感染乙腦病毒小鼠腦組織的轉(zhuǎn)錄組變化分析

高明星，張金花，劉澤霖，周靜靜，胡薛英，張萬坡，程國富，谷長勤

(華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 動物醫(yī)學(xué)院，湖北 武漢 430070)

日本乙型腦炎病毒(Japanese encephalitis virus，JEV)是由庫蚊傳播的黃病毒屬的正鏈單鏈RNA病毒。JEV是一種神經(jīng)入侵性病毒，會導(dǎo)致血腦屏障通透性發(fā)生改變[1]。JEV進(jìn)入中樞神經(jīng)系統(tǒng)后，在腦內(nèi)復(fù)制和增殖，引起許多動物的腦炎和神經(jīng)系統(tǒng)疾病，嚴(yán)重威脅人類和其他動物的生命安全[2]。在臨床腦炎病例中，有20%～30%的病例是致命的，有30%～50%的恢復(fù)病例會有嚴(yán)重的神經(jīng)系統(tǒng)癥狀[3]。雖然有商品化的疫苗，但JEV仍是亞洲病毒性腦炎的主要原因[4]，可能與各國免疫制度有關(guān)。

RNA-Seq技術(shù)，又被稱為轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)，已成為研究動物病毒傳染病與宿主相互作用的重要技術(shù)之一[5]。探索JEV的致病機(jī)理，可以為更好的預(yù)防和治愈乙型腦炎提供科學(xué)依據(jù)。已有研究用轉(zhuǎn)錄組技術(shù)分析JEV感染巨噬細(xì)胞、敲除RIPK3基因小鼠和人神經(jīng)母細(xì)胞瘤細(xì)胞后細(xì)胞因子和通路的變化[6-8]。然而至今很少有體內(nèi)乙腦病毒感染在基因轉(zhuǎn)錄水平上較全面的調(diào)控機(jī)制分析。

本研究以105PFU的P3株乙腦病毒感染6周齡BALB/c雌鼠，感染6 d后分別取對照組和感染組腦組織，進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析，分析體內(nèi)參與抗病毒過程的相關(guān)基因和途徑，為乙腦的發(fā)病機(jī)制及防控提供理論依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 毒株和試驗動物乙型腦炎病毒P3株由華中農(nóng)業(yè)大學(xué)微生物國家重點實驗室曹勝波教授饋贈。病毒采取乳鼠腦內(nèi)擴(kuò)增，空斑試驗測定病毒毒價。6周齡BALB/c雌鼠購自華中農(nóng)業(yè)大學(xué)動物實驗中心。……