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蘿卜乙烯合成途徑基因的鑒定及對脅迫的響應

2022-05-24 08:20:22劉同金徐銘婕崔群香張愛慧包崇來王長義
西北植物學報 2022年4期
關鍵詞:途徑生物植物

劉同金,徐銘婕,崔群香,張愛慧,包崇來,王長義*

(1 金陵科技學院 園藝園林學院, 南京 210038;2 浙江省農業科學院 蔬菜研究所, 杭州 310021)

乙烯是一種重要的氣體植物激素,廣泛存在于植物的各種組織和器官。乙烯在植物生長發育和環境適應過程中發揮重要作用,不僅參與種子萌發、根毛發育、抽薹開花、果實軟化和成熟、器官衰老和脫落等植物生長發育過程[1],也參與了植物對細菌、真菌、病毒、線蟲和昆蟲等生物脅迫的響應[2],及機械損傷、低氧、冷害和凍害、水分脅迫、鹽脅迫等非生物脅迫的響應[3-4]。因此,乙烯的內源產生和信號轉導途徑得到研究者的廣泛關注和深入研究。

乙烯生物合成起始于甲硫氨酸,在S-腺苷甲硫氨酸合成酶(S-adenosylmethionine synthesis,SAMS)催化下生成S-腺苷甲硫氨酸(SAM)。SAM是植物體內乙烯、精胺/亞精胺等生物合成途徑主要的甲基供體,由ACC合酶(ACC synthesis,ACS)催化生成氨基環丙烷羧酸(1-aminocyalopropane-1-carboxylate,ACC)和5′-甲硫酰苷,前者進行乙烯合成,而后者則進入甲硫氨酸循環途徑重新合成甲硫氨酸。ACC在ACC氧化酶(ACC oxidase,ACO)的催化下產生乙烯[1]。植物中SAMS、ACS和ACO均由多基因家族編碼。

SAMS也被稱為蛋氨酸腺苷轉移酶(methionine adenosyltransferase,MAT),烏拉爾圖小麥(Triticumurartu)、水稻(OryzasativaL.)和高粱[Sorghumbicolor(L.) Moench]基因組中各有3個MAT,擬南芥(Arabidopsisthaliana)、番茄(Lycopersiconesculentum)、茄子(SolanummelongenaL.)和大麥(HordeumvulgareL.)基因組中各有4個MAT,而蒺藜苜蓿(Medicagotruncatula)、向日葵(HelianthusannuusL.)和大豆[Glycinemax(Linn.) Merr.]基因組中分別有5、7和9個MAT基因[5]。研究表明MAT基因參與了植物對多種脅迫的響應。低溫、ABA、H2O2和NO等非生物脅迫顯著誘導紫花苜蓿MfSAMS1上調表達,在煙草中過表達該基因顯著提高了其耐寒性[6]。番茄中MAT不同成員對非生物脅迫和外源激素處理的響應不同[5]。

ACS是乙烯生物合成的限速酶,ACO催化乙烯生物合成的最后一步,二者的活性影響植物體內乙烯的含量。擬南芥基因組上分別有12個ACS基因(AtACS1-12)[7]和5個ACO基因(AtACO1-5)[8]。AtACS3是假基因,ACS10和ACS12特異的對天冬氨酸和芳環氨基酸進行氨基轉移,其余9個AtACS具有催化ACC生物合成的功能[7]。研究表明,ACS和ACO基因在植物生長發育、抵抗生物和非生物脅迫過程中起重要作用。梨(Pyrusspp.)基因組中分別有13個ACS和11個ACO基因,其中2個ACS和3個ACO在果實中不表達,4個ACS和3個ACO被乙烯利誘導顯著上調表達,且1-甲基環丙烯(1-MCP)顯著抑制其表達[9]。乙烯利、茉莉酸甲酯、水楊酸和低溫顯著誘導匍匐翦股穎ACO上調表達,而干旱和NaCl處理抑制其表達[10]。過表達ACO顯著提高了轉基因擬南芥的耐水淹能力[11]。

