張玳寧,于秀華,張 舒,段 銘*
(1.吉林大學 動物醫學學院 人獸共患病研究所 人獸共患病研究教育部重點實驗室,吉林 長春 130062;2.吉林大學 第一醫院,吉林 長春 130021)
環狀RNA(circular RNA,circRNA)是近些年才發現的一種新的內源性非編碼RNA,具有獨特的閉合環狀結構,由前體mRNA反向剪接產生[1]。大約40年前,這些環狀轉錄本被認為是mRNA剪接的副產物[2],但隨著RNA測序技術的發展,現在已發現數以千計的circRNA。已有的研究結果表明,circRNA表達具有較高的組織特異性和發育階段特異性,且在基因表達調控中具有重要的生理功能[3],在癌癥、心血管疾病、中樞神經系統疾病等生理病理進程中扮演了重要的角色。
甲型流感病毒(influenza A virus,IAV),屬于正黏病毒科,單股負鏈RNA病毒,對人類及動物的生命健康具有重大危害,但是宿主編碼的circRNA在IAV與宿主細胞相互作用中的功能及其機制尚不清楚[4]。本實驗室前期基于基因芯片技術分析circRNA在IAV感染A549細胞中的表達,發現hsa_circ_0070421的表達顯著上調[5]。本研究探討了hsa_circ_0070421在IAV感染過程中的表達及其功能,研究結果有助于認知circRNA在IAV與宿主相互作用中的作用。
1.1 主要試劑聚肌苷酸胞苷酸(Poly I:C)和大腸桿菌O55:B5的脂多糖(LPS)購自Sigma-Aldrich公司;Cisplatin購自MedChem Express公司;超純瓊脂糖凝膠(UltraPure Agarose)購自Invitrogen公司;抗IAV-M1抗體購自Abcam公司;抗β-actin抗體購自Cell Signaling公司。
1.2 細胞培養A549和THP-1細胞在含有10%胎牛血清(FBS)(HyClone)和100 U/mL青霉素和100 mg/L鏈霉素的RPMI-1640(Corning)中培養;將MDCK、A172、Caco-2和SH-SY5Y細胞維持在含10% FBS的DMED(Corning)中培養,并置于37℃、4%CO2培養箱中生長。
1.3 病毒和病毒感染將流感病毒株A/PR/8/34(H1N1)在11日齡雞胚尿囊腔中增殖。用PBS洗滌細胞,并用感染復數(MOI)=3的病毒與含有1 mg/L TPCK處理的胰蛋白酶(Sigma-Aldrich)的培養基一起孵育1 h,吸附后,吸出上清液,將細胞培養指定的時間。……