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水生棲熱菌漆酶TaLac的性質分析及對孔雀石綠染料的脫除

2022-06-09 08:48:10毛國濤王杰王凱王方園曹樂言張宏森宋安東
生物技術通報 2022年4期

毛國濤 王杰 王凱 王方園 曹樂言 張宏森 宋安東

(河南農業大學生命科學學院,鄭州 450002)

漆酶(laccase,EC 1.10.3.2)屬于藍色多銅氧化酶家族,可氧化多種酚類和非酚類化合物,同時將氧氣還原為水,無其他副產物的生成[1-2]。漆酶含有保守的組氨酸殘基,結合4個銅原子,參與底物的氧化[2-3]。由于其底物的寬泛性和綠色催化特性,漆酶被廣泛應用于紙漿的漂白、生物質的預處理、酚類污染物的降解以及合成染料的脫色和脫毒等方面[3-5]。孔雀石綠(malachite green,MG)是一種人工合成的三苯甲烷類化合物,廣泛應用于紡織品、皮革、紙張等的染色,以及魚類真菌、寄生蟲等感染的防治[6]。但MG具有致畸、致癌、致突變等毒害作用,MG的濫用和排放嚴重威脅人類健康[7]。研究表明漆酶可有效降解MG,使MG脫色,顯著降低MG對微生物、植物和動物等的毒害作用[8-10]。

漆酶廣泛存在于植物、動物、細菌和真菌中,其中細菌漆酶因其易重組表達、良好的溫度耐受性而受到越來越多的研究[3]。2006年,一個新的細菌漆酶家族DUF152被鑒定出來[11]。該家族漆酶的分子量約為30 kD,遠小于經典漆酶(60-100 kD);且DUF152家族漆酶中不含有保守的經典漆酶銅原子結合位點[11]。但 DUF152 家族漆酶對 2,2′-聯氮雙(3-乙基苯并噻唑啉 -6-磺酸)(2,2′-azinobis(3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonic acid),ABTS)、2,6-二甲基苯酚(2,6-dimethylphenol,DMP)等經典漆酶底物具有催化活性[11-13]。已鑒定DUF152家族漆酶RL5、Tfu1115、LaclK均具有優異的熱穩定性,且能夠降解多種合成染料如乙基紫、堿性藍B和亞甲基藍[11-13]。DUF152家族漆酶對MG的脫色和脫毒性質仍待進一步探究。本研究通過在大腸桿菌過量表達來源于水生棲熱菌(Thermus aquaticus)的DUF152家族漆酶TaLac,利用Ni親和層析法純化得到高純度的TaLac蛋白,表征TaLac的最適pH、最適溫度等酶學性質,探究TaLac對MG脫色和脫毒的能力,為構建MG污染水體的生物修復體系提供理論依據。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 質粒與菌株 表達載體pET-28a(+)、大腸桿菌BL21(DE3)為河南農業大學能源微生物實驗室保存。

1.1.2 主要試劑 酵母提取物和胰蛋白胨購于英國OXID公司;卡那霉素、異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(isopropyl-β-D-Thiogalactoside,IPTG)、NaH2PO4、Na2HPO4、咪唑、醋酸、NaNO3和三(羥甲基)氨基甲烷(Tris)均購于索萊寶(北京)科技有限公司,分析純;Ni親和介質購于德國Qiagen公司;限制性內切酶Nde I和Xho I購自美國NEB公司;ABTS、DMP、愈創木酚(guaiacol)、L-多巴胺(L-dopamine,DPA)和丁香醛連氮(syringaldazine,SGZ)等購自Sigma公司。

1.2 方法

1.2.1 TaLac的生物信息學分析 用ExPASy在線服務器ProtParam(https://web.expasy.org/protparam/)工具分析TaLac蛋白的基本性質;利用Clustal Omega對TaLac與同源蛋白進行序列比對[14];利用Swiss Model預測 TaLac的三級結構[15]。