蘿卜是中國重要的蔬菜作物,其生長發育過程中可能遭受營養元素缺乏、病蟲危害、極端溫度等生物和非生物脅迫。乙烯及其參與的信號轉導途徑在植物品質形成、抵抗多種生物和非生物脅迫過程中起重要作用[11]。本研究在全基因組水平對蘿卜乙烯合成途徑MAT、ACS和ACO基因家族成員進行鑒定,分析其啟動子包含的順式作用元件,并分析其在蘿卜不同組織中的表達及對生物和非生物脅迫的響應,為其生物學功能的解析奠定基礎。

1 材料和方法

1.1 材 料

以‘北京心里美’蘿卜種子為供試材料,經10%次氯酸鈉消毒后置于28 ℃恒溫箱中避光催芽24 h。出芽后播種于10×10 cm育苗缽,于光照培養箱(16 h光照,22 ℃;8 h黑暗,20 ℃)中培養至三葉一心期,分別澆灌1.5% NaCl、20% PEG、2% 葡萄糖、2%果糖和2%蔗糖溶液,以蒸餾水處理為對照。每個處理8株,3次生物學重復。處理3 h后用蒸餾水將根系洗凈,擦干后于液氮速凍后置于-80 ℃冰箱中保存。

1.2 方 法

1.2.1MAT、ACS和ACO基因家族成員鑒定與蛋白理化性質分析由TAIR網站(http://arabidopsis.org/)下載擬南芥MAT、ACS和ACO基因家族成員的核苷酸序列,在XYB36-2蘿卜基因(https://www.ncbi. nlm.nih.gov/assembly/GCA_002197605.1/)[12]中執行本地BlastN(E-value=10-5),獲得蘿卜MAT、ACS和ACO基因家族成員的候選序列;將其在TAIR 數據庫中進行BlastN搜索,最終篩選分別獲得蘿卜MAT、ACS和ACO基因家族成員序列。利用ExPASy(http://web.expasy.org/protparam/)對蘿卜MAT、ACS和ACO蛋白的分子量、等電點等理化性質進行預測和分析。

1.2.2 染色體定位分析根據XYB36-2蘿卜參考基因組注釋文件確定MAT、ACS和ACO基因的染色體位置信息,使用MapInspect軟件進行染色體定位作圖。

1.2.3 系統發育樹構建擬南芥MAT、ACS和ACO蛋白質序列由TAIR網站(http://arabidopsis.org/)下載,水稻MAT、ACS和ACO蛋白質序列下載于MBKbase網站(http://mbkbase.org/R498/)[13],并根據Heidari等[5]、Houben等[8]和Xu等[14]報道進行命名。使用MEGA5.05的ClustalW進行序列比對,鄰接法(NJ,Neighbor-Joining)構建系統發育樹,Bootstrap設為1 000次。

1.2.4 啟動子順式作用元件分析利用TBtools軟件(https://github.com/CJ-Chen/TBtools/releases)[15]提取蘿卜MAT、ACS和ACO基因起始密碼子上游1 500 bp序列作為啟動子區域,通過PlantCARE網站(http://bioinformat ics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)的Search for CARE工具進行順式作用元件的預測。

1.2.5MAT、ACS和ACO基因轉錄組表達分析根據前人發表的XYB36-2蘿卜芽期、破肚期、膨大前期、膨大盛期和成熟期共5個不同發育時期的肉質根和5個不同組織(薹、愈傷組織、花、葉和角果)的轉錄組數據[16-17],分析MAT、ACS和ACO在蘿卜不同組織中的表達;利用Tkachenko等[18]報道的抗、感根癌農桿菌蘿卜自交系接種根癌農桿菌7 d后下胚軸的轉錄組數據,分析MAT、ACS和ACO對生物脅迫的響應;利用前人報道的鎘脅迫(0.876 mmol/L CdCl2·2.5H2O)、鉻脅迫(600 mg/L K2Cr2O7)和鉛脅迫[1 000 mg/L Pb(NO3)2]蘿卜根的轉錄組數據,分析MAT、ACS和ACO對重金屬脅迫的響應[19-21];利用4 ℃低溫處理3 d的蘿卜幼苗轉錄組數據分析MAT、ACS和ACO對冷脅迫的響應[22]。轉錄組表達數據經log2均一化處理后,利用TBtools軟件進行表達熱圖的繪制[15]。

