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植物類鈣調素CML37 的轉錄激活活性分析

2020-09-24 03:25:28蘇智宏黎圣金田長恩周玉萍
科技視界 2020年26期
關鍵詞:酵母菌

蘇智宏 黎圣金 田長恩 周玉萍

植物鈣調素和類鈣調素是細胞內最重要的一類Ca2+感受器,CaM/CML 通過與鈣調素結合蛋白結合來調節細胞生理過程[1]。擬南芥有4 個CaM 蛋白和50 個CML 基因,干旱脅迫下類鈣調素CML37 突變體積累的ABA含量顯著低于野生型,表明CML37 正向調節植物對生物和非生物脅迫的響應,參與JA和ABA信號調節[2]。擬南芥IQM4 是一個Ca2+不依賴型鈣調素結合蛋白,通過參與ABA合成調節種子休眠和萌發,但IQM4 上游CaM 或CML尚未鑒定[3]。在通過酵母雙雜交實驗來研究CML37 與IQM4 的相互作用時,觀察到轉化了pGBKT7- CML37 和pGADT7 質粒的酵母菌在四缺培養基(SD- Ade/His/Leu /Trp)上正常生長并激活了報告基因LacZ 的表達。同時,酵母單雜交實驗也證實了擬南芥類鈣調素CML37 具有轉錄激活活性。

1 材料與方法

1.1 材料

擬南芥為Columbia 生態型;大腸桿菌為E.coli DH5α;酵母雙雜交系統為Clontech公司的Matchmaker Gal4 Two- Hybrid System3;Carrier DNA 購自Sigma 公司;實驗所使用的膠回收試劑盒、DNA 片段純化試劑盒、限制性核酸內切酶、DNA 連接酶、PRIMER STAR 高保真DNA 聚合酶、rTaq DNA 聚合酶均為TaKaRa 公司產品。

1.2 方法

1.2.1 擬南芥CML37 與IQM4 基因克隆

從TAIR 數據庫獲取CML37 和IQM4 的CDS 序列,分別設計克隆引物。以擬南芥cDNA 為模板,利用PRIMERSTAR 高保真DNA 聚合酶進行PCR 擴增,PCR 反應結束后,取少量產物進行瓊脂糖凝膠電泳分析。

1.2.2 酵母表達載體構建

PCR 產物分別用DNA 片段純化試劑盒純化后,其中AD- CML37 片段用EcoR I 和BamH I 定向插入酵母表達載體pGADT7 質粒,BD- CML37 片段用EcoR I 和Pst I 定向插入pGBKT7 質粒,而IQM4 片段用Nde I 和Xma I 分別定向插入pGADT7 和pGBKT7 質粒。4 種連接產物分別轉化E.coli DH5α 感受態細胞,涂布至含相應抗生素的LB 固體培養基(pGADT7 為氨芐青霉素抗性;pGBKT7為硫酸卡那霉素抗性),使用克隆用引物直接菌落PCR 鑒定陽性轉化子并送至華大公司測序證實。

1.2.3 酵母單雜交分析

采用PEG/LiAC 法將BD- CML37 和BD 質粒分別轉化酵母感受態細胞AH109(圖1),涂布于SD- Trp;將AD- CML37和AD 質粒分別轉化酵母感受態細胞并涂布于SD- Leu,30℃培養4 d 至菌落形成。從SD- Trp 平板上挑取長勢良好的單菌落接種于SD- Ade/His/Trp,從SD- Leu 平板挑取長勢良好的單菌落接種于SD- Ade/His/Leu,30℃繼續培養4 d。

2 結果

2.1 擬南芥CML37 與IQM4 基因克隆及載體構建

擬南芥CML37 的CDS 序列長558bp,IQM4 的CDS 序列長1599bp,克隆產物經PCR 擴增和瓊脂糖凝膠電泳后,得到的條帶符合預期。連接產物轉化E.coliDH5α 感受態細胞,采用菌落直接PCR 鑒定陽性轉化子,陽性克隆送至華大公司測序,測序結果證明CML37、IQM4 基因序列內部沒有發生改變。

2.2 酵母雙雜交分析

前期酵母雙雜交實驗結果表明,含有AD- IQM4+BD- CM L37 和AD+BD- CML37 質粒組合的酵母菌不僅在四缺培養基上正常生長,還能分解X- α- gal 產生藍色菌落;但AD- CML 37+BD- IQM4 質粒組合的酵母不能在四缺培養基上生長。結果表明:在酵母細胞內,CML37 不能與IQM4 蛋白相互作用,BD- CML37 融合蛋白具有轉錄因子功能,而AD- CML37 不具備轉錄因子功能。

2.3 酵母單雜交分析

酵母單雜交實驗中將AD- CML37 質粒轉化酵母細胞后,涂布于SD- Leu 上培養4d 后,將轉化酵母轉接到SD- Leu/His/Ade 上繼續培養4d 后沒有觀察到酵母菌落(圖1A);將BD- CML37 質粒轉化酵母細胞后,涂布于SD- Trp 上培養4d 后,挑取篩選培養基上的酵母接種另一種三缺培養基SD- Trp/His/Ade 上繼續培養4d 后觀察到酵母菌落(圖1B)。轉化有BD- CML37 質粒的酵母菌能夠在三缺培養基上生長,但轉化AD- CML37 質粒的酵母菌不能生長。酵母單雜交分析表明,擬南芥CML37 蛋白缺少DNA 結合活性,但具有激活活性;在酵母細胞中,CML37 與BD(DNA 結合域)融合后具有轉錄因子的功能。

圖1 CML37 的酵母單雜交分析

3 結論和討論

酵母雙雜交技術交廣泛應用于蛋白分子之間相互作用的研,酵母單雜交實驗能夠應用于驗證轉錄因子的DNA 結合活性和自激活活性[4],擬南芥CML37 蛋白有3 個EF- hand 基序,沒有其他功能結構域,但酵母雙雜交和單雜交分析都證明CML37具有轉錄激活功能,說明CML37 基因功能研究還存在未認識的問題。

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