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滄州市漢族人群髓系腫瘤遺傳易感性與TET2基因單核苷酸多態性相關性研究

2020-10-28 01:32:46張睿王澎李連連
健康必讀·下旬刊 2020年10期

張睿 王澎 李連連

【摘 要】目的:觀察滄州市漢族人群髓系腫瘤遺傳易感性與TET2基因單核苷酸多態性相關性。方法:選擇2019年1月-2019年12月至我院進行髓系腫瘤治療的患者34例作為觀察組,隨機選擇同一時期至我院體檢健康志愿者100例作為對照組。所有患者均基于TET2基因單核苷酸檢查。結果:兩組參與研究人員的TET2rs2454206、TET2rs12498609基因型分布和位點等位基因頻率均有明顯差異,觀察組TET2rs2454206、TET2rs12498609基因型AA基因型比例高于對照組,且無GG分型。結論:滄州市漢族人群髓系腫瘤遺傳易感性與TET2基因單核苷酸多態性具有一定的相關性。

【關鍵詞】髓系腫瘤;遺傳;TET2;單核苷酸多態性

【中圖分類號】R730.2 【文獻標識碼】A 【文章編號】1672-3783(2020)10-30--02

TET2基因是位于染色體4q24上,屬于哺乳動物TET氧化酶蛋白家族。TET2蛋白作為氧化酶,能夠通過改變基因甲基化狀態進而起到調控表達的作用。目前在針對髓系腫瘤的研究中發現,多數腫瘤都發現TET2基因突變的情況[1]。為了觀察滄州市漢族人群髓系腫瘤遺傳的易感性與TET2基因單核苷酸多態性的相關性,我院對近一年來診的髓系腫瘤患者進行了研究,現報道如下。

1 資料與方法

1.1 患者選擇

選擇2019年1月-2019年12月至我院進行髓系腫瘤治療的患者34例作為觀察組,所有患者均在滄州居住5年以上,民族為漢族。其中男性患者19例,女性患者15例,年齡16-64歲,平均年齡(47.31±8.22)歲。其中骨髓增殖性腫瘤(MPN)11例,骨髓增生異常綜合征13例,急性白血病(AML)7例。隨機選擇同一時期至我院體檢的在滄州居住5年以上的漢族健康志愿者100例作為對照組。其中男性67例,女性33例,年齡18-70歲,平均年齡(51.18±10.73)歲。兩組參與研究人員性別、年齡等基線資料無統計學差異(p>0.05),所有參與研究人員均對本次研究知情同意。

1.2 方法

1.2.1 研究方法

所有患者均基于TET2基因單核苷酸檢查。

試劑:少量全血基因組DNA提取試劑盒,購自美國OMEGA公司;dNTPs,購自美國Promega公司;引物合成,購自中國通用公司;10×Taq緩沖液、TaqDNA聚合酶,購自美國Thermo公司;DL-1000Marker購自日本TaKaRa公司。

檢測步驟:(1)提取DNA。根據OMEGA試劑盒受命去,提取骨髓或者外周血標本中的DNA。取300μml標本于EP管,留取白細胞沉淀,加入試劑盒配備試劑的WTL240μl,水浴,依次加無水乙醇250μl,離心、加HBBuffer500μl,離心,加WashBuffer650μl,離心,洗脫DNA溶液,-80℃儲存備用。(2)引物設計。通過數據庫檢索TET2序列,設計引物,并進行合成。(3)PCR反應。將包含TET2rs2454206、TET2rs12498609的DNA片段進行PCR反應,并將PCR產物電泳、測序、基因分型。R顯帶技術染色體核型分析。

1.2.2 分析指標

比較兩組參與研究人員TET2位點基因型分布情況,以及等位基因頻率情況。

1.3 數據處理

用SPSS19.0統計學數據處理軟件處理研究中所有相關數據,計數資料采用(n,%)表示,采用χ2檢驗,以p<0.05為差異有統計學意義。

2 結果

兩組參與研究人員的TET2rs2454206、TET2rs12498609基因型分布和位點等位基因頻率均有明顯差異,觀察組TET2rs2454206、TET2rs12498609基因型AA基因型比例高于對照組,且無GG分型。詳見表1、表2。

3 討論

TET2基因是TET氧化酶蛋白家族中的一員,在其羧基末端含有富含半胱氨酸的結構域以及雙鏈β鏈螺旋結構。前者可以將DNA固定在DSBII的核心結構上。TET2已經證實是維持胚胎肝細胞多能性的轉錄因子的下游靶點,在多種組織中表達廣泛,其中在造血細胞中的表達最高。2008年的一項研究表明,TET2確實的髓系腫瘤患者,其造血干細胞CD34+細胞的增殖能力明顯強于TET2未缺失的患者[2]。后續的研究發現,幾乎在所有的髓系中環患者中均會發現TET2突變的患者,因此TET2突變已經成為惡性髓系腫瘤的致病標記基因[3]。

在本次研究中,兩組參與研究人員的TET2rs2454206、TET2rs12498609基因型分布和位點等位基因頻率均有明顯差異,觀察組TET2rs2454206、TET2rs12498609基因型AA基因型比例高于對照組,且無GG分型。TET2rs2454206觀察組等位基因A所占比例明顯高于對照組,TET2rs12498609等位基因C所占比例明顯高于對照組。因此滄州市漢族人群髓系腫瘤遺傳易感性與TET2基因單核苷酸多態性具有一定的相關性,但是仍然需要更大的樣本量進行進一步的研究。

參考文獻

張艷,吳曉梁,侯金超,等.TET2基因單核苷酸多態性與膿毒癥易感性和預后的相關性研究[J].中華急診醫學雜志,2019,28(10):1261-1265.

楊少迪.microRNA靶基因多態性與腫瘤遺傳易感性的相關性研究[D].湖南工業大學,2014.

李榮,許明江,楊逢春,等.TET2基因突變在髓系腫瘤中的研究進展[J].中國醫學科學院學報,2016,38(5):583-588.

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