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YAP在非賁門胃癌的表達(dá)及其基因多態(tài)性與YAP表達(dá)水平的關(guān)系

2022-09-21 01:06:04馬立聰田旭陽劉得利白雪峰賈彥彬2
關(guān)鍵詞:胃癌水平研究

馬立聰,田旭陽,劉得利,白雪峰,賈彥彬2,,5

胃癌是常見的惡性腫瘤之一,其發(fā)病率和死亡率均位居所有惡性腫瘤的前列[1]。我國是胃癌的高發(fā)地區(qū),據(jù)統(tǒng)計,2018年我國新增胃癌病例45.6萬例,因胃癌死亡病例39萬例[2],嚴(yán)重影響人民的生命健康。Yes相關(guān)蛋白(Yes-associated protein,YAP)是Hippo腫瘤抑制通路中的主要效應(yīng)因子[3],去磷酸化的YAP能夠在細(xì)胞核中作為轉(zhuǎn)錄共調(diào)節(jié)因子誘導(dǎo)一些基因的轉(zhuǎn)錄和表達(dá),調(diào)控細(xì)胞的增殖、凋亡、分化,進(jìn)而調(diào)控組織穩(wěn)定和器官生長[4]。目前,國內(nèi)外有關(guān)YAP基因單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNP)與其蛋白表達(dá)水平的關(guān)系未見報道。該研究采用免疫組織化學(xué)SP法檢測YAP蛋白在非賁門胃癌組織和癌旁正常胃組織中的表達(dá)差異,分析YAP蛋白表達(dá)水平與臨床病理特征的關(guān)系,并首次研究了YAP基因SNP與其蛋白表達(dá)水平之間的關(guān)系,初步探討YAP與非賁門胃癌發(fā)生發(fā)展的關(guān)系,為胃癌的防治提供新思路。

1 材料與方法

1.1 研究對象病例組為2008—2011年包頭市腫瘤醫(yī)院經(jīng)病理學(xué)確診的非賁門胃癌病例126例,所有病例均為漢族,且三代無與其他民族通婚史,發(fā)病時已在包頭市居住5年以上的原發(fā)病例,且未接受過化療和放療。其中104例為手術(shù)根治標(biāo)本,同時留取了距腫物≥5 cm的正常胃組織。其余22例為胃鏡下咬鉗組織,無正常對照。所有癌組織和正常胃組織均經(jīng)高年資病理醫(yī)師在顯微鏡下確認(rèn)。所有病例均留取2 ml外周血,并提供知情同意書,本課題已獲包頭醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)倫理委員會批準(zhǔn)。

1.2 YAP蛋白表達(dá)水平檢測采用免疫組織化學(xué)SP法檢測126例非賁門胃癌組織和104例癌旁正常組織中YAP蛋白的表達(dá)水平。SP試劑盒購自福州邁新生物技術(shù)開發(fā)有限公司,YAP一抗購自艾博抗(上海)貿(mào)易有限公司。將非賁門胃癌組織及癌旁正常組織進(jìn)行石蠟切片,切片厚3 μm,烤片2 h,然后依次用二甲苯脫蠟,梯度乙醇脫二甲苯,水洗,檸檬酸高溫高壓修復(fù),PBS緩沖液洗脫,一抗4 ℃孵育過夜,PSB緩沖液洗脫,二抗孵育0.5 h,DAB顯色,顯微鏡下觀察染色結(jié)果。所有免疫組化染色結(jié)果均由2位高年資病理醫(yī)師采用雙盲法判定,每張切片隨機(jī)選取5個視野,以胞核和胞質(zhì)中出現(xiàn)背景清晰的棕黃色顆粒作為陽性結(jié)果,由陽性細(xì)胞百分比和陽性強度共同決定其表達(dá)水平。陽性細(xì)胞百分比:≤5%為0分,>5%~25%為1分,>25%~50%為2分,>50%~75%為3分,>75%為4分;陽性強度:陰性為0分,弱陽性為1分,中度陽性為2分,強陽性為3分。陽性細(xì)胞百分比與陽性強度評分乘積≥1分則認(rèn)為YAP呈陽性表達(dá)。

