廣西PRRSV分離株Y12018全基因組擴增和遺傳進化分析

王 政，解長占，于成東，于 桐 ，李亭玉，李金鳳，孟 媛 ，魯會軍，金寧一，張雪梅

(1.延邊大學 農學院，吉林 延吉 133002；2.軍事醫學研究院 軍事獸醫研究所，吉林 長春 130122；3.吉林農業大學 動物科學技術學院，吉林 長春 130118；4.吉林大學 動物醫學學院，吉林 長春 130062)

豬繁殖與呼吸系統綜合征(porcine reproductive and respiratory syndrome，PRRS)是由豬繁殖與呼吸綜合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)引起的一種以受孕母豬繁殖障礙和仔豬呼吸綜合征為主要特征的高度接觸性傳染病。不同性別、年齡階段和品種的豬均可被感染，感染妊娠母豬出現流產、死胎、弱胎和木乃伊胎等情況，流產率達30%，1月齡以內的仔豬相對較易被感染，感染仔豬伴有呼吸困難、發育遲緩和敗血癥等現象[1-2]。自1987年首次報道以來，全球除僅有少數國家如新西蘭、瑞士及澳大利亞無疫情報道外，在其他地區和國家仍然呈地方流行性趨勢[3]。我國PRRSV流行至今大致分為以下3個階段：美洲型經典PRRSV流行期；高致病性PRRSV流行期；多種PRRSV流行的穩定控制期。當前PRRS依然給我國及世界的養豬業帶來巨大的經濟損失，對養豬業的影響和危害依然存在。

在1996年國際病毒分類委員會的報告中，將PRRSV歸屬至動脈炎病毒科(Arteriviridae)，動脈炎病毒屬(Arterivirus)，該屬病毒共同存在的特點即發生變異和重組的頻率較高，并且具有巨噬細胞內復制的能力，能夠誘發自然宿主持續性感染[4]。PRRSV為不分節段的單股正鏈RNA病毒，全長約15 kb，其開放性閱讀框(ORF)依次命名為ORF1a(ORF1a-TF)-ORF1b-ORF2a-ORF2b-ORF3-OR-F4-ORF5a-ORF5a-ORF6-ORF7，5′端有帽子結構，3′端有UTR和Poly(A)尾巴。其中ORF1a和ORF1b主要編碼與病毒復制和轉錄相關的酶，ORF2～5 分別編碼 GP2、GP3、GP4、GP5 蛋白，ORF6編碼N端非糖基化的膜蛋白M，ORF7編碼病毒核衣殼蛋白N[5-7]。……