裴 妍,任 禛*,李秋樺,陳 秀,夏體淵,蔣明星,尹 敏
(1昆明學(xué)院農(nóng)學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院/云南省高校生物炭工程研究中心,云南昆明 650214;2昆明學(xué)院醫(yī)學(xué)院,云南昆明 650214;3云南大學(xué)醫(yī)學(xué)院,云南昆明 650091)
【研究意義】叢枝菌根真菌(Arbuscular mycorrhizal fungi,AMF)是一類廣泛分布于土壤微生態(tài)環(huán)境的真菌(曹敏等,2020)。AMF與宿主植物建立共生體后,不僅可通過(guò)菌絲網(wǎng)絡(luò)幫助植物吸收營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),還可提高宿主對(duì)生物和非生物脅迫的抵抗能力(董琦等,2020;張學(xué)林等,2021)。煙草(L.)為茄科煙屬植物,是我國(guó)重要的經(jīng)濟(jì)作物,我國(guó)煙草種植面積、產(chǎn)量及銷售量均居世界首位(王成己等,2021)。煙草根莖性病害是煙草生產(chǎn)上面臨的主要難題,其中煙草黑脛病危害最突出,其發(fā)生面積廣、防治難度大,每年因此病害造成的經(jīng)濟(jì)損失高達(dá)數(shù)千萬(wàn)元(汪漢成等,2021)。煙草黑脛病是主要由寄生疫霉()侵染引起的土傳病害,該病害可在煙株各生長(zhǎng)階段發(fā)生,且分布廣泛,嚴(yán)重制約著煙草產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)健康發(fā)展(張凱等,2015)。煙草是AMF的共生植物之一,有綜述報(bào)道在煙草根際土壤中存在豐富的AMF種類,共計(jì)13屬54種(曹本福等,2021)。煙草對(duì)菌根依賴性較強(qiáng),AMF侵染煙株根系建立菌根共生體后,可促進(jìn)煙株對(duì)水分及礦物質(zhì)的吸收(姚娟等,2012),增加煙株生物量(Janou?kovú et al.,2006a,2006b),改善煙葉品質(zhì)(王茂勝等,2011),提高煙株對(duì)重金屬(Janou?ková et al.,2006)、干旱(周霞等,2012)和土傳病害(劉先良等,2014)等不良脅迫的抵抗能力;同時(shí),AMF可有效解決育苗中煙苗抗旱、抗病能力弱的問(wèn)題,提高成活率(Pavithra and Yapa,2018);此外,AMF還可保護(hù)煙草的土壤,可在一定程度上緩解連作障礙問(wèn)題(李亮和蔡柏巖,2016)。AMF對(duì)煙草具有重要的功能作用,因此,掌握煙草與AMF的共生特性,對(duì)煙草產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展具有促進(jìn)作用。【前人研究進(jìn)展】AMF與煙株共生效應(yīng)的強(qiáng)弱與其侵染定殖狀況密切相關(guān),但侵染狀況會(huì)受煙草品種、AMF種類、自然環(huán)境和人為農(nóng)事操作等多種因素的影響(李雪靜等,2017;Wang et al.,2018;Veresoglou et al.,2019;尼瑪此姆等,2020;朱亮等,2020)。煙草品種和AM種類是影響煙株AMF侵染的重要因素之一。本課題組前期研究發(fā)現(xiàn),云煙202、云煙87、云煙85和K326根部的主要AMF種類相同,但稀有AMF種類在4個(gè)煙草品種中存在明顯差異(任禛等,2016)。周霞等(2012)通過(guò)對(duì)煙草品種K326接種根內(nèi)球囊霉()、幼套球囊霉()BEG-168和BGC-HEB07A,探究AMF對(duì)烤煙生長(zhǎng)、營(yíng)養(yǎng)及抗旱性的影響,結(jié)果表明,接種AMF對(duì)煙苗生物量、營(yíng)養(yǎng)狀況、丙二醛和葉綠素含量及根系活力的影響因菌株不同而異,且與干旱程度有關(guān)。