趙世帆, 薛華磊, 陳 凱, 李 曉, 王 米
(中國農(nóng)業(yè)科學院上海獸醫(yī)研究所 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部獸用化學藥物及制劑學重點實驗室,上海200241)
隨著全球經(jīng)濟的快速發(fā)展, 人們生活水平日益提高,消費觀念也日漸更新,絕大對數(shù)人除了在支付養(yǎng)寵物的日常開支外, 也更希望能把寵物養(yǎng)好、 養(yǎng)健康。 因此寵物食品也受到越來越多的關(guān)注。在寵物飼養(yǎng)過程中,由于寵物和人飲食結(jié)構(gòu)的不同,以及在傳染病的感染下,導致寵物胃腸道疾病頻發(fā)。隨著飼主對寵物食品要求的提高,加強對無抗、無殘留,具有改善腸道菌群、促進腸道健康、增強機體免疫力的天然植物成分的研究和開發(fā),對寵物飼料行業(yè)具有重要意義。
葛根(Pueraria lobata)為豆科植物野葛的干燥根,主要分布于我國遼寧、河北、河南、山東、安徽、江蘇、浙江、福建、臺灣、廣東等地,具有解肌退熱、生津止渴、透疹、升陽止瀉等功效(中國獸藥典委員會,2020)。葛根中的主要成分包括葛根素、異黃酮類、多糖等(Wang 等,2020),具有抗炎抗氧化(Zhao 等,2022;Dong 等,2020)、 抗 糖 尿 病(Luo等,2021;Yang 等,2019)、 保護心血管 (Lv 等,2022;Jiang 等,2022)、抗腫瘤(Fang 等,2022)等活性。本課題組前期發(fā)現(xiàn)葛根多糖具有免疫調(diào)節(jié),改善小鼠腸道菌群(陳融等,2021;Chen 等,2020)的功效。當前,葛根多糖對于貓腸道菌群影響的研究鮮見報道。 本試驗給健康家貓飼喂葛根多糖后收集糞便,通過高通量測序,研究葛根多糖對貓腸道菌群結(jié)構(gòu)和豐度的影響, 探究葛根多糖作為改善寵物腸道健康的飼料添加劑的可能性。
1.1 葛根多糖制備 葛根購于上海雷允上中藥飲片有限公司。 將葛根用石油醚回流法去除脂質(zhì)和色素等雜質(zhì)后, 使用水提醇沉法獲得葛根粗多糖; 酶解法和Sevage 試劑法除去淀粉和蛋白質(zhì),通過透析除去小分子物質(zhì)。 使用苯酚-硫酸法和酶標儀檢測并收集葛根多糖溶液, 烘干后得到葛根多糖。
1.2 試驗動物 健康成年家貓8 只(公母各半),體重2.5 ~ 3.7 kg,試驗動物來源于貓舍,所有貓飼養(yǎng)在中國農(nóng)業(yè)科學院上海獸醫(yī)研究所動物實驗中心,室溫控制在(22±2)℃。
1.3 儀器和試劑 旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)器(R206B)購自上海申生科技有限公司;真空泵(SHB -ⅢA)購自上海豫康科技儀器設備有限公司; 酶標儀(Multiskan MK3,美國賽默飛世爾),純水機(JMCDCNF1LS,德國默克密理博)),自動部分收集器(SBS-100)和恒流泵(HL-2)均購自于上海滬西分析儀器廠有限公司;電熱恒溫鼓風干燥箱(DHG-9023A)購自上海習仁科學儀器有限公司。
無水乙醇、苯酚、濃硫酸、氯仿、三氯甲烷等購自國藥企業(yè);α-淀粉酶購自西格瑪奧德里奇 (上海)貿(mào)易有限公司。
1.4 試驗設計 將8 只家貓隨機分為2 組,每組4 只貓(兩只公貓,兩只母貓),每只貓單獨飼養(yǎng)在籠中。對照組(W 組)和試驗組(E 組)自由飲水和采食成貓日糧,E 組每天定時按體重飼喂3.75 mg/kg葛根多糖溶液,共飼喂30 d。
1.5 測試指標及方法
1.5.1 樣品采集 試驗最后1 d, 收集每只家貓糞便, 于超凈工作臺中取中間干凈無其他污染物的糞便置于1.5 mL EP 管中,-80 ℃保存。
1.5.2 基因組DNA 提取、PCR 擴增和測序 基因組DNA 提取、PCR 擴增和測序均由上海派森諾生物技術(shù)公司完成。
1.6 數(shù)據(jù)統(tǒng)計和分析 數(shù)據(jù)用SPSS 20.0 軟件(IBM,Chicago,IL)進行t 檢驗分析。 數(shù)據(jù)以“平均數(shù)±標準差”表示。
2.1 Alpha 多樣性分析
2.1.1 稀釋曲線 (Rarefaction Curve) 和Shannon曲線 稀釋曲線和Shannon 曲線反映了測序深度是否合適。 曲線的平緩程度反映了測序深度對于觀測樣本多樣性的影響大小,曲線越平緩,表明測序結(jié)果已足夠反映當前樣本所包含的多樣性,繼續(xù)增加測序深度已無法檢測到大量的尚未發(fā)現(xiàn)的新ASV/OUT。 由圖1 可知,當樣品測序深度達到8000 reads 時,Alpha 多樣性開始接近飽和, 表明該數(shù)據(jù)量已足夠進行樣品菌群多樣性分析。 除此之外,稀釋曲線還可以比較不同樣本中ASV/OTU數(shù)的多少, 從一定程度上反映出試驗組樣本多樣性高于對照組。

