桑耶寺　西藏第一座寺廟

強巴次仁　卓　瑪

馳名中外的桑耶寺，位于西藏山南地區扎囊縣雅魯藏布江北岸哈布日山西側的桑耶鎮，寺院周圍河渠索繞、農田肥沃、樹木蔥茂。桑耶寺自創建至今已有一千多年的歷史，它是藏族文物古跡中歷史最悠久的著名寺院，是吐蕃時期最宏偉、最壯麗的建筑群。寺內珍藏和保存著白吐蕃王朝以來西藏各個時期的歷史、宗教、建筑、壁畫、雕塑等文化遺產。正如《賢者喜宴》所說：“此寺系一難以想像之建筑。此世間無以倫比之寺院”。

建寺背景及年代

眾所周知，佛教起源于印度，正式傳人西藏地區則是公元七世紀，吐蕃第三十二代贊普松贊干布(593～650年)時期。此前的藏區，土生土長的苯教文化已融入到藏民的生活習俗中。但是隨著社會的發展變化，它不再適應統治階級政權的需要。為了鞏固吐蕃王朝的集權統治，松贊干布將佛教作為鄰近國家的先進文化引入西藏，并采取扶持的態度，在迎娶尼泊爾尺尊公主和大唐文成公主后，興建了大昭寺和小昭寺以及十二鎮魔寺等，以削弱支持守舊貴族集團的苯教的影響。但由于佛教剛剛引人西藏還未能形成規模較大的宗教團體和僧侶隊伍，佛教寺廟建筑也只是一些供奉佛像、佛經的小廟，并無常住僧人，更無合乎佛教戒律的儀式活動。

赤德祖贊(704～755年)時期，為增強與鄰近國家的關系和援助，意欲弘揚佛法，采取了從唐朝迎娶金城公主、修建寺院、翻譯佛經、邀請漢僧等一系列措施，但由于篤信苯教的貴族及苯教勢力的阻撓，佛教還是未能得到真正的傳播，赤德祖贊本人亦因此而遭暗算身亡。所以，從松贊干布至赤德祖贊期間，佛教雖然開始傳播，但并來真正立足，依舊由苯教一統天下。

公元755年，年幼的赤松德贊繼任贊普。此時，反對佛教的權臣在苯教徒的支持下，“挾天子，令天下”，操縱朝政，左右王室事務，發動第一次“禁佛運動”，宣布禁佛法令，驅逐外地僧人、焚燒佛教經典，將佛教寺院改為苯教寺，而統治階級內部矛盾在這一時期日益惡化。直至赤松德贊年長親政，決定利用佛教來鞏固王室權益。他與親信密議，用計除去了馬尚·春巴杰和達扎路恭等為首的崇苯大臣，結束了權臣掌政的局面。之后派大臣遣韋·益西旺布(又名巴賽朗)等人到長安去取經并迎請漢僧，接著在巴賽朗大臣引薦下從印度那爛陀寺邀請印度著名佛學家寂護(約700～760年，藏譯名“希瓦錯”)到吐蕃傳教，但由自然災害及瘟疫的傳播使寂護沒能在吐蕃順利傳教。于是他建議贊普邀請鄔仗那國的白瑪炯乃(蓮花生)大師進藏宣法。依靠強大的后盾，兩位大師在吐蕃舉辦了一系列規模空前的傳教活動，并決定興建“三寶”(經、律、論)所依之桑耶寺，作為弘揚佛法的根本道場。