Cosme等(2016)研究發(fā)現(xiàn),煙草接種根內(nèi)根孢囊霉(,RI)和摩西斗管囊霉(,F(xiàn)M)及二者混合物,在不同菌劑處理下叢枝的定殖率存在明顯差異。自然環(huán)境因素和人為農(nóng)事操作亦會(huì)對(duì)AMF的侵染定殖產(chǎn)生一定影響。Veresoglou等(2019)證實(shí)AMF的定殖率會(huì)隨著緯度梯度的升高呈減少趨勢(shì),且AMF與植物共生關(guān)系也會(huì)逐漸消弱。李榮波等(2021)研究發(fā)現(xiàn),土壤有機(jī)質(zhì)、全氮、全磷和全鉀是影響根際土壤AMF孢子密度和侵染狀況的重要因子。在農(nóng)事管理中,灌溉澆水量過(guò)多會(huì)使AMF的侵染率及其與宿主的共生效應(yīng)減弱(Langeroodi et al.,2017)。而適度的干旱和適當(dāng)減量施用化肥均會(huì)使根系產(chǎn)生一定的應(yīng)激反應(yīng),會(huì)促進(jìn)AMF的侵染,其共生效應(yīng)也相應(yīng)增強(qiáng)(宋福強(qiáng),2018;葛詩(shī)蓓等,2020)。煙草黑脛病的發(fā)生與土壤微生物具有密切關(guān)系。向立剛等(2019,2020)研究發(fā)現(xiàn),相比健康煙株,感染黑脛病煙株的根際土壤真菌群落豐富度和多樣性均降低,細(xì)菌群落豐富度明顯提高。同時(shí),AMF的存在可提高農(nóng)作物對(duì)疫霉病害的抵抗能力,當(dāng)AMF與宿主根系形成菌根后,菌根與病原真菌競(jìng)爭(zhēng)生態(tài)位點(diǎn),使病原菌侵染位點(diǎn)減少,進(jìn)而疫霉病菌數(shù)量下降,間接地提高農(nóng)作物對(duì)疫霉病菌的抵抗力(Vigo et al.,2000)。Vigo等(2000)通過(guò)對(duì)番茄根際接種摩西斗管囊霉,發(fā)現(xiàn)引起根腐病的病原菌寄生疫霉()在菌根化根系中的入侵位點(diǎn)數(shù)明顯少于對(duì)照。婁璇(2019)通過(guò)對(duì)辣椒植株接種根內(nèi)根孢囊霉(),其疫霉病發(fā)病率、病情指數(shù)均有所降低,防治效果達(dá)54%。【本研究切入點(diǎn)】AMF在提高農(nóng)作物對(duì)疫霉病害抗性方面發(fā)揮著重要作用,但AMF對(duì)農(nóng)作物的定殖會(huì)受到生物和非生物因素的影響。疫霉病菌作為生物因素,其存在可導(dǎo)致土壤中真菌和細(xì)菌類群結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,但是否影響到共生真菌AMF在農(nóng)作物根域的定殖及其類群結(jié)構(gòu)尚不明確。【擬解決的關(guān)鍵問(wèn)題】以煙草品種云煙121為研究對(duì)象,采用顯微形態(tài)觀察法對(duì)健康和患黑脛病煙株根系A(chǔ)MF侵染水平及根際土壤AMF孢子密度進(jìn)行測(cè)定,并應(yīng)用Illumina高通量測(cè)序技術(shù)分析2種煙株根系A(chǔ)MF多樣性和群落結(jié)構(gòu)的差異,進(jìn)一步采用冗余分析(RDA)和Spearman相關(guān)性系數(shù)揭示根際土壤理化性質(zhì)對(duì)AMF屬水平相對(duì)豐度及AMF多樣性的影響,明確疫霉侵襲對(duì)煙草和AMF共生關(guān)系的影響,為后續(xù)AMF在緩解煙株土傳病害方面的應(yīng)用打下理論基礎(chǔ)。
1.1.1 試驗(yàn)田概況 試驗(yàn)于2020年3月在云南省煙草公司紅河州分公司橄欖坡煙草綠色防控示范基地(海拔1451 m,北緯24°22′35″,東經(jīng)103°27′34″)進(jìn)行。試驗(yàn)用地約1 ha,前作為蘿卜,將試驗(yàn)地均分為3份,植煙前采用五點(diǎn)取樣法對(duì)土壤樣品進(jìn)行取樣,測(cè)定土壤理化性質(zhì),結(jié)果顯示3塊試驗(yàn)地土壤理化性質(zhì)間無(wú)顯著差異(>0.05,下同),說(shuō)明3塊試驗(yàn)地土壤背景較一致(表1)。于2020年4月開始種煙,煙草品種均為云煙121,田間管理方法一致。