1.2.2 重組表達載體pET28a-TaLac的構建 編碼TaLac(WP_003046852.1)蛋白的基因經南京金斯瑞生物科技有限公司優化后合成。以5′-AATCTCACCA TGGGCATGGTTCCGCTGCTGACC-3′和 5′-AATCTCA CTCGAGGCCGTGGCTCAGCGCCAGC-3′為引物擴增TaLac基因,利用Nco I和Xho I限制性內切酶處理后,連接至pET-28a(+),構建重組表達載體pET28a-TaLac。TaLac基因經DNA測序進行驗證。

1.2.3 TaLac的重組表達及純化 pET28a-TaLac轉化至BL21(DE3),挑取單克隆在含有25 mg/L卡那霉素的LB培養基中37℃震蕩培養至OD600為0.8時,加入0.5 mmol/L的IPTG于16℃震蕩培養12 h。離心收集菌體,使用裂解緩沖液(20 mmol/L磷酸鹽緩沖液,pH 7.4)重懸菌體,經高壓破碎后,14 000×g離心30 min,收取上清。上清液流穿Ni親和層析柱,洗雜緩沖液(20 mmol/L磷酸鹽緩沖液,40 mmol/L咪唑,pH 7.4)流穿Ni親和層析柱,洗脫緩沖液(20 mmol/L磷酸鹽緩沖液,300 mmol/L咪唑,pH 7.4)流穿Ni親和層析柱洗脫TaLac蛋白,利用截留值為10 kD的超濾管(美國Millipore公司)進行脫鹽濃縮。通過SDS-PAGE分析TaLac的純度,利用Bradford法測TaLac的蛋白濃度,TaLac蛋白分裝凍存于超低溫冰箱。

1.2.4 TaLac酶活力的測定 采用DMP對TaLac的活力進行測定??傮w積為0.2 mL的反應體系中含有20 mmol/L乙酸-乙酸鈉緩沖液(pH 4.0)、1 mmol/L CuSO4、1 mmol/L DMP和適量的TaLac,于60℃反應10 min,測定其在468 nm波長處的吸光值[ε420=148 000 L/(mol·cm)],計算 TaLac的酶活力。1 min內氧化1 μmol 底物所需的酶量定義為1個酶活力單位(U)。

1.2.5 溫度和pH對TaLac酶活力的影響 在乙酸-乙酸鈉緩沖液(pH 3.0-6.0)、Tris-HCl緩沖液(pH 7.0-9.0)等緩沖液條件下,以DMP為底物,于60℃測定TaLac的酶活力,以得到的最高酶活力處的pH為TaLac的最適pH。

在乙酸-乙酸鈉緩沖液(pH 4.0)條件下,以DMP為底物,于30-80℃測定TaLac的酶活力,以得到最高酶活力處的溫度為TaLac的最適溫度。

分別將TaLac在50和60℃條件孵育一定時間后,以DMP為底物測定TaLac的殘余酶活力。以未經熱處理TaLac的酶活力為100%。

1.2.6 金屬離子對TaLac酶活力的影響 在20 mmol/L乙酸-乙酸鈉緩沖液(pH 4.0)中,分別添加不同濃度的CuSO4,以DMP為底物,于60℃測定TaLac的酶活力,確定Cu2+對TaLac的酶活力的影響。

在20 mmol/L乙酸-乙酸鈉緩沖液(pH 4.0)、1 mmol/L CuSO4緩沖液中,分別添加10 mmol/L MgCl2、CaCl2、MnCl2、ZnCl2、BaCl2和 1 mmol/L EDTA,以DMP為底物,于60℃測定TaLac的酶活力,確定不同金屬離子對TaLac的酶活力的影響。以不添加其他金屬離子和EDTA時TaLac的酶活力為對照(Ctrl)。

1.2.7 TaLac動力學參數的測定 于60℃測定TaLac在0.1-5.0 mmol/L DMP條件下的酶促反應速率,利用GraphPad Prism8軟件計算動力學參數Km和kcat。

1.2.8 TaLac的底物特異性 在20 mmol/L乙酸-乙酸鈉緩沖液(pH 4.0)、1 mmol/L CuSO4緩沖液條件下,于60℃測定TaLac對ABTS[ε420=38 000 L/(mol·cm)]、SGZ[ε530=64 000 L/(mol·cm)]、guaiacol[ε470=26 600 L/(mol·cm)]和 DPA[ε300=2 835 L/(mol·cm)]的酶活力。