桑耶寺的建寺地點為蓮花生大師所選定，整個結構布局由寂護設計，赤松德贊親自奠基動工，并于建成后舉行了隆重的開光儀式，同時從印度請來比丘12人。由寂護任堪布，為七位藏族人首次剃度授比丘戒，這是藏族佛教史上最早的出家僧侶，史稱“七覺士”。但關于桑耶寺動工至竣工的年代歷來眾說紛紜，莫衷一是。《巴協》《西藏王臣記》認為“藏王(赤松德贊)卯年生，年屆十三，時逢卯年(767年)修建寺廟。”至公元771年完工，僅五年時間。《賢者喜宴》說桑耶寺“兔年(763年)奠基，兔年(774年)竣工，十二年圓滿告成。”布敦《佛教史大寶藏論》說陰火兔年(787年)奠，陰土兔年(799年)竣工。法尊法師在《中國佛教》中認為應是762～766年完成桑耶寺。王森先生在《關于西藏佛教史的十篇資料》中認為是“約于779年，建成了在西藏佛教史上著名的桑耶寺”。東嘎·洛桑赤列先生認為在公元763年始建桑耶寺，至766年建成，歷時四年竣工。以上諸種觀點，雖各不相同，但其建造年代都相差無幾，皆在公元8世紀中葉。桑耶寺的建成和吐蕃本土僧侶的產生，標志著佛教初勝苯教，進而立足于吐蕃。

宏偉的建筑群

桑耶寺建筑規模宏大，殿塔林立，以金碧輝煌的“烏孜”大殿(烏孜仁松拉康)為主體，組成一座龐大、完整的建筑群，總面積約25000余平方米。整個寺院的布局，是按佛學思維中的“宇宙”的結構設計而成，一般認為是以古印度摩揭陀地方的歐丹達菩提寺(飛行寺)為藍本；也有人認為，桑耶寺的建筑形式與佛教密宗的“壇城”(即曼陀羅)相似，是仿照密宗的曼陀羅建造的。在《西藏王統記》中對寺院總體布局有詳細描述，認為位于全寺中心的“烏孜”大殿，象征宇宙中心的須彌山；“烏孜”大殿四方各建一殿，象征四大部洲；四方各殿的附近，各有兩座小殿，象征八小洲；主殿兩旁又建兩座小殿，象征日、月；主殿四角又建紅、綠、黑、白四塔，象征四大天王，以鎮服一切兇神魔剎，防止天災人禍的發生；而且在塔周圍遍架金剛杵，形成108座小塔，每杵下置一臺利，象征佛法堅不可摧。此外還有一些其它建筑，為護法神殿、僧舍、經房、倉庫等。全部建筑又圍上一道橢圓形圍墻，象征鐵圍山，四面各開大門一座，東大門為正門。

“烏孜”大殿

“烏孜”大殿即“祖拉廉”，是桑耶寺的中心主殿。《賢者喜宴》上說“其地基高厚而大，所備之原材料靜致完好，如同螺碗盛滿瑪瑙一般。”大殿建筑面積達6000多平方米，整個建筑坐西向東，殿高三層，式樣別致，獨具風格。每層殿堂的空間很高，一般在5.5～6米之間，而且第二、三層均在殿堂前建有低于大殿的寬敞陽臺，這既使大殿內得到充足的光線，同時外觀也顯得更加壯麗大方。從遠外眺望，大殿似五層樓房，實際只有三層，這三層各屬不同的建筑風格。據有關文獻記載，“烏孜”大殿的建筑汲取了西藏、內地和印度的構造風格。底層采用藏族建筑形式，中層采用漢族建筑形式，上層采用印度建筑形式。各層的壁畫和塑像也都按照各自不同的法式進行繪畫和雕塑。這種藏、漢、印合璧的建筑格調，在建筑史上是非常罕見的，所以有人據此又稱桑耶寺為“三樣寺”。

“烏孜”大殿還有兩重圍墻，外圍墻范圍最大、最壯觀，四面各開一門。墻內有兩層建筑，下層是寬敞的回廊，每邊各有列柱兩排，每排二十二根八棱柱，在四門廊處增柱一排，東西門廊為六柱，南北門廊為四柱。皆有石柱礎，多呈覆碗形，石礎上雕有覆蓮瓣、升云紋、桃心、方框等，全為四對，與八棱形柱對稱。回廊的墻壁上滿繪壁畫，尤以東大門內左側的壁畫珍貴，有雜技、舞蹈、體育等罕見內容。上層是僧舍，僧合前有一排方柱的回廊。內圍墻規模較小，亦有兩層建筑，上下層皆有一排方柱的回廊，只是下層西、南、北三面各有三間密室，上層三面還各有一大間五根列柱的庫房。回廊滿繪壁

