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α-地中海貧血融合基因檢測方法及應用評價*

2021-11-24 02:54:30鞠愛萍李友瓊李娜劉淑賢梁亮廣州市花都區(qū)婦幼保健院檢驗科廣州50800廣西壯族自治區(qū)人民醫(yī)院醫(yī)學遺傳與產(chǎn)前診斷中心廣西南寧500廣州市花都區(qū)炭步鎮(zhèn)中心衛(wèi)生院計劃免疫科廣州5080
臨床檢驗雜志 2021年10期
關鍵詞:融合檢測

鞠愛萍,李友瓊,李娜,劉淑賢,梁亮(.廣州市花都區(qū)婦幼保健院檢驗科,廣州50800;.廣西壯族自治區(qū)人民醫(yī)院醫(yī)學遺傳與產(chǎn)前診斷中心,廣西南寧500;.廣州市花都區(qū)炭步鎮(zhèn)中心衛(wèi)生院計劃免疫科,廣州5080)

地中海貧血(以下簡稱“地貧”)是一種常見的溶血性單基因隱性遺傳病,主要是由于珠蛋白基因缺陷導致珠蛋白鏈合成減少或缺如而引起的[1]。我國長江以南地區(qū),特別是廣西、廣東、云南、海南是該病的高發(fā)區(qū)[2-4]。目前臨床實踐中常規(guī)使用的檢測試劑盒,主要是針對中國人群的常見基因突變。導致地貧表型的α2珠蛋白融合基因于2013年首次報道[5],其人群分布尚不清楚,常規(guī)試劑盒常不包含該檢測位點,故此突變的臨床檢測是目前所面臨的一個具體問題。本研究采用臨床常規(guī)使用的缺口PCR(gap-PCR)、PCR-導流雜交法α-地貧基因檢測試劑盒以及Sanger一代測序技術,檢測2例α2珠蛋白融合基因樣本,探討當前分子診斷常規(guī)方法在α-地貧融合基因檢測中的應用。

1 對象和方法

1.1 研究對象 2例α2珠蛋白融合基因樣本來自廣州市花都區(qū)婦幼保健院婚育體檢者,其籍貫為廣州花都區(qū),漢族,既往體健,否認輸血史,無貧血貌,均簽署知情同意書。

1.2 標本采集與處理 分別采集2份2 mL靜脈血,EDTA-K2抗凝,1份用于血細胞和血紅蛋白電泳分析,另1份用于地貧基因分析。

1.3 表型分析 在確定儀器運行狀態(tài)良好、室內(nèi)質(zhì)控在控后,進行血細胞分析和血紅蛋白電泳。觀察紅細胞參數(shù)即血紅蛋白(Hb)、紅細胞平均體積(MCV)、紅細胞平均血紅蛋白含量(MCH);參考區(qū)間:Hb,女性110~155 g/L,男性120~160 g/L,MCV 80~100 fL,MCH 26~34 pg。血紅蛋白組分定量以電泳出所有條帶的峰值為100%,各個條帶所占的峰面積作為條帶的相對含量;參考區(qū)間:HbA 91.5%~98%,HbF 0~5%,HbA2 2.4%~3.5%。

1.4 地貧基因常規(guī)檢測 用gap-PCR法(深圳益生堂公司試劑盒)檢測中國人群常見的4種缺失型α-地貧(--SEA、--THAI、-α3.7、-α4.2)。用PCR-導流雜交法(廣州凱普公司試劑盒)檢測中國人群常見的3種缺失型(--SEA、-α3.7、-α4.2)和3種非缺失型α-地貧(Hb Constant Spring即Hb CS、Hb Westmead即Hb WS、Hb Quong Sze即Hb QS)。

1.5 α珠蛋白基因DNA測序 根據(jù)參考文獻[6]設計引物,進行α珠蛋白基因Sanger測序(委托廣州凱普生物公司)。上游引物序列為5′-GCGAGCGG GATGGGCGGGAGT-3′,下游引物序列為5′-TGAGT GCTGTGTTGACCTA-3′。擴增體系50μL(Qiagen公司產(chǎn)品),含5μL 10×PCR buffer,5μL Q-solution,2.5μL 25 mmol/L MgCl2,1.0μL 25 mmol/L dNTPs,1.5 U Taq polymerase,5 pmol上、下游引物。擴增條件:95℃15 min;97℃50 s,60℃1 min,72℃2 min,共35個循環(huán);72℃10 min。采用3500基因分析儀(美國Life公司)進行DNA測序。采用Vector NTI Advance 11分析軟件進行序列分析,將序列與NCBI上參考序列(NG_000006.1)進行比對。