1.1.2 樣品采集 2020年8月分別采集健康和患黑脛病煙株根系和根際土壤。在每塊試驗(yàn)田分別選取長(zhǎng)勢(shì)一致的健康與患黑脛病煙株,從煙株基部開始,使用土壤刀逐層挖去上層土壤,直至側(cè)根暴露為止,之后將煙株完整取出,立刻帶回實(shí)驗(yàn)室,在根頸處截?cái)啵瑢⒏街诟瞪系母H土壤抖落至密封袋中保存?zhèn)溆茫謩e用于土壤理化性質(zhì)和AMF孢子密度測(cè)定。將去除根際土壤的根系在輕緩的流水下沖洗,沖洗干凈后自然風(fēng)干,將根系剪成1 cm的根段,分別用于菌根侵染狀況測(cè)定和DNA提取。健康煙株分別標(biāo)記為H、H、H;患病煙株分別標(biāo)記為D、D、D。
1.2.1 土壤理化性質(zhì)測(cè)定 土壤pH用pH儀測(cè)定;土壤有機(jī)質(zhì)含量采用重鉻酸鉀法測(cè)定;土壤堿解氮含量采用堿解擴(kuò)散法測(cè)定;土壤有效磷含量采用碳酸氫鈉浸提—鉬銻抗比色法測(cè)定;土壤速效鉀含量采用原子吸收分光光度法測(cè)定。
1.2.2 菌根侵染狀況和土壤AMF孢子密度測(cè)定 菌根侵染狀況參照Koske和Gemma(1989)的方法進(jìn)行檢測(cè),將數(shù)據(jù)輸入MYCOCALC軟件,對(duì)菌根侵染數(shù)據(jù)進(jìn)行計(jì)算。土壤AMF孢子密度測(cè)定采用濕篩—傾析法和蔗糖離心法進(jìn)行分離,在解剖鏡下計(jì)數(shù)統(tǒng)計(jì)。
1.2.3 煙草根系DNA提取和測(cè)序 根系DNA提取:稱取煙草根系樣品各2 g,將樣品置于無(wú)菌研缽中,加入適量液氮,將其研磨成粉末狀。采取CTAB法對(duì)煙草根系總DNA進(jìn)行提取;提取的DNA在1.0%瓊脂糖凝膠中通過(guò)電泳檢測(cè)其質(zhì)量。以各樣品總DNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,引物見(jiàn)表2。PCR反應(yīng)體系20.00 μL:10×Buffer 2.50 μL,DNA模板(20 ng/L)2.00 μL,dNTPs(2.5 mmol/L)1.50 μL,特異引物(10 mmol/L)1.50 μL,聚合酶(5 U/μL)0.25 μL,ddHO補(bǔ)足至20.00 μL。擴(kuò)增產(chǎn)物使用NEXTFLEXRapid DNA-Seq Kit建庫(kù),委托上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司運(yùn)用Illumina Miseq PE300/NovaSeq PE250平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序。

選擇97%相似度的OTU 分類學(xué)水平,利用Mothur計(jì)算不同隨機(jī)抽樣下的Alpha多樣性指數(shù),應(yīng)用Excel 2003對(duì)各分類單元數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì);用Qiime(v1.9.1)計(jì)算Beta多樣性距離矩陣;通過(guò)R語(yǔ)言工具繪制Shannon指數(shù)稀釋曲線、Venn圖和PCA分析;應(yīng)用Canoco 4.5分析AMF在屬水平上的相對(duì)豐度與土壤理化性質(zhì)的相關(guān)性;應(yīng)用SPSS 22.0的Spearman相關(guān)性系數(shù)對(duì)土壤理化性質(zhì)與煙株根系A(chǔ)MF多樣性的相關(guān)性進(jìn)行分析。同時(shí),應(yīng)用SPSS 22.0對(duì)土壤理化性質(zhì)、根系侵染率、根際土壤AMF孢子密度和Alpha多樣性指數(shù)進(jìn)行配對(duì)樣本檢驗(yàn),差異顯著水平為0.05。
