建立育種技術體系 打造南方區“豬芯片”
——記南方區地方豬新品種（配套系）培育及良繁項目

文丨陳力 王金勇

生豬產業是我國畜牧業乃至農業的支柱產業，關系到“肉盤子”產品穩定供給，對保障人民群眾生活、穩定物價、保持經濟平穩運行和社會大局穩定具有重要意義。種業作為生豬產業的源頭，位于生豬科技創新鏈與產業鏈的頂端，是生豬產業的“芯片”，是決定生豬產業發展的核心要素，是大國養豬業的競爭焦點，是國家糧食戰略安全的重要組成部分。

我國擁有世界上最大的引進豬種群體和最多的地方豬種資源。對引進豬種而言，經過幾十年的本土化發展，我國建設形成了育種、擴繁、推廣的繁育體系，育種進展明顯加快。雖然種豬質量與國際先進水平仍有差距，但從種豬數量供給來看，我國每年約有20萬頭的純種豬更新需要量，近5年年均引進種豬約8000頭，90%以上的種豬更新靠自主選育，為穩定生豬生產起到了重要的支撐作用。對地方豬種而言，受傳統飲食文化習慣的影響，肉質風味優良的地方豬肉日益受到消費者青睞，地方豬種質資源價值日益提升。然而，由于地方豬種存在單一品種規模小、育種體系不健全、生產效率低等不足，同時在非洲豬瘟等重大疾病的影響下，種業安全正在經受嚴峻挑戰，因此迫切需要從種業源頭開展科技創新和品種培育，為實現地方豬產業現代化提供核心競爭力，也為我國生豬種業的供給側結構性改革提供種源支撐。

2021年，中國農村技術開發中心積極探索“部省聯動”等科技管理改革舉措，就“畜禽新品種培育與現代牧場科技創新”重點專項設置兩個部省聯動項目，其中由重慶市科技局推薦的“南方區地方豬新品種（配套系）培育及良繁”項目受到多方肯定，項目牽頭單位重慶市畜牧科學院在中國農村技術開發中心與重慶市科技局的指導下，團結10家項目參與單位，設立了項目實施領導小組、項目管理辦公室、項目專家咨詢組等組織，詳細制定了《項目執行與管理方案》《項目管理手冊》等文件，有計劃、有組織、有重點地開展各項研究任務。

項目緊緊圍繞生豬種業安全和地方豬種現代化，以優質、高繁、高效為目標，充分利用我國南方區優勢地方豬種資源，研發優質高繁抗病抗逆育種新技術，構建精準高效的地方豬基因組育種技術體系，培育系列特色突出的地方豬新品種（配套系），目前各項研究工作均有序開展并取得階段性的成果。

地方豬優質高繁抗病抗逆特性研究，技術研發的基石

肉質感官評價員培訓現場照片

豬肉品質怎么樣？好不好吃？怎么評價呢？項目組重慶市畜牧科學院肉質團隊對70余名志愿者進行視覺（顏色深淺）、味覺（酸、甜、苦、咸等）、嗅覺（果、肉類香精）綜合測試，最終篩選出21名初選肉質風味感官評價員組成了感官評價小組，經過一年多的感官評價培訓，培訓出一支標準化強、準確性高、重復性好的肉質感官風味評價團隊，并篩選確定了12個肉質風味感官描述詞，結合樣品采集、樣品制備、樣品評價等，已初步構建豬肉質感官評價體系，邁出了國內豬肉質風味標準化評價體系構建的第一步，為實現地方豬肉優質優價的分級評價體系構建奠定了基礎。

要想效益好，多生優生是關鍵。我國地方豬是高繁殖力寶貴的基因庫，為了挖掘地方豬高繁殖力特性，項目組南京農業大學團隊赴太湖流域各地方豬保種場進行二花臉豬和梅山豬樣品采集和表型測定，目前共收集到736頭梅山豬共17胎次3982條產仔數數據，1012頭二花臉豬118胎次共3509條產仔數數據，配種后12天13頭二花臉豬子宮角總長度和總重量數據，妊娠24天11頭二花臉豬子宮角總長度和總重量數據，明確了高產母豬子宮角總長度和總重量顯著增加的特性，通過GWAS分析，篩選鑒定出影響產仔數的候選基因2個（CATSPER1 和SLC46A3）、調控豬卵泡發育的候選基因1 個（SAMD5），為高產性狀遺傳機理深度解析和育種提供可靠數據和理論依據。

目前我國豬場疫病防控壓力大，很多豬場受到豬流行性腹瀉、藍耳病等疫病影響，為了進一步揭示地方豬抗病機理，項目組多個團隊以攻毒的形式分別對豬流行性腹瀉、豬藍耳病和豬恢復力進行研究，初步構建了病理研究模型，測定了大量血液、病毒量、體重等表型指標，為地方豬抗病表型指標的鑒定提供了支撐，為進一步挖掘地方豬抗病遺傳機理提供保障。

由于我國地形地貌、氣候條件等豐富，我國地方豬種在進化中表現出較好的適應性和抗逆性，如高原適應性、耐粗飼、耐高溫高濕等，而地方豬抗逆性研究不夠，項目組多家單位根據南方區地方豬的抗逆特色，在不同地方挖掘地方豬抗逆表型特征，如高原適應性豬的呼吸頻率、耐粗飼豬的表觀消化率、耐高溫高濕豬的體溫等，為進一步挖掘地方豬抗逆特性遺傳機理提供保障。