1.2.6MAT、ACS和ACO基因熒光定量PCR(qRT-PCR)表達分析使用華越洋生物科技有限公司的通用植物RNA提取試劑盒進行總RNA的提取,使用天根生化科技有限公司的FastKing RT Kit(With gDNase)反轉錄成cDNA。qRT-PCR采用TaKaRa公司的SYBR Green qPCR試劑盒,體系和反應程序參見試劑盒說明書。引物序列見表1,以GAPDH作為內參,生物學和技術重復均為3次,采用2-ΔΔCT方法進行相對定量分析。使用SPSS17.0軟件進行顯著性分析,并利用Excel繪圖。

表1 本實驗所用引物

2 結果與分析

2.1 蘿卜MAT、ACS和ACO基因家族成員鑒定與蛋白理化性質分析

利用生物信息學方法,在蘿卜基因組中分別鑒定出8個RsMAT、16個RsACS和7個RsACO基因(表2),其CDS序列全長分別為1 173~1 182、1 017~1 656和933~966 bp,分別編碼390~393、338~551和310~321個氨基酸,RsMAT和RsACO基因序列長度比較保守,RsMAT和RsACS序列長度顯著大于ACO。RsMAT、RsACS和RsACO基因家族成員蛋白分子量分別為42.54~43.2、38.58~60.03和35.40~36.47 kD,理論等電點分別為5.36~6.08、5.19~8.21和4.96~7.83,親水性分別為-0.333~-0.243、-0.361~0.122和-0.575~-0.459,脂肪指數分別為80.08~84.05、81.11~91.88和74.04~81.03。

表2 蘿卜與擬南芥MAT、ACS和ACO基因家族成員信息

2.2 蘿卜MAT、ACS和ACO基因的染色體定位

參考XYB36-2基因組的注釋信息將乙烯生物合成途徑的30個基因定位于蘿卜的8條染色體,1個基因(RsACO1.1)定位于Scaffold2443(圖1)。它們在染色體上的分布十分不均勻,1、2和9號染色體上各分布有5個,3和4號染色體各分布有4個,5和6號染色體各有3個,7號染色體上有1個,而8號染色體上無MAT、ACS和ACO分布。染色體定位分析(圖1)未發現蘿卜MAT、ACS和ACO基因存在串聯重復,其基因數目的增加是由于蘿卜基因組多倍化的結果。

左側比例尺表示染色體長度圖1 蘿卜MAT、ACS和ACO基因在染色體上的分布The scale on the left provides the relative length of chromosomeFig.1 The distribution of MAT, ACS and ACO genes on radish chromosomes

2.3 蘿卜MAT、ACS和ACO的系統進化分析

利用蘿卜(Rs)、擬南芥(At)和水稻(Os)的MAT、ACS和ACO蛋白質序列構建系統進化樹,結果可將其分別分成3類。MAT家族第Ⅰ類群包括3個RsMAT、2個AtMAT和全部的OsMAT,第Ⅱ類群為AtMAT4、RsMAT4.1和RsMAT4.2,第Ⅲ類群為AtMAT3及其在蘿卜中的3個同源基因(圖2,A)。蘿卜、擬南芥和水稻ACS(圖2,B)以及ACO(圖2,C)家族成員在3個類群中均有分布。ACS和ACO的編碼基因在3個物種雖然基因數目有較大差異,但在3個類群中均有成員分布,表明ACS和ACO進化上比MAT保守,可能不同類群的成員在植物生長發育過程中發揮不同的功能。

