黃 琪,任樹華,吳 平,鮑偉奇,周維燕,孔艷艷,姜東朗,華 濤,王 堅,胡 杰,陳 亮,顧宇翔,郭起浩,左傳濤,管一暉,謝 芳*
(1.復旦大學附屬華山醫院核醫學/PET中心,2.神經內科,3.神經外科,上海 200040;4.上海交通大學附屬第六人民醫院老年科,上海 200030)
醫學影像學技術的發展推動了神經影像學臨床及科研進步,但獲取數據難度及成本均較高。建設神經影像數據庫可避免重復采集數據所致成本增加和周期延長,支持在不同背景和目的下深入挖掘數據,提高其利用率。目前國內外已有多個神經影像學數據庫,但多針對MRI,核醫學PET神經影像學數據庫發展相對滯后,尤其缺少基于我國人群的PET神經影像學資料。本研究基于復旦大學附屬華山醫院資料嘗試建立基于我國人群的PET神經影像學數據庫,包括阿爾茨海默病(Alzheimer's disease,AD)、帕金森病(Parkinson disease,PD)、煙霧病、腦膠質瘤、癲癇及非疾病腦。
1.1 研究對象
1.1.1 AD數據庫 納入2018年11月—2022年3月50~80歲、性別和受教育程度不限的AD患者,于神經心理學評估后1個月內接受顱腦MR、18F-AV45及18F-FDG或18F-MK6240 PET檢查;無明確腦卒中病史;Hachinski缺血指數表得分≤4分。排除標準:①合并明顯心、肝、腎或肺功能不全,血液系統疾病、嚴重感染、癌癥、酒精或藥物濫用等;②頭顱MRI顯示大血管性病灶、皮質下彌漫性白質腦病或多發腔隙性腦梗死;③其他腦部疾病或系統疾病伴癡呆,以及甲狀腺功能低下、維生素B12缺乏等;④因視、聽障礙影響認知評估;⑤抑郁性障礙;⑥缺乏合作或理解。
1.1.2 PD數據庫 納入2010年2月—2022年3月接受18F-FDG或11C-CFT PET顯像(停用PD藥物12 h以上)PD患者,依據文獻[1-3]標準,經顱腦MRI及臨床評估運動障礙診斷PD。納入患者年齡、性別不限。排除標準:神經或精神系統疾病史,神經安定類或毒品暴露史,神經查體或MRI顯示異常,多巴胺轉運體阻斷劑用藥史等。
1.1.3 煙霧病數據庫 納入2019年12月—2022年3月接受18F-FDG或18F-FDG灌注相PET的18~80歲、性別不限煙霧病患者;均經數字減影腦血管造影參照煙霧病診療指南[4]標準確診。排除標準:①合并影響認知功能的其他神經系統疾病;②酗酒、吸毒;③拒絕神經心理檢查。
1.1.4 腦膠質瘤數據庫 納入2011年8月—2022年3月接受氨基酸PET檢查的腦腫瘤患者,年齡14~80歲,性別不限;顯像前未接受腦占位性病變手術、放射治療及化學治療等;以手術或腦立體定向活檢獲取腦組織學標本后經常規病理學診斷。排除標準:氨基酸PET顯像陰性;脫髓鞘病變、炎性反應、其他非膠質腫瘤。部分患者經分子病理學檢查,對其結果根據2016版WHO中樞神經系統腫瘤分類標準獲得新分級標準下的病理診斷;根據IDH1 R132H抗體免疫組織化學染色判斷IDH1基因突變。
1.1.5 難治性癲癇 納入2013年11月—2022年3月接受18F-FDG或FMZ PET檢查的難治性癲癇患者,年齡18~80歲,性別不限,經≥2種藥物足量足療程無法有效控制,經常規腦電圖、MR及認知評估,且檢查前停用苯二氮卓類藥物時間1個月以上。排除合并癔癥者或妊娠婦女。
1.1.6 非疾病腦代謝 納入于2012年11月—2019年4月接受18F-FDG PET檢查,經2名核醫學科醫師結合病史閱片確認無腦卒中、重大顱腦創傷或神經精神疾病,無惡性腫瘤、藥物濫用或酒精成癮史等者。
1.2 圖像采集 采用Siemens Biograph mCT Flow Edge 128 PET/CT儀,顯像劑劑量及掃描時間等見表1。采用3D模式采集PET圖像,軸向視野30 cm,范圍包括顱頂至顱底,經衰變校正、歸一化校正、時間校正、衰減校正、散射校正及隨機符合校正,并獲得迭代、濾波反投影、TRUX和以all-pass算法重建的圖像,重建圖像矩陣為256×256×148,體素1.59×1.59×1.50。

表1 PET掃描方案
或采用Biograph Truepoint HD 64 PET/CT儀,掃描及校正方式同前,重建算法包括迭代、濾波反投影和TRUEX算法,重建PET圖像矩陣為168×168×148,體素2.04×2.04×1.50。
1.3 預處理 由研究人員通過嚴格視覺檢查剔除不滿足質量要求的圖像,其流程如下:①以MIRC CTP對DICOM文件行匿名化;②采用dcm2niix將DICOM格式文件轉換為NIFTI格式;③將圖中的前聯合-后聯合線的原點調至前聯合;④以SPM12軟件對PET圖像進行空間標準化,并變換到蒙特利爾神經研究所(Montreal Neurological Institute,MNI)空間;⑤以半高寬8 mm×8 mm×8 mm平滑核進行平滑。
2.1 數據庫基本信息 所獲PET神經影像數據庫主要包括5個專病數據庫及1個非疾病腦代謝數據庫,基本信息見表2。

表2 PET神經影像數據庫基本信息
2.2 數據存儲、檢索與安全 數據庫所有圖像均可提供DICOM或NIFTI格式,參照腦成像數據結構(https://bids.neuroimaging.io/)通用規范存儲;記錄基本人口學信息,包括ID、獲取日期,檢查時年齡、性別、體質量、利手及顯像劑注射劑量等;并可提供基于自動解剖定位地圖集的標準化攝取值。
為便于管理和應用,本課題組與上海銳邦數據系統有限公司合作搭建了數據管理云平臺,其前端采用HTML5+Javascript,后端采用Java開發語言的技術架構,硬件為HP ML110塔式服務器,可提供數據建模、數據清洗、CRF表單設計、數據同步、數據分析及數據全生命周期管理等功能,支持多個字段檢索、批量上傳及下載等;同時以多種措施確保數據安全和受試者隱私,包括設定有關人員權限,記錄使用人員、操作時間和內容,并建立、健全安全相關制度和規章,涉及人員操作、系統維護和變更的管理流程即出現系統故障時的應急預案;設定任何單位或個人未經授權不得擅自調閱、復制數據。
本研究建立的顱腦疾病數據庫均以特定PET儀成像,可最大限度提高數據的同質性,有助于PET臨床應用,可填補國內核醫學數據庫的缺失[5-8]。但本數據庫為單中心來源,且局限于PET圖像,希望未來能拓寬數據來源,進一步擴展基于我國人群的多病種、多中心及多模態影像數據庫。