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Orfeo ToolBox 影像處理技術體系和應用

2023-10-11 08:48:50牛坤龍木嘯林王晉年蔡世榮楊現坤
地理空間信息 2023年9期

牛坤龍,木嘯林,王晉年,2,蔡世榮,楊現坤*

(1.廣州大學 地理科學與遙感學院,廣東 廣州 510006;2.廣州大學 遙感大數據智能應用創新中心,廣東 廣州 510006)

Orfeo ToolBox(OTB)是一個用于處理遙感衛星數據的工具包,具有基于開源社區、支持多語言開發、可擴展和算法集成、文檔完善等特點,最早由法國航天局(CNES)于2006年發起,用于處理Orfeo計劃中法國晶宿星(Pléiades)衛星和意大利“宇宙—地中海”高分雷達衛星的高分辨率圖像,隨后逐漸應用于其他衛星數據處理。OTB建立在開源地理空間社區的基礎上,除CNES 外還有眾多軟件開發者參與開發并將其整合到應用項目中。OTB 可處理高達TB 級的高分辨率光學、多光譜、高光譜和雷達圖像,并提供正射校正、全色銳化、監督或非監督分類、特征提取、SAR 數據處理等[1]多種處理工具;還具有很強的兼容性,在Windows、Linux 和Mac OS X 等各種平臺以及從筆記本電腦到高性能計算機集群[2]等不同性能的計算機都支持其運行。目前,OTB是多個大型遙感圖像處理項目的核心組成部分,也是研究遙感圖像處理算法實驗和編寫遙感圖像處理新算法、模型的首選工具。可擴展性、多功能性和開放性一直是OTB的關鍵特征,也是推動其不斷擴展應用的主要動力。然而,限于其發展起步較晚,在國內應用極少,因此本文介紹了OTB的技術體系和主要特點,并通過典型案例說明OTB技術和工具的可行性與實用性,以期為國產衛星圖像處理技術發展提供新的思路。

1 OTB的主要特點

OTB經過30多個版本的更新迭代,已從一個服務于Orfeo 計劃、處理超高分辨率遙感數據的工具箱發展成為一個處理多傳感器遙感數據的完整工具集。

1)算法高效。OTB 核心庫是基于Insight Toolkit(ITK)包,采用C++語言編寫的。ITK是用于醫學成像的開源軟件工具包,包括影像配準、分割等功能。OTB 深度集成了泛型編程思想,實現代碼更加高效,可在代碼編寫時及時發現軟件問題,還能處理從不同波段到不同尺寸再到不同像素類型的圖像。OTB算法涵蓋了從衛星圖像預處理到高性能遙感圖像深度學習[3]的大量功能,所有算法均可通過Monteverdi、QGIS、Python、控制臺或C++集成開發和處理。OTB集成了Monteverdi 圖像可視化工具,可采用硬件加速方式渲染顯示高分辨率圖像;用戶可操作顯示TB 級的衛星圖像,并可通過工具箱中的工具集對圖像進行處理分析。OTB的目標是為衛星影像信息提取(基于通用、高性能C++類庫)提供一個免費的“端到端”軟件解決方案(基于大數據管道計算模式)。在此基礎上,OTB可以構建應用程序和鏈式處理流程來滿足從遙感影像處理到用戶桌面應用程序開發的不同需求。

2)接口復用。OTB 為遙感圖像處理軟件庫提供了一個通用接口,使各種軟件都可通過該接口調用其提供的軟件處理和分析模塊,從而提高其代碼和模型的復用能力[4]。因此,OTB 采用地理空間數據抽象庫(GDAL)讀寫柵格和矢量格式,采用開源安全信息管理系統對幾何傳感器建模,采用libSVM、OpenCV 和Shark 進行機器學習,采用MuParser 解算高性能數學表達式。此外,OTB開發一直堅持跟蹤遙感圖像處理技術的前沿進展,在新算法出現時及時跟進集成該算法。目前較流行的形態譜[5]、降維算法(PCA、NA-PCA、ICA 等)[6]、直 線 提 取 算法(LSD)[7-8]、Haralick 紋理和SURF 關鍵點匹配等算法都已集成在OTB軟件包中。

