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SciFinder Scholar 2007檢索的主要特點及其應用

2009-06-17 03:00:26陳克銘
中國校外教育(下旬) 2009年6期
關鍵詞:數據庫結構功能

陳克銘

[摘要] SciFinder Scholar是美國《化學文摘》網絡版專門提供學術研究機構使用的桌面檢索平臺,本文主要介紹SciFinderScholar 2007的檢索主要特點并通過實例來說明具體的應用。

[關鍵詞] SciFinder Scholar 2007主要特點 應用

美國化學文摘社CAS(Chemical Abstract Service)自1907年成立以來,已經走過了輝煌的百年。一百年來,CAS不僅致力于內容的精心選擇和編輯,為世界范圍內的科技與創新領域提供領先的、整合的、全面的信息,而且在技術上做到與時俱進,不斷革新,使用戶能更全面、準確地從信息海洋中獲取有價值的信息。CAS的主要產品《化學文摘》自1907年問世以來,經歷了印刷版、光盤版、網絡版,其網絡版檢索系統SciFinder Scholar,是專門供學術研究機構使用的桌面檢索平臺。目前使用的是2007版,新增了多項功能,比如,文獻分類、組合答案集、在物質顯示中進行檢索等。SciFinder Scholar收錄6個數據庫,涵蓋了期刊論文、專利文獻、會議論文、化學物質、化學反應等信息,具體包括CA與Medline數據庫以及由CA數據庫派生的化學反應數據庫(CASREACT)、物質數據庫(CAS REGISTRY)、商業來源數據庫(CHEMCATS)、管制信息數據庫(CHENLIST)。SciFinder Scholar收錄的信息是海量的,但科研人員不必擔心在信息的海洋中無所適從,SciFinder Scholar提供了強大的分析、提煉信息的功能,幫助科研人員從海量的信息中發掘有創意的、有參考價值的信息。關于SciFinder Scholar的使用方法,已有文獻作過詳細介紹。本文將著重介紹SciFinder Scholar 2OO7檢索主要特點及對檢索結果的分析提煉功能。

一、SciFinder Scholar的檢索特點

我們平時常用的一些數據庫,不論中文數據庫還是外文數據庫,一般都會提供簡單檢索、高級檢索和專家檢索。一般用戶可以使用表單式的高級檢索,通過檢索字段間的邏輯組配,構造檢索策略;專業級用戶可使用專家檢索,通過建立復雜的檢索表達式,來構造檢索策略。盡管這樣的檢索方式減少了檢索步驟,節省了檢索時間,但不足之處在于,往往因用戶不能全面表達檢索要求,比如,遺漏了關鍵詞的同義詞、近義詞、縮寫等,而影響了查全率。而SciFinder Scholar數據庫和很多檢索系統的設計理念不同,SciFinder Scholar不提倡用戶從一開始就進行精確的、設置很多限定的檢索,這樣會遺漏了用戶未知的重要信息,所以,SciFinder Scholar不提供表單式的高級檢索或專家檢索,其主題檢索類似于自然語言檢索。SciFinder Scholar提倡用戶從廣域的檢索開始,獲得大量比較相關的信息,然后利用文獻分析功能、物質分析功能或反應分析功能,逐步提煉檢索結果,獲得最佳的檢索效果。SciFinder Schlolar實現了6個數據庫之間無縫鏈接的跨庫檢索,用戶可從文獻、物質或反應3個入口進行檢索,獲得的檢索結果也可以在文獻數據庫、物質數據庫和反應數據庫中相互鏈接。

二、Scifinder Scholar的檢索方式

SciFinder Scholar提供了豐富的檢索途徑,但可歸納為文獻檢索、物質檢索、反應檢索3種方式。

1.文獻檢索

SciFinderScholar的文獻檢索提供了多種檢索途徑,如文獻標識符(即專利號、CA文摘號等)、書目信息、主題、作者、機構名、瀏覽核心期刊等。在進行主題(Research Topic)檢索時,以輸入2~3個關鍵詞為最佳。

