代國威,劉婷婷,李好先,胡林,樊景超*,曹尚銀*
數據論文
2012—2017年優勢產區落葉果樹農家品種資源調查數據集
代國威1,2,劉婷婷1,2,李好先3,胡林1,2,樊景超1,2*,曹尚銀3*
1. 中國農業科學院農業信息研究所,北京 100081;2. 國家農業科學數據中心,北京 100081;3. 中國農業科學院鄭州果樹研究所,鄭州 450009
果樹資源是一種具有較高經濟效益和生態效益的種質資源。我國的落葉果樹品種資源是國家農業戰略性資源,收集和保存落葉果樹品種種質資源是開展優良品種選育的基礎,可以為果樹資源育種工作者選育優良果樹品種提供更多優異的原始材料。文章數據集收集了13個落葉果樹農家品種樹種的序號、調查編號、品種名、品種拉丁名、樣本類型、所屬樹種、提供人和調查人的姓名、電話及地址、調查地點、海拔、經緯度、生境信息、植株情況、植物學特性、果實性狀、生物學習性與品種評價等數據。果樹基本性狀按照《果樹種質資源描述規范和數據標準》制表,所有資源的調查結果和數據均由相關樹種專家多次實地調查訪問農家品種資源所在地獲取,果樹農家品種資源鑒定信息參考中國植物物種數據庫,獲取的數據按照指定匯交格式形成規范的數據集,并命名為《2012—2017年優勢產區落葉果樹農家品種資源調查數據集》。本數據集包含國內瀕臨滅絕及具有特異農藝性狀的落葉果樹農家品種資源,可為我國果樹資源保存和育種研究提供數據支撐。
落葉果樹;種質資源;資源調查;植物學信息
數據庫(集)基本信息匯總表

數據庫(集)名稱2012—2017 年優勢產區落葉果樹農家品種資源調查數據集 數據作者及分工代國威:論文撰寫與修訂;劉婷婷:數據整理與分類匯總;李好先:特色落葉果樹的資源調查和收集、數據整理與分類匯總;胡林,總體方案設計與組織實施;樊景超:總體方案設計與組織實施;曹尚銀:總體方案設計與組織實施 數據通信作者樊景超,E-mail:fanjingchao@caas.cn;曹尚銀,E-mail:13937192127@ 163.com 數據采集時間2012—2017 年 地理區域全國優勢產區 數據量15 MB 數據格式*.xlsx 數據服務系統網址https://dx.doi.org/10.12205/A0002.20230228.00.ds.3476CSTR:17058.11.A0002.20230228.00.ds.3476 基金項目國家農業科學數據中心(NASDC2022XM00),農業科學數據融合與自動化挖掘框架(2022YFF0711801),中國農業科學院院級基本科研業務費(Y2022LM20) 數據庫(集)組成本數據集包含石榴、核桃、獼猴桃、李、杏、棗、山楂、葡萄、桃、櫻桃、蘋果、柿、梨與板栗13 個樹種農家品種資源的名稱、品種拉丁名、樣本類型、所屬樹種、提供人和調查人的姓名、電話及地址、調查地點、海拔、經緯度、生境信息、植株情況、植物學特性、果實性狀、生物學習性以及品種評價等調查信息,每個樹種形成對應的13 個Excel 文件,共計1683 條記錄
農業種質資源是國家戰略性資源[1],也是開展優良品種選育的物質基礎。中國是世界上重要的果樹起源中心之一,世界各國廣泛種植的梨、桃、核桃和獼猴桃等落葉果樹樹種多起源于我國。由于我國國土面積較大,各地區環境條件復雜多樣[2-4],不同樹種對于環境的要求也不甚相同,樹種在優勢產區具有較高的適應性,因此我國資源呈現出多樣化特點。種質資源收集是所有植物育種和遺傳改良項目的首要原料來源。得益于世界各地的果樹種質資源,目前全球水果市場上已有大量新育成品種。保存果樹克隆活體種質的果園、苗圃等地作為獨特的種質資源庫,蘊藏著多種有價值的資源,包括優良品系、商業化栽培品種、傳統栽培品種、農家品種以及其他育種材料或野生近緣種[5-6]。果樹活體種質被果樹育種專家和其他生物學家廣泛應用,生物學家可能感興趣的是研究植物的特征、行為、馴化歷史和進化系統發育,而果樹育種專家關注的是直接表觀價值的商業特征[7]。
本研究通過對13個落葉果樹農家品種情況調查,收集和保存了大量落葉果樹農家品種資源,采集了相關數據,豐富了我國種質資源庫,可為選育優良果樹品種提供更多原始材料。
通過查閱文獻和果樹志等途徑,大體掌握我國主要落葉果樹優勢產區的地域分布,確定科學調查的主要區域和基本范圍。在實地走訪過程中,通過當地林業站、農業局等單位的協助,以及直接詢問當地人等方式,有效地確定調查的主要區域和主要樹種。
本研究選擇了石榴、核桃、獼猴桃、李、杏、山楂、葡萄、桃、櫻桃、蘋果、柿、梨和板栗等13個樹種,其中石榴具有218個品種,核桃206個品種,獼猴桃133個品種,李110個品種,杏151個品種,山楂66個品種,葡萄60個品種,桃86個品種,櫻桃64個品種,蘋果84個品種,柿110個品種,梨149個品種與板栗132個品種。在2012—2017年間分階段多次地按照堅果、核果、仁果和漿果4類制定“我國優勢產區落葉果樹農家品種資源調查與收集表”,調查表的制定參考《農作物種質資源技術規范》叢書系列中“果樹種質資源描述規范和數據標準”[8-20]相關專著標準。
現場調查前,通過摸底調查填寫當地果樹農家品種現有情況摸底調查表和地區果樹農家品種所有者登記表,到達現場后根據果樹種類分類填寫。首先對調查對象進行編號,編號采用唯一性流水線號,即子專題(片區)負責人姓全拼+名拼音首字母+調查者姓名拼音首字母+流水號數字。然后依次填寫表格內容,其中樹高、冠幅、干高等通過卷尺測量,葉長、葉寬、花冠直徑等通過游標卡尺測定。
采集自然成熟果實2.5~3.0 kg,通過游標卡尺測定果實橫徑、縱徑等,果實重量通過天平測定,果實可溶性固形物含量、可溶性糖含量、可滴定酸含量和維生素C含量等數據由農業農村部果品及苗木質量監督檢驗測試中心(鄭州)測定。
在樹種領域專家的帶領下多次訪問農家品種資源所在地進行數據采集,果樹農家品種資源鑒定信息參考中國植物物種數據庫,完成填寫我國優勢產區落葉果樹農家品種資源調查與收集表中的全部數據后,請相關領域專家對數據進行審核,然后將審核通過的數據按照數據匯交格式填寫到2012—2017年優勢產區落葉果樹農家品種資源調查數據Excel表中。
