沙眼衣原體蛋白酶CPAF的結構特征及抗原表位分析

王道 張宏波 劉文彬 陳建林

摘 要：衣原體蛋白酶樣活性因子（CPAF）是一種沙眼衣原體蛋白酶，其活性可抑制宿主炎癥信號、細胞骨架重塑和中性粒細胞活化等過程。本研究運用生物信息學方法對CPAF蛋白的理化性質、親/疏水性、信號肽、亞細胞定位、跨膜結構、保守結構域、N-糖基化和磷酸化位點、二級/三級結構、配體結合區域和小分子藥物、B/T細胞抗原表位以及相互作用蛋白等進行分析。CPAF由601個氨基酸組成，分子質量為67 252.57 Da，理論等電點為5.68，為不穩定的親水性蛋白質；含有信號肽，無跨膜區，保守結構域位于3～586位氨基酸序列，屬于CPAF超家族，主要分布在細胞質；分別存在1個N-糖基化和53個磷酸化位點，二級結構主要以無規則卷曲和α-螺旋組成，存在14個配體結合位點、20個B細胞抗原表位、4種B細胞構象抗原表位、多個可能的T細胞抗原表位。此外，本文還虛擬篩選出5種潛在的有效小分子化合物，CPAF能與htrA、pbpB、recC等10種其他蛋白發生互作關系。這為深入研究CPAF蛋白在沙眼衣原體發病機制中的重要作用提供了理論依據，使其可能成為疫苗研發和藥物治療的靶點。

關鍵詞：沙眼衣原體；CPAF蛋白；生物信息學；結構；抗原表位

中圖分類號：R374 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?文獻標志碼：A DOI：10.3969/j.issn.1007-7146.2023.03.008

Analysis of Structure Features and Epitopes of Chlamydia trachomatis Protease CPAF

WANG Dao1， ZHANG Hongbo2， LIU Wenbin3， CHEN Jianlin1*

（1. Department of Obstetrics and Gynecology， the Second Xiangya Hospital of Central South University， Changsha 410011， China; 2. Department of Pathology， the Second Xiangya Hospital of Central South University， Changsha 410011， China; 3. State Key Laboratory of Developmental Biology of Freshwater Fish， College of Life Science， Hunan Normal University， Changsha 410081， China）

Abstract： Chlamydial protease-like activity factor （CPAF） is a Chlamydia trachomatis protease， which activity results in dampened host inflammation signaling， cytoskeletal remodeling， and suppressed neutrophil activation. We used series of bioinformatics to analyze and predict CPAF protein， physicochemical properties and hydrophobicity， signal peptide， subcellular localization， transmembrane protein structure， conserved region and N-glycosylation sites and phosphorylation sites， the secondary and tertiary structure， ligand-binding regions and small molecular compounds， B-/T-cell epitopes and the interacting proteins. CPAF， which consist of 601 amino acids， the relative molecular weight is 67 252.57 Da， the theoretical isoelectric point is 5.68. The CPAF protein contains a signal peptide and has non-transmembrane regions. The conserved domain of CPAF protein is located at 3～586 amino acid sequence and belongs to CPAF superfamily. The CPAF protein contains 1 N-glycosylation site and 53 phosphorylation sites. The secondary structure is mainly composed of irregular coiling and α-helix. The CPAF protein contains 14 ligand-binding sites， 20 B-cell epitopes， 4 conformational epitopes and several potential T-cell epitopes， and 5 potentially effective screening small molecule compounds. Meanwhile， CPAF may interact with 10 other proteins including htrA、pbpB、recC and so on. This study provides a theoretical basis for further researching the role of CPAF in the pathogenesis of Chlamydia trachomatis， which could be used as a target for vaccine developments and drug therapies.