H、H、H、D、D和D上傳在NCBI SRA數(shù)據(jù)庫(kù)中的登錄號(hào)分別為SRR14278382、SRR14278381、SRR 14278380、SRR14278385、SRR14278384、SRR1427 8383。
從表3可看出,健康和患病煙株根際土壤pH呈中性,均為7.17;云煙121根際土壤的有機(jī)質(zhì)含量均趨于中等水平,其中健康煙株為23.24 g/kg,患病煙株為14.46 g/kg,健康煙株根際土壤的有機(jī)質(zhì)含量更高,但二者差異未達(dá)顯著水平(>0.05,下同);患病煙株根際土壤的有效磷、速效鉀和堿解氮含量均明顯高于健康煙株,且有效磷和速效鉀含量顯著高于健康煙株(<0.05,下同)。可見(jiàn),黑脛病的侵染可改變煙株根際土壤的理化性質(zhì),降低有機(jī)質(zhì)含量,明顯增加速效養(yǎng)分含量。

在云煙121健康和患病煙株根系及根際土壤中均檢測(cè)到AMF的存在(表4),且健康和患病煙株根系的AMF侵染率均較高,在70.00%以上。從表4可看出,健康與患病煙株根系A(chǔ)MF的侵染率、侵染密度和叢枝豐富度雖無(wú)顯著差異,但健康煙株根系A(chǔ)MF侵染狀況明顯好于患病煙株;另外,在每10 g健康和患病煙株根際風(fēng)干土壤中,AMF的孢子密度均在20.00個(gè)以上,且健康煙株根際土壤AMF孢子密度顯著高于患病植株,說(shuō)明健康煙株根際土壤的AMF孢子更豐富,與煙株根系A(chǔ)MF侵染狀況相符。

2.3.1 健康與患病煙株根系A(chǔ)MF序列統(tǒng)計(jì)比較分析 從表5可看出,健康和患病煙株根系A(chǔ)MF經(jīng)測(cè)序分別獲得72495和73058條原始序列,經(jīng)質(zhì)控后可得到70762和71658條有效序列,平均序列長(zhǎng)度為218.00和216.00 bp,按照97%的相似度進(jìn)行聚類分析,分別得到738.00和636.00個(gè)OTUs。從檢驗(yàn)結(jié)果可看出,健康煙株根系的OTUs數(shù)量顯著高于患病煙株,健康煙株根系的AMF種類更豐富。

2.3.2 健康與患病煙株根系A(chǔ)MF稀釋曲線比較分析 Shannon指數(shù)稀釋曲線可反映樣本在不同測(cè)序數(shù)量時(shí)的微生物多樣性。從圖1可看出,采樣點(diǎn)供試樣品的稀釋曲線已趨于平穩(wěn),表明樣品測(cè)序數(shù)據(jù)量足夠大,能客觀反映煙株根系中AMF群落的真實(shí)情況,可進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。從OTU水平上的Shannon指數(shù)值結(jié)果可看出,各健康植株樣品明顯高于患病植株樣品,說(shuō)明健康煙株根系A(chǔ)MF多樣性更豐富。

2.3.3 健康與患病煙株根系A(chǔ)MF多樣性比較分析Alpha多樣性可用于反映樣品的物種豐富度及多樣性。由表6可看出,健康煙株根系A(chǔ)MF的ACE、Shannon和Chao指數(shù)均顯著高于患病煙株,同時(shí)Simpson指數(shù)顯著低于患病煙株,說(shuō)明在患病煙株根系中連續(xù)抽樣得到相同AMF物種的概率較高,其AMF多樣性較低,且與健康煙株間達(dá)顯著差異水平;此外,所測(cè)健康與患病煙株根系樣品覆蓋率分別為99.89%和99.91%,均在99.00%以上,說(shuō)明本次檢測(cè)結(jié)果準(zhǔn)確可靠,能客觀代表樣品中AMF的多樣性。