3)開發社區。與許多開源項目一樣,很多沒有編程能力的用戶也參與了OTB軟件的開發,極大地促進了其發展。例如,他們可以協助文檔更新、BUG上報、功能反饋等,不斷完善OTB不同類別的文檔是OTB開發中的一環。目前國內很少有開發者參加該開發社區,造成當前OTB對應的中文開發材料太少,使用和應用案例也極少見,進而導致國內對OTB 的應用較少。2015年初,OTB成立了官方項目指導委員會(PSC),該思想來源于其他GIS軟件項目(GRASS GIS[9]和QGIS)。PSC是OTB項目發展的協調中心,決定重大事件;也是OTB項目的長期運行機構和資源中心,以吸引更多的開發人員參與,并保證OTB開源和獨立發展。

2 OTB的技術架構

OTB是適應用戶桌面上交互式計算和多核架構TB級遙感影像處理的軟件包,通過模塊化的3 層軟件架構來實現(圖1)。其核心是C++API,用于實現大數據管道計算模式,支持多線程、流和消息傳遞。因此,所有模塊均可根據內存和CPU資源自動調整達到最優處理。此外,借助內存應用程序鏈(最小化磁盤I/O訪問)的輔助功能,可非常容易地從開發機器移植代碼并擴展到高性能計算集群。由于采用模塊化架構,OTB允許用戶快速設計從預處理到高級特征提取方法和機器學習算法的遙感圖像處理模塊,完成用戶從原始數據到標準專題產品的一系列處理。

圖1 OTB軟件架構

2.1 Monteverdi影像瀏覽工具

OTB集成了Monteverdi影像顯示工具。Monteverdi是基于Qt 和OpenGL 開發的輕量級圖像渲染和操作工具,利用飛冰圖形渲染引擎使圖像顯示和瀏覽更快速、高效,并能以傳感器幾何結構顯示圖像。Monteverdi的主要功能包括:①利用GDAL流暢顯示和瀏覽地理大數據;②高級OpenGL 功能,如采用浮雕紋理和OpenGL 著色語言實現局部和全局渲染;③多源影像顯示,可實時簡單配準各影像坐標參考系統,集成顯示多源影像。

2.2 OTB工具集

OTB工具集具有跨平臺、即用型的特點,提供了90多個遙感圖像處理工具。每個處理工具均可獲取底層C++類庫中影像處理函數或將它們組合成高級的管道計算模式[10],為許多復雜的遙感算法提供簡單的接口,使基于OTB 的各類工具集研發更加便捷。例如,正射校正工具采用管道計算模式,集成一系列復雜的圖像處理算法,用戶只需設置一些簡單的參數(如輸出數據的投影坐標系、數字高程模型數據、插值模式等)即可開始數據處理工作。OTB工具集大多采用了類似的設計思想,使各工具可與用戶更好地交互并協同工作。OTB 工具集的代碼與用戶界面是相互獨立的,這是通過應用程序框架實現的。基于該框架,OTB無需重寫代碼即可為每個應用工具提供不同的交互接口,以滿足在不同場景的調用需要。

OTB 工具可通過以下接口獲得:①控制臺/命令行;②基于Qt的GUI界面;③Python用于高級編程和與NumPy數組模塊結合分析;④Monteverdi用于交互式查看衛星影像;⑤QGIS 通過其處理工具箱訪問;⑥Zoo-Project[11]通過Web 處理服務訪問。此外,OTB工具還可通過Python 插件在QGIS 軟件中使用,OTB所有工具集集成在QGIS 處理工具箱內,借助QGIS 軟件使空間分析更加容易實現[12]。OTB 還支持協同工作,使基于OTB的不同界面交互更加便捷,如OTB可把每個工具的配置參數保存到XML文件,也可將GUI參數自動轉換為Bash腳本以便于在Linux平臺運行。