畫，內容豐富，題材廣泛，技法高超，其中的西藏歷史畫卷是西藏歷史發展的形象寫照。

大殿底層分為前后兩部分，前為經堂，后為佛殿。經堂面寬七間，進深四間，兩側各有塑像七尊，左側為松贊干布、赤松德贊、唐東杰布和四尊祖師像；右側七尊全為祖師像。經堂內懸掛著大小幡幢，多姿多彩、富麗唐皇。經堂與佛殿之間，有三道高大的殿門，門上有雕刻細膩的龍和升云紋等。圍繞佛殿有一周回廊，回廊兩壁滿繪壁畫。整個佛殿的地基抬高，殿內明柱十根，呈八棱形，皆有石柱礎，前兩排柱子幾乎相并，間隔只有0.5米。柱頭亦有繁褥的雕飾。天花板上根據時輪金剛、極樂世界繪成團花圖案，壁畫全為千佛像。佛殿后部及左右筑有厚達4，3米的隔墻，據說這是根據當時一位譯師兩臂伸直的距離所定的厚度，這些厚墻直通三層，反映了早期建筑堅固古樸的特點。佛殿主供一尊高大的釋迦牟尼像，是用整塊巨石雕刻而成。頭戴高冠，內著僧祗支，外著袒右肩袈裟，手作指地印，結跏趺坐，像高3.9米，肩寬1.8米。在釋迦像前方左右兩邊，各有泥塑菩薩五尊和護法神一尊，菩薩像高達4.2米。這些塑像都是早期作品，只是后來進行了修補設彩。佛殿后部列置經架，其上滿置經書。

大殿中層相當于底層的后部佛殿，殿前有六根八棱形大柱的明廊。明廊南壁繪有蓮花生傳記畫，北壁繪的是早期桑耶寺全景圖。大門兩側為厚約1.3米的板壁夾墻，門上即是同樣寬度的門樓。據說當時第一個來到桑耶寺的洛扎瓦大澤師就曾住在此門樓上。中層的建筑結構與底層后部佛殿完全～樣，只是大花板的組織裝飾不同。前排屋頂為直木椽，二間是紅、蘭、黃三色染成的人字棧棍，后三間則是紅、蘭、黃三色圓點組成的藻井圖案，美觀大方，別具風格。本殿主供三尊合金剛銅佛像，中間原為無量壽佛，現供為蓮花生，兩側為寂護及藏王赤松德贊。殿內壁畫均為“佛傳故事”。大殿上層是五頂相峙，按印度法式建造。殿中主供大日如來佛像，兩邊陪塑眷屬和八大菩薩，四角塑歡喜佛。上層在“文革”中被毀，1987年修復。這一層是按印度風格建造，內匝一周轉經回廊，佛殿墻壁木框，框內嵌石板，上刻佛像，殿頂用復雜的斗拱支撐，因此據說這一層墻倒屋不塌，佛殿四面各設一門，內供五部如來，其中四尊各面向一個大門，大日如來則以壇城畫形式繪于藻井之上，四周供奉四十八大成就者立像及護法神像。

另外，在“烏孜”大殿東大門前有一座格古康，意為展佛殿。格古康主體三層，西側為高達七層的展佛墻。每年藏歷一月五日和五月十六日，將巨幅釋迦牟尼繡像掛在格古康的展佛墻上，讓人們頂禮，是謂展佛。在“文革”時，展佛墻被拆毀，現只存主體建筑。

十二洲

桑耶寺以象征須彌山的“烏孜”大殿為中心，在東南西北四面分別建造江白林(東勝身洲)、阿雅巴律林(南贍部洲)、強巴林(西牛貨洲)、桑結林(北俱盧洲)四座神殿，代表佛經上所謂四大洲，在四大洲的附近又建有參康林、參瑪林、頓窮拉巴林、達角倉瑪林、甲珠甲卡林、隆丹白薩林、桑丹林、那措扎扎林、白哈貢則林八座小神殿，代表所謂的八小洲，還有日、月兩洲。這大小十二洲大多保存至今，只是由于年代久遠、幾次失火、幾經廢毀，多已失去本來面目。在《賢者喜宴》里對這一部分進行了詳細描述：