本數據庫為我國優勢產區落葉果樹農家品種資源的相關數據信息,優勢產區包括河南、湖北、湖南、西藏、北京、天津、河北、內蒙古、遼寧、吉林、黑龍江、江蘇、廣東、廣西、重慶、貴州、云南、四川、山東、上海、浙江、安徽、福建、江西、山西、陜西、甘肅、青海、寧夏和新疆等落葉果樹重點分布地區,收集數據并設置了2012—2017年間石榴、核桃、獼猴桃、李、杏、棗、山楂、葡萄、桃、櫻桃、蘋果、柿、梨和板栗13個樹種的序號、調查編號、品種名、品種拉丁名、樣本類型、所屬樹種、提供人和調查人的姓名、電話及地址、調查地點、海拔、經緯度、生境信息、植株情況、植物學特性、果實性狀、生物學習性與品種評價等數據,數據以樹種為單元。數據包含13個數據表,1569條記錄,主要通過對收集、調查的落葉果樹資料規范化測定、整理而成。
數據集包含果樹序號、調查編號(子專題片區負責人姓全拼+名拼音首字母+調查者姓名拼音首字母+所在地調查流水號)、品種名、品種拉丁名、樣本類型、所屬樹種、提供人和調查人的姓名、電話及地址、調查地點、海拔、經緯度、生境信息、植株情況、植物學特性、果實性狀、生物學習性與品種評價,數據樣本見表1。
數據調查過程中涉及個人隱私信息的部分尊重個人意愿,在數據共享發布前根據提供者要求進行相應脫敏處理。數據調查根據不同樹種特性及當時生長狀態采取合適的調查方式。調查表中的數據涉及到樹齡、調查地點等需要向至少3人核實后并經相關樹種專家鑒定后確定。枝條、芽、葉和花等植物學特征測定采用(上下左右中)5點取樣,即采即測,每個樣品重復3次,測定的數據取平均值。花、果實、果肉和種子等顏色性狀采用5點取樣,用比色卡輔助比對后確定,即采即測。果實采集后,5日內送到檢測中心進行可溶性固形物含量、可溶性糖含量、可滴定酸含量和維生素C含量等品質指標測定。
填寫后的數據要經過評估,經緯度、海拔和采集地點通過儀器測定,經實地調查詢問后適當修正。現場采樣測定的數據,要與參考書籍和專家咨詢鑒定相符合,特別是符合“果樹種質資源描述規范和數據標準”[8-20]相關標準,不應超出各地區區域規定閾值。果品尺寸實際數據通過卷尺、游標卡尺、電子天平和折射儀等工具測定,果品成分的分析由第三方檢測機構測定。所有資源的調查和采集均由相關樹種領域專家的帶領,是多次訪問農家品種資源所在地獲取的,果樹農家品種資源鑒定信息參考中國植物物種數據庫[21]。同時組建不同樹種領域的聯合專家組進行農家品種資源優勢產區所在地考察,以保證調查資源的可靠性和唯一性。
在國家科技部科技基礎性工作專項重點項目“我國優勢產區落葉果樹農家品種資源調查與收集”支持下,中國農業科學院鄭州果樹研究所聯合全國多家科研單位、大專院校的百余名科技人員,利用現代化的調查手段系統收集、整理和保護了我國主要落葉果樹農家品種資源并建立了檔案,形成數據庫。這項工作摸清了我國果樹農家品種的家底,為全國性的果樹農家品種鑒定評價、優良基因挖掘和種質創新利用奠定了堅實的基礎。我國優勢產區落葉果樹農家品種資源的原生境調查、植物學、生態適應性和重要農藝性狀調查與初步評價是第一手真實詳細的資料,這些資料包含原生境生存現狀,調查相關植物學性狀、生態適應性、栽培性能和果實品質等主要農藝性狀(文字、特征數據),以及對優良農家品種資源進行初步評價、收集,對推動我國果樹遺傳學研究和新品種選育等科技創新工作有非常重要的價值。
數據作者分工職責
代國威(1997—),男,四川省德陽人,碩士,研究生,主要從事人工智能及農業信息化工作研究。本研究主要工作:論文撰寫與修訂。
劉婷婷(1985—),女,北京人,碩士,助理研究員,主要從事農業科學數據獲取與研究。本研究主要承擔工作:數據整理與分類匯總。
李好先(1986—),男,河南省周口市人,碩士,助理研究員,研究方向為果樹遺傳育種。本研究主要工作:特色落葉果樹的資源調查和收集、數據整理與分類匯總。
胡林(1967—),男,內蒙古商都縣人,博士,研究員,研究方向為科學數據管理。主要承擔工作:總體方案設計與組織實施。
樊景超(1980-),男,遼寧沈陽人,博士,副研究員,碩士生導師,主要從事農業科學數據管理、農業信息技術研究。本研究主要工作:總體方案設計與組織實施。
曹尚銀(1961—),男,河南省信陽市人,博士,研究生,研究員,研究方向為果樹發育生物學和分子遺傳育種學。本研究主要工作:總體方案設計與組織實施。
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引用數據
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2012—2017 Data Set for the Survey of Deciduous Fruit Tree Farm Variety Resources in Dominant Production Areas
DAI Guowei1,2, LIU Tingting1,2, LI Haoxian3, HU Lin1,2, FAN Jingchao1,2*, CAO Shangyin3*
1. Agricultural Information Institute of Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China; 2. National Agriculture Science Data Center, Beijing 100081, China; 3. Zhengzhou Fruit Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Zhengzhou 450009, China