2.3 無縫擴展

OTB 處理遙感影像對計算機內存幾乎沒有要求,因此OTB工具可無縫擴展到服務器平臺甚至服務器集群去處理更大的遙感影像數據集。OTB中實現的算法都是分塊執行處理,所需內存不變,這意味著數據量越大、所需處理時間越長。采用分塊處理方式是因為OTB依賴于ITK管道計算模式(分塊處理在ITK中也稱為流處理)。即使在管道計算模式中集成多種算法,分塊運算也會一直有效[13]。當某些算法沒有明顯的分塊計算方法時,OTB 還提供了這些工具的自開發編譯版本,以保障分段或分塊計算處理的結果穩定,如Mean-Shift分割算法[14]和大規模區域增長分割算法[15]等。

內存不同的機器都可以處理不同量級的遙感衛星影像是OTB的一大優勢。實際上,OTB還可充分利用現代CPU架構和高性能計算基礎設施(HPC)提高運算效率[16],即OTB算法處理盡可能做到線程化,充分利用CPU 的多核性能提高運算效率,主要通過Open-Threads[17]和OpenMP[18](用于小部分代碼)命令來實現。隨著數據量級的不斷增大,應優先在HPC架構上處理遙感大數據的衛星影像,以充分利用共享的高帶寬存儲的相似節點。OTB也可實現該功能,采用信息傳遞接口并行處理,整個管道計算模式跨節點復制運行,每個節點產生一部分結果圖像[19],最后匯總合并,如OTB對整個Pleiades 衛星圖像(16 億像素)進行全色銳化,分布在560 個單線程節點上執行,處理時間僅需4.3 min。從多個OTB工具集構建一個處理鏈非常簡單且容易擴展,但每個工具產生的中間數據必須寫入磁盤,再由下一個工具讀取,若不想保留中間結果,反復存儲將浪費不必要的磁盤讀寫時間,OTB可在不同應用工具之間建立內部管道,并在整個處理鏈中啟用分塊處理,以減少磁盤讀寫時間,提高數據分析效率。

3 OTB的主要功能

OTB 工具包提供的主要功能包括遙感圖像讀取、寫入、轉換和提取,遙感圖像正射校正、輻射校準和全色銳化等預處理,常見圖像處理任務(閾值分割、傅里葉或小波變換等),特征提取(輻射指數、紋理、形狀等),形態算子分析,圖像分割并矢量化分割結果,監督或非監督分類,基于面向對象的圖像分析和機器學習以及專題遙感圖制作和發布。

3.1 遙感圖像讀寫

OTB 提供支持各類文件的I/O 結構,不強制特定的文件格式,當有新格式文件時,用戶可以很容易地擴展新格式的訪問。OTB圖像讀寫結構類圖見圖2。

圖2 OTB圖像讀寫結構類圖

3.2 遙感圖像配準

在OTB中,圖像配準是在可插入組件的框架中執行的,可以很容易地更換組件,這就意味著用戶可創建多種組合的配準方法,進而選擇合適的工具在程序中應用。在OTB/ITK中采用圖像配準框架建立圖像配置的管道結構見圖3。

圖3 圖像配準樣例管道結構圖

3.3 正射校正

正射校正是將傳感器幾何圖像轉換為地理或地圖投影的過程,具體流程為:①傳感器建模,通過幾何傳感器模型將圖像坐標(行、列)轉換為地理坐標(緯度、經度),嚴格的建模需數字高程模型來參考地形情況[20];②光束法平差,在圖像具有序列結構的情況下,可利用圖像間的同名點來細化幾何模型和參數(這是一個可選步驟,目前未在OTB中實現);③地圖投影,允許地理坐標投影到一些特定的地圖投影,如蘭伯特投影、墨卡托投影或UTM投影。

3.4 圖像融合

遙感圖像融合大多采用全色銳化方法[21],將衛星的全色波段(高空間分辨率數據)與多光譜(XS)波段(幾個光譜波段的較低分辨率)結合起來,生成具有多個光譜波段的高分辨率圖像;再利用低通濾波器使全色波段的頻譜內容(在傅里葉域中)等同于XS數據;最后利用低通濾波處理的全色波段對XS 數據進行歸一化,并將結果與原始全色波段相乘。

3.5 圖像分割

圖像分割是面向對象遙感數字圖像處理中的一個重要步驟。OTB 工具包中集成了ITK 中相應的算法,最典型的是區域增長算法。區域增長算法是將成組的像素或區域發展成更大區域的過程,從種子點的集合開始,逐個把與每個種子點具有相似屬性強度、灰度級、紋理顏色等的相鄰像素合并到該區域。ITK 中包括連通閾值算法[22]、大津法分割算法[23]和鄰域連接算法[24]等區域增長算法。