2.3.4 健康與患病煙株根系A(chǔ)MF種群歸類比較分析 在患病與健康煙株根系中共獲得1410個(gè)AMFOTUs,排除不可歸類,其余均為球囊菌綱(Glomeromycetes)的種類。所有可歸類的AMF分別歸屬于4個(gè)目:原囊霉目(Archaeosporales)、多孢囊霉目(Diversisporales)、球囊霉目(Glomerales)和類球囊霉目(Paraglomerales);5個(gè)科:原囊霉科(Archaeosporaceae)、多孢囊霉科(Diversisporaceae)、巨孢囊霉科(Gigasporaceae)、球囊霉科(Glomeraceae)和類球囊霉科(Paraglomeraceae);6個(gè)屬:球囊霉屬()、類球囊霉屬()、多孢囊霉屬()、原囊霉屬()、盾巨孢囊霉屬()和巨孢囊霉屬()。從不同分類階層總數(shù)統(tǒng)計(jì)結(jié)果可知,在目、科水平上,健康與患病煙株根系A(chǔ)MF的組成數(shù)目差異不明顯,但在屬水平上,健康煙株根系A(chǔ)MF種類多于患病煙株。
2.3.5 健康與患病煙株根系A(chǔ)MF在目水平上比較分析 在目水平上(圖2),健康與患病煙株根系A(chǔ)MF可歸類目均為原囊霉目、多孢囊霉目、球囊霉目和類球囊霉目。在健康煙株根系中,球囊霉目為優(yōu)勢(shì)目,占比48.46%;其次為類球囊霉目,占比40.60%;多孢囊霉目和原囊霉目數(shù)量相對(duì)較少,占比分別為10.76%和0.17%。在患病煙株根系中,類球囊霉目為優(yōu)勢(shì)目,占比為53.55%;其次為球囊霉目和多孢囊霉目,占比分別為24.46%和20.90%,原囊霉目占比較少,僅占總數(shù)的1.08%。可見(jiàn),在目水平上健康與患病煙株根系A(chǔ)MF種類相同,但占比不同,優(yōu)勢(shì)目種類亦不相同。

2.3.6 健康與患病煙株根系A(chǔ)MF在科水平上比較分析 在科水平上(圖3),健康與患病煙株根系A(chǔ)MF可歸類科均為原囊霉科、多孢囊霉科、巨孢囊霉科、球囊霉科和類球囊霉科。其中,健康煙株根系中球囊霉科為優(yōu)勢(shì)科,占比48.50%;其次為類球囊霉科和多孢囊霉科,占比分別為40.63%和10.01%;巨孢囊霉科和原囊霉科數(shù)目相對(duì)較少,占比分別為0.75%和0.09%。在患病煙株根系中,類球囊霉科為優(yōu)勢(shì)科,占比53.70%;其次為球囊霉科和多孢囊霉科,占比分別為24.53%和20.57%;原囊霉科和巨孢囊霉科占比較少,僅占0.92%和0.27%。可見(jiàn),在健康與患病煙株根系中,在科水平上AMF種類相同,但優(yōu)勢(shì)科不同,與目水平的結(jié)果指向一致。

2.3.7 健康與患病煙株根系A(chǔ)MF在屬水平上比較分析 由圖4可知,在屬水平上,健康煙株根系A(chǔ)MF可歸類屬為球囊霉屬、類球囊霉屬、多孢囊霉屬、原囊霉屬、盾巨孢囊霉屬和巨孢囊霉屬;患病煙株根系A(chǔ)MF可歸類屬為球囊霉屬、類球囊霉屬、多孢囊霉屬、原囊霉屬和盾巨孢囊霉屬。其中,健康煙株根系中球囊霉屬為優(yōu)勢(shì)屬,占比48.50%;其次為類球囊霉屬和多孢囊霉屬,占比分別為40.63%和10.02%;原囊霉屬和盾巨孢囊霉屬占比相對(duì)較少,僅占0.52%和0.08%;巨孢囊霉屬為健康煙株根系中特有的群落,僅占0.22%。在患病煙株根系中,類球囊霉屬為優(yōu)勢(shì)屬,占比53.69%;其次為球囊霉屬和多孢囊霉屬,占比分別為24.53%和20.57%;而原囊霉屬和盾巨孢囊霉屬占比不足1.00%,僅0.92%和0.27%。綜上所述,在屬水平上,健康與患病煙株根系A(chǔ)MF優(yōu)勢(shì)屬存在差異,且巨孢囊霉屬為健康煙株根系A(chǔ)MF特有的屬。

2.3.8 健康與患病煙株根系A(chǔ)MF Venn圖比較分析Venn圖可直觀地體現(xiàn)健康與患病煙株根系A(chǔ)MF群落OTU組成的差異及共有物種的情況。由圖5可知,健康煙株根系中特異性AMF群落OTU數(shù)量為393,占總OTU序列數(shù)的27.87%,患病煙株根系中特異性AMF群落OTU數(shù)量為259,占總OTU序列數(shù)的18.37%;此外,健康與患病煙株根系共有的OTU數(shù)量為758,占總OTU序列數(shù)的53.76%。其中,球囊霉屬、類球囊霉屬、多孢囊霉屬、原囊霉屬和盾巨孢囊霉屬為健康和患病煙株根系共有屬,巨孢囊霉屬為健康煙株根系特有屬。