2 結果

2.1 血液學表型 見表1。紅細胞參數(shù)(Hb、MCV、MCH)未見異常,血紅蛋白電泳分析未見異常條帶,HbA和HbA2結果均在參考區(qū)間內(nèi)。

表1 2例α-地貧患者血液學表型和基因型結果

2.2 地貧基因常規(guī)檢測 PCR-導流雜交法在-α4.2突變位點可見弱顯影,見圖1A;gap-PCR法未見異常條帶,見圖1B。

圖1 PCR-導流雜交法和gap-PCR法檢測結果

2.3 α珠蛋白基因DNA測序 α2珠蛋白基因測序結果顯示有7個突變位點,分別為nt34528T>C、nt34532A>C、nt34535G>A、nt34538C>A、nt34546G>A、nt34556A>G、nt34662T>C,見圖2,與報道的α2珠蛋白融合基因結果[5]一致。

圖2 Sanger測序α-地貧融合基因

3 討論

據(jù)報道,α2珠蛋白融合基因是在配子生成過程中,α2珠蛋白基因與Ψα1發(fā)生了片段重組[5,7],改變了α2珠蛋白基因的3′UTR,并引起了多聚腺苷酸信號突變,從而產(chǎn)生廣泛的α2珠蛋白基因轉錄本,引起α+-地貧。此融合基因的序列結構是α2珠蛋白基因中有一段序列與Ψα1一致,涉及7個差異堿基位點,故據(jù)此7個差異位點,從而實現(xiàn)此基因的準確檢測分析。

目前的地貧基因診斷臨床實踐中,未將α2珠蛋白融合基因納入檢測位點范圍;且其為α+-地貧基因,攜帶者通常為靜止型表型特征,這是α2珠蛋白融合基因文獻報道比較少的原因[5-6,8]。因此,α2珠蛋白融合基因的表型篩查和分子診斷是目前所面臨的難題之一。在當前此融合基因未納入常規(guī)檢測位點范圍的情況下,若有線索提示其可能存在,進而檢測確定,在某種程度上有一定的實際意義和應用價值。本研究發(fā)現(xiàn),用PCR-導流雜交法檢測2例樣本時,在-α4.2突變位點有弱顯影,顯色程度淡(圖1A),可能會誤判為-α4.2雜合子,但經(jīng)α-地貧缺失gap-PCR試劑盒復核時,未檢出缺失目的條帶,結果為-α4.2陰性(圖1B)。通過隨后的α2珠蛋白基因DNA測序顯示7個位點發(fā)生堿基置換,而確定為α2珠蛋白融合基因,與已有的報道結果一致[5]。經(jīng)序列比對分析,此差異位點位于缺失型α-地貧基因擴增體系中正常內(nèi)參序列范圍,很可能是此內(nèi)參序列與反向點雜交膜上的-α4.2突變位點探針發(fā)生了非特異雜交,從而導致PCR-導流雜交法-α4.2位點弱顯影,易誤判讀為-α4.2雜合子。由此可見,PCR-導流雜交法的結果判斷中,-α4.2突變位點的顯色程度須與對照位點基本一致才能判讀為-α4.2缺失突變;弱顯影則提示可能存在其他情況,如本研究中的α2珠蛋白融合基因。PCR-導流雜交法-α4.2位點弱顯影雖然可以提示可能存在α2珠蛋白融合基因,但需要通過基因測序來確證。

本研究中的2例患者均為雜合子狀態(tài),血液表型均未見異常,這提示α2珠蛋白融合基因引起的是α+-地貧,不會造成貧血。但根據(jù)文獻報道,α2珠蛋白融合基因合并--SEA時,可引起血紅蛋白H?。?],提醒我們在日常地貧篩查和基因診斷中需要注意。因為如果夫妻雙方的一方為α2珠蛋白融合基因,另外一方為輕型α地貧時,可能會有生育血紅蛋白H病患兒的風險。

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