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長鏈非編碼RNA IGF2BP2-AS1通過調控miR-375表達對喉癌細胞遷移及增殖的影響

2024-04-02 13:42:54王挺張楊郭潔范崇盛劉亞芳
國際醫藥衛生導報 2024年6期
關鍵詞:檢測研究

王挺 張楊 郭潔 范崇盛 劉亞芳

1鄭州大學附屬洛陽中心醫院耳鼻咽喉頭頸外科,洛陽 471000;2吉林大學第一醫院腫瘤科,長春 130061

喉癌是全球常見的咽喉部惡性腫瘤,其發病通常較隱匿,確診時可能已發生轉移[1-2]。喉癌的發生和發展涉及多種基因、多種信號通路的改變,特別是表觀遺傳基因的表達異常[3]。因此,探究喉癌發生發展的基因調控機制,有助于尋找新的治療靶點。長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類內源性小分子RNA,參與調控染色質的結構變化、基因轉錄、基因翻譯過程[4-6]。lncRNA 作為一種非編碼RNA,被證實在喉癌、前列腺癌、肝癌等惡性腫瘤中異常表達,與腫瘤細胞的分化、放化療敏感度以及患者預后密切相關[7-10]。胰島素樣生長因子2 mRNA 結合蛋白2(IGF2BP2)-AS1 是新發現的一種lncRNA,其在多種腫瘤(如膀胱癌、口腔鱗狀細胞癌等)中高表達,表現為明顯的癌基因功能[11-12]。IGF2BP2-AS1在喉癌細胞中的表達及對喉癌細胞的調控機制 并 不 清 楚 。本 研 究 以 IGF2BP2-AS1/微RNA-375(miR-375)軸為切入點,探究IGF2BP2-AS1 對喉癌細胞增殖、遷移的影響及分子機制,以期為喉癌的診療提供新策略。

材料與方法

研究時間為2022年1月至2023年11月,研究地點為鄭州大學附屬洛陽中心醫院中心實驗室,研究類型為基礎研究。

1.細胞系和主要試劑

支氣管上皮細胞系16HBE 和喉癌細胞系AMC-NH-8、TU159、TU138、TU686 購自北京索萊寶科技有限公司。胎牛血清和DMEM 培養基購自美國Gibco 公司。陰性對照RNA 和IGF2BP2-AS1 小干擾RNA 購自武漢益普生物科技有限公司。miR-375、miR-NC 購自上海恒斐生物科技有限公司。Lipofectamine 3000、CCK-8 試劑盒購自美國Invitrogen公司。SYBR試劑盒、雙熒光素酶活性試劑盒購自深圳晶美生物工程有限公司。雙熒光素酶載體購自北京智杰方遠科技有限公司。兔源N-鈣黏著蛋白(N-Cadherin)、叉頭框蛋白C2(FOXC2)、β 肌動蛋白(β-actin)、CDK2、細胞周期蛋白A(Cyclin A)一抗抗體購自美國Sigma公司。

2.細胞培養和分組

恒溫箱參數設置為37 ℃、5%CO2,AMC-NH-8、TU159、16HBE、TU138、TU686 均用含12%胎牛血清的DMEM 培養基培養。將對數生長期的TU686 細胞接種在12 孔板,TU686 細胞分為si-NC 組和si-IGF2BP2-AS1 組,分別采用Lipofectamine 3000 轉染試劑將陰性對照RNA 和IGF2BP2-AS1 小干擾RNA 轉染到TU686 細胞,轉染45 h后進行后續實驗。

3.實時熒光定量PCR(qPCR)檢測細胞中IGF2BP2-AS1、miR-375表達

采用Trizol法提取各細胞系的總RNA,進一步反轉錄為cRNA。按照SYBR 試劑盒說明書設置qPCR 反應體系,以GAPDH 為內參比較IGF2BP2-AS1 表達量,以U6 為內參比較miR-375 表達量,引物序列見表1。采用2-ΔΔCt法計算IGF2BP2-AS1、miR-375相對表達量。

表1 qPCR引物序列

4.CCK-8 法檢測敲降IGF2BP2-AS1 后TU686 細胞的增殖能力

收集轉染后的各組TU686 細胞,分別以3×103個/孔接種于96孔板,在恒溫箱內持續培養1、2、3、4、5 d。每天固定時間分別向各孔加40 μl的CCK-8試劑,恒溫箱內處理2 h。采用全自動酶標儀測量各孔TU686細胞在450 nm處的吸光度(OD)值。