3.6 圖像分類

圖像分類是對遙感圖像上的信息進行屬性識別并分類,從而達到識別圖像信息對應的實際地物類別、提取所有地物信息的目的。除人工目視解譯外,監督分類和非監督分類[25]是遙感圖像分類的常用方法。OTB提供了監督和非監督分類算法,包括K均值、自組織映射(SOM)、貝葉斯分類和支持向量機等。SOM 算法是由Kohonen 提出的一種非監督神經學習算法[26],在學習過程中相鄰像素通過相互作用、相互競爭、相互適應來匹配樣例的特征模式,實現了從高維特征空間到低維空間(通常是二維空間)的非線性投影,能在保持特征空間拓撲關系的同時,找到結構化數據集與低維網絡之間的對應關系。由于這種拓撲結構,最終得到的分類結果呈現了集群關系。SOM分類結果見圖4。

圖4 SOM分類結果

在OTB的貝葉斯分類中,OTB首先將一個矢量訓練樣本分為兩個子樣本,每個子樣本只存儲一類矢量;然后分別利用參數估計算法和高斯密度函數處理得到各自的概率密度;最后由概率密度與由子樣本得到的先驗概率組成樣本分類器。

4 應用案例

除在OSGeo4W、QGIS和Zoo等第三方工具中集成了OTB工具集之外,OTB類庫和工具集也逐步延伸到不同的遙感圖像處理生產環境中,承擔大量對地觀測專題產品生產任務。

4.1 哨兵2號(Sentinel-2)影像分割

Sentinel-2 的主要任務是提供連續覆蓋全球的衛星影像,具有高空間分辨率、高時間分辨率和從可見光到短波紅外的多個波段數據;每天產生約1.2 TB原始數據,因此需要設計具有高效圖像處理能力的有效載荷數據地面站(PDGS)來生產近乎實時的1C 級數據產品(大氣層頂部正射校正數據產品)。為開發PDGS的圖像處理模塊,歐洲航天局(ESA)選取OTB類庫作為儀器處理設備模塊的主要部分。準確來說,自2016年7月以來,OTB濾波器已用于所有Sentinel-2影像的輻射校正(去噪、缺陷像素檢測和校正、掩膜和衛星大氣頂層轉換)和重采樣操作等。OTB在Sentinel數據處理框架中的集成,數據質量和處理性能都取得了非常好的效果。此外,OTB類庫也在ESA的任務效率評價中心用于一些校準和驗證處理工作。

4.2 多時相大氣校正和云檢測

遙感是研究地表狀態和變化的有力工具,但太陽光進入大氣層會受到嚴重干擾(云、氣體分子與氣溶膠會散射和吸收太陽光或地球表面反射的光,導致傳感器接收的光譜信息不準確),因此遙感圖像需通過預處理獲得準確的光譜反射數據,如云檢測和大氣校正等。這些過程對處理陸表衛星影像來說比較困難,主要問題為無云像元的識別和大氣影像的消除。云檢測問題現在可采用多個云檢測模型[27]解決;而大氣校正必須考慮兩個影響:①大氣氣體(特別是水蒸氣、臭氧、氧氣和二氧化碳)的吸收,吸收在特定吸收波段起主要作用,但地表觀測的光譜通常會回避這些強吸收帶,在這些波段中,可采用大氣校正簡化模型[28]或6S輻射傳輸模型[29]等準確校正氣體吸收;②空氣分子和氣溶膠的散射,大氣中的散射可以非常精確地建模,但需準確知道大氣成分,對于空氣分子來說,建模已沒有問題,主要困難在于氣溶膠的影響,因為氣溶膠在不同位置和時間的吸收特征差異很大。

根據氣溶膠光學厚度和氣溶膠模型的經驗積累,利用輻射傳輸模型可以校正氣溶膠影響并將衛星大氣頂層反射率轉換為地表反射率[30]。OTB的多時相大氣校正和云檢測(MACSS)工具是一連串處理工具的集成[31],由CNES設計,完全基于OTB類庫開發,最早應用于法國THEIA陸地數據中心,以近乎實時的方式生成和分發在500萬km2區域獲取的Sentinel-2數據,并在2016年底和2017年初逐步推廣到其他數據中心使用。