2.3.9 健康與患病煙株根系A(chǔ)MF群落PCA分析為進(jìn)一步探明黑脛病侵染對(duì)煙草根系A(chǔ)MF群落結(jié)構(gòu)的影響,基于OTU水平進(jìn)行PCA分析。結(jié)果(圖6)發(fā)現(xiàn),健康與患病煙株在PC1維度上分為2組,說(shuō)明黑脛病的侵染可明顯改變煙株根系的AMF群落結(jié)構(gòu);患病煙株3個(gè)重復(fù)間更加聚集,而健康煙株3個(gè)重復(fù)間較分散,患病與健康煙株根系2組樣品間分化明顯,說(shuō)明健康與患病煙株根系A(chǔ)MF群落結(jié)構(gòu)存在差異。

2.3.10 土壤理化性質(zhì)對(duì)煙株根系A(chǔ)MF多樣性的影響 通過(guò)Spearman相關(guān)性系數(shù)評(píng)估煙株根際土壤理化性質(zhì)與根系A(chǔ)MF多樣性的相關(guān)性,結(jié)果見(jiàn)表7。由表7可看出,速效鉀和有效磷對(duì)AMF多樣性和豐富度的影響最大,其中,有效磷、速效鉀和堿解氮與AMF豐富度指數(shù)(Chao指數(shù)和ACE指數(shù))均呈負(fù)相關(guān),且有效磷和速效鉀與之相關(guān)性達(dá)極顯著水平(<0.01,下同);有效磷、速效鉀和堿解氮與AMF多樣性指數(shù)(Shannon指數(shù))均呈負(fù)相關(guān),且有效磷和速效鉀與之相關(guān)性達(dá)顯著水平;有效磷、速效鉀和堿解氮與AMF多樣性指數(shù)(Simpson指數(shù))均呈正相關(guān),且有效磷和速效鉀與之相關(guān)性達(dá)顯著水平;pH、有機(jī)質(zhì)與多樣性和豐富度指數(shù)相關(guān)性均未達(dá)顯著水平。

2.3.11 土壤理化性質(zhì)對(duì)煙株根系A(chǔ)MF屬水平上相對(duì)豐度的影響 由圖7可知,pH、有效磷、速效鉀、堿解氮和有機(jī)質(zhì)含量均對(duì)AMF優(yōu)勢(shì)屬的豐度有一定影響。第1排序軸和第2排序軸解釋信息量分別為76.4%和18.8%,其中,有效磷對(duì)AMF屬水平上的相對(duì)豐度影響最大,其次為速效鉀;有效磷、速效鉀和堿解氮均與類球囊霉屬、原囊霉屬和多孢囊霉屬的相關(guān)豐度呈正相關(guān),與盾巨孢囊霉屬、巨孢囊霉屬和球囊霉屬的相關(guān)豐度呈負(fù)相關(guān);pH與盾巨孢囊霉屬、巨孢囊霉屬和球囊霉屬的相關(guān)豐度呈正相關(guān),與類球囊霉屬、原囊霉屬和多孢囊霉屬的相對(duì)豐度呈負(fù)相關(guān);有機(jī)質(zhì)含量與巨孢囊霉屬、多孢囊霉屬和球囊霉屬的相關(guān)豐度呈正相關(guān),與其他屬的相關(guān)豐度呈負(fù)相關(guān)。

AMF作為植物常見(jiàn)的共生真菌,可定殖于90%以上的維管植物中(曹敏等,2020)。煙草是可與AMF建立共生關(guān)系的農(nóng)作物之一,前人研究表明在煙草根際土壤和根內(nèi)存在著豐富的AMF資源(曹本福等,2021)。李昕竺(2013)采用DGGE法在攀枝花市鹽邊縣5個(gè)不同煙草生產(chǎn)區(qū)土壤中共發(fā)現(xiàn)3屬29種AMF孢子。王婷婷(2013)采用顯微形態(tài)觀察法在貴州省主要煙草產(chǎn)區(qū)土壤共分離、鑒定出4屬20種AMF。本課題組前期采用分子克隆文庫(kù)方法在4個(gè)云南主栽煙草品種根系共發(fā)現(xiàn)21個(gè)OTUs(任禛等,2016)。而本研究采用Illumina高通量測(cè)序技術(shù),在健康與感黑脛病煙株根系中共檢測(cè)到1410個(gè)AMFOTUs。可見(jiàn),采用高通量測(cè)序技術(shù)可在煙草根系中獲得更多的AMF種類。由于AMF缺乏明顯的種屬特性,在顯微鏡下難以區(qū)別鑒定,給AMF多樣性研究帶來(lái)一定的局限性;同時(shí),DGGE和克隆文庫(kù)構(gòu)建等分子生物學(xué)方法則存在擴(kuò)增片段短、信息量不足的問(wèn)題;而Illumina高通量測(cè)序具有通量高、準(zhǔn)確率高的優(yōu)勢(shì)(秦楠等,2011;施軍瓊等,2020),可克服這些方法的局限,擴(kuò)大人們對(duì)煙草AMF類群的認(rèn)知。