地方豬精準高效基因組育種新技術研究，技術應用的核心

團隊成員赴太湖流域各地方豬保種場進行樣品采集

目前，對種豬體尺、背膘、眼肌面積、肌內脂肪含量等表型數據的收集依賴于人工，測定的準確性受到豬只站立狀態、測定人員熟練程度等影響，為了更高效、更準確獲取種豬表型數據，項目組湖北農業科學院畜牧獸醫研究所團隊搭建了視頻圖像數據采集平臺，運用紅外及可見光深度相機采集了2.7TB 標準化豬只體尺、體重預測圖像數據，運用CNN 技術對特征圖像進行了分割識別；同時，項目組重慶市畜牧科學院團隊結合B 超測定和索氏抽提技術，獲得1216 組高質量圖片與肌內脂肪含量對應數據，正在利用FCN 和R-CNN 等模型進行初步測試，完成了選定模型小樣本初試，測試準確率達85%，選擇準確性更高的預測模型用于圖片的訓練。

團隊成員在豬場進行紅外影像數據收集設備安裝與調試

現有基因組選擇方法主要針對外種豬，而針對地方豬基因組選擇方法測定準確度較低，項目組中國農科院北京畜牧獸醫研究所團隊利用全基因組關聯分析結果，提出全基因組育種值估計新方法GF_PCR，該方法在達100千克體重日齡、達100千克體重校正背膘厚及總產仔數這三個性狀相關數據驗證中證實，該方法具有三大優勢，一是能夠整合GWAS結果提高基因組預測準確性，二是能減少非致因突變對預測結果的干擾，三是能大大縮短計算時間，為基因組選育提供了穩定、準確的新途徑。

為了加快推進地方豬基因組選擇進展，項目組中國農科院北京畜牧獸醫研究所通過基因組測序、現有數據下載等方式，收集30多個地方豬品種的數據，共獲得938萬個在＞80%群體的最小等位基因頻率(MAF) ＞= 0.05的SNPs，針對需要，已設計出50K、80K、100K等3種規格地方豬適用性芯片，目前正處于實驗室效果驗證階段，預計2023年8—9月發布并項目組內部群體試應用。

地方豬新品種（配套系）培育，技術推廣的保障

由于氣候條件、飲食文化的不同，為了滿足多元化的豬肉市場需求，項目組分析我國西南、華東、華南、華中等地區特色，綜合選擇南方區榮昌豬、內江豬、監利豬等代表豬種，開展地方豬新品種（配套系）培育，目前項目組共組建11個育種群體，并進行不同程度的測定和選育。

鄉下黑豬新品種種豬（左為母豬，右為公豬）

由項目組壹號食品股份有限公司牽頭經過10余年培育的鄉下黑豬新品種已獲得國家畜禽遺傳資源委員會頒發的新品種證書，該品種聚合了多個生態區域的品種，包括廣東小耳花豬、萊蕪豬、湘西黑豬、圩豬與杜洛克豬，遺傳基礎豐富，生產性能較突出，總產仔數11.2頭，日增重639克，飼料轉化率3.07：1，瘦肉率51.5%，肌內脂肪含量3.7%。該品種生產的豬肉通過開設的“壹號土豬”專營連鎖店遍布廣州、深圳、北京、上海、成都等全國近30個主要城市，門店數量近2500家，2022年實現銷售收入24.71億元。

金烏豬新品種生產的年豬活動（左圖）和豬肉品嘗活動（右圖）

由項目組重慶市種豬場有限公司主導培育的“海聆I號”豬配套系從各系制種到持續選育至今已有15年，目前該群體性能穩定，已經完成中間試驗及種豬第三方性能測定，國家新品種（配套系）審定申請材料已于2023年7月30日提交到重慶市農業農村委員會，待主管部門同意后遞交材料到國家畜禽遺傳資源委員會。目前，該群體商品豬具有適應性強、肉質好、生長速度較快的優點，日增重653克，飼料轉化率3.23：1，瘦肉率55.2%，肌內脂肪含量2.86%。該群體育繁推銷一體化，主要以西南地區市場為導向，大力推出“涪陵黑豬”品牌，正在打造含繁育基地、屠宰場、生態飼料加工配送中心、食品深加工廠、豬肉專賣店、電子商務平臺的20萬頭黑豬全產業鏈。

由項目組浙江農科院自主培育的金烏豬新品種2017年開始開展0世代選育，到現在已持續選育6個世代，正在開展中間試驗和種豬第三方性能測定，目前產仔數11.25頭，飼料轉化率3.25：1，瘦肉率54.16%，肌內脂肪含量4.25%。該群體通過“規模豬場+農戶”模式推廣應用種豬1500余頭、商品豬3萬余頭，產值近5000萬元；其生產的商品豬相關產品通過年豬認購、形象門店、專賣店、超市、線上銷售等方式，在浙江省12個縣市區廣泛銷售，實現銷售額2000萬元，口碑較好。

項目組培育的青蓮黑豬新品種、高繁大黑豬新品種、蘇梅豬配套系已完成多個世代選育，中廣黑豬新品種和高繁殖力榮昌豬專門化新品系已完成制種開始進行持續選育，榮昌豬專門化父系、錦華黑豬新品種和荊貢豬配套系已完成選育群體組建。所有育種群體都圍繞各自目標，以市場為導向，開展持續選育，以期從種業源頭保障地方豬產業高質量發展，提升市場核心競爭力，滿足優質化市場需求，推動地方豬產業轉型升級。

項目組成員開展種豬性能測定（左圖為體尺測定，右圖為B超測定）