1.3 SNP的篩選根據(jù)Hapmap數(shù)據(jù)庫(http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/)提供的中國漢族人群多態(tài)性數(shù)據(jù),在YAP基因進(jìn)行了標(biāo)記單核苷酸多態(tài)性(Tag-SNP)的篩選,要求最小等位基因頻率(minimum allele frequency,MAF)>0.05,連鎖不平衡相關(guān)系數(shù)(r2)>0.8。根據(jù)文獻(xiàn)報道的可能與疾病相關(guān)的SNP[5-6],優(yōu)先選擇了rs11225163和rs1820453兩個多態(tài)性位點進(jìn)行分析。

1.4 SNP的分型采用外周血DNA提取試劑盒提取126例樣本外周血白細(xì)胞DNA,試劑盒購自北京天根生化科技(北京)有限公司。采用Taqman探針法對126例樣本進(jìn)行基因分型,基因分型在北京賽默百合生物科技有限公司完成。實驗中設(shè)陰性對照和陽性對照,基因分型沒有成功的樣本不再進(jìn)行重復(fù)實驗。實驗中隨機(jī)選取5%DNA質(zhì)量和數(shù)量較好的樣本進(jìn)行重復(fù)實驗,以驗證結(jié)果的準(zhǔn)確性。經(jīng)檢測,所有重復(fù)樣本基因分型結(jié)果的一致性為100%。

1.5 統(tǒng)計學(xué)處理采用R軟件(version3.5.0;http://www.r-project.org)進(jìn)行統(tǒng)計分析,采用χ2檢驗或Fisher確切概率法分析病例組和對照組中YAP蛋白表達(dá)水平的差異以及YAP蛋白表達(dá)水平與年齡、性別、腫瘤分化程度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況以及腫瘤大小等臨床病理特征之間的關(guān)系,P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。采用非條件性Logistic回歸法計算經(jīng)年齡、性別調(diào)整后的比值比(odds ration,OR)值以及95%置信區(qū)間(confidence intervals,CI),用以評估兩個SNP在共顯性、顯性、超顯性、隱性和附加5種遺傳模式下與YAP蛋白表達(dá)水平之間的關(guān)聯(lián)性,采用Haploview 4.2軟件構(gòu)建單體型,并分析單體型與YAP蛋白表達(dá)水平的關(guān)聯(lián)性。

2 結(jié)果

2.1 YAP蛋白在126例非賁門胃癌組織和104例癌旁正常組織中的表達(dá)情況在126例非賁門胃癌組織中,YAP蛋白表達(dá)陰性者16例(12.7%),陽性者110例(87.3%),其中,評分1分者37例,2分者40例,3分者33例。在104例癌旁正常組織中,YAP蛋白表達(dá)陰性者57例(54.8%),陽性者47例(45.2%),其中,評分1分者35例,2分者11例,3分者1例。統(tǒng)計分析得出,YAP蛋白在非賁門胃癌組織中的表達(dá)水平高于其在癌旁正常組織中的表達(dá)水平,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=46.630,P<0.001),見圖1。

圖1 YAP蛋白在非賁門胃癌組織及癌旁正常組織中的表達(dá)情況 ×100

2.2 YAP蛋白表達(dá)與臨床病理特征的關(guān)系YAP蛋白表達(dá)水平與腫瘤分化程度呈負(fù)相關(guān)(P<0.05),與性別、年齡、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及腫瘤大小無關(guān)聯(lián)(P>0.05),見表1。

2.3YAP基因多態(tài)性與其蛋白表達(dá)水平的關(guān)聯(lián)性統(tǒng)計結(jié)果顯示,SNP rs11225163和rs1820453在共顯性、顯性、超顯性、隱性和附加5種遺傳模式下與YAP蛋白表達(dá)水平之間無關(guān)聯(lián),見表2。

表2 5種遺傳模型下SNP rs11225163、rs1820453與YAP蛋白表達(dá)的關(guān)聯(lián)性

2.4YAP單體型與蛋白表達(dá)水平的關(guān)聯(lián)性使用Haploview 4.2軟件對所研究的SNP進(jìn)行連鎖不平衡檢驗,計算LOD值、連鎖不平衡系數(shù)D′,采用D′置信區(qū)間法構(gòu)建單體型。結(jié)果顯示,所研究的YAP基因2個SNP位點之間未構(gòu)成單體型塊。

