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結直腸癌患者Kras基因突變與分化程度及組織類型的相關性研究①

2022-03-24 01:37:40王海鵬朱襲嘉李盛國蔣世宇張琪琦
華夏醫(yī)學 2022年1期
關鍵詞:基因突變研究

,王海鵬 ,朱襲嘉,李盛國,蔣世宇,張琪琦

(桂林醫(yī)學院第二附屬醫(yī)院胃腸外科,廣西 桂林 54199)

結直腸癌,是腸道高發(fā)的惡行腫瘤之一,通常侵襲大腸,通常以腸壁息肉開始[1],是男性第三大常見癌癥,女性第二常見癌癥。KRAS基因是與人類腫瘤相關的RAS基因家族的成員。因為RAS蛋白編碼為21 kD[2],所以,KRAS也被稱為p21基因。目前,已經有多個研究表明,在結直腸癌患者中,KRAS基因的突變率最高[3],且在女性、中高分化患者中的突變率更高[4-5]。KRAS的第二號外顯子突變存在于45%的結直腸癌中,涉及到腫瘤的發(fā)生、增殖和進展及預后[6]。 KRAS的其他外顯子突變、NRAS等突變也占了10%的比例。 臨床研究證實,不論是西妥昔單抗、帕尼單抗,還是厄洛替尼、吉非替尼,都未能讓RAS突變的腸癌患者從EGFR靶點的靶向治療中受益。基于此,本研究分析結直腸癌患者的KRAS基因的突變情況及其潛在突變位點,為結直腸癌患者診療提供新的方向。

1 資料與方法

1.1 一般資料

選取2017年3月至2020年7月于桂林醫(yī)學院第二附屬醫(yī)院確診為結直腸癌患者89例,其中有26 例KRAS突變陽性患者,將其納入突變組;63 例KRAS突變陰性患者,將其納入未突變組。

納入標準:①術后病理學確診為結直腸癌;②術前檢查后 1 周內接受根治性手術治療,淋巴清掃至腸系膜血管根部,腸系膜下動脈選擇根部離斷或保留左結腸動脈分支后離斷,直腸遠切緣距腫瘤至少2 cm;③腫瘤邊緣≥5 cm行KRAS基因檢測。

排除標準:①有原發(fā)性直腸癌外的其他腹盆腔疾病或相關血管相關疾病(如門靜脈高壓、血管狹窄、血栓或發(fā)育變異);②合并嚴重糖尿病、高血壓、感染者;合并腎、心、肝、肺等臟器功能嚴重障礙者及患有其他惡性腫瘤患者;③臨床資料不完整。

本研究經桂林醫(yī)學院第二附屬醫(yī)院醫(yī)學倫理委員會審核批準后執(zhí)行。

1.2 方法

采用熒光定量PCRTaqman-ARMS探針法測定K-ras基因突變。①總RNA提取:將Trizol裂解組織的混合液收集至滅菌的1.5 ml EP管中,4 ℃、12 000 r/min、離心15 min,吸取上清液至另一滅菌的1.5 ml EP管中,并加入200 μl氯仿,蓋緊管蓋,劇烈充分震蕩15~30 s,至乳化充分,無分相現象。室溫靜置5 min,4 ℃、12 000 r/min、離心15 min,于上清液中加入500 μl異丙醇,并蓋緊管蓋,正反顛倒EP管,混勻。室溫靜置10 min,4 ℃、12 000 r/min、離心15 min。最后,去除EP管,仔細觀察管底部是否有微小的白色沉淀,此即總RNA。②用75 %乙醇洗滌RNA,去除上清液,小心沿管壁加入75 %乙醇1 ml/管,輕輕上下翻動EP管,使沉淀從管壁脫落,4 ℃、12 000 r/min、離心5 min,去除上清液,以濾紙吸干管口乙醇,開蓋晾干。加入DEPC水30 μl/管,溶解RNA,用紫外分光光度計測定OD260與OD280,并計算OD260與OD280比值,篩選比值在1.8~2.0的樣本用于后續(xù)實驗。RNA濃度計算:RNA濃度(μg/μl)=(OD260×40×稀釋倍數)/1 000。③配置RT-PCR反應液及瓊脂糖凝膠:首先安裝好制膠架和梳子,然后秤取瓊脂糖1.5 g,用100 ml電泳緩沖液溶解,微波爐中加熱2 min至沸騰,取出后冷卻至50 ℃左右,加入緩沖液,調節(jié)終濃度為0.5 μg/ml,最后將加入染料的瓊脂糖凝膠傾倒入制膠架內,室溫凝固20 min,垂直拔掉梳子,將瓊脂糖凝膠轉移至水平電泳槽內,加入電泳緩沖液,使液面與凝膠面齊平,梳子孔中充滿電泳緩沖液。將擴增產物按照5∶1加入6×上樣緩沖液,混勻,每孔加入5 μl進行電泳。電泳儀參數設定為80 V、60 min,恒壓電泳,電泳過程中隨時觀察溴酚藍電泳位置,跑至凝膠邊緣立即停止電泳。④測序反應及純化:向新的0.2 ml的EP管中加測序試液1 μl、酶解產物2 μl和引物2 μl 進行 PCR 擴增,擴增條件為96 ℃、1 min循環(huán) 1 次,96 ℃、10 s,50 ℃、5 s,60 ℃、2 min循環(huán) 25 次,25 ℃、1 min循環(huán)1 次。加醋酸鈉-乙醇混合物16 ul(醋酸鈉∶乙醇=1∶15)并劇烈震蕩,避光靜置15 min后4 ℃、12 000 r/min、離心30 min,去除上清液,加預冷70 %乙醇70 μl,劇烈震蕩,4 ℃、12 000 r/min、離心15 min后去除上清液。顛倒數次混勻后4 ℃、12 000 r/min、離心5 min后去除上清液。再次加預冷70 %乙醇70 μl,顛倒數次混勻后4 ℃、12 000 r/min、離心5 min后去除上清液,室溫放置30 min讓酒精揮發(fā)干凈,加入去離子甲酰胺溶解DNA。⑤PCR儀變性:95 ℃、4 min,4 ℃、4 min。向96孔板內移液,每孔加11 μl,避免孔內出現氣泡。

