劉向楠,劉助紅,劉賢旭,田存鋒,康艷梅,劉國(guó)乾,李桂珍
(廣東科貿(mào)職業(yè)學(xué)院 廣州 510430)
《動(dòng)物疫病防控》是一門綜合應(yīng)用性學(xué)科,具有較強(qiáng)的實(shí)踐性和應(yīng)用性。實(shí)驗(yàn)教學(xué)是《動(dòng)物疫病防控》教學(xué)過(guò)程中的一個(gè)重要的必須環(huán)節(jié),通過(guò)基本方法和技能培訓(xùn),培養(yǎng)學(xué)生理論聯(lián)系實(shí)際、發(fā)現(xiàn)問(wèn)題及解決問(wèn)題的綜合能力。目前我國(guó)農(nóng)業(yè)院校開設(shè)的《動(dòng)物疫病防控》課程中在疫病實(shí)驗(yàn)室診斷方法部分普遍存在教學(xué)內(nèi)容相對(duì)陳舊,實(shí)驗(yàn)內(nèi)容落后等問(wèn)題。例如,經(jīng)典的細(xì)菌培養(yǎng)或病毒分離方法耗時(shí)長(zhǎng),主要適用于科研型實(shí)驗(yàn)室;熒光定量PCR等分子生物學(xué)檢測(cè)方法近年來(lái)迅速發(fā)展和應(yīng)用,但對(duì)儀器設(shè)備要求較高,在基層推廣較為困難。為了學(xué)生能更好地學(xué)習(xí)《動(dòng)物疫病防控》課程,從業(yè)后滿足就業(yè)崗位的實(shí)際需要,本教學(xué)團(tuán)隊(duì)將環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(loop-mediatediso the rmalam plification,LAMP)技術(shù)添加到實(shí)訓(xùn)課程教學(xué)中,與學(xué)生共同探討了該方法的技術(shù)優(yōu)勢(shì)及在臨床應(yīng)用的價(jià)值,得到了較好的效果。
LAMP技術(shù)是一種新型核酸擴(kuò)增技術(shù),其原理是采用4或6條能夠識(shí)別目的基因上的6個(gè)特異區(qū)域的引物,依賴與Bst DNA聚合酶的強(qiáng)鏈置換活性,在65℃等溫條件下30min就能擴(kuò)增出約109~1010拷貝的靶序列。試劑盒內(nèi)配備變色反應(yīng)指示劑,可根據(jù)顏色變化判定實(shí)驗(yàn)結(jié)果。LAMP技術(shù)對(duì)核酸質(zhì)量要求不高,可配合核酸免提取技術(shù)使用,現(xiàn)場(chǎng)即可完成檢測(cè),耗時(shí)短,無(wú)需昂貴儀器設(shè)備。目前,基于LAMP檢測(cè)方法建立的非洲豬瘟檢測(cè)試劑盒已獲得新獸藥證書,在獸醫(yī)臨床中得到廣泛應(yīng)用。故將環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)應(yīng)用到《動(dòng)物疫病防控》能夠讓學(xué)生了解一線動(dòng)物疫病實(shí)驗(yàn)室診斷新方法,為學(xué)生畢業(yè)后走向工作崗位打下一定的基礎(chǔ)。
該方法是目前教學(xué)和實(shí)踐中均廣泛使用的方法。PCR方法發(fā)明至今已有將近30年的歷史,技術(shù)非常成熟、配套試劑價(jià)格低廉、儀器設(shè)備價(jià)格也逐年降低,是實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)的主流方法之一,已具有替代傳統(tǒng)分離鑒定法的趨勢(shì)。但該方法在完成擴(kuò)增程序后需要進(jìn)行凝膠電泳,這一過(guò)程費(fèi)時(shí)費(fèi)力且在開蓋過(guò)程中極易造成氣溶膠污染,因此在臨床一線實(shí)驗(yàn)室較少應(yīng)用。
