(qū)，被廣泛應(yīng)用于造紙及園林綠化等領(lǐng)域[30].其中在造紙領(lǐng)域，按照竹種對(duì)造紙質(zhì)量的影響進(jìn)行分級(jí)……