5.劃痕愈合實驗檢測敲降IGF2BP2-AS1后TU686細胞的遷移能力

收集轉染后的各組TU686 細胞,用含15%胎牛血清的培養基重懸。調整細胞密度后,分別將TU686 細胞加入24孔板,培養24 h。PBS溶液清洗3次,用10 μl移液槍吸頭在24 孔板底劃痕,PBS 溶液清洗3 次,加入1 ml 不含胎牛血清的培養基,在光學顯微鏡下觀察、拍照,測量劃痕寬度P1。培養24 h 后,PBS 溶液清洗3 次,加入1 ml 不含胎牛血清的培養基,在光學顯微鏡下觀察、拍照,測量劃痕寬度P2。TU686細胞劃痕愈合率=(P1-P2)/P1×100%。

6.雙熒光素酶報告基因實驗驗證IGF2BP2-AS1 與miR-375的靶向

分別構建IGF2BP2-AS1 野生型質粒IGF2BP2-AS1-Wt和突變型質粒IGF2BP2-AS1-Mut,采用Lipofectamine 3000 試劑分別將IGF2BP2-AS1-Wt、IGF2BP2-AS1-Mut 與miR-NC 或miR-375 轉染到TU686 細胞。轉染45 h,利用雙熒光素酶檢測試劑盒檢測TU686細胞的海腎熒光素酶活性和螢火蟲熒光素酶活性,分析各組TU686 細胞的熒光素酶活性。

7.Western blotting 檢測TU686 細胞中N-Cadherin、FOXC2、CDK2、Cyclin A蛋白表達

采用RIPA 裂解液提取轉染后TU686 細胞的總蛋白,蛋白變性后經聚丙烯酰胺凝膠電泳,電轉到硝酸纖維素膜,經10%牛血清白蛋白封閉50 min。加入一抗N-Cadherin(1∶2 000 稀釋)、FOXC2(1∶3 000 稀釋)、CDK2(1∶4 000 稀釋)、β-actin(1∶4 000 稀釋)、Cyclin A(1∶4 000 稀釋),在4℃孵育8 h。經TBST 溶液清洗后,加入二抗羊抗鼠免疫球蛋白G(IgG)抗體(1∶7 000稀釋),在25 ℃孵育50 min。經TBST 溶液清洗后,采用化學發光法曝光并顯影。

8.統計學方法

所有實驗均獨立重復4 次。用SPSS 22.0 軟件統計數據,用GraphPad 7.0軟件繪圖。呈正態分布的計量資料以均數±標準差()表示,多組間比較采用單因素方差分析,兩組間比較采用t檢驗。P<0.05為差異有統計學意義。

結果

1.IGF2BP2-AS1在喉癌各細胞系中的表達

qPCR 檢測顯示(圖1),與16HBE 細胞相比,喉癌細胞AMC-NH-8、TU159、TU138、TU686 中IGF2BP2-AS1 呈高表達(F=37.42,P<0.01),其中以TU686細胞中IGF2BP2-AS1表達最高(P<0.01)。因此,后續以TU686細胞為研究。

圖1 IGF2BP2-AS1在支氣管上皮細胞系16HBE和喉癌細胞系AMC-NH-8、TU159、TU138、TU686中的表達量

2.IGF2BP2-AS1小干擾RNA的敲降效率

qPCR檢測顯示,si-NC組和si-IGF2BP2-AS1組TU686細胞中IGF2BP2-AS1 表達分別為(7.25±0.22)和(1.02±0.30),si-IGF2BP2-AS1 組TU686 細胞中IGF2BP2-AS1 表達低于si-NC組(t=16.79,P<0.01),提示IGF2BP2-AS1 小干擾RNA敲降成功。

3.敲降IGF2BP2-AS1后TU686細胞遷移情況

劃痕愈合實驗顯示,si-NC 組和si-IGF2BP2-AS1 組TU686 細胞劃痕愈合率分別為(65.08±3.82)% 和(28.16±6.13)%,si-IGF2BP2-AS1 組細胞劃痕愈合率低于si-NC組(t=5.11,P<0.01)。

4.敲降IGF2BP2-AS1后TU686細胞增殖情況

CCK-8 結果顯示(圖2),在鋪板后第2、3、4、5 天si-IGF2BP2-AS1 組TU686 細胞增殖能力均低于si-NC 組(t=3.83、3.17、3.02、6.31,均P<0.01)。

圖2 敲降IGF2BP2-AS1對喉癌細胞TU686增殖的影響

5.IGF2BP2-AS1與miR-375的靶向關系

采用LncRNome在線軟件預測顯示(圖3),IGF2BP2-AS1與miR-375存在結合位點,miR-375可能是IGF2BP2-AS1靶基因。雙熒光素酶報告基因檢測顯示(圖4),IGF2BP2-AS1-Wt中,miR-375 組相對熒光素酶活性低于miR-NC 組(t=8.95,P<0.01);IGF2BP2-AS1-Mut中,miR-NC組與miR-375組熒光素酶活性比較差異無統計學意義(t=0.74,P>0.05)。