本研究通過(guò)高通量測(cè)序首次在煙株根系A(chǔ)MF中發(fā)現(xiàn)多孢囊霉屬,多孢囊霉屬為健康與患病煙株共有屬,且相比健康煙株,患病煙株的多孢囊霉屬相對(duì)豐度增加10.55%。朱亮等(2020)研究表明,多孢囊霉屬與磷含量的相關(guān)性最大,且與磷含量呈正相關(guān),本研究結(jié)果與之一致。初步推測(cè)可能是煙株患病后有效磷含量顯著增加,這可能是導(dǎo)致患病煙株根系中多孢囊霉屬豐度增加的原因之一。此外,本研究發(fā)現(xiàn)巨孢囊霉屬為健康煙株特有屬,Duc和Posta(2018)通過(guò)對(duì)番茄植株接種珠狀巨孢囊霉(),發(fā)現(xiàn)珠狀巨孢囊霉雖然定殖率較低,但對(duì)其枯萎病和潰瘍病病原(subsp.)的抗性較高。因此,巨孢囊霉屬可能會(huì)提高植物對(duì)病害的抗性,但是否會(huì)提高煙株對(duì)黑脛病的抗性還需進(jìn)一步驗(yàn)證。
有研究報(bào)道AMF侵染率和孢子密度與農(nóng)作物病害的發(fā)病率、病情指數(shù)呈顯著負(fù)相關(guān)(尼瑪此姆等,2020),因此,農(nóng)作物被病害侵襲就有可能影響AMF的侵染率和孢子密度。本研究發(fā)現(xiàn),健康煙株根系的AMF侵染率、侵染密度和叢枝豐富度明顯高于患病煙株,且前者根際土壤中的AMF孢子密度顯著高于后者。婁璇(2019)在對(duì)辣椒疫病發(fā)病率與AMF侵染率的關(guān)系研究中同樣證實(shí)健康幼苗的AMF侵染率高于患病幼苗。AMF與引發(fā)煙株黑脛病和辣椒疫病的疫霉均為真菌微生物,且均為土傳病害,感病煙株其根際土壤中必然存在著大量病原菌,這些病原菌可與AMF在土壤中競(jìng)爭(zhēng)生存空間及營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),兩者此消彼長(zhǎng),可導(dǎo)致AMF孢子密度下降。在煙株根內(nèi),AMF侵染水平下降除與病原菌相互競(jìng)爭(zhēng)有關(guān)外,還可能與根際土壤中AMF孢子密度減少所引發(fā)的競(jìng)爭(zhēng)能力減弱有關(guān)。同時(shí),土壤理化性質(zhì)分析結(jié)果表明,感病煙株根際土壤中的有效磷、速效鉀和堿解氮含量等均高于健康煙株,初步推測(cè)可能是煙草黑脛病為維管束系統(tǒng)性病害,患病后煙株根部和莖基部的維管束壞死(張凱等,2015),使土壤養(yǎng)分無(wú)法從植株地下部運(yùn)輸?shù)降厣喜浚瑢?dǎo)致土壤養(yǎng)分殘留量較大,患病煙株根際土壤中大量元素的速效含量偏高。但土壤理化性質(zhì)—土傳病害—AMF間的相關(guān)關(guān)系還有待進(jìn)一步研究。
AMF多樣性和群落結(jié)構(gòu)會(huì)受到土壤因子、不同宿主植物、氣候因子和CO濃度等因素的影響(Johnson,2010;Ma?ek et al.,2011;蔣勝競(jìng)等,2014;李雪靜等,2017)。本研究發(fā)現(xiàn),與感染黑脛病的煙株相比,健康煙株根系A(chǔ)MF-OTUs數(shù)量更豐富,且ACE、Shannon和Chao指數(shù)更高,差異均達(dá)顯著水平。可見(jiàn),感染黑脛病可顯著降低煙草根系A(chǔ)MF的多樣性。