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分子考古學家的科研日常

2024-11-30 00:00:00畢鶴洋
知識就是力量 2024年11期

古DNA分子作為遺傳信息的載體,是開展分子考古學研究的重要介質。分子考古學家能根據遺骸的古DNA分子,找到其所屬族群,將遺骸“對號入座”。例如,山羊和綿羊的遺骸,其骨骼外形相似,用肉眼無法區分。分子考古學家通過提取遺骸中的古DNA分子,并與生物基因庫中的山羊、綿羊族進行比對,就能判斷出遺骸的真實身份。

山羊角 右側
綿羊角 右側
首都師范大學實驗室動物考古實驗室收藏樣品

揭秘遺骸身份的古DNA分子提取實驗

傳統的考古發掘工作大都在鄉間田野進行,因此又被稱為“田野考古”。而分子考古學家開展的古DNA分子提取實驗需要在室內進行,并且要嚴格控污,對實驗環境要求極高。

進入實驗室之前,實驗員會從遺址運輸來的骨骼材料中選取保存良好的部分,切割出2×2厘米左右大小的樣品,進行編號、記錄,以備提取實驗。

實驗員進入實驗室后,需按照實驗室工作規程穿戴工作服、佩戴口罩、使用專用橡膠手套,以避免人體DNA分子混入樣品。

同時,為避免實驗過程中發生交叉污染,總實驗會分為5階段小實驗,在不同的實驗室依次進行。

樣品準備——前處理實驗

如果說采樣、編號是為了評估、篩選優質樣品,前處理實驗則是對所選樣品進行清洗和研磨處理。

在實驗中,實驗員會將樣品用酸泡、清洗,之后用液氮研磨機將其研磨成骨粉,盛裝進干凈的離心管,放入冰箱冷凍封存,從而保證古DNA分子的完整性,防止其降解和被污染。

提取古DNA分子——離心、提取實驗

實驗員在裝入骨粉的離心管中,加入可將古DNA分子從骨骼細胞中分離出來的裂解液(通常包含鹽離子、離液劑、還原劑和蛋白酶抑制劑等成分),從而破壞骨粉細胞表面的脂質結構,使古DNA分子被釋放、進而懸浮在溶液中。

為更高效地提取古DNA分子,過夜后的離心管會被放入離心機離心,離心后的骨粉漸漸沉淀于管底。實驗員為有效回收古DNA分子片段,會將含有古DNA分子的上層清液提取至新試管中。

修復古DNA分子——PCR擴增

與現代DNA分子不同,受埋藏環境的影響,古DNA分子會出現不同程度的降解,即雙螺旋結構遭到破壞。

因此,提取出的古DNA分子需加入特定劑量的引物、酶和混合劑,混勻后放入PCR儀中進行擴增,修復它的雙螺旋結構。

純化古DNA分子

電泳是一種利用帶電粒子在電場中移動速度不同而達到分離的技術。在純化階段,實驗員會借助電泳實驗結果,判斷古DNA分子是否提取成功。

解開考古謎題——測序

提取成功后,會對樣品進行專業的堿基序列檢測。

實驗員將骨粉裝入離心管
實驗員將古DNA分子裝入測序樣品管

在這樣一系列的實驗操作后,就可以獲得一條完整的古DNA分子信息了。實驗員對檢測結果進行分析,就能回答部分考古學問題,如可通過檢測結果判斷該生物的所屬族群。

考古界的微觀“偵探”

考古學的目標是盡可能地復原古人類的社會生活環境,而考古遺址中的遺跡、遺物都是古人類生活更迭的記錄者,因此,遺跡、遺物研究是探尋當時人類生活環境、社會發展狀況不可或缺的線索。

古DNA分子研究以骨骼遺存為依托,在解決人類起源和遷徙、動植物的家養與馴化過程等重大考古學問題上扮演著重要角色,讓我們從遺傳信息中看到種族基因的歸屬與演變。

但是,古DNA分子具有含量極低、高度降解和廣泛損傷的特點,它是否能被提取,以及提取出的結果,都嚴重依賴樣品的保存情況。實驗過程中,古DNA分子的提取過程易被污染,且人類或動物的起源與擴散問題也十分復雜,這些都為古DNA分子的研究帶來很大的難度。

不過,隨著科技水平不斷提升、設備更新、實驗環境升級以及歷代分子考古學家的不斷努力,古DNA分子研究技術已顯著提高,為解決更多考古學中的困難提供了堅實支持。

雖然遺骸不會說話,但攜帶遺傳物質的古DNA分子記錄著它們的故事。在科技與學術發展齊頭并進的當下,只要遺骸尚在,分子考古學家就能夠找到它們的古DNA分子信息,幫助更多遺骸再見天日、重歸故里。

(責任編輯 / 王佳璇 美術編輯 / 徐博宇)

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