關于建造其它諸佛殿情況，《巴協》記載道：“建有與論藏相符合的十二洲及曰、月(洲)等”。首先建造了以東勝身洲為模式的半圓形(佛堂)。在中間，將清凈法院洲中的五尊能仁佛等主要塑像改為新月圖畫，并交由螺王頂髻者(管理護衛)。總之，在十二洲中，其中心各有一門，在轉經路上各有二門。而在左右的兩座附屬洲中的智慧妙吉祥洲中，有七尊由皮革制成的妙吉祥等佛眷屬佛像。還有門神閻王之兩尊大威德佛像，以及妙吉祥莊嚴佛士像及《華嚴經》畫圖。這些均交火輪閻王(管理護衛)。在釋名多室洲(或譯作：眾多證驗洲)中有七尊能仁佛主要眷屬畫像及多種珍寶。其外部是僧侶餐室灶廚之地，這些均交予穿皮袍之龍王(管理護衛)。在南部諸佛殿中為三角形建筑，其中有伏魔密咒洲，內有能仁佛伏魔狀之四塑像，中央部分為《十地經》圖；而轉經巡禮道上有《大摩尼寶髻經》圖，此處交予鄔魔天女(管理護衛)。再者，如前述之阿雅波羅洲，在該洲突出于墻壁的屋中塑有王者像‘尊，該像以旃檀為骨架，以安息香為塑像之肌膚，其外以銀皮敷之。此外，該洲還有大本尊佛母神像，頗羅彌佛塔，《寶篋經》圖，由漆布制成一千零二尊大女像，在轉經巡禮道上畫有“十地經》圖。上述這些交予達摩熱咱仙人八部眷屬(管理護衛)。在印度洲中，有釋迦尊者等印度風格的五尊主要眷屬佛像、無量光佛像及集清凈之畫圖。又在其前有譯師之譯場，每個門均可觀察。這些均交予夜叉羅喉羅(管理護衛)。

在西面之三座圓形寺院(洲)中，其有毗盧遮那洲，內有銅制之毗盧遮那佛像。另有佛眷屬四明妃畫圖、毗盧現證佛。這些均交予牛頭夜叉(管理護衛)。在兜率仁慈洲中，有以彌勒佛為主之七佛眷屬，另有兩位大威德之畫圖。因行惡業，致使佛教衰落，自人壽十歲起，彌勒佛使之實行善事，由是人壽始增。此外，還有二十一位頂禮度母(畫像)。再者，還畫有以舅臣杰擦拉囊為工頭所制作的桑耶寺圖，還有悔罪之諸天眾圖，這些均交予穿有豹(紋)衣服的空行母(管理護衛)。在虛空靜慮洲中，有毗盧父王之五種本尊加持者圖，十六位佛眷屬聞思圖，《金光明經》及了義之道等圖，這些均交予銀首王(管理護衛)。在北方的三個四方形洲中的諸寶洲內，有能仁佛諸眷屬，其間有如下畫圖：在兜率大為佛母講經圖、《報恩經》圖等。這些均交予以藤圈為飾物的猞猁孫王(管理護衛)。

在發心菩提洲中，在其間的金剛年宮圣須彌山頂處，畫有如下畫圖：以金剛杵、金剛撅及甘露漩明王三者解救災難圖，無礙蓮花佛往游虛空，而有大乘心之諸眾人向其請求消除障礙。并請具有十地慈心、金剛本性等等之四十二位佛為之發菩提心。