圖3 IGF2BP2-AS1與miR-375的靶向結合位點

圖4 雙熒光素酶報告基因實驗驗證IGF2BP2-AS1 與miR-375的靶向關系

6.敲降IGF2BP2-AS1對miR-375表達的影響

si-NC 組和 si-IGF2BP2-AS1 組 TU686 細胞中miR-375 表達分別為(1.02±0.40)和(4.95±0.49),si-IGF2BP2-AS1 組TU686 細胞中miR-375 表達高于si-NC組(t=6.23,P<0.01)。

7.敲降IGF2BP2-AS1后TU686細胞中遷移及增殖蛋白表達情況

Western blotting 顯示(圖5),敲降IGF2BP2-AS1 表達后的TU686 細胞中遷移蛋白N-Cadherin、FOXC2 表達與增殖蛋白CDK2、Cyclin A表達均低于si-NC組。

圖5 敲降IGF2BP2-AS1 對喉癌細胞TU686 中遷移蛋白和增殖蛋白表達的影響

討論

研究顯示,lncRNA 廣泛參與調控細胞的各種生命過程,如凋亡、代謝、遷移[13-16]。喉癌細胞中存在多種lncRNA的異常表達,lncRNA 已成為喉癌診斷的生物標志物以及治療的分子靶點[17-19]。Lu 等[20]研究顯示,喉癌組織和細胞系中lncRNA ZFAS1表達高于癌旁組織和正常鼻咽上皮細胞,高表達的lncRNA ZFAS1 與患者淋巴結轉移、臨床分期相關,lncRNA ZFAS1 可促進喉癌細胞增殖、侵襲以及N-鈣粘蛋白和波形蛋白表達,并抑制E-鈣粘蛋白表達。Wan 等[21]研究顯示,lncRNA SNHG16 在喉癌組織和細胞系中表達上調,其通過調節miR-140-5p/Wnt/β-catenin 通路軸促進喉癌的發生發展。IGF2BP2-AS1是近年來新發現的一種促癌性lncRNA[11]。Tong 等[12]研究表明,與正常組織樣本相比,口腔鱗狀細胞癌中IGF2BP2-AS1 表達上調,且IGF2BP 2-AS1 高表達與口腔鱗狀細胞癌患者的較差生存率相關;IGF2BP2-AS1 主要定位在細胞質中,其下調能夠抑制細胞增殖和遷移,導致細胞周期停滯和細胞凋亡。目前,IGF2BP2-AS1對喉癌細胞調控的功能尚不清楚。

本研究證實,IGF2BP2-AS1在喉癌細胞系中高表達,提示IGF2BP2-AS1 可能參與調控喉癌的發生和進展。沉默IGF2BP2-AS1 表達后,喉癌TU686 細胞增殖和遷移能力均受到限制,說明IGF2BP2-AS1可能是喉癌治療的潛在靶點。lncRNA 可發揮競爭性RNA 作用,以海綿吸附的方式降低miRNA 的表達,從而影響腫瘤細胞的各種生物過程[22-25]。例如,lncRNA NEAT1 可以通過功能性海綿miR-577 和miR-1224-5p 促進喉癌細胞的增殖,并抑制細胞凋亡[26]。本研究采用生物信息學軟件LncRNome 分析顯示,IGF2BP2-AS1 的核苷酸序列與miR-375 具有互補位點。miR-375 在結直腸癌、胃癌、膀胱癌等惡性腫瘤中低表達,能抑制腫瘤細胞的細胞周期、轉移以及生長[27-29]。Dai等[30]研究顯示,miR-375 在喉癌組織和細胞系中表達下調,過表達miR-375 明顯抑制喉癌細胞的增殖、細胞周期和遷移能力。本研究通過雙熒光素酶報告基因實驗證實IGF2BP2-AS1 靶向結合miR-375。在TU686 細胞中,敲降IGF2BP2-AS1 后,miR-375 表達增高,進一步證實miR-375和IGF2BP2-AS1存在負向調控關系。

綜上所述,IGF2BP2-AS1 在喉癌細胞系中呈高表達,IGF2BP2-AS1通過海綿吸附miR-375可影響喉癌細胞的遷移及增殖,IGF2BP2-AS1 的研究可為喉癌診斷和靶向治療提供新的靶點。

利益沖突所有作者均聲明不存在利益沖突

作者貢獻聲明王挺:研究設計與實施、文章撰寫;張楊、郭潔:數據采集;范崇盛:研究設計、對文章的知識性內容作批評性審閱;劉亞芳:統計分析、指導

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