1.2.9 TaLac對MG的脫色 在20 mmol/L乙酸-乙酸鈉緩沖液(pH 4.0)、1 mmol/L CuSO4緩沖液中,加入0.8 mg/L TaLac和50 mg/L MG染料,分別在添加ABTS和不添加0.1 mmol/L ABTS的情況下,于60℃反應一定時間后,測定反應體系在617 nm處的吸收值。以未添加酶液的反應體系為對照,計算TaLac對MG的脫色率:脫色率(%)=(A0-A)/A0×100%,其中A0為未添加酶液反應體系的OD值,A為添加酶液反應體系的OD值。

1.2.10 MG的脫色產物的毒性評價 50 mg/L MG經TaLac于60℃處理3 h后,pH調整為7.0以減少對玉米萌發的影響。將玉米種子分別置于含有ddH2O(對照組)、未經TaLac處理的MG以及經TaLac處理后的MG脫色產物的保溫盒中,于25℃下避光培養5 d,記錄玉米種子發芽情況,測定胚芽和胚根的長度。

1.2.11 數據分析 文中相關實驗至少重復3次,相應數值使用平均值±標準偏差表示,使用Excel進行數據統計。

2 結果

2.1 TaLac的生物信息學分析

TaLac具有244個氨基酸殘基,理論分子質量為26.1 kD,理論等電點為7.1。序列比對結果(圖1-A)顯示,TaLac與已研究DUF152家族成員RL5、Tfu1114和LaclK的序列一致性分別為27.6%、36.5%和23.5%。TaLac具有DUF152家族保守的氨基酸殘基,如可能的銅原子結合位點H66、C100和H116(圖1-A)。TaLac的結構模型顯示,TaLac與結構已解析的DUF152家族成員GsYlmD具有相似的三級結構(圖1-B)。

2.2 TaLac的克隆、表達及純化

重組質粒pET28a-TaLac表達的TaLac蛋白C末端帶有6×His標簽,可利用Ni親和層析法進行純化(圖2)。TaLac在BL21(DE3)中呈可溶性表達形式。在SDS-PAGE顯示,純化后的TaLac蛋白處于25-30 kD之間(圖2-B)。TaLac經Ni親和層析法純化后純度可達到95%以上,滿足后續酶活性分析要求。

圖2 TaLac的克隆及純化Fig.2 Cloning and purification of TaLac

2.3 TaLac的酶學性質

2.3.1 溫度和pH對TaLac活力的影響 TaLac可氧化漆酶的經典底物DMP。以DMP為底物,測定TaLac催化的最適條件。結果(圖3-A、B)表明,TaLac的最適pH為5.0,最適溫度為60℃。TaLac在50℃和60℃分別處理4 h后,仍保留原始活力的80%和52%(圖3-C)。

圖3 pH和溫度對TaLac活力的影響Fig.3 Effects of pH and temperature on the activity of TaLac

2.3.2 TaLac的動力學和底物特異性分析 以DMP為底物,最適條件下測得TaLac的動力學參數Km為0.74 mmol/L,kcat為1.61/min(圖4-A)。除了可以氧化DMP外,TaLac還可以DPA和愈創木酚為底物;但TaLac不能催化以ABTS和SGZ為底物的氧化反應(圖4-B)。

圖4 TaLac的底物特異性(A)和對DMP的動力學參數(B)Fig.4 Substrate specificity of TaLac(A)and kinetic parameters against DMP(B)

2.3.3 金屬離子對TaLac活力的影響 在體系中沒有Cu2+時,TaLac完全失去催化活性;在1、2和5 mmol/L Cu2+條件下,TaLac能夠發揮最大酶活力;當Cu2+濃度升高至10 mmol/L時,TaLac部分活性被抑制(圖5)。當EDTA螯合去除溶液中Cu2+后,TaLac失去催化活力(圖6)。