圖2 蘿卜(Rs)、擬南芥(At)和水稻(Os)的MAT(A)、ACS(B)和ACO(C)系統進化樹Fig.2 Phylogenetic tree for MAT (A), ACS (B) and ACO (C) of radish (Rs),Arabidopsis thaliana (At) and rice (Os)

2.4 蘿卜MAT、ACS和ACO基因的啟動子順式作用元件分析

為了解蘿卜MAT、ACS和ACO基因的表達調控機制,對其啟動子序列進行順式作用元件預測,3個基因家族分別發現39、41和38類順式作用元件(圖3)。蘿卜MAT、ACS和ACO基因啟動子中含有23種與光響應相關的順式作用元件。除RsACO1.1和RsACO3,其余基因啟動子中均至少含有一種響應植物激素的順式作用元件。本研究還發現蘿卜乙烯生物合成途徑基因啟動子中存在多種響應生物及非生物脅迫的順式作用元件,如響應脫水、低溫和干旱的DRE元件,響應低溫的LTR和干旱的MBS元件,厭氧誘導的ARE和GC-motif元件,以及參與抗性和脅迫響應的TC-rich repeats。推測蘿卜乙烯合成途徑基因參與了其對生物和非生物脅迫的響應。此外,部分基因啟動子區還有ATBP-1和MYBHv1結合位點,分生組織、種子和胚乳特異表達的順式作用元件,及響應晝夜節律和細胞周期的元件,表明蘿卜部分MAT、ACS和ACO基因表達可能具有時空特異性。

圖3 蘿卜MAT、ACS和ACO基因啟動子區域順式作用元件的種類及數目Fig.3 The types and number of cis-acting elements in the promoter regions of the MAT,ACS and ACO genes in radish

2.5 蘿卜MAT、ACS和ACO基因的組織表達分析

利用轉錄組數據對其在肉質根的5個不同發育時期,以及葉片、薹、花、角果和愈傷組織中的表達進行了分析,根據表達趨勢進行聚類分析將31個乙烯合成途徑基因分為3類:第一類包含蘿卜MAT2.1、MAT2.2、MAT3.1、MAT3.2、MAT3.3、MAT4.1、MAT4.2、ACS6.1和ACO2共9個基因,這些基因在不同組織中的表達量均較高;第二類包含蘿卜ACS1、ACS2、ACS4、ACS5.1、ACS5.2、ACS5.3、ACS7.1、ACS7.2、ACS8、ACS9、AACS11、ACS12.2和ACO1.2共13個基因,這些基因在不同組織中的表達量均較低;第三類包含蘿卜MAT1、ACS6.2、ACS10、ACS12.1、ACO1.1、ACO3、ACO4、ACO5.1和ACO5.2共9個基因,這些基因呈現組織或發育時期特異性表達(圖4)。

ESS.芽期;SS.破肚期;EES.膨大前期;RES.膨大盛期;MS.成熟期。圖例表示標準化的FPKM值。紅色表示高表達水平,白色表示低表達水平,下同圖4 蘿卜MAT、ACS和ACO基因的組織表達模式ESS. Seedling stage; SS. Splitting stage; EES. Early expanding stage; RES. Rapid expanding stage; MS. Mature stage. Legends represent the normalized FPKM values. Red means high expression level, while white means low expression level, the same as belowFig.4 The expression profiles of radish MAT, ACS and ACO gens in various tissues

