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慢性粒-單核細胞白血病與骨髓增生異常綜合征的遺傳學差異分析

2023-05-27 03:26:34吳越陳瑩石淙鄒多兵王怡牧啟田
現代實用醫學 2023年4期
關鍵詞:基因突變檢測研究

吳越,陳瑩,石淙,鄒多兵,王怡,牧啟田

慢性粒單核細胞白血病(CMML)是一種臨床少見的造血系統克隆性疾病,發病率為(3 ~4)/10 萬,主要表現為骨髓中的一系或多系病態改變,外周血單細胞持續增多(>1×109/L)。既往,CMML 被認為是骨髓增生異常綜合征(MDS)的一個亞型,但鑒于其兼有骨髓發育異常和骨髓增殖的特點,2001 年WHO造血和淋巴細胞腫瘤分類將CMML歸屬于骨髓增生異常/骨髓增殖性疾病(MDS/MPN)[1-2]。Geyer等[3]提出寡單核細胞CMML 特殊亞型,從而更好地區分早期“增生不良”的CMML 和骨MDS。近年來隨著二代測序技術等高通量技術的發展,發現CMML和MDS 患者存在高頻突變。這些突變涵蓋了多種基因控制通路,其中包括表觀遺傳改變、剪接體復合通路依據轉錄因子和信號調節異常。但是關于CMML與MDS遺傳學異常,尤其是基因突變差異分析的研究國內罕見報道。本文回顧性分析32 例CMML 患者和159 例MDS 患者的臨床資料,比較CMML 與MDS 染色體核型和基因突變特征,報道如下。

1 資料與方法

1.1 一般資料 收集2012 年1 月至2021 年9 月在寧波市第一醫院就診且完成染色體核型或基因突變檢查的CMML 或MDS 患者(CMML 32 例,MDS 159 例)的臨床和實驗室資料,并參照WHO(2016)標準進行診斷分型。本研究通過寧波市第一醫院醫學倫理委員會審查批準(2022RS021)。

1.2 染色體核型檢查 抽取骨髓,接種于含20%小牛血清1 640 培養基中,37 ℃培養16 ~24 h,加入秋水仙酰胺,使細胞阻滯在分裂中期,經低滲、預固定、3 次固定等步驟制備染色體懸液。將細胞懸液在玻片上過火滴片,R 顯帶后,用吉姆薩液染色。顯微鏡分析10 ~20 個分裂中期細胞及染色體核型。依據《人類細胞遺傳學國際命名體制(ISCN)2020》進行核型描述。

1.3 二代測序檢測基因突變 提取CMML、MDS患者骨髓細胞,抽提基因組DNA,采用Ampliseq 多重PCR 擴增并構建樣本文庫,在Ion proton 平臺上進行高通量測序,測序后參考COSMIC 數據庫進行生物信息學分析,確定致病性基因突變位點,測序深度為2 000×。檢測由武漢康圣達醫學檢驗所完成。檢測位點包括NRAS、DNMT3A、SF3B1、IDH1、TET2、EZH2、JAK2、CBL、ETV6、IDH2、TP53、SRSF2、ASXL1、RUNX1 共14 種常見MDS 相關基因突變位點。

1.4 統計方法 數據使用SPSS 21.0 統計軟件進行分析。計量資料比較采用Mann-Whitney U 檢驗,計數資料比較采用2檢驗或Fisher 確切概率法。P <0.05 表示差異有統計學意義。

2 結果

2.1 CMML 與MDS 一般臨床實驗室指標比較CMML 患者中寡單核 CMML 7 例(21.88%),CMML-0 6 例(20.69%),CMML-1 13 例(44.83%),CMML-2 6 例(18.75%);按照M.D.安德森預后積分(MDAPS)進行預后分層,其中低危6 例(18.75%),中危(中危1+2)24 例(75%),高危2 例(6.25%)。MDS 患者按照IPSS-r 劃分:低危(極低危+低位)36例(26.64%),中危49 例(30.82%),高危(極高危+高危)56 例(35.22%),因統計資料不完整無法分層18例(11.32%)。

與MDS 患者相比,CMML 患者的男性、血小板計數、白細胞計數、中性粒細胞計數、單核細胞計數、骨髓原始細胞比例、乳酸脫氫酶和2 微球蛋白更高(均P<0.05);兩組年齡、血紅蛋白及血清鐵蛋白水平等差異均無統計學意義(均P >0.05),見表1。

表1 CMML 與MDS 臨床實驗室指標特征比較

2.2 CMML 與MDS 染色體核型差異分析 在32例CMML 患者中,有30 例進行染色體核型檢測,8例(8/30,26.67%)為異常核型,見表2;MDS 患者有155 例行染色體核型檢測,其中80 例為異常核型(80/155,51.61%),CMML患者發現異常核型率低于MDS 患者(2=7.450,<0.05),其中+8、+Mar 和-7/del(7q)是MDS 的常見異常核型,見圖1。