1.3 統(tǒng)計學方法

2 結果

2.1 突變組與未突變組一般資料均一性檢驗

突變組和未突變組的年齡分別為(57.12±8.40)歲、(58.71±9.02)歲;突變組26例,男12例,女14例;未突變組63例,男31例,女32例;突變組BMI(23.81±2.09 kg/m2),未突變組BMI(58.71±9.02 kg/m2);突變組病變部位:結腸癌18例,直腸癌8例;未突變組病變部位:結腸癌39例,直腸癌24例。比較突變組與未突變組臨床一般資料無顯著的統(tǒng)計學差異(P>0.05),資料有較好的可比性,見表1。

表1 一般資料均一性比較

2.2 KRAS基因突變與組織學類型的相關性分析

分析KARS基因突變與組織學類型的關系,發(fā)現突變組腺癌比例(80.77%)顯著高于未突變組腺癌比例(44.44%),且差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05),見表2。此外,分析腫瘤分化程度和KARS基因突變的關系,發(fā)現高分化、中分化和低分化的程度和突變與否有統(tǒng)計學差異(P<0.05),在突變組中中分化的比例較高,見表3。

表2 兩組不同組織學類型結直腸癌組織中KRAS基因突變分析(n,%)

表3 兩組不同分化程度結直腸癌組織中KRAS基因突變分析(n,%)

3 討論

結直腸癌是腸道高發(fā)的惡性腫瘤之一,也是繼肺癌之后人類最高發(fā)的癌癥種類[7],在世界范圍以北美洲及大洋洲地區(qū)多發(fā),在我國東南沿海地區(qū)常見。結直腸癌的發(fā)生發(fā)展與很多基因相關,如KRAS基因、RAS基因等。各種基因共同或單獨作用,影響結直腸癌的進程,如KRAS和PIK3CA雙突變與侵襲性臨床病理特征顯著相關[8]。CRC患者糞便中BRAF V600E突變及KRAS突變與腫瘤的位置、組織病理及分化程度也有顯著關系[9]。KRAS蛋白為單聚體G蛋白,其磷酸化可導致PI3K-PDK1-PKB和RAF-MEK-MRK1/2信號通路的激活,一般認為KRAS突變是結直腸癌形成的早期。有研究已證實,β-catenin和Cyclin D1兩種蛋白在KRAS突變型結直腸癌樣本中的表達水平非常高,且抑制β-catenin表達后KRAS突變型結直腸癌細胞的增殖也降低,這促進了細胞的凋亡[10]。也有研究表明,KRAS基因突變與性別、分化程度有關,NRAS基因突變與分化程度、腫瘤類型有關[4]。而結直腸癌中hMSH2表達缺失對KRAS基因突變也有一定影響[11]。KRAS基因突變不僅可以為診斷結直腸癌提供幫助,也會影響EGFR抑制劑在臨床上的作用,用KRAS StripAssay檢測結直腸癌患者KRAS突變是一種新型的有效方法[12]。

KRAS基因突變的結直腸癌患者中,約85%~90%的突變集中在第2號外顯子的12、13密碼子上[13],其余突變中約5%發(fā)生在61密碼子上,5%發(fā)生在146外顯子上[14]。KRAS基因突變與PD-L1表達有相關性[15]。研究表明,有28.7%的CRCs存在密碼子12和13的KRAS突變,密碼子12上甘氨酸-天門冬氨酸突變(p.G12D)和密碼子13上甘氨酸-天門冬氨酸突變(p.G13D)是最常見的突變類型[16]。相關研究結果顯示,KRAS基因在結直腸癌中患者的突變率為20%~50%[5]。也有相關文獻報告[17],KRAS基因突變與結直腸癌pTNM分期密切相關。由此可見,KRAS基因突變與結直腸癌密切相關,而KRAS基因突變與很多因素都有直接或間接的關系[18]。

本研究中,通過篩查結直腸癌患者,檢測出26例KRAS基因突變,提示KRAS在結直腸癌發(fā)生和進展中的重要性。通過選取的臨床病例統(tǒng)計發(fā)現,腫瘤高、中、低分化程度及pTNM分期與KRAS突變情況有顯著統(tǒng)計學差異,也有一些報告與本研究結果類似[9]。然而通過比對發(fā)現,KRAS突變組腺癌比例顯著高于未突變組,且具有統(tǒng)計學差異。相較于黏液腺癌,腺癌發(fā)生KARS基因突變的比例更高,說明KARS基因突變的患者更容易出現腺癌而非黏液腺癌。既往有研究證明,在許多結直腸腺瘤組織中也可以檢測到KRAS基因突變,這說明KRAS基因突變先于腫瘤發(fā)生之前,這也解釋了本研究結果的科學性。此外,本研究結果提示,腫瘤發(fā)生前的KRAS基因突變檢測,能為癌前患者作出風險評估,起到提前預防的效用。

綜上所述,KRAS基因突變與結直腸癌組織學類型和分化程度有一定相關性。本研究后續(xù)通過隨訪結直腸癌患者,對KRAS基因可能突變位點與突變率進行分析,這將有助于開展臨床個體化精準治療,提升患者的預后及生活質量[19]。

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