4.3 地表覆蓋數據產品

及時準確的土地覆蓋數據對于許多地表分析應用至關重要,學術界已把地表覆蓋數據作為一個關鍵的氣候變量[32],在各種地表變化過程分析和氣候變化模擬中應用。因此,土地覆蓋數據需要及時不斷地更新,以反映地球表面的現勢性。法國THEIA土地數據中心成立了一個科學專業知識中心,其主要目的是利用Sentinel-2 時間序列影像對全球進行全自動土地覆蓋制圖。該產品每年更新一次,包含20 個10 m 分辨率的專題圖。法國生物圈研究中心開發的基于OTB的開源系統可統一生成類似于法國THEIA土地數據中心生產的土地覆蓋制圖,且不斷更新。該系統可通過大批量地表覆蓋數據評估新的遙感影像分類算法的性能,以更好地服務于全球遙感地表土地覆蓋數據生產。此外,該系統設計目的之一是使其可移植到全球任何國家和地區,并允許用戶修改影像命名規則和更新頻率,以適應不同的應用場景,因此系統內每個步驟都是獨立的,與不同地區的地圖編碼規則或地類類別配置沒有關系;同時還可通過輸入數據(其他對地觀測數據、參考數據等)把所有特征考慮在內,無需修改工作流程的其他任何部分即可執行數據生產任務。2020年法國土地覆蓋圖見圖5。

圖5 2020年法國上空的THEIA土地覆蓋產品原型

4.4 地理信息服務于可持續發展(GEOSUD)

生態系統、農業系統和國土空間信息對于環境可持續發展、農業評估和國家公共政策實施至關重要。GEOSUD旨在調整國家環境和國土管理策略,方便學術界和公眾獲取空間信息。目前,該部分數據由提供超高分辨率遙感產品的地理空間數據基礎設施提供(如RapidEye、Pléiades、SPOT6/7 等)。GEOSUD 可由OGC的網絡服務進行數據訪問、數據可視化和目錄請求等實現。實現OGC Web處理服務標準的基礎設施可支持遠程交互式地理空間數據處理[33]。當前OTB已集成在該集群計算架構中,以加快密集數據的處理流程。OTB提供了大量應用工具集以滿足不同層次用戶的應用需求。

4.5 Sentinel-2數據服務于精準農業

對于農業管理和糧食安全來說,基于對地觀測遙感數據研發高效的農業遙感監測網絡至關重要。Sentinel-2 任務具有區域到全球農業監測能力,在此背景下,ESA 于2014 年啟動了“Sentinel-2 農業”項目,旨在通過開發相關產品的開源處理工具,利用Sentinel-2 數據進行農業遙感監測。這些處理工具是基于OTB 應用程序框架和類庫開發的,可通過Sentinel-2(Landsat8)在區域或國家范圍內(圖6)快速生成2A級數據產品,包括無云的地面反射數據集、植被狀況指標(LAI、NDVI 和物候指標)、動態農田掩膜和作物種類制圖。作為OTB 應用工具,“Sentinel-2 農業”處理工具集可與其他標準開源處理框架深度對接,如可與Sentinel應用程序平臺完美集成。

圖6 作物種類制圖和LAI制圖

5 結語

在過去十幾年中,OTB 已從基于C++類庫服務于Pléiades 衛星影像處理的工具包發展為滿足大多數遙感圖像處理需求的多功能軟件工具包,目前已是多個大型遙感圖像處理項目的核心組成部分,是遙感圖像處理算法實驗和編寫新算法、模型的首選工具。可擴展性、多功能性和開放性一直是OTB 的關鍵特點,也是推動其不斷擴展應用的主要驅動力。OTB發展始終以用戶為導向,其項目指導委員會充分吸收開發社區不同參與者的建議,促進軟件可持續發展。隨著OTB 開發社區參與者的不斷增加,軟件不斷發展,擁有更多先進的算法,并使其深度集成,具有較強的交互性,最終更好地服務于遙感圖像處理。

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