圖1 CMML 和MDS 異常核型的構成

表2 8 例CMML 染色體異常核型

2.3 CMML 與MDS 基因突變分析 CMML 患者中有21 例行基因突變檢測,其中18 例至少有一種基因突變(18/21,85.71%):MDS 患者有75 例行基因突變檢測,有45 例至少有一種基因突變(45/75,60.0%),CMML 發生基因突變率遠高于MDS(2=4.809<0.05)。

CMML 伴有基因突變患者中,僅1 種基因突變6例(6/18,33.33%),同時有2種基因突變7例(7/18,38.88%),3 種基因突變2 例(2/18,11.1%),4 種基因突變3 例(3/18,16.67%)。常見的基因突變依次為ASXL1(6/18,33.33%)、TET2(6/18,33.33%)、NRAS(5/18,27.78%)、SF3B1(4/18,22.22%)、RUNX1(3/18,16.67%)。MDS 中僅1 種基因突變23 例(23/45,51.11%),有2 種基因突變11 例(11/45,24.44%),同時有3 種基因突變5 例(5/45,11.11%),有4 種基因突變1 例(1/45,2.22%),同時超過4 種基因突變的有5 例(5/45,11.11%)。常見的基因突變依次為AXSL1(18/45,40.00%)、TP53(17/45,33.78%)、RUNX1(15/45,33.33%)、EZH2(13/45,28.89%)、SF3B1(13/45,28.89%),見圖2。

圖2 CMML 和MDS14 種基因突變的分布

進一步將14 種基因突按照功能分類:表觀遺傳學調控因子(包括AXSL1、EZH2、TET2、DNMT3A、IDH1/2)、信號轉導因子(CBL、JAK2 和NRAS)、pre-RNA 剪接因子(SF3B1 和SRSF2)、DNA 損傷因子(TP53)和基因轉錄因子(RUNX1、ETV6)。分析結果發現,CMML 表觀遺傳學調控基因突變率和信號通路調控的基因突變率均高于MDS(均<0.05),而其他類型差異均無統計學意義,見表3。

表3 CMML 與MDS 基因功能的基因突變率比較 例(%)

3 討論

在本研究中,與MDS 患者相比,CMML 患者白細胞計數更高,粒細胞及單核細胞增多,骨髓原始細胞比例更高,且伴有更高的血小板(均P <0.05)。這反映了CMML骨髓增殖特性,進而導致血小板進一步增加。同時筆者觀察到CMML 患者相較MDS患者具有較高的乳酸脫氫酶和2 微球蛋白(均P <0.05),這也反映了CMML 由于細胞增殖呈現高代謝狀態,與Germing 等[4]研究結果較為一致。

本研究CMML患者染色體異常檢出率為26.67%,與國外文獻報道20%~30%[5]結果較為一致。CMML總體染色體異常率明顯低于MDS(P <0.05)。CMML 常見染色體異常類似于MDS,以+8、-Y、-7/7q-、20q-等為主[6-7],但孤立性5q-要明顯低于MDS[8]。本研究盡管CMML病例數較少,但+8 有3 例。

國外文獻報道接近90%的CMML 患者可能出現分子學異常[9]。本研究中CMML 患者基因突變率為85.7%。在波蘭的一項研究中,檢測42 種基因突變,發現100%CMML患者存在至少1 個基因突變,而74% MDS 患者存在至少1 個基因突變[10]。在單個基因突變中,NRAS 基因突變率也明顯高于MDS(P <0.05)。Han 等[11]研究發現,NRAS 突變在CMML中出現的概率約為36.17%,本研究NRAS基因突變出現的頻率為23.81%,低于上述報道,這可能與本隊列中含有7 例寡單核細胞CMML 患者有關。Carr 等[12]研究證實NRAS 突變能通過KMT2APLK1 軸持續促進細胞增殖,這可能是CMML 白細胞計數高于MDS原因之一。本研究結果顯示CMML患者CBL基因突變概率高于MDS患者(P<0.05),這與Schnittger 等[13]研究發現,CBL 突變在CMML中發生的概率約為10%,遠高于MDS 的CBL 突變(小于5%)。研究顯示,CBL 突變與白細胞計數呈正相關,是CMML去甲基化治療獨立預后的不良因素。新近一項研究發現,CBL 突變與LYN 激活能促進CBL 自身磷酸化,激活PI3K/AKT 信號,從而促進CMML 腫瘤細胞持續增值。本研究進一步把基因按照功能進行分類,發現CMML參與表觀遺傳學調控和信號通路調控的基因突變的頻率高于MDS(均P <0.05),這提示兩種疾病分子發病機制存在差異。

總之,與MDS 相比,CMML 具有高代謝性,更低染色體異常率,更高基因突變率。本研究還存在許多不足,如樣本量不大,檢測基因突變種類不多,還需要進一步擴大樣量、增加基因突變種類進行多中心研究來驗證。

利益沖突 所有作者聲明無利益沖突

作者貢獻聲明 吳越:采集數據、分析數據、統計分析、撰寫論文;陳瑩:數據采集、分析數據;石淙、鄒多兵:采集數據;王怡:研究指導、行政、技術支持;牧啟田:研究指導、論文修改、經費支持

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