ELISA是免疫學(xué)診斷中常用的檢測(cè)技術(shù),已成功地應(yīng)用于多種病原微生物所引起的傳染病檢測(cè)。本方法具有靈敏度高、特異性好、操作較為簡(jiǎn)單的特點(diǎn),由于1d內(nèi)可以同時(shí)檢測(cè)幾百上千份標(biāo)本,因此在大型養(yǎng)殖企業(yè)中主要使用該技術(shù)方法評(píng)估疫苗免疫后的抗體水平。但是商品化的ELISA試劑盒主要以進(jìn)口產(chǎn)品為主,成本較高,并且檢測(cè)依賴于實(shí)驗(yàn)室,無(wú)法應(yīng)用于現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)。
血凝實(shí)驗(yàn)及血凝抑制實(shí)驗(yàn)是檢測(cè)新城疫、禽流感等禽傳染病的常用方法,也是檢測(cè)家禽免疫抗體水平的常用方法。因其操作簡(jiǎn)便、快速、經(jīng)濟(jì)、無(wú)需儀器設(shè)備和可以對(duì)抗體水平進(jìn)行量化的優(yōu)點(diǎn)被廣泛應(yīng)用于基層飼養(yǎng)場(chǎng)。但該方法僅應(yīng)用于特定的病原,絕大多數(shù)疫病不適用,1%紅細(xì)胞懸液的制備需要新鮮配制和保存,結(jié)果判讀主觀性較強(qiáng)。
瓊脂擴(kuò)散實(shí)驗(yàn)主要原理是利用擴(kuò)散原理,將可溶性抗原與抗體分別加入在半固體瓊脂孔內(nèi),緩慢擴(kuò)散,當(dāng)抗原與抗體對(duì)應(yīng)且比例適宜則形成白色沉淀線為陽(yáng)性結(jié)果,否則為陰性結(jié)果。此方法非常經(jīng)典,目前仍應(yīng)用于馬立克氏病等傳染病檢測(cè)。其缺點(diǎn)是需要過(guò)夜反應(yīng),耗時(shí)長(zhǎng),靈敏度欠佳。
在畜牧獸醫(yī)領(lǐng)域LAMP技術(shù)最早大規(guī)模應(yīng)用于水產(chǎn)病原微生物檢測(cè),未引起足夠重視。伴隨著基于LAMP技術(shù)的非洲豬瘟病毒檢測(cè)試劑盒獲得農(nóng)業(yè)部的新獸藥證書并在基層得到大量使用,LAMP技術(shù)已被普遍接受和認(rèn)可。為了適應(yīng)技術(shù)進(jìn)步,緊跟發(fā)展趨勢(shì),作為畜牧獸醫(yī)相關(guān)專業(yè)的學(xué)生有必要了解LAMP技術(shù)。
本課程以實(shí)踐應(yīng)用為導(dǎo)向,教師結(jié)合案例帶領(lǐng)學(xué)生分析豬塞內(nèi)加谷病的流行病學(xué)特征、臨床癥狀、病理變化以及設(shè)計(jì)LAMP方法的方案。
①了解豬塞內(nèi)加谷病毒的流行情況、致病性和預(yù)防措施;②掌握環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(LAMP)技術(shù)的原理及操作方法;③建立豬塞內(nèi)加谷病毒環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(LAMP)檢測(cè)方法。
環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)利用識(shí)別多區(qū)域特異性引物組和具有鏈置換活性的Bst DNA聚合酶,在65℃左右等溫條件下30min即可擴(kuò)增109~1010拷貝的靶序列。在反應(yīng)體系中加入指示劑,可裸眼觀察判斷結(jié)果。
2×Lamp Master Mix購(gòu)自哈爾濱新?;驒z測(cè)有限公司;RNA提取試劑盒購(gòu)自天根生化科技有限公司;豬塞內(nèi)加谷滅活病毒由廣東省實(shí)驗(yàn)動(dòng)物監(jiān)測(cè)所提供;金屬浴購(gòu)自大龍興創(chuàng)實(shí)驗(yàn)儀器(北京)股份有限公司。
以豬塞內(nèi)加谷病毒作為檢測(cè)對(duì)象。
序列查找和引物設(shè)計(jì):從Genbank上查找并下載豬塞內(nèi)加谷滅活病毒VP1基因序列,將序列遞交到在線網(wǎng)站http://primerexplorer.jp/e/v5_manual/index.htm l自動(dòng)生成多個(gè)LAMP引物組合,評(píng)分最高的引物序列委托上海生工合成。