Key words： Chlamydia trachomatis; CPAF; bioinformatics; structure; antigenic epitope

（Acta Laser Biology Sinica， 2023， 32（3）： 247-258）

沙眼衣原體（Chlamydia trachomatis，Ct）是引起細菌性性傳播疾病（sexually transmitted infections，STIs） 的主要病原體之一，據報道，全球每年感染人數超過1億［1］。多項研究［2-3］證實，Ct只能在人或動物細胞內復制，并能與宿主細胞的新陳代謝和信號通路相互作用，引起基因表達的改變，從而阻斷宿主細胞凋亡。在生殖道感染中，Ct主要在男性尿道上皮和女性子宮內膜復制，造成泌尿生殖道炎癥、水腫以及黏膜分泌物異常，進一步感染可導致盆腔炎、輸卵管疤痕、異位妊娠和不孕癥等嚴重并發癥［4］。然而，80%女性和50%男性感染后可能沒有任何癥狀，因此，Ct感染長期被人們忽視［5］。但Ct具有高傳播率的特點，高危病人的再感染率和治療失敗導致的反復感染，使其成為一種嚴重的公共衛生重大威脅。

在早期研究Ct與宿主細胞的相互作用過程中，一種新的衣原體蛋白酶樣活性因子被Zhong等［6］檢測并鑒定出來，命名為CPAF（chlamydial protease-like activity factor）。CPAF屬于衣原體絲氨酸蛋白酶，由衣原體網狀體（reticulate body，RB）產生，具有多種活性，抑制抗衣原體免疫反應［7］。Rajeeve等［8］報道，Ct能通過CPAF干擾化學介導的中性粒細胞活化，逃避宿主的先天免疫反應。Zhang等［9］報道，CPAF能夠選擇性和特異性地降解衣原體T細胞抗原，以促進Ct存活。Cheong等［10］還通過ELISA測定多種細胞因子，證實了CPAF具有引發宿主免疫細胞反應的能力。盡管人們一致認為CPAF是一個關鍵的毒力因子，可切割宿主蛋白，其中包括細胞骨架中間纖維波形蛋白、核膜層黏連蛋白等，但在感染細胞中CPAF是怎么被激活及其被調節的分子機制仍然不明確。而且，Ct復雜的二相性發育周期和血清型變異成為制備抗衣原體疫苗的限制因素。

本課題組Peng等［11］的研究表明，CPAF可以促進不依賴C3的C5活化，揭示了活化衣原體感染誘導的新機制。本文運用多種生物信息學軟件和網站對Ct的CPAF蛋白的理化性質、二級/三級高級結構、配體結合位點、小分子藥物、互作蛋白以及B/T細胞抗原表位進行綜合解析，為研制CPAF為靶點的抗衣原體疫苗防治性傳播疾病和尋找有效小分子藥物提供理論基礎。

1 材料與方法

1.1 材料

從GenBank數據庫（http：//www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank）獲取Ct CPAF蛋白的氨基酸序列信息：CT D/UW-3/CX標準株基因組序列號為AE001273.1，CT_858的Gene ID為884659，CPAF蛋白的氨基酸序列登錄號為AAC68456.2。

1.2 方法

1.2.1 CPAF蛋白的理化性質分析

運用ExPasy網站的ProtParam（http：//web.expasy.org/protparam/）分析CPAF蛋白的理化性質；運用Protein-Sol軟件（https：//protein-sol.manchester.ac.uk/）分析CPAF蛋白的溶解度。

1.2.2 CPAF蛋白的親/疏水性、信號肽以及跨膜結構分析

利用ProtScale軟件（https：//web.expasy.org/protscale/）預測CPAF蛋白的親/疏水性；利用SignalP 5.0 Serve軟件（https：//services.healthtech.dtu.dk/service.php？SignalP-5.0）預測CPAF蛋白的信號肽；利用PSORTII網站（https：//psort.hgc.jp/form2.html）對CPAF蛋白進行亞細胞定位；利用TMHMM Server v2.0網站（https：//services.healthtech.dtu.dk/service.php？TMHMM-2.0）對CPAF蛋白的跨膜結構進行分析。

1.2.3 CPAF蛋白的N-糖基化、磷酸化位點和結構域分析

利用NetPhos3.1 Server（https：//services.healthtech.dtu.dk/service.php？NetPhos-3.1）和NetNGly1.0 Server（https：//services.healthtech.dtu.dk/service.php？NetNGlyc-1.0）分別預測CPAF蛋白的N-糖基化和磷酸化位點。利用NCBI Conserved Domains Database（https：//www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd）對CPAF蛋白的保守結構域進行分析。

1.2.4 ?CPAF蛋白的二級結構和三級結構模型

運用SOPMA軟件（https：//www.ibcp.fr/predict.html）對CPAF蛋白的二級結構進行分析；使用SWISS-MODEL構建CPAF蛋白的三級結構模型；采用The Structure Analysis and Verification Serve（https：//saves.mbi.ucla.edu/）對其三級結構模型進行驗證。