有研究報(bào)道,黃龍病菌侵染贛州柑橘可降低其根系A(chǔ)MF的Chao、Shannon和Sobs等多樣性指數(shù)(宋放等,2019),本研究結(jié)果與之一致,均證實(shí)病原菌存在對(duì)AMF多樣性的負(fù)調(diào)控作用。同時(shí),本研究證實(shí),在目和科水平上,健康煙株和患病煙株根系A(chǔ)MF種類相同,但具體分布不同,優(yōu)勢(shì)種類亦不相同;在屬水平上2種煙株根系A(chǔ)MF群落結(jié)構(gòu)差異明顯,球囊霉屬是健康煙株根系的優(yōu)勢(shì)屬,而類球囊霉屬是感病煙株根系的優(yōu)勢(shì)屬;PCA分析結(jié)果表明健康與患病煙株根系A(chǔ)MF群落存在明顯差異。結(jié)合上述結(jié)果,本研究認(rèn)為黑脛病侵染不僅可降低煙草根系A(chǔ)MF侵染的種類及多樣性,還可改變AMF的群落結(jié)構(gòu)。宋放等(2019)亦證實(shí)黃龍病存在可明顯改變柑橘根系A(chǔ)MF的菌種組成和相對(duì)豐度。初步推測(cè),一方面,由于患病煙株其根際土壤及根內(nèi)均存在一定程度的病原菌,病原菌的存在改變了煙草根系周圍微生態(tài)環(huán)境,且與AMF發(fā)生競(jìng)爭(zhēng)關(guān)系,導(dǎo)致患病煙株根系A(chǔ)MF多樣性下降;另一方面,不同AMF種類對(duì)脅迫環(huán)境的適應(yīng)性存在差異,有些非主要的AMF,由于其能更好地適應(yīng)脅迫環(huán)境而轉(zhuǎn)變成為主要種類,有些AMF對(duì)脅迫環(huán)境較敏感,其數(shù)量下降或消失,最終導(dǎo)致感黑脛病煙株根系A(chǔ)MF組成結(jié)構(gòu)發(fā)生改變。
在土壤中,速效養(yǎng)分是可被植物直接吸收利用的養(yǎng)分形態(tài),其與AMF間的關(guān)系更為密切。本研究結(jié)果表明,煙株根際土壤中的有效磷、速效鉀和堿解氮均與根系A(chǔ)MF多樣性指數(shù)呈負(fù)相關(guān),其中有效磷和速效鉀與之相關(guān)性達(dá)顯著水平。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),在土壤的速效養(yǎng)分中,有效磷和速效鉀對(duì)根系A(chǔ)MF多樣性和豐富度影響最大。可見(jiàn),土壤中的有效磷含量對(duì)煙株根系A(chǔ)MF組成結(jié)構(gòu)的影響更明顯。劉敏等(2020)對(duì)柄扁桃根圍土壤理化性質(zhì)與土壤中AMF群落組成進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)AMF豐富度與土壤速效磷和土壤含水量呈顯著負(fù)相關(guān),且AMF多樣性與速效磷和速效氮含量間呈顯著負(fù)相關(guān),本研究結(jié)果與之一致,均證實(shí)土壤速效養(yǎng)分含量與AMF多樣性和豐度間的負(fù)相關(guān)性,尤其是磷元素的影響更重要。研究者認(rèn)為導(dǎo)致這種現(xiàn)象可能存在兩方面的原因:一方面,在土壤速效養(yǎng)分含量較高的條件下,植物可更多地利用自身根系去吸收營(yíng)養(yǎng),從而降低對(duì)AMF的依賴性,兩者共生關(guān)系弱化,影響AMF生長(zhǎng)及對(duì)煙株根系的侵染(Liu et al.,2019);另一方面,AMF是對(duì)磷較敏感的真菌微生物,土壤有效磷含量較高往往會(huì)抑制AMF的發(fā)育和功能,導(dǎo)致AMF生長(zhǎng)受阻,多樣性下降(He et al.,2010)。本研究?jī)H初步探究了土壤速效養(yǎng)分與AMF多樣性和豐富度的相關(guān)性,但不同濃度的速效養(yǎng)分對(duì)AMF的影響有待進(jìn)一步探究。
與健康煙株相比,感染黑脛病煙株根際土壤速效養(yǎng)分含量增加,土壤AMF孢子密度下降;煙株根系A(chǔ)MF侵染率減少,AMF種類及多樣性下降,且根系A(chǔ)MF群落結(jié)構(gòu)發(fā)生明顯改變。