核酸提取:按RNA提取試劑盒說(shuō)明書提取滅活病毒中的RNA,測(cè)定RNA濃度和純度。
按以下組分配置反應(yīng)混合液,轉(zhuǎn)入0.2mLPCR管中:
2×HNB Iso Amp Mix 12.5μL;
10×LAMPPrimerMix 2.5μL;
5M Beta in 2μL;
模板DNA 1μL;
Bst 2.0DNA Polymerase 1μL;
dd H2O補(bǔ)充至25μL。
Bst 2.0DNA Po lymerase 1μL;dd H2O補(bǔ)充至25μL。
將配置好的反應(yīng)液充分混勻并瞬時(shí)離心,置于65℃金屬浴中,30min后觀察顏色變化。若擴(kuò)增樣本為陽(yáng)性則由紫羅蘭色變?yōu)樘焖{(lán)色(圖1)。

圖1 豬塞內(nèi)加谷病毒LAMP檢測(cè)結(jié)果
本實(shí)驗(yàn)內(nèi)容涉及的病原為新發(fā)傳染病,一般教材中未涉及該病原,需要老師課前與學(xué)生查閱相關(guān)參考文獻(xiàn)了解豬塞內(nèi)加谷病毒的背景信息。實(shí)操過(guò)程中按4~6人每組進(jìn)行分組,鼓勵(lì)組內(nèi)分工協(xié)作,共同完成整個(gè)實(shí)驗(yàn)過(guò)程,組間進(jìn)行平行實(shí)驗(yàn)來(lái)驗(yàn)證LAMP技術(shù)的穩(wěn)定性。在結(jié)果判讀結(jié)束后,教師提供非洲豬瘟、藍(lán)耳病、偽狂犬等其他病原序列,供學(xué)生進(jìn)一步演練引物設(shè)計(jì)環(huán)節(jié)。最終通過(guò)組內(nèi)匯總分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果完成實(shí)驗(yàn)報(bào)告。
本次從畜牧獸醫(yī)行業(yè)實(shí)際需求出發(fā),理論與實(shí)踐相結(jié)合。在課前要求學(xué)生查閱文獻(xiàn)資料了解豬塞內(nèi)加谷病毒和LAMP技術(shù)相關(guān)知識(shí),由學(xué)生自主設(shè)計(jì)引物鍛煉了學(xué)生分析問(wèn)題、解決問(wèn)題的能力。在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,進(jìn)一步鞏固了核酸提取、反應(yīng)體系配制等分子生物學(xué)相關(guān)技能,提高了學(xué)生的動(dòng)手能力和團(tuán)隊(duì)協(xié)作能力。在課后的案例分析中,引導(dǎo)學(xué)生對(duì)臨床案例進(jìn)行分析討論,舉一反三,強(qiáng)化了科學(xué)分析能力并增強(qiáng)了學(xué)生自主學(xué)習(xí)的積極性。為后續(xù)專業(yè)課程的學(xué)習(xí)及日后就業(yè)打下了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。
目前《動(dòng)物疫病防控》實(shí)訓(xùn)內(nèi)容中的疫病實(shí)驗(yàn)室診斷側(cè)重于PCR方法、ELISA法和HA/HI實(shí)驗(yàn)進(jìn)行動(dòng)物疫病診斷,而臨床上已經(jīng)出現(xiàn)了一些新檢測(cè)技術(shù),LAMP技術(shù)在臨床應(yīng)用廣泛,將其應(yīng)用于《動(dòng)物疫病防控》課程,可以為學(xué)生提供一個(gè)相對(duì)真實(shí)的動(dòng)物疫病診斷環(huán)境,將理論和實(shí)踐結(jié)合起來(lái),對(duì)學(xué)生的應(yīng)變能力和技能熟練度要求較高,提高實(shí)踐動(dòng)手能力,在實(shí)驗(yàn)中考察學(xué)生檢測(cè)技能,從而提高學(xué)生的學(xué)習(xí)效率和教習(xí)效果。█