1.2.5 ?CPAF蛋白的抗原表位和抗原決定簇分析

運用ABCpred server（https：//webs.iiitd.edu.in/raghava/abcpred/）、ElliPro server（http：//tools.iedb.org/ellipro/）、IEDB（http：//www.iedb.org/）以及SYFPEITHI（http：//www.syfpeithi.de/）網站對CPAF蛋白的抗原表位進行分析。然后，運用 Immunomedicine Group（http：//imed.med.ucm.es/Tools/antigenic.pl）對CPAF蛋白的抗原決定簇進行分析。

1.2.6 CPAF蛋白的抗原性和致敏性分析

進一步運用VaxiJen v2.0（www.ddgpharmfac.net/vaxijen/VaxiJen/VaxiJen.html）和ANTIGENpro（http：//scratch.proteomics.ics.uci.edu）對CPAF蛋白的抗原性進行分析；使用AllerTOP v2.0和 Allergen FP v1.0預測CPAF蛋白的過敏性。

1.2.7 CPAF蛋白的配體結合位點預測和小分子化合物篩選

將CPAF蛋白的三級結構模型PDB文件上傳至PrankWeb（https：//www.prankweb.cz/）數據庫，對CPAF蛋白表面可能的配體結合位點進行預測；使用Discovery Studio 2020 Client 軟件、PubChem數據庫（https：//pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/）以及PyRx軟件的Vina進行TOP5有效化合物篩選。

1.2.8 CPAF相互作用的蛋白質預測

運用STRING 11.5（https：//cn.string-db.org/）數據庫構建與CPAF蛋白發生相互作用的蛋白互作網絡圖。

2 結果與分析

2.1 CPAF蛋白的理化性質和溶解度分析

利用ProtParam網站對CPAF蛋白的氨基酸序列進行分析，結果表明：CPAF蛋白由601個氨基酸構成，其中亮氨酸（Leu）的數量為62個（10.3%），含量最高；半胱氨酸（Cys）的數量為7個（1.2%），含量最低（圖1a）；其中包含69個帶負電荷的氨基酸殘基（Asp + Glu）和57個帶正電荷的氨基酸殘基（Arg + Lys）；分子式為C3044H4692N798O890S17，總原子數為9 441，分子質量為67 252.57 Da，理論等電點為5.68；280 nm波長處消光系數為85 175，吸光度為1.266，半衰期為30 h，不穩定系數為40.21，推測CPAF為不穩定蛋白；脂肪系數為88.39，平均總親水值為-0.149。運用Protein-Sol Server網站預測出CPAF蛋白的溶解度為0.229，小于群體平均值（PopAvrSol）0.450，說明該蛋白的溶解度一般（圖1b）。

2.2 CPAF蛋白的親疏水性分析

基于Hydropath/Kyte & Doolittle算法，運用ProtScale預測CPAF蛋白的親疏水性。CPAF蛋白有6個高分值峰區（Score>1.5），分別在氨基酸的第9～13、89、101、288～290、372～377、496位氨基酸，其中最高分值的氨基酸是第289位氨基酸的異亮氨酸（Score=2.267）；有3個低分值的峰區（Score<-2），分別在第72～74、76、243～244位氨基酸，其中最低分值的氨基酸是第72位的精氨酸（Score =-2.533）（圖2）。CPAF大多數氨基酸位于親水區，推測其是親水性蛋白。

2.3 CPAF蛋白的信號肽、跨膜區和亞細胞定位分析

利用Signal5.0分析CPAF蛋白存在的信號肽，在氨基酸序列23和24位點之間有一個裂解位點VQG～ES的概率為95.85%，所以推測該蛋白極大可能產生信號肽（圖3）。同時，TMHMM Serve v2.0預測表明，CPAF蛋白不存在跨膜區（圖 4）。PSORTII對CPAF蛋白進行亞細胞定位的結果表明，其主要存在于細胞質（56.5%），其次在線粒體（21.7%）和細胞核（17.4%）。