圖1 稀釋曲線(A)和Shannon 曲線(B)
2.1.2 Alpha 多樣性分析 圖2 顯示,E 組的豐富度(Chao1)、多樣性(Shannon)、優(yōu)勢度(Simpson)和進化的多樣性(Faith’ PD)均顯著高于W 組,表示糞便中微生物群落的總數(shù)和多樣性發(fā)生了變化;各組覆蓋度(Goods_coverage)均高于99%,表明本次測序結(jié)果代表了糞便微生物群落的真實情況。

圖2 葛根多糖對Alpha 多樣性指數(shù)的影響
2.1.3 Beta 多樣性 主坐標分析(PCoA)利用樣本中物種(ASV/OTU)的豐度信息、特征/代表序列間的進化關(guān)系等信息進行計算, 將多維度的物種數(shù)據(jù)降成一維數(shù)據(jù)——樣本差異距離, 從而在不同的角度表征這兩個樣本間的群落差異。 從圖3可以看出, 試驗組和對照組的群落組成存在顯著差異,說明葛根多糖能夠改善腸道群落組成。

圖3 基于加權(quán)與未加權(quán)UniFrac 距離的PCoA
2.2 家貓糞便菌群差異顯著分析 根據(jù)韋恩圖(圖4-A),兩組樣本中共有511 種常見OUT(Operational Taxonomic Units), 試驗組和對照組分別特有628 和636 種OUT。

圖4 ASV/OUT 的韋恩圖(A)、分類學分枝圖(B)和LDA 值分布柱狀圖(C)
LEfSe 分析是一種差異分析方法, 在直接對所有分類水平進行差異分析的同時, 可以深入到不同的子分組(Subgroup)中,挑取在不同子分組中表現(xiàn)一致的標志微生物類群。 LEfSe 的分析結(jié)果包括兩部分,分別是物種分類學分枝圖(Cladogram)(圖4-B)和顯著差異物種LDA 值分布柱狀圖(圖4-C)。 圖5 是在門和屬水平上的各組腸道菌群相對豐度的顯著性差異分析。結(jié)果顯示,在門水 平 上,厚 壁 菌 門(Firmicutes)、放 線 菌 門(Actinobacteria)、變形桿菌門(Proteobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)是主要的優(yōu)勢物種;在屬水平上,罕見小球菌屬(Subdoligranulum)、雙歧桿菌屬(Bifidobacterium)是主要的優(yōu)勢物種。

圖5 菌群相對豐度變化圖
腸道菌群數(shù)量龐大種類繁多,是一個相互作用相互競爭的群體。 腸道菌群的多樣性反映了腸道環(huán)境的健康程度以及抵抗疾病的能力。 有研究表明多種疾病與腸道菌群多樣性存在密切關(guān)系:陸江等(2020)的研究發(fā)現(xiàn),慢性腎衰竭可以使犬腸道菌群多樣性降低、 菌群結(jié)構(gòu)失調(diào)以及菌群功能改變; 在仔豬中腸道微生物多樣性的改變會導致仔豬腹瀉的發(fā)生(唐勛,2019)。 本試驗Alpha 多樣性分析和Bate 多樣性分析探究了葛根多糖對家貓腸道微生物多樣性的影響。Alpha 多樣性分析能夠反映微生物群落的總數(shù)和多樣性, 試驗組的豐富度 (Chao1)、 多樣性(Shannon)、優(yōu) 勢 度(Simpson)和 進 化 的 多 樣 性(Faith’ PD)均顯著高于對照組,表明葛根多糖能夠提高家貓腸道種微生物群落總數(shù), 增加微生物群落多樣性。在Bate 多樣性分析中,試驗組中的菌落組成和對照組存在明顯差異, 反映出葛根多糖能夠影響菌落組成。 進一步分析微生物群落種類顯示兩組樣本中共有511 種常見OUT, 試驗組和對照組分別特有628 和636 種OUT。結(jié)果表明葛根多糖能夠改變腸道菌群的結(jié)構(gòu),增強腸道菌群多樣性。
腸道菌群能夠幫助宿主分解和消化營養(yǎng)物質(zhì),其代謝產(chǎn)物能夠幫助維持腸道環(huán)境平衡,提高宿主從飲食中獲得能量的能力。 其中的有益菌極為重要。 在一些研究中擬桿菌門參與了癌癥免疫治療和預防(Zafar 等,2021);雙歧桿菌與人類健康有很大關(guān)系且具有多種多樣的生物學功能, 如免疫調(diào)節(jié) (Choi 等,2022;Henrick 等,2021),抗腫瘤活性(Yin 等,2014),抗致病性作用,抗炎、抗衰老等(Luo 等,2018)。除此之外,放線菌屬等有害菌也存在于腸道環(huán)境中。 本試驗在家貓糞便中檢測到在門水平上厚壁菌門、放線菌門、變形桿菌門、擬桿菌門是主要的優(yōu)勢物種;在屬水平上,罕見小球菌屬、雙歧桿菌屬是主要的優(yōu)勢物種。 葛根多糖能夠提高有益菌擬桿菌門、 雙歧桿菌屬和罕見小球均屬的相對豐度,降低放線菌門、厚壁菌門的相對豐度。 結(jié)果表明葛根多糖能夠提高有益菌的相對豐度,降低有害菌的相對豐度。
本試驗結(jié)果表明, 葛根多糖能夠改善貓的腸道微生物內(nèi)環(huán)境,提高其腸道菌群多樣性,改善腸道健康, 可以開發(fā)成為改善寵物腸道健康的飼料添加劑。