基于整合藥理學(xué)分析小承氣湯治療胃腸功能障礙的作用機(jī)制

王春子,趙良偉

作者單位： 313000 浙江省湖州市，浙江中醫(yī)藥大學(xué)附屬湖州市中醫(yī)院

胃腸道功能障礙原發(fā)和繼發(fā)于多種疾病，又能反向促進(jìn)疾病的進(jìn)展加重病情，增加病死率，受到醫(yī)務(wù)人員的重視[1]。臨床除相應(yīng)的對(duì)癥治療外，中醫(yī)藥的應(yīng)用也取得不錯(cuò)的成果，小承氣湯治療胃腸道功能障礙的臨床報(bào)道逐漸增多，但機(jī)制研究尚不足，筆者欲運(yùn)用整合藥理學(xué)的方法，將小承氣湯與胃腸道功能障礙的研究成果進(jìn)行資源整合，明確小承氣湯治療胃腸道功能障礙的作用機(jī)理，為臨床運(yùn)用提供理論基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 中藥成分、作用靶點(diǎn)及疾病靶點(diǎn)收集 小承氣湯由大黃、厚樸、枳實(shí)3味中藥組成，每味中藥的成分通過(guò)中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)和分析平臺(tái)TCMSP(http://ibts.hkbu.edu.hk/LSP/tcmsp.php)和知網(wǎng)、萬(wàn)方中的文獻(xiàn)收集得到。為明確可能發(fā)揮藥物作用的成分，根據(jù)藥代動(dòng)力學(xué)，篩選口服利用度(OB)>30%且類(lèi)藥性(DL)>0.18[2-3]的主要活性成分。將得到的活性成分輸入PUBCHEM(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)數(shù)據(jù)庫(kù)得到每一個(gè)成分的SMILES結(jié)構(gòu)，然后通過(guò)SWISS TARGET PREDICTION (http://www.swisstargetprediction.ch/)和TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)中的靶點(diǎn)預(yù)測(cè)功能收集潛在作用靶點(diǎn)。GENECARDS數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.genecards.org/)、DRUGBANK數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.drugbank.ca/)、DisGeNET數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.disgenet.org/)以胃腸道功能障礙為關(guān)鍵詞獲取疾病靶標(biāo)。

1.2 關(guān)鍵靶基因篩選 將3味中藥的靶點(diǎn)與胃腸功能障礙靶標(biāo)進(jìn)行匹配，得到小承氣湯藥物活性成分與胃腸功能障礙的共有靶點(diǎn)。將共有靶點(diǎn)導(dǎo)入String數(shù)據(jù)庫(kù)(https://string-db.org/cgi/input.pl)，物種限定為智人，得到蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系網(wǎng)絡(luò)(PPI網(wǎng)絡(luò))并保存文件。將上述文件中的信息導(dǎo)入Cytoscape 3.5.1軟件，應(yīng)用network analyzer插件工具計(jì)算出靶點(diǎn)的連接度……