又，上述礙圖之間，有十方佛為彼等加持祝福。以上所畫渚惕，以及《寶云經》圖，這些可往轉經巡禮道上尋得，并能瞻觀了知。上述諸圖畫均交予斯柯王及具有玫瑰步態的空行母所(護衛)。在寶庫貝哈爾洲中，有以能仁佛為主之佛眷屬圖像及《父子相會經》畫圖。在突出于墻外的房屋之內，在其間的極為精巧的倉庫之中，有保護(寺院經濟)收入之賬目文冊的護法神。這些均交予貝嘎爾王管理護衛。在雅克廈前天神滿賢房屋之中，有五位能仁佛主要眷屬畫圖，另有千佛畫圖等，這些均交予天神滿賢(管理護衛)。在雅克廈之下方，有天神善財之房室，其間

之塑像與圖畫相同，彼等均交予天神善財(管理護衛)，此即是日月洞。東面諸洲(寺院)，其色呈白水晶色，南面諸洲為蘭琉璃色；西面諸洲為紅瑪瑙色；北面諸洲色黃，如天然之黃金。諸洲(建筑之)墻面均飾有水紋樣之波紋。在裝飾方面，在潔凈的(墻)外表面上又繪制出大海。再者，在西面倉芝格如洲(神殿)之上屋，有阿閣黎菩提薩煩之寢室，象牙神殿、白色下殿及灶房，這些均交予手持珊瑚的夜叉管理。南面有水浴室，內部裝以旃檀，下鋪燒磚。其旁，為使人產生厭離之心，遂依‘洞伏骸髏諸象之所云畫以圖畫，這些均交予持杖夜叉管理護衛。在北方之威力洲中，有八根樹枝，這些均為將一堆刺糜樹經過火祭之后形成，繼之將八根樹枝制成八條巨龍。在中間部位，建有白色金剛手做息靜調伏之塑像，此外尚畫有魚、龜、水怪等畫圖。(見《西藏民族學院學報》1982年第二期，黃顥：《賢者喜宴》摘譯七)。

白、紅、黑、綠四塔及圍墻四塔分別在“烏孜”大殿四角成直線的地方，塔與殿角相距數十米。據《賢者喜宴》記載，在十二洲人完工后，“又建白塔即大菩提塔，此塔以獅裝飾，遂建成聲聞之風格。(此工程)以許甫彌杰多日為工頭，但其因瘟熱病死去。于是許甫墀珍更贊復任工匠首領。此塔交予星面夜叉(管理護衛)。又，紅塔系長壽菩薩之風格，其上飾以蓮花。此塔乃那囊杰擦拉囊所建，并交予熒惑星(神管理護衛)。再者，黑塔以如來佛之遺骨為飾物，其形制系獨覺佛風格。此塔乃恩蘭達熱路恭所建，交予鐵嘴夜叉(管理護衛)。再者，綠塔乃法輪如來風格，以十六門為飾物，此塔乃琳氏多吉芝瓊所建，交予日面夜叉(管理護衛)。”

白塔建在大殿東南角，皆用石塊、石板砌成，因塔體全為白色故名“白塔”。在塔基的方形圍墻上，立有108座小塔，塔身方形，在腰部以上逐層收分如階梯，上有覆缽形塔腹。但覆缽扁平而寬大，沒有龕門，寶剎上置十七環相輪。在轉經道旁有十六羅漢石像，分別雕刻在邊長為0.74米的方形石板上，極為精致。

紅塔為聚蓮塔，建在大殿的西南角，造型極為特殊，塔身用磚石砌成，形方而實圓，狀如覆鐘，腰部以上呈環狀紋，上部為覆缽形塔腹，寶剎之上置兩段相輪，上為七環，下為九環，塔身為土紅色并泛有光澤。

黑塔為涅槃塔，建在大殿的西北角。塔形也很特殊，塔身如三疊覆鍋，剎盤上托寶劍。第二級相輪七環，上即瓶蓋和寶珠。塔身為條磚砌成，全為黑色。

綠塔為吉祥多門塔，建在大殿的東北角，平面呈四方多角形。塔基甚高，沿階數級而達第一層，四面各有龕室三間，內有塑像，每面都有明梯通往二層。二層每面只有龕室一間，亦各有塑像。第三層為覆缽形的塔身，上置相輪寶剎，剎身很長。相輪分為三級，每一級自方形托盤上置相輪九環，中間一段為第二級，有相輪七環，第三級有相輪五環。傘蓋上承寶瓶和寶珠。塔身為綠色琉璃磚砌成。磚為土加粗沙燒制，質地堅硬，釉色蒼郁而富光澤，極其精美。