2.4 CPAF蛋白的糖基化、磷酸化位點以及保守結構域分析

NetNGlyc 1.0 Server 網站分析CPAF蛋白表明，其包含1個可能的N-糖基化位點，閾值設為0.5（圖 5）；NetPhos 3.1 Server網站預測CPAF蛋白共有53個磷酸化位點，其中有32個絲氨酸（Serine）磷酸化位點、5個酪氨酸（Tyrosine）以及16個蘇氨酸（Threonine）磷酸化位點（圖6）。運用NCBI Conserved Domains Database發現，CPAF蛋白有1個保守結構域，屬于Chlamy_CPAF超家族（圖 7）。

2.5 CPAF蛋白的二級結構和三級結構分析

使用SOPMA軟件對CPAF蛋白的二級結構進行分析，其中多肽鏈中α-螺旋229個（38.10%），延伸鏈95個（15.81%），無規則卷曲247個（41.10%），β-折疊鏈30個（4.99%）（圖8）。運用SWISS-MODEL預測CPAF蛋白的三級結構模型，結果得到4個模型。根據建模評價指標QMEAN =-1.21（值在-4～0 之間，越接近0匹配度越好）和GMQE = 0.86（值在0～1之間，越接近1則建模質量越好），選取模型質量最好的結構（圖9a）并且利用拉曼光譜圖進一步驗證，發現僅0.8%的氨基酸殘基分布在不合理區域，證明該模型具有良好的可靠性（圖9b）。

2.6 CPAF蛋白的配體結合位點和小分子藥物篩選

基于隨機森林算法，運用PrankWeb網站對CPAF蛋白表面上的配體結合位點進行預測。結果顯示，該蛋白表面分別用14種不同顏色代表預期口袋和實際結合的可能區域。蛋白質的原子則使用灰色描述，灰色程度越深代表保守性越高。在所有預測的口袋區域中，黑色區（Rank1）口袋得分為5.30，氨基酸殘基數為12，氨基酸殘基位點為A_378、A_400、A_405、A_406、A_409、A_413、A_450、A_471、A_472、A_527、A_529、A_53；紅色區（Rank2）口袋得分為5.27，氨基酸殘基數為11，氨基酸殘基位點為B_400、B_406、B_409、B_413、B_450、B_471、B_472、B_527、B_528、B_529、B_53；黃色區（Rank3）口袋得分為3.65，氨基酸殘基數為10，氨基酸殘基位點為A_105、A_375、A_376、A_377、A_378、A_499、A_500、A_503、A_527、A_528；桔色區（Rank4）口袋得分為3.34，氨基酸殘基數為10，氨基酸殘基位點為B_118、B_151、B_152、B_159、B_182、B_183、B_185、B_194、B_200、B_216；藍色區（Rank5）口袋得分為3.30，氨基酸殘基數為10，氨基酸殘基位點為B_105、B_374、B_376、B_378、B_499、B_500、B_503、B_526、B_527、B_528。因此，推測黑色區域是口袋和實際配體結合最有可能的區域（圖10）。

圖10 CPAF蛋白的配體結合區域分析

Fig. 10 The ligand-binding domains of CPAF

以SWISS-Model同源建模CPAF蛋白的3D結構作為受體蛋白文件（PDB格式），使用Discovery Studio 2020 Client 軟件對蛋白結構進行預處理，下載PDB格式文件。然后，從PubChem數據庫中下載篩選出重要化合物的2D結構（SDF格式）。最后，使用PyRx軟件內部的Vina進行對接，篩選結合能最低（結合能越低，結合越穩定）的前5種化合物，其中化合物Pubchem CID分別是Imatinib（5 291）、Fluprostenol（4 449）、Nefazodone（528 222 6）、Travoprost（531 122 1）和Latanoprost（531 110 0）（圖11）。

圖11 CPAF蛋白的小分子藥物預測

Fig. 11 Prediction of small molecules of CPAF

2.7 CPAF蛋白的B細胞和T細胞抗原表位分析

運用ABCpred Prediction Server 對CPAF蛋白的氨基酸序列進行B細胞抗原表位預測（閾值為0.5）。其中分值大于0.5的有52個B細胞抗原表位，分值大于0.8的有20個B細胞抗原表位（表2）。根據結果綜合分析，推測第375～394、74～93、60～79、414～433、399～418位氨基酸為CPAF蛋白的B細胞表位的可能性最大。使用ElliPro服務器的結果發現共形成了12個構象的B細胞表位，其中評分有4個（>0.740），分別為 0.828（圖12a）、0.791（圖12b）、0.779（圖12c）、0.747（圖12d）。

