T細胞受體(TCR)通過識別主要組織相容性復合物傳遞的肽來監(jiān)視細胞環(huán)境。特定的TCR克隆可用作癌癥和自身免疫性疾病的治療劑。TCR通過V、D、J區(qū)段的體細胞重組最多可產(chǎn)生1 015個獨特序列,因而需要高靈敏度和特異性的技術(shù)來分離和鑒定對目標抗原有反應的TCR序列。
當T細胞遇到抗原時,TCR就會識別并起作用,從而產(chǎn)生大量自身復制并指示免疫系統(tǒng)的其他部分攻擊攜帶該抗原的細胞。在此過程中,一些不能對引起免疫反應的抗原起反應的細胞也會被周圍細胞的免疫活動所激發(fā)。采用傳統(tǒng)方法分離T細胞時會捕獲許多上述細胞,因此需要對收集到的細胞進行分離,接著采用液滴的mRNA測序法(Drop?seq)對分離后細胞進行分析。然而,分離具有特定受體的T細胞的過程會用到交聯(lián)技術(shù),交聯(lián)會降解T細胞的RNA,這給Drop?seq分析帶來了極大的挑戰(zhàn)性。
近日,美國加州大學等高校的研究人員采用化學可裂解的伯胺交聯(lián)劑,構(gòu)建了一種通過交聯(lián)劑調(diào)控的mRNA測序的方法——CLInt?Seq,該方法利用了可逆的交聯(lián)方式保留了T細胞的RNA的完整性,可有效回收細胞中與細胞內(nèi)蛋白質(zhì)(如細胞因子或轉(zhuǎn)錄因子)相關(guān)的抗原特異性TCR。該方法可以高通量分離和鑒定對任何抗原具有特異反應的低頻TCR。該方法或可用于確定對SARS?CoV?2病毒起反應的T細胞受體、開發(fā)針對前列腺癌的T細胞療法等。
研究的相關(guān)結(jié)果于2021年1月19日發(fā)表在《PNAS》期刊上。