這四座塔現均為上世紀八九十年代新建，宿白先生在1959年調查時還較為完整，在其《藏傳佛教寺院考古》一書中有詳細記述。

桑耶寺現在的橢圓形圍墻，東、南、西、北各設一大門，東門為正門，原門樓上方嵌有清咸豐皇帝手書“宗乘不二”大匾。周長1200米，墻上建有塔剎1008座。但根據“桑耶寺全景”圖壁畫可看出，早期的圍墻并非圓形或橢圓形，而是四方多角形的圍墻。《賢者喜宴》明確記載：“在多角圍墻金剛步處，以一千另八座佛塔一一圍繞之，每一圈上放置佛猜俐一顆”。現存的橢圓形圍墻是五世達賴以后重修的。

磚瓦是桑耶寺現存數量最多、時代最早的文物之一。根據史書記載，磚瓦主要用于紅、黑、綠塔和王妃拉康，大多燒制于吐蕃時期。現存的磚有紅、黑、綠三種顏色(綠磚施釉)，分別屬于紅黑綠三座塔的建筑材料。磚的形制有方形、長方形、梯形、子母口形四種，大小型號也不一致，磚面一般都有文字，皆古藏文，系燒前模印而成，其內容都是表示該磚所在的方位，如“內”“外”等。瓦的形制有板瓦、筒瓦兩種，大小也有幾種不同型號。皆施綠釉，釉薄而光亮，瓦面一般都有藏文火印，內容與磚文相同，瓦內有很細的布紋。有些板瓦和筒瓦帶滴水或瓦當，滴水上飾乳釘紋、三蓮瓣波浪紋，瓦當上裝飾靈塔、大乳釘和連珠紋等圖案，非常精致。

另外，在“烏孜”大殿正門上懸銅鐘，鐘體高瘦，極具唐鐘形制，鐘面藏文銘文為“王妃甲茂贊母子二人為供奉十方三寶之故，鑄造此鐘”。在“烏孜”大殿大門南側立有一座石碑，為著名的“興佛證盟碑”，此碑保存完好。由碑座、碑身、碑帽三部分組成，通高4.9米。碑座呈束腰圓形仰覆蓮座，蓮瓣紋大多剝落不清。碑座直徑1.84米，可測高度O-7米，碑座一部分被鑲入“烏孜”大殿外墻內和周圍的石塊護座里。碑身基本呈長方形，上寬0.84米，下寬0.88米，上厚0.4米，下厚0.46米，高3.6米。碑身有藏文二十一列，刻字較深，極為工整。碑文內容反映了吐蕃王室為了與苯教勢力所代表的大貴族集團進行奪權斗爭，大力扶持佛教勢力的歷史事實。參加盟誓的有贊普父于與小幫王子、王妃、諸大臣和武將等。譯文如下：

“邏些(拉薩)及札瑪之諸神殿建立三寶之所依處，奉行緣覺之教法。此事，無論何時，均不離不棄所供養之資具，均不得減少，不得匱乏。今邇后，每一代子孫，均需按照贊普父子所作之盟誓，發愿。其咒誓書詞不得棄置，不得變更。祈請一切諸天、神人、非人，來作盟證。贊普父子與小幫王子，諸論臣工，與盟申誓。此詔敕盟書之詳細節目文字正本，存之于別室。”(見王堯《吐善金石錄》)。

碑身與碑座采用榫卯相套，其縫隙灌鑄銅水。碑帽呈長方形，四角上翹，邊長1.56米，高0.6米，素面元飾。碑帽頂部四角各有一個小圓坑，后來，在其中部加有鐵皮太陽和月亮圖案。