運用SYFPEITHI對CPAF蛋白的CLT抗原表位進行預測，其中MHC-I類型為HLA-A*02：01，分值大于20以上的有24個（表3）；當MHC-II類型為HLA-DRB1*04：01、HLA-DRB1*07：01、HLA-DRB1*01：01、HLA-DRB1*03：01，Th細胞表位有0個。采用IEDB軟件預測CPAF蛋白的MHC-I和MHC-II類型的表位：MHC-I型抗原表位（HLA-A*01：01，HLA-A*02：01，HLA-A*03：01）Percentile Rank<1的有45個，其中分數最高的肽段氨基酸，即HLA-A*01：01，Score=0.978，位于第430～438位；HLA-A*03：01，Score=0.972，位于第224～232位；HLA-A*02：01，Score=0.905，位于第379～387位（表 4）；MHC-II類型的表位（HLA-DRB1*03：01和HLA-DRB1*04：01）Adjust-rank<1的有15個（表5）。

2.8 CPAF蛋白的抗原決定簇

利用Immunomedicine Group網站對CPAF蛋白的抗原決定簇進行預測，平均抗原傾向性為1.035 7，共計有23個抗原決定簇表位，主要位于氨基酸序列的第5～46、56～70、78～89、94～116、121～127、136～157等位點，這些位點形成抗原決定簇可能性較高（圖13、表6）。

2.9 CPAF蛋白的抗原性和過敏性分析

鑒于Ct的CPAF蛋白的特點，使用VaxiJen v2.0服務器對其抗原性進行非對齊預測，閾值設為0.4，總體預測的抗原可能性為0.461 4；運用ANTIGENpro服務器驗證CPAF蛋白的抗原性為0.717 4，這兩個結果都證明CPAF蛋白具有抗原性。使用AllerTOP v2.0和Allergen FP v1.0分別對其進行過敏性預測，結果都顯示，CPAF蛋白為非過敏原性，不會誘導過敏原特異抗體產生。

2.10 CPAF蛋白的相互作用蛋白

STRING11.5數據庫預測與Ct CPAF蛋白（CT_858）發生相互作用的高置信度的蛋白有10個（Score>0.5），其中包括htrA、CT_790、CT_648、pbpB、CT_114、recC、CT_339、CT_017、pmpA和CT_425（圖 14），其分數排名信息見表7。

3 討論

Ct與宿主細胞相互作用過程中，CPAF主要在感染宿主細胞的胞質中被檢測到，這與亞細胞定位顯示該蛋白集中分布在細胞質的結論相符。多項研究［12-13］表明，CPAF對Ct致病機理有潛在的重要作用，具有多種逃逸宿主免疫反應的新機制來促進Ct的存活并且迅速進入宿主細胞的胞漿，但該機制仍然是個未知數。本研究預測CPAF蛋白N端含有一個分泌的信號肽。信號肽的主要功能是指導蛋白在細胞內運輸，參與細胞內物質運輸，這與Chen等［14］報道的CPAF是依賴于前導信號肽提供SecB來實現穿過內膜的運輸功能相一致。以往研究［15］也表明，CPAF是Ct的主要毒力因子，能夠在哺乳動物體外分裂出一組特定的衣原體蛋白，有助于調節一系列細菌和宿主的細胞功能。因此，近年來研究CPAF蛋白在細胞感染變量模型中作用的報道成為當今的熱點［16］。本研究對理化性質進行分析發現，CPAF是不穩定的親水性蛋白質，半衰期為30 h，這與CPAF即使發生分子間二聚化、催化或切割殘基發生突變，但仍能產生活性CPAF耐受更多突變的特性相關。只有通過同時突變分子間二聚化和催化殘基，CPAF才會在感染期間完全失活，表明了關鍵殘基的重要性和CPAF蛋白對細胞內環境突變的耐受極限，提示需進一步分析CPAF蛋白的基本結構。CPAF蛋白質的二級結構分析發現，其肽鏈上的無規則卷曲和α-螺旋水平最高，說明該蛋白具有較好的可塑性，易于形成配體和受體結合的部位，有利于衣原體疫苗的設計。近年來也有研究［17-18］表明，借助生物信息學推動衣原體疫苗研發的方法具有可行、高效、低成本的優勢。

