HMGN 基因家族在肝癌中的表達及預后價值的分析

蔡典葵，李昂，楊思加，韋金星，閔軍

肝癌是最常見的癌癥之一，在2020 年新發病例約為9.06 萬人，相關死亡人數約為83 萬人；肝癌是世界上常見的第六大癌癥，也是第三大癌癥相關死亡病例［1］。近年來，病人的預后隨著肝癌治療水平的提高而逐步好轉［2］。但是肝癌病人總體預后仍然不容樂觀。所以，尋找新的診療目標刻不容緩。

高遷移率基團核小體結合蛋白（high mobility group nucleosome-binding protein，HMGN）是脊椎動物細胞細胞核內普遍表達的非組蛋白染色質結構蛋白家族［3］。HMGN 基因家族共有5 個成員，分別是能與核小體特異性結合的HMGN1、HMGN2、HMGN3、HMGN4 和HMGN5。在近年的研究中，有一些證據顯示HMGN 基因家族在癌癥的發生和發展過程中扮演著重要角色［4-15］，但是僅有少量研究表明HMGN 基因家族對肝癌的發生發展中起著重要的作用［16-18］，這些研究都是單獨調查，缺乏系統的分析。

在本研究中，我們從TCGA 和GEO 數據庫中提取HMGN 基因家族的表達和臨床數據，并結合GEPIA 數據庫對HMGN 基因家族進行系統分析。在為肝癌患者帶來福音的同時，探索新的診療目標，也為后續的研究打下基礎。

1 材料與方法

1.1 TCGA 和GEO

TCGA 和GEO 是開放的數據庫［19，20］。在這項研究中，我們從TCGA 和GEO 數據庫中獲得了HMGN 基因家族在肝癌組織和正常組織中的相對表達量以及臨床數據。我們探究了HMGN 基因家族在肝癌組織和正常組織的轉錄水平差異，并比較了HMGN 基因家族在肝癌不同分期的轉錄水平差異。

1.2 GEPIA

GEPIA 是一個癌癥和正常基因表達譜和交互式分析的網絡服務器［21］。在這項研究中，我們通過GEPIA 的生存模板，以75%的高表達組為界，以25%的低表達組為界，分析了HMGN 基因家族中mRNA 水平與肝癌患者生存率的相關性。……