文 /農委信
艾滋病為全世界范圍內嚴重公共衛生問題,依據國家衛健委網站消息得出,截止至2020年,全球艾滋病病毒感染者約有4000萬,每年新增艾滋病病毒感染者約為200萬。為此,早期檢出并配合相應阻斷治療,可有效降低艾滋病患病人數。同時,尋找一種有效生物標志將其用于早期艾滋病診斷具有十分重要意義[1]。長鏈非編碼RNA歸為一類不具有翻譯蛋白質功能、長度超出200個核苷酸的非編碼RNA(In-cRNA),廣泛參與機體內幾乎所有生理、病理過程,可在表觀遺傳、轉錄水平以及轉錄后水平等多個層面上調節基因表達。同時,In-cRNA被證實可穩定機體外周血,表達水平可作為疾病早期診斷、預后評價。研究指出[2],In-cRNA與HIV-1感染中作用關系緊密,對HIV-1感染患者外周血T細胞系中的In-cRNA改變,發現NEAT1在HIV-1感染靶細胞過程中發揮著重要作用,轉錄后調控病毒表達及活化,并證實與HIV-1感染關系密切。MALAT1又稱之為NEAT2,為迄今為止發現少數與病毒感染相關In-cRNA之一[3]。目前為止,IncRNA在HIV-1感染患者體內變化作用尚無報道。本文就HIV-1感染患者中兩種In-cRNA變化水平進行以下綜述,現報道如下。
NEAT1作為一種新的調控分子,NEAT1在固有免疫應答中發揮著重要調控作用。NEAT1為人類第11號染色體上的多發性內分泌瘤病I型轉錄位點轉錄而來。NEAT1基因主要編碼2個轉錄本,即NEAT1-1、NEAT1-2。2個轉錄本均位于亞核體paraspeckles,為共享相同啟動子,但具有不同的3,端處理機制。亞核體paraspeckles確切功能尚不清晰,對其研究得出,與黃體、乳腺形成及骨髓分化關系緊密。Paraspeckles內含有多種蛋白因子,包括SFPQ、p54nrb、RBN14和p54nrb,并參與到paraspeckles形成及形態位置,敲除或敲低NEAT1導致paraspeckles的分解[4]。Paraspeckles通過核保留RNA并調控基因表達,在其中發揮著至關重要作用。經過這種機制paraspeckles及其家族成員可在多個生物學過程中起著調控基因表達作用。
MALAT1編碼基因定位在染色體11q13.1,轉錄本序列長約8kb,歸屬為基因間轉錄本。在轉錄后水平,兩個內源RNA酶-Rnase P和Rnase Z可修飾MALAT1。初生的轉錄產物MALAT1在其多聚腺苷酸位點上游幾百堿基處形成tRNA樣三葉草二級結構,上述結果可被Rnase P特異識別,Rnase P結合三葉草結構后,可迅速與上游段剪切,形成大小為7072nt的MALAT1成熟轉錄本和近3,端小轉錄本兩個片段。小轉錄本被轉運至胞漿,經Rnase Z剪切加工,在CCA添加酶輔助作用下,其3,端加上CCA臂后可形成大小為61nt胞漿成熟tRNA樣轉錄本,稱之為Rnase Z-associated small cytoplasmic RNA,后續轉送至細胞質。研究指出[5],RNA轉錄后修復,通過剪切、加帽等可增加RNA功能多樣性,但masc RNA功能迄今未知。因此,對其功能上,無法將masc RNA與MALAT1聯系緊密。MALAT1的5,端未存在帽子結構,不參與蛋白質翻譯,3,沒有ploy尾,但其是一個非常穩定的IncRNA,最新研究得出,因3,末端形成三螺旋結構。研究指出[6],MALAT1 3,末端形成三螺旋結構,并保護MALAT1 3,端免受3,-5,核酸外切酶的剪切,并維持MALAT1完整性。
研究指出[7],NEAT1、NEAT2與惡性腫瘤發生、免疫應答調控、肺結核感染以及免疫系統疾病治療關系緊密,對其治療進程存在一定聯系。研究指出[8],在肺結核患者中,血清中NEAT1、NEAT2表達水平檢測,結果顯示,患者水平異常升高。研究指出[9],乳腺癌患者中NEAT1處于高表達狀態,且與腫瘤細胞增殖、集落形成關系緊密,表明NEAT1與乳腺癌發生相關。部分學者指出[10],對臨床HIV-1感染患者中,NEAT1水平同樣處于高表達水平,而NEAT1降低則促進病毒產生,主要機制是增加了HIV-1 mRNA從細胞核到胞質轉運及出核。當病毒載量較高的未接受治療HIV-1感染者中,NEAT1表達水平顯著高于正常水平,對接受治療且病毒復制被有效抑制的HIV-1感染者中,NEAT1表達水平接近正常水平,上述結果證實,HIV-1復制可促進靶細胞中NEAT1表達。MALAT1則作為最早發現與人類疾病相關聯Inc RNA之一,早期被廣泛用于非小細胞肺癌患者中。研究指出[11],對免疫系統疾病患者,當患者免疫力越低,則MALAT1表達異常增加,與疾病發展、轉歸相關,下調MALAT1表達能夠提高巨噬細胞清除病原菌能力。研究指出[12],對未接受治療HIV-1感染者中,MALAT1水平較高,對接受治療HIV-1感染者中水平偏低,血漿MALAT1水平改變不顯著。MALAT1同樣與其他病毒感染相關,如非典感染者肺組織中MALAT1高表達。目前對HIV-1感染者MALAT1高表達相關機制尚不明確,仍需進一步研究。
研究指出[13],NEAT1和 MALAT1在HIV-1感染中主要作用為抑制病毒RNA出核,對調控基因表達為Inc RNA的重要作用之一。因此,Inc RNA可能未參加HIV-1前病毒活化過程。目前相關研究指出[14],NEAT1、MALAT1與前病毒DNA有一定關系,與某些Inc RNA通過轉錄因子NFAT作用,間接調控HIV-1前病毒表達,進而指出,Inc RNA與HIV-1潛伏感染形成相關。目前所得出研究結果得出[15],NEAT1、MALAT1表達與HIV-1感染關系緊密,對疾病進展起著重要影響,但目前對其作用機制尚未完全闡明,仍需進一步深入分析。血漿NEAT1水平與CD4+T細胞數量呈現正相關,提示NEAT1水平可作為HIV-1感染某一個潛在生物學標志。由于目前臨床對NEAT1、MALAT1與HIV-1感染相關研究較少,對其結論尚無大數據支持,但多數研究得出,免疫性疾病、腫瘤疾病發生發展與NEAT1、MALAT1關系密切。
隨著國內檢驗學技術不斷發展,高通量測序及基因芯片技術應用,對基因診斷上應用越來越廣泛。目前In-cRNA指出與疾病發生、發展關系緊密。NEAT1、MALAT1表達異常與疾病形成關系緊密。但目前臨床多數研究僅在NEAT1、MALAT1表達與腫瘤疾病發生發展關系緊密。隨著后續對NEAT1、MALAT1表達相關研究不斷深入,并不斷拓展至免疫性疾病,HIV-1感染中,NEAT1、MALAT1在疾病進展中發揮一定作用,且血漿中NEAT1可作為潛在HIV-1感染病程進展生物標記物。