3 討論

YAP是Hippo腫瘤抑制通路中的核心組件,被證實在肺癌、乳腺癌、大腸癌等多種惡性腫瘤中的表達(dá)水平顯著升高[7-9]。此外,韓新影 等[10]發(fā)現(xiàn),YAP蛋白在胃癌組織中的表達(dá)水平顯著高于癌旁組織(P<0.05)。Yan et al[11]同樣在其研究中發(fā)現(xiàn),YAP蛋白在人胃癌細(xì)胞系A(chǔ)GS中的表達(dá)水平顯著高于正常胃黏膜細(xì)胞,提示YAP可能參與了胃癌的發(fā)展。但所有相關(guān)研究均未對胃癌的組織學(xué)類型進(jìn)行分類,這可能對研究結(jié)果造成偏倚。胃癌分為賁門癌和非賁門癌兩類,賁門癌在流行病學(xué)、臨床病理特征及分子生物學(xué)特征等方面與食管癌相近,因此,為了保持研究樣本的均質(zhì)性,本研究將病例限定為非賁門胃癌。

本研究結(jié)果顯示,YAP蛋白在非賁門癌組織中的表達(dá)水平較正常胃組織顯著升高,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.001),與上述學(xué)者相關(guān)研究結(jié)果相符,說明YAP可能參與了非賁門胃癌的發(fā)病過程。Han et al[12]在其研究中發(fā)現(xiàn),YAP蛋白在胃癌組織中的表達(dá)水平顯著高于癌旁正常胃組織,并且與年齡、腫瘤分化程度、浸潤深度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及TNM分期等臨床病理特征呈正相關(guān)。本研究同樣分析了YAP蛋白表達(dá)水平與臨床病理特征之間的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)其表達(dá)水平與腫瘤分化程度呈正相關(guān)(P<0.05),與Han et al[12]的研究結(jié)果一致。這一結(jié)果剛好證實了YAP具有調(diào)節(jié)細(xì)胞分化程度的生物學(xué)功能[13-14],腫瘤細(xì)胞分化程度越低提示患者預(yù)后越差,換言之,可以推測YAP在非賁門胃癌組織中的表達(dá)水平越高,患者的預(yù)后越差,YAP蛋白表達(dá)水平或許可能成為判斷非賁門胃癌患者預(yù)后的指標(biāo)。

本研究并未發(fā)現(xiàn)YAP蛋白表達(dá)與性別、年齡、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和腫瘤大小存在關(guān)聯(lián),與Han et al[12]的研究結(jié)果不符,出現(xiàn)這一結(jié)果的原因可能有:第一,本研究將胃癌類型限定為非賁門胃癌,而Han et al[12]的研究并未區(qū)分賁門癌與非賁門癌,YAP蛋白在非賁門胃癌組織中的表達(dá)水平可能不受性別、年齡、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和腫瘤大小等因素的影響;第二,可能與本研究納入的樣本量較小有關(guān),因此本研究結(jié)果還需進(jìn)一步證實。

YAP蛋白由YAP基因所編碼,該基因位于人類常染色體11q22.1[15]。本研究選擇了YAP基因中rs11225163和rs1820453這兩個SNP進(jìn)行研究,其中rs11225163位于內(nèi)含子區(qū)域,被發(fā)現(xiàn)與黑色素瘤患者的存活率相關(guān)[5],與攜帶CT+TT基因型比較,攜帶CC基因型患者存活率降低[CCvs.CT+TT:HR=1.79,95%CI=1.18~2.72,P=0.007]。rs1820453位于可變區(qū)上游2 kb,Chen et al[6]的研究發(fā)現(xiàn),rs1820453與中國婦女乳腺癌的發(fā)病相關(guān),與攜帶AA基因型的人比較,攜帶CC基因型的人患乳腺癌的風(fēng)險顯著增加(OR=2.05,95%CI=1.19~3.53,P= 0.009)。上述研究并未探討疾病的發(fā)生是否是由于兩個SNP引起蛋白表達(dá)的改變從而致病,或研究的SNP是否與其他已知致病SNP之間存在強連鎖不平衡而與疾病的發(fā)生發(fā)展關(guān)聯(lián)。

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