圖5 TaLac活力對Cu2+的依賴Fig.5 Dependence of TaLac activity on Cu2+

如圖6所示,在10 mmol/L二價金屬離子Mg2+、Ca2+、Mn2+和Ba2+的作用下,TaLac的活力提高至原有活力的120%-135%,說明這些金屬離子可以提高TaLac的活力;而在10 mmol/L Zn2+的影響下,TaLac可發揮92%的酶活力。

圖6 金屬離子對TaLac活力的影響Fig.6 Effects of metal ions on the activity of TaLac

2.4 TaLac對MG的脫除

2.4.1 ABTS對TaLac脫除MG的影響 由圖7可知,在無介體輔助的情況下,TaLac在4 h對50 mg/L MG的脫色率可達67%。而在ABTS介體的作用下,TaLac在0.5 h時對MG的脫色率為58%,2 h時脫色率達到90%,在3 h即可對MG完全脫色。

圖7 TaLac催化MG的脫色Fig.7 Decolorization of MG catalyzed by TaLac

2.4.2 MG脫色產物的毒性評價 利用玉米萌發實驗評價TaLac脫除MG后產物的毒性。如表1所示,未經TaLac處理的50 mg/L MG組的玉米發芽率、胚芽長度和胚根長度顯著低于對照組。經TaLac處理的MG脫色產物組玉米的發育率為100%、胚芽長度為1.55 cm、根長為5.25 cm,與對照組相比無顯著差異(表1)。

表1 MG及其脫色產物的植物毒性實驗Table 1 Phytotoxicity test of MG and MG decolorized products

3 討論

印染行業是我國的傳統支柱產業,我國每年染料的生產量可達90余萬t[16]。由于染料利用效率低下,致使超過11%的染料被排入印染廢水中[17]。由于染料結構穩定、色度高、毒害作用大,導致印染廢水難以處理。印染廢水的肆意排放,會嚴重抑制水體生物的生長發育;并且,有毒有害染料在水產及農作物中的富集,嚴重威脅人體的健康[7,18-20]。漆酶可有效降解染料,降低其毒害作用,在印染廢水的綠色處理中具有巨大的應用潛力。因此,新型漆酶的挖掘及鑒定具有重要的理論意義和應用價值。

本研究在嗜熱菌水生棲熱菌中挖掘到DUF152家族成員TaLac,該蛋白分子量為26.1 kD,與已鑒定DUF152家族漆酶成員大小相當,均遠小于經典漆酶的分子量[11-13]。TaLac與已鑒定DUF152家族漆酶的同源性在23%-36%,具有家族內保守的銅原子結合位點和相似的高級結構,極有可能是具有催化活性的DUF152家族漆酶。

TaLac在大腸桿菌中過量表達,利用Ni離子親和層析1步純化即可得到高純度的TaLac蛋白。TaLac可氧化愈創木酚、DPA和DMP,驗證了生物信息學的分析結果;而同家族的LaclK只能夠氧化DPA和DMP,不能夠催化愈創木酚的氧化反應[13]。TaLac對DMP底物的動力學參數Km為0.74 mmol/L,與同家族的LalK(0.46 mmol/L)、Tfu1114(1 mmol/L)相當[12-13]。來源于嗜熱菌的TaLac具有較好的熱穩定性,在50℃孵育4 h后,活性保留80%;60℃孵育4 h后,活性保留52%。不同來源漆酶的熱穩定性差異較大。一色齒毛菌(Cerrena unicolor)漆酶LacT-1在50℃處理1 h后僅保留40%活性,60℃處理1 h后失去全部活性[21]。地衣芽孢桿菌(Bacillus licheniformis)ANSB821漆酶CotA分別在50和60℃熱處理2 h后,活力僅剩余40%和30%[22]。TaLac良好的熱穩定性與其水生棲熱菌的來源相關。水生棲熱菌來源的Taq DNA聚合酶、3-磷酸甘油醛脫氫酶等均具有極高的耐熱性[23-24]。