此碑在藏文史書中不乏記載，如《巴協》說：“桑耶寺建成后，于后墻樹立一碑，上鐫蓮花，勒詔敕誓文要義，并以石獅鎮之。”《西藏王統記》說：“(桑耶寺)以外，更圍以大甬道，建立大日如來護持惡趣壇城，壇城之后立有一碑。”《賢者喜宴》說：“為奉行(佛教和尊循佛教大法)，除贊普父子及權臣之外，大臣以下所有首領均持劍發誓，并建興佛盟誓碑。”“在寺院后面，有一座飾有蓮花的石碑，其上刻有盟誓之盟文，其上安放(石)獅。”從這些史料和碑帽上的四個圓孔來看，興佛證盟碑頂原為石獅，這在桑耶寺壁畫上也可找到佐證。

大門兩邊還有石獅～對，形制大小完全一致。石獅通高1.23米，形態古樸，豪放有力，嘴鼻

突出，額部后縮，雙目有神，背披螺吉，頂系寶鈴，長尾上卷，兩耳下垂。為吐蕃時期的珍貴文物。

大殿正門的門楣上原掛有清代皇帝所題“格魯伽蘭”的匾額，可惜現已不存。現在尚能見到的是大殿二門上懸掛的“大千普佑”清代匾額，長2.92米、寬1.38米，四周金龍框邊，藍地金字，圖章和落款均被毀掉，不知系哪位皇帝的手筆。

桑耶寺建成后，赤松德贊命在此剃度第一批藏人出家為僧，號稱“七覺士”，為西藏第一座佛、法、僧三寶齊全的佛教寺院。吐蕃晚期，朗達瑪滅佛毀寺，奴隸平民大起義在西藏各地相繼暴發，王子云丹這一支便在桑耶寺附近扎下腳跟。從此，他們既是山南地方勢力的首領，又是桑耶寺的寺主。公元十一世紀時，大譯師桑嘎和佛學家洛雜哇曾經對桑耶寺進行過小規模的維修，十一世紀后，成為寧瑪派的根本道場之一。

后來，由于政治中心的轉移，地理環境的變化，該寺亦逐漸冷落。十三世紀至十六世紀期間，桑耶寺已破爛不堪，不但香火寥寥，僧眾減少，而且建筑也多殘毀，無人修繕。到十七世紀初，薩迦派喇嘛乃重加修整桑耶寺。從此，原為藏傳佛教寧瑪派的中心寺院，現多改屬薩迦派管理，只有護法神殿仍歸寧瑪派僧人住持。此后不久，格魯派取得西藏地區的統治地位，歷任達賴喇嘛或支持寧瑪派，或兼學寧瑪派密法。每遇戰爭、災疫等重大事件，均邀請桑耶寺內的寧瑪派為首僧人作法禳解，以擴大瑪派的影響。但是桑耶寺改屬薩迦派的既成事實，始終未變。桑耶寺的歷任座主仍由薩迦委派，這種情況一直延續到1959年西藏民主改革前。

十七世紀中葉，桑耶寺曾遭一場大火，大殿建筑多被燒毀，后來繪的壁畫中尚有烈火熊熊，大殿被焚的場面。到六世達賴倉央嘉措(1683～1706年)以后，又才陸續修建起來。

十八世紀末，清朝駐藏大臣松筠在《西招圖略·西藏圖考》里對當時桑耶寺的情形描述道：“桑鳶寺在西藏南，與甘丹寺相近，土城內建大寺一坐，樓閣經堂佛像俱裝金，與大小昭寺相類，住坐堪布大喇嘛一名，掌事僧官二名，管理喇嘛約數千眾，均于城內居住”。

在二十世紀四十年代，熱振活佛攝政期間，又對桑耶寺進行過一次較全面的維修。

桑耶寺的八個扎倉，到衰落時只剩下“烏孜”和“覺”兩個扎倉。“烏孜”即現存的“烏孜”大殿，“覺”在“烏孜”大殿北邊。這個扎倉，從現存的建筑看，只是一個護法神殿，但卻是一座很特殊的建筑。在殿的前檐建有檐廊一排，而檐廊頂部內檁椽上，滿鋪寶劍鋼刀等作為頂飾。據說這是數百年前和塔工地區打仗時所得的戰利品，蓋此建筑用來紀念這次勝利。