2.6 蘿卜MAT、ACS和ACO基因對生物脅迫的響應

為明確蘿卜MAT、ACS和ACO基因對生物脅迫的響應,利用轉錄組數據比較了其在抗、感根癌農桿菌蘿卜高代自交系接種A.tumefaciens7 d后下胚軸中的表達情況(圖5)。接種后,蘿卜MAT基因在抗病材料中除MAT1外均上調表達,而感病材料除MAT4.1和MAT4.2外均下調表達。抗病蘿卜ACS2、ACS7.1和ACS7.2受A.tumefaciens侵染顯著上調表達;而感病材料ACS4、ACS6.2、ACS8和ACS11顯著上調表達。抗、感蘿卜RsACO基因對A.tumefaciens侵染的響應不同,抗病材料ACO1.1、ACO1.2和ACO4受其侵染顯著上調表達,其余基因的表達水平無顯著變化;而感病材料中除ACO5.2在其侵染前后差異不顯著、ACO5.1顯著上調表達外,其余成員均顯著下調表達。

Line_18和Line_19分別為抗和感根癌農桿菌蘿卜高代自交系。CK和T分別表示接種LB培養基和根癌農桿菌7 d后的樣品圖5 抗和感根癌農桿菌蘿卜接種根癌農桿菌7 d 后下胚軸MAT、ACS和ACO基因的表達Line_18 and Line_19 is resistance and susceptible radish inbred lines to A. tumefaciens, respectively. CK and T represent 7 d after incubated with LB medium and A. tumefaciens, respectivelyFig.5 The expression profiles of MAT, ACS and ACO genes in 7 d after incubated with A. tumefaciens in radish hypocotyls

2.7 蘿卜MAT、ACS和ACO基因對非生物脅迫的響應

圖6顯示,重金屬脅迫均顯著抑制RsMAT1、RsACO5.1的表達,促進RsMAT4.2、RsACO1.1和RsACO4的表達;鉛和鎘處理誘導RsMAT3.2和RsACO2上調表達,但鉻誘導其下調表達;此外,鎘顯著誘導RsACS6.1、鉛顯著誘導RsACO3上調表達(圖6,A)。4 ℃低溫處理顯著抑制RsMAT2.1、RsMAT2.2、RsMAT4.1、RsACO1.1和RsACO5.2的表達(圖6,B)。

CK.對照;T1.鉛脅迫;T2.鎘脅迫;T3.鉻脅迫;RT.室溫處理;VE.4 ℃處理3 d圖6 重金屬(A)和低溫(B)脅迫對蘿卜MAT、ACS和ACO基因表達的影響CK. Control; T1. Lead stress; T2. Cadmium stress; T3. Chromium stress; RT. Room temperature treatment; VE. 4 ℃ for 3 d treatmentFig.6 The expression profiles of MAT, ACS and ACO genes in radish with heavy metal (A) and low temperature (B) stress

同時,選取轉錄組分析獲得的響應生物和非生物脅迫顯著上調或下調表達的11個基因,通過qRT-PCR方法研究其對1.5% NaCl和20% PEG-6000兩種非生物脅迫的響應(圖7)。所有樣品中均未檢測到RsMAT1表達,其余基因響應一種或多種處理表達量發生顯著變化。NaCl和PEG-6000處理均顯著抑制RsMAT4.1和RsACO4的表達,但顯著促進RsACO5.1和RsACO5.2的表達。此外,NaCl處理還誘導RsMAT2.2、RsMAT4.2、RsACS2和RsACS6.1顯著上調表達,RsACO1.1顯著下調表達,但對RsMAT2.1表達無顯著影響;PEG-6000處理還顯著抑制RsMAT2.1和RsMAT4.2的表達。

另外,為了解糖是否參與對上述差異表達的基因的調控,利用qRT-PCR分析了葡萄糖、果糖和蔗糖處理對上述差異表達基因的影響,發現3種糖處理均顯著抑制RSMAT2.1、RSMAT2.2、RSMAT4.1和RSMAT4.2的表達;均誘導RSACO5.1和RSACO5.2顯著上調表達;但對RsACS2和RsACS6.1表達無顯著影響(圖8)。此外,葡萄糖和果糖處理顯著促進RSACO1.1的表達,但蔗糖對其表達無顯著影響;果糖顯著促進、蔗糖顯著抑制RSACO4的表達,但葡萄糖對其表達無顯著影響。

