李 偉,任重杰
(鄆城縣檢驗檢測中心,山東菏澤 274700)
近年來,由于食品行業的迅速發展,食源性致病微生物引發的食物中毒、食源性疾病的發生率不斷增加,給人們的健康和生活帶來極大的威脅,同時也給我國的公共健康和經濟帶來了巨大損害。由于食物環境的原因,大腸桿菌不耐熱腸毒素一直是引起食物中毒的主要原因。因此,快速、靈敏地檢測出大腸桿菌不耐熱腸毒素對食品安全管理具有重要意義。
交叉引物擴增技術是一種新的核酸等溫擴增技術。交叉引物擴增技術采用一種DNA 聚合酶,在溫度為62 ℃的恒溫下保溫1 h,即可特異、快速、高效地完成核酸的擴增[1]。本技術與快速檢測技術(如快速檢測紙條、一次性核酸檢測設備)的組合,為臨床快速檢測、分子診斷、檢疫和生物醫藥等領域的發展提供了新的檢測方法。
交叉引物擴增方法在檢驗檢疫、檢測突發傳染病和醫院的早期篩查中得到了廣泛的應用。由于CPA 的成本較低,CPA 的擴增只能在離心機和諸如水浴、金屬浴等簡單的恒溫裝置中進行。由于其操作簡單,且對操作者不具備太高的操作水平要求,一般人只要經過簡單的訓練或自學就可熟練使用,這為推廣這項技術創造了良好的條件。該方法具有很好的特異性,能為6 個目標基因區設計6 ~8 條特異引物,以確保反應的特異性[2]。同時,其靈敏度高,可從少量復制中分離到目標基因,其敏感性能夠達到10 個拷貝。產品的檢測方法簡單,特異性高,可用瓊脂糖凝膠電泳法進行鑒定,也可將熒光染料添加到擴增產品中,根據顏色的改變來判斷,也可采用一次性的抗污染核酸檢測設備進行檢測,降低了假陽性的發生概率。
CPA 擴增系統主要由置換引物、交叉引物和Bst DNA 聚合酶組成,通過Bst DNA 聚合酶的鏈替換,可實現DNA 的連續重復擴增。CPA 的擴增過程包括以下幾個步驟。①生成具有交叉引物位點的擴增產物。PFs 的5’末端和反交引物PRa 的雜交序列是一致的。在交叉引物的前面,排列著替代引物。取代引物的濃度比交叉引物要低。BST DNA 聚合酶可通過替換的方式,在不同的位置上不斷地延伸出不同的交叉引物。固定的前鏈5’末端是由替換引子和交叉引子不斷地擴展而形成的。PFa 也是同樣的原理,它可通過伸展和排列來形成另外一條固定的鏈條[3]。②擴增交叉引物。該排列鏈由末端新生成的引物位點構成,并將其3’端交叉引物的導入點模板。利用引物的不斷雜交、延伸以及擴增產物自身的雜交延伸,可形成多個引物雜交,加快擴增進程。③對產品的生成進行檢測。在反應完成后,會產生一種單鏈、雙鏈、半雙鏈的混合物。
CPA 方法得到的核酸擴增產物在瓊脂糖凝膠上顯示為一條帶狀。通過電泳觀察,可判斷是否出現了一個梯度條。可將嵌入的熒光染料(乙溴錠、SYBR Green I)等加入反應系統,且根據反應溶液中熒光強度的改變判定產品的生成,從而判定是否有擴增反應。若將1 μm SYBR GreenI 型熒光染料加入雙鏈DNA 的小溝中,在產生擴增產物時,可與DNA 雙鏈連接,使熒光染料從橙色轉變為綠色[4]。利用一次性的核酸檢測儀和核酸膜色譜快速檢查紙等產品,對顯色試紙進行目視判讀,只在C 質控區處有一條紅線時,判定為陰性,即沒有反應;若有兩條紅線,分別在T 檢測區和C 質控區,判定為陽性,表示有反應,若無紅線,則判定為無效。
用麥康凱瓊脂平板37 ℃下培養C83903(LT’)菌株16 ~24 h。用LB 液為載體,在37 ℃下,用200 r·min-1的振蕩試驗研究了該菌的生長特性。將 5 mL 的培養基,在10 000 r·min-1下進行3 min 的離心,將上清液作為DNA 模板,貯存于-20 ℃的無菌環境下備用。
用麥康凱培養基C83903(LT′*)菌株在37 ℃下過夜培養,稀釋1 000 倍后,將其稀釋菌液與無LT毒素的豬肉樣品進行混勻。在10 000 r·min-1的條件下離心3 min 后,將上清液排出,用1 mL 0.9%的生理鹽水進行懸浮培養,再用腸毒素大腸埃希氏菌對樣本進行人工污染,并進行記錄。