蛋白質翻譯后修飾是通過改變蛋白質的性質包括疏水性、可溶性和表面特性從而改變蛋白質的功能［19］，這些都可能會影響蛋白質的構象、底物、輔助因子以及與其他分子的相互作用。對CPAF蛋白翻譯后修飾位點的研究結果發現，其存在1個糖基化位點和多個磷酸化位點，推測該蛋白存在不同的修飾表型。CPAF蛋白總共存在53個可能的磷酸化位點，其中數量最多的是絲氨酸（Serine）磷酸化位點，推測是Ct和有毒物質的結合位點，可為新藥或抑制劑的研發提供基礎，同時該蛋白可能通過糖基化、磷酸化而發揮多種重要的生物學作用，還有待于以后試驗驗證。對CPAF蛋白保守結構域分析發現，該蛋白屬于CPAF超家族，其結構域位于第3～586位氨基酸序列上，推測該蛋白功能區域可能位于3～586氨基酸序列上。Maksimchuk等［20］以往研究報道，CPAF的N端106～212位氨基酸是一個類似宿主PDZ的保守結構域，與人類含有PDZ結構域的蛋白質具有很強的結構相似性。這種序列保守性表明，該蛋白在Ct感染和免疫識別中起著重要作用，推測其可能在參與破壞上皮細胞連接以促進Ct感染中至關重要。

與CPAF相關的蛋白有htrA、CT_790、CT_648、pbpB、CT_114、recC、CT_339、CT_017、pmpA和CT_425，其中htrA被報道在致病性衣原體中發揮溶解蛋白和分子伴侶的功能，被視為潛在的藥物靶點，還可能成為輸卵管因素不孕的生物標志物［21-22］；pmpA屬于衣原體表面的膜結合蛋白家族成員，不僅被發現對衣原體感染的初始階段非常重要，而且有助于引發Th1介導的保護性免疫反應，成為候選疫苗的重要蛋白［23］。本文對上述CPAF的互作蛋白的預測，將有助于揭示以CPAF蛋白為核心的信號通路。

B細胞又稱B淋巴細胞，在抗原刺激下產生保護性抗體參與機體的免疫應答。T細胞分為兩個功能不同的亞群：CD4+T輔助細胞（Th）和CD8+細胞毒性T淋巴細胞（CTL），數量充足的CD4+和CD8+T細胞活化對清除病原體感染至關重要。所以，尋找Ct中能夠激活免疫細胞的優勢抗原表位對疫苗研究具有重要意義。本文使用ABCpred服務器篩選出5個可能性最大的B細胞表位；利用ElliPro服務器發現了4個Score最高的B細胞表位構象。按照中國人群人類白細胞抗原（human leukocyte antigen，HLA）基因型分布頻率，使用SYFPEITHI網站預測得到多個潛在的CD8+和CD4+T細胞表位，還證實可能存在23個抗原決定簇表位。采用VaxiJen2.0和ANTIGENpro進一步評估了CPAF蛋白的抗原性，還使用AllerTOP v2.0和Allergen FP v1.0分別對其過敏性進行預測，證實該蛋白為非過敏原性。本研究發現了14個配體結合位點，其中黑色區域是口袋和實際配體結合最有可能的區域；虛擬篩選出5種潛在的小分子藥物，分別是伊馬替尼（Imatinib）、氟前列醇（Fluprostenol）、奈法唑酮（Nefazodone）、曲沃前列素（Travoprost）和拉坦前列素（Latanoprost）。人類被Ct感染后，臨床治療采取如四環素、大環內脂類和喹諾酮類等藥物［24-26］和中藥治療［27］。不過，要根除衣原體慢性感染很困難，大多數抗生素是通過抑制蛋白質或核酸合成來靶向代謝活躍的衣原體網狀體，而對代謝失活的衣原體網狀體卻沒有任何影響［28］。我們不得不要考慮新的化合物作為抗菌活性的方法，例如，從生物材料和植物化學物中提取的化合物包括黃酮、萜類、生物堿和部分油劑，其中許多化合物具有抗菌特性［29］。

生殖道Ct感染是最常見的性傳播疾病之一，未經治療的Ct感染可上升至上生殖道，并且形成慢性感染，導致嚴重并發癥，增加人們的健康負擔。總之，我們迫切需要一種安全有效的預防性疫苗來減少衣原體疾病的傳播。本文將為促進Ct疫苗和小分子藥物的研發提供理論參考。

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