10 mmol/L Zn2+僅使TaLac活力降低8%,而10 mmol/L Mg2+、Ca2+、Mn2+和Ba2+則不同程度地促進TaLac的活力,表明TaLac可耐受高濃度的二價金屬離子。Cu2+對于漆酶的催化反應是必需的。TaLac的活性嚴格依賴于Cu2+。在沒有Cu2+時,TaLac沒有漆酶活性;0-5 mmol/L Cu2+促進TaLac的活性;10 mmol/L Cu2+則抑制了TaLac的活性。該結果表明,Cu2+參與了TaLac對DMP的氧化反應,即TaLac與Cu2+具有相互作用。但TaLac與已鑒定DUF152家族中可能的Cu2+結合位點不同于經典漆酶[11-13]。電感耦合等離子體質譜實驗表明每個RL5分子可能結合4個銅原子,但Tfu1114與LaclK的研究表明每個漆酶分子結合1個銅原子[11-13]。Cu2+與DUF152家族漆酶的結合比例與相互作用方式仍不清晰,有待進一步研究。定點突變與等溫滴定量熱法的結合,可以確定TaLac與Cu2+的結合比例、結合位點等信息;TaLac與Cu2+高級結構的解析,能夠更進一步闡明Cu2+在DUF152家族漆酶催化反應中的作用,解釋該家族漆酶的催化機制是否與經典漆酶一致。

MG大量應用于印染等工業,其無序排放對自然環境、動植物乃至人類形成巨大的威脅。熱穩定性好、金屬耐受性高的TaLac在條件復雜的MG廢水中具有應用潛力。實驗表明,TaLac可高效脫除MG。TaLac于60℃在4 h內對MG的脫色效率達到67%。介體的加入,可提高漆酶對污染物的降解效率[2,25]。在ABTS的輔助下,TaLac可于3 h內完全脫除MG。同樣在ABTS的參與下,LaclK在1 h內對9 mg/L MG的脫色效率不足40%[13];一色齒毛菌漆酶LacT-1在12 h內對MG的降解效率為95%[21]。同溫層芽孢桿菌BCMC2漆酶BaCotA對MG僅具有微弱的降解活性;而在ABTS存在時,BaCotA于3 h可降解82% MG[26]。值得注意的是,TaLac和LaclK均不能催化ABTS的氧化,但ABTS卻能加速TaLac和LaclK對MG的脫色反應[13]。該現象無法使用經典的漆酶介體系統機制進行解釋,可能與DUF152家族漆酶的催化機制相關,需要進一步的研究。MG經TaLac處理后顏色的高效脫除,表明MG的生色基團受到破壞。因此,TaLac可能與白腐真菌齒毛菌(Cerrena sp.)漆酶LacA、棘孢木霉(Trichoderma asperellum)漆酶等經典漆酶一致,通過氧化作用等降解MG,進而實現MG的脫色[10,27]。TaLac對MG的具體降解途徑仍待液相色譜質譜聯用等方法進一步的確定。

漆酶對MG的降解是否可以脫除MG的毒性,需要進一步的研究。本研究利用玉米萌發實驗評價MG脫色產物的毒性,該方法也被用于評價活性黑5染料的毒性[28]。MG組中玉米種子的發芽僅為33%,且發芽種子的胚芽及胚根長度顯著低于對照組,表明MG對玉米發芽及生長的嚴重抑制作用。經TaLac處理后的MG組中玉米的發芽及生長基本不受抑制,說明TaLac完全消除了MG對玉米的毒害作用。然而,MG經LacA漆酶處理后毒性雖然顯著降低,但仍對煙草、萵苣的生長有一定的抑制作用[27]。綜上,TaLac可對MG進行高效脫色及脫毒。

4 結論

在嗜熱菌水生棲熱菌篩選到具有漆酶活性的DUF152家族成員TaLac。TaLac具有DUF152家族保守的銅原子結合位點,有較好的溫度穩定性,且能夠耐受高濃度的 Mg2+、Ca2+、Mn2+、Zn2+和 Ba2+等金屬離子。在ABTS介體的輔助下,TaLac可在3 h完全脫除50 mg/L MG,并且TaLac的處理徹底消除了MG對玉米的毒害作用。因此,DUF152家族漆酶TaLac在MG污染水體的修復中具有應用潛力。

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