采用14 個試驗菌(6 個大腸桿菌和8 個非大腸桿菌),將其與LAMP 法進行對比。反應完成后,將預先滴入的SYBR GreenI 型熒光染料與所述擴增產品相混合,在自然和紫外線下進行觀察,使用濃度為2%瓊脂糖凝膠電泳技術對擴增產物進行檢測。
采用CPA 法、LAMP 法、qPCR 法,對人工感染經產腸毒素的大腸埃希氏菌生豬肉樣本共計50 例進行了檢驗,采用DNA 萃取試劑對豬肉樣品進行處理,以DNA 基因組為模板,以2%的瓊脂糖凝膠電泳法檢測CPA、LAMP 擴增產物,并與qPCR 進行對比。
該引物的特異性較強, 在60 ℃、60 min 條件下可大量擴增LT 毒素,用2%的瓊脂糖電泳法檢測,其陽性呈不規則的梯形條紋,而在陰性對照組中無條帶。用華峰管另一頭的SYBR GreenI 染料與反應產物進行混合,用肉眼觀察,在正試管中呈綠色,陰性試樣為橙色;在紫外線的作用下,陽性管的熒光呈綠色,而陰性管則不變,如圖1 所示。

圖1 反應產物的陰性管與陽性管
通過實驗,對反應溫度、Bst 聚合酶、dNTPs、Mg、甜菜堿濃度和擴增時間進行了優化,發現62 ℃、 64 ℃、66 ℃是最佳的擴增溫度;采用8 U/管Bst 聚合酶法進行擴增,得到的條帶最明顯,最佳的Bst聚合酶濃度是8 U/管;在0.3 mmol·L-1dNTPs 中,dNTPs 的擴增條件最為明顯;實驗結果表明,在 45 min 內,樣品中有一條明顯的階梯狀條紋,但隨著反應時間的延長,條帶的亮度沒有顯著的改變,因此45 min 是最佳的擴增時間。按上述原理進行CPA反應,最佳Mg 濃度為2.0 mmol·L-1,甜菜堿濃度為 0.8 mol·L-1。
采用CPA 法,對14 個不同的細菌進行了特異性測定,并重復了3 次。用瓊脂糖電泳法測定了2 個帶有LI+基因的菌株,其余12 個是未攜帶LI+基因的菌株,與LAMP 的檢測結果相吻合,證明了該方法的特異度較高。
采用CPA 法和LAMP 法,對50 例無菌感染的豬肉樣品進行了快速檢測。結果表明,CPA、LAMP法各檢測到7 個帶有LT 的基因,與qPCR 的檢測結果基本相符,其檢出率為14%。

表1 臨床樣本檢測結果(n=50)
本文通過優化反應溫度、酶濃度、dNTPs 濃度等因素,構建了一種快速、特異、靈敏度高的新型CPA探針。與LAMP 法比較,該方法特異性強,從加樣到反應結束,只需1.5 h 就能完成目標基因的特異擴增,而對非攜帶目標基因的鑒定結果為陰性[5]。本文采用人工污染的生豬肉模擬樣品,采用熒光PCR 技術,采用CPA、LAMP 法進行人工感染,其陽性檢出率達到14%(7/50),表明CPA 是一種新的檢測技術,可滿足食品衛生領域微生物質量檢驗的需要。
CPA 擴增時,由于系統中DNA 的連續合成,會導致大量的焦磷酸鎂沉淀,因此可通過是否有白色沉淀來判斷,但當LT 毒素基因擴增時,沒有發現明顯的乳白色沉淀,而用2.0%的瓊脂糖凝膠電泳法檢測,可看到不同尺寸的區域帶階梯狀結構[6]。為了避免在打開瓶蓋時產生的大量氣溶膠對周圍環境的影響,本文選擇廣州華峰生物科技有限公司生產的華峰管進行可視化檢測,將SYBR 綠色I 型染料和反應系統的混合液加入華峰管,使二者在反應結束后進行混合,以確定反應的效果,有效地防止了氣溶膠所致的交叉污染。
綜上,產腸毒素大腸桿菌是一種非常危險的病原體,會引起食源性疾病,因此建立一種快速、準確的檢測方法,對于保證食物安全和人體的健康非常重要。交叉引物擴增法具有時間短、成本低、特異性高等優點,且無需特殊、昂貴的儀器和實驗環境,為食品致病菌的檢測開辟了一條新途徑。