不同小寫字母表示基因表達量在處理間存在顯著差異(P<0.05),下同圖7 蘿卜MAT、ACS和ACO基因響應NaCl和PEG-6000脅迫的qRT-PCR分析Different lowercase letters indicate significant difference in gene expression among treatments (P<0.05), the same as belowFig.7 The expression profiles of MAT, ACS and ACO genes in radish response to NaCl and PEG-6000 treatment by qRT-PCR

圖8 蘿卜MAT、ACS和ACO基因響應葡萄糖、果糖和蔗糖處理的qRT-PCR分析Fig.8 The expression profiles of MAT, ACS and ACO genes in radish response to glucose,fructose and sucrose treatments by qRT- PCR

3 討 論

本研究基于XYB36-2蘿卜參考基因組數據[12],采用生物信息學分析方法,在蘿卜基因組中共鑒定出8個RsMAT、16個RsACS和7個RsACO基因。RsMAT基因家族成員數目多于烏拉爾圖小麥、水稻和高粱(各3個)、擬南芥、番茄、茄子和大麥(各4個)、向日葵(7個)和蒺藜苜蓿(5個),但少于大豆(9個)[5];RsACS基因家族成員數目多于黃瓜(8個)[23]、甜瓜(11個)[24]、擬南芥(12個)[7]、梨(13個)[9]和香蕉(MusananaLour.,14個)[25],但少于蘋果(MaluspumilaMill.,19個)[26];RsACO基因家族成員數目多于擬南芥(5個)[8],與番茄、蘋果和水稻中數目一致[8],但少于梨(11個)[9]中相應基因家族成員數目。蘿卜MAT2、MAT3、MAT4、ACS5、ACS6、ACS7、ACS12、ACO1和ACO5在基因組有2~3個拷貝,而其余基因均為單拷貝,表明蘿卜MAT、ACS和ACO基因家族成員在基因組多倍化之后均出現了基因丟失。

本研究發現蘿卜MAT、ACS和ACO基因啟動子序列中含有與光響應相關的順式作用元件最多,其次是與植物激素、生物及非生物脅迫響應相關的順式作用元件。趙薇等[24]發現甜瓜ACS基因啟動子序列中,主要含有參與防御和脅迫響應的順式作用元件和參與響應各種激素的順式調控元件。Wang等[27]對12種陸生植物ACO基因啟動子進行分析發現光響應元件數目最多,推測其可能參與了光調控途徑;此外也包含大量的植物激素、生物和非生物脅迫及生長發育相關元件。前人多項研究均表明乙烯與其他植物激素均有交叉作用,共同影響植物生長發育及對生物和非生物脅迫的響應[28],本研究同樣發現乙烯合成途徑基因啟動子含有響應脫落酸、生長素、赤霉素、水楊酸、茉莉酸甲酯的順式作用元件。上述結果表明,不同植物中乙烯合成途徑基因家族成員的表達調控可能具有一定的相似性。本研究發現多數基因的表達和該基因啟動子的順式作用元件的種類有顯著關系,如本研究鑒定的31個蘿卜乙烯合成途徑基因啟動子至少含有一個響應光照的順式作用元件,組織表達分析也發現多個基因在葉片中具有較高的表達量;但二者也并非完全對應,如RsACS4啟動子中雖然含有多達16個(9類)參與光響應的順式作用元件,但該基因在本研究所分析的組織中不表達或表達量很低。