Fruit tree resources are a germplasm resource with high economic and ecological benefits. China's deciduous fruit tree variety resources are strategic national agricultural resources, and collecting and preserving deciduous fruit tree variety germplasm resources is the basis for carrying out excellent variety selection and breeding, which can provide more excellent primary materials for fruit tree resource breeders to select and breed excellent fruit tree varieties. The dataset collects data on the serial number, survey number, variety name, variety Latin name, sample type, tree species to which they belong, name, telephone number and address of the provider and surveyor, survey location, altitude, latitude and longitude, habitat information, plant condition, botanical characteristics, fruit traits, biological habits and variety evaluation of 13 deciduous fruit tree farm varieties. The specifications and data standards tabulated the basic traits of fruit trees for the Description of Fruit Tree Germplasm Resources. The survey results and data of all resources were obtained by experts of the relevant tree species who visited the location of the farm variety resources for several field surveys. The information on identifying fruit tree farm variety resources was referred to the Chinese Plant Species Database. The data obtained were formed into a standardized data set by the specified remittance format and named "2012—2017. The data were collected according to the specified ren-dezvous format to form a standardized dataset named "2012—2017 National Deciduous Fruit Tree Farm Variety Resource Survey Dataset". This dataset contains the resources of deciduous fruit tree farming varieties that are in danger of extinction and have specific agronomic traits in China, which can provide data support for conserving fruit tree resources and breeding research in China.
deciduous fruit trees; germplasm resources; resource survey; botanical information
代國威,劉婷婷,李好先,等.2012—2017年優勢產區落葉果樹農家品種資源調查數據集[J].農業大數據學報,2023,5(1):24-28.
DAI Guowei,LIU Tingting,LI Haoxian,et al.2012—2017 Data set for the survey of deciduous fruit tree farm variety resources in dominant production areas[J].Journal of Agricultural Big Data,2023,5(1):24-28.
10.19788/j.issn.2096-6369.230109
2023-01-16
國家農業科學數據中心(NASDC2022XM00),農業科學數據融合與自動化挖掘框架(2022YFF0711801),中國農業科學院院級基本科研業務費(Y2022LM20)
第一作者代國威,男,碩士生,研究方向:人工智能及農業信息化研究;E-mail:dgwstyle@foxmail.com。通信作者樊景超,男,博士,副研究員,研究方向:農業科學數據管理、農業信息技術研究;E-mail:fanjingchao@caas.cn;通信作者曹尚銀,男,博士,研究員,研究方向:果樹遺傳育種;E-mail: 13937192127@163.com。