2.物質檢索

SciFinder Scholar的物質檢索提供兩種檢索途徑:(1)通過物質標識符查找物質,如物質名稱、CAS登記號、俗名、商品名;(2)通過結構或分子式查找物質,結構檢索又提供精確結構檢索、亞結構檢索和相似結構檢索。精確結果檢索要求返回的結構完全一致,可獲得物質的、聚合物、混合物、配合物等;亞結構檢索要求所繪制的結構必須存在;相似結構檢索要求獲得相似度在60分以上的結構。

3.反應檢索

通過繪制結構,指定反應原子、反應位置和反應角色,即可進行反應檢索。這是Scifinder中最有創新的部分,讓使用者很直觀,并且這些結構式還可以放到Chemdraw軟件中重新加工和使用,非常方便。

三、SciFinder Scholar 的分析功能

不論用戶進行了上述何種方式的檢索,對返回的大量檢索結果,SciFinder Scholar提供征對不同類型檢索結果的特定分析、限定功能。

1.文獻檢索的分析功能

SciFinder Scholar的文獻檢索,對檢索結果可進行多達11項的分析,不僅可對文獻的內容進行分析。還可對文獻的來源等進行分析。比如,CAS登記號(CAS RegistrationNumber),可分析文獻中出現的物質;學科領域(CA Section Title)、索引詞(Index Term)和輔助索引詞(Supplementary Term),可分析文獻的學科分布情況;作者(Author Name)、機構(Company/Organization)可了解該領域活躍的研究人員和研究機構;數據庫(Database)、期刊(Joumal Name)可分析文獻的來源;出版年(tkublication Year)可了解該領域的研究歷史和發展;還可對文獻類型(Document Type)、語種(Language)進行分析。文獻檢索還可進行7項限定,進一步提煉檢索結果。選擇Research Topic限定項,可用其他的關鍵詞進行二次檢索;選擇Company Name或Author Name,可對研究機構、作者進行限定,篩選出用戶感興趣的機構或作者的研究論文。另外可對出(Publication Year)、文獻類型(DocumentType)、語種(Ian 1age)、來源數據庫(Database)進行限定。

2.物質檢索的分析功能

SciFinderScholar的物質檢索,根據化學結構的特性,提供6個分析項目,可分析某一特定原子上的修飾(Real atom attachments)、結構定義中的某類基團(Variable group A,Q,X,and W composition)、R基團(R-group composition)、精確結構(Precision)、環骨架(Ring skeletons)和結構中存在構象(conformation)。物質檢索還可以進行7項限定,可限定結構(Chemical Structure)、包含的同位素(Isotope-Containing Substances)、包含的金屬(Meta1 Containing Substances)、必須提供物質的理化性質數據(Property Data)、可購買的物質(Commercial Availability)、能提供物性數據(Property Availability)及可獲得參考文獻(Reference Availability)。

3.反應檢索的分析功能

SciFinder Scholar的反應檢索,對檢索結果可進行10項分析,可分析反應中出現的催化劑(Catalyst)、了解反應中出現的溶劑(Solvent)、了解反應的步數(Number of Steps in Reaction)、了解產物的產率(Product Yield)。這4個分析項目是反應檢索特有的,其他6個分析項目,如Author、Journal Name等和文獻檢索的分析功能相同。反應檢索還可限定反應物、產物、催化劑等(Reaction Structure)、對反應的產率(Product Yield)、反應的步數(Number of Steps)、反應的類型(Reaction Classification)也可進行限定。

四、檢索實例

下面以實例詳細介紹從文獻檢索入口,通過文獻、物質之間的相互鏈接。綜合利用SciFinder Scholar的文獻分析、結構分析以及限定等功能,逐步接近檢索課題的要求,獲得最相關的文獻的過程。

檢索例子(1):檢索關于金屬鈀催化交聯反應。

我們可以首先選擇鈀催化(Pd catalyst)作為主題詞來檢索,可以找到有4996條,通過去重(Remove Duplicates)可以除去86條,這樣所得的文獻還是很多,這時你可以采用分析/過濾(Analyze/Refine)功能輸入第二個關鍵詞如交聯反應(Cross-coupling reaction)后只剩下115條,然后你可以逐條看,找到你所需要的文獻。

檢索