在進化過程中,不同物種的同源基因多數保留了相同或相似的生物學功能,基因的表達模式也往往與其功能密切相關。本研究通過分析蘿卜不同組織的轉錄組數據發現:蘿卜MAT2.1/2.2/3.1/3.2/3.3/4.1/4.2、ACS6.1和ACO2在不同組織中的表達量均較高,推測這些基因可能是維持植物正常生長發育所必需的。前人的研究也表明MAT催化甲硫氨酸和三磷酸腺苷反應生成的S-腺苷甲硫氨酸[29],不僅參與植物乙烯合成途徑,還是主要的甲基供體以及生物素和多胺合成的前體物質[30],此外還具有轉氨基[31]和硫基[32]的作用,是維持植物生長發育所必需的。ACO1.1/3/4/5.1呈組織或發育時期特異性表達,這些基因可能參與植物特定生長發育階段或特定組織器官的發育。擬南芥ACO1主要在根中表達,其缺失突變體根毛數量顯著增加[33],本研究發現其蘿卜同源基因在破肚期、膨大前期、膨大盛期表達量較高,可能調控蘿卜根毛的發育。RsACO3在花和角果中的表達量最高,RsACO5.1在蘿卜肉質根尤其是成熟期表達量最高。研究表明,抑制植物內源ACO表達可抑制乙烯合成而延遲花器官衰老[34],果實成熟過程中普遍伴隨乙烯含量的增加,因此推測RsACO3和RsACO5.1可能分別控制花和角果、肉質根乙烯合成,進而調控其衰老和成熟,其具體生物學功能有待進一步的功能驗證。

前人研究發現植物中存在大量響應生物脅迫的ERF型轉錄因子,ERF轉錄因子通過響應乙烯信號轉導途徑而調控下游基因的表達,進而提高植物對生物脅迫的抗性[4]。郝麗芬等[35]研究表明,油菜乙烯合成途徑基因被黑脛病菌侵染強烈誘導表達。本研究也發現,A.tumefaciens侵染誘導抗根癌農桿菌的蘿卜中多數MAT和ACO基因上調表達而感病材料下調表達,表明乙烯合成通路基因在蘿卜對生物脅迫的響應過程中發揮重要作用。本研究發現,低溫處理顯著抑制乙烯生物合成途徑基因的表達。前人研究結果也表明,低溫處理顯著抑制了蘋果果實[36]和水稻植株[37]乙烯的合成,過表達乙烯合成基因或外施ACC會提高乙烯含量進而降低植物的耐寒性[4]。鄧麗等[38]也發現短時間4 ℃低溫抑制溶質型桃果實內源乙烯的釋放。本研究還發現同一基因的不同拷貝可能參與不同非生物脅迫的響應。4 ℃低溫處理顯著抑制RsMAT4.1的表達,重金屬脅迫促進了其另一個拷貝RsMAT4.2的表達;重金屬脅迫和4 ℃低溫處理分別抑制RsACO5.1和RsACO5.2的表達。前人研究也發現,擬南芥MAT4受生物脅迫顯著上調表達,而響應非生物脅迫顯著下調表達[5];擬南芥ACS基因家族不同成員受不同因素的調節[39-40],與本研究結果一致。前人研究發現鎘脅迫通過上調擬南芥ACO2和ACO4、ACS2和ACS6的表達而促進乙烯的合成[41],本研究結果與之一致,但值得注意的是,RsACS6受鉛和鉻脅迫、RsACO2受鉻脅迫顯著下調表達。上述基因在植物抵御生物和非生物脅迫中的功能有待深入研究。糖作為一種信號分子和滲透調節物質廣泛參與植物對脅迫的響應,低濃度外源蔗糖能緩解干旱對水稻種子的萌發的抑制作用[42],NaCl脅迫增加了流蘇幼苗葉片可溶性糖含量[43],外源糖處理顯著影響乙烯合成途徑基因的表達[44],本研究通過qRT-PCR對發現,除RsMAT2.2外,其余9個基因響應蔗糖和PEG-6000處理的表達趨勢一致;除RsMAT2.2和RsACO4外,其余8個基因響應果糖和PEG-6000處理的表達趨勢一致。表明果糖和蔗糖可能參與了蘿卜對PEG-6000脅迫的響應。

本研究通過對蘿卜MAT、ACS和ACO基因的全基因組鑒定及表達分析,為進一步探討這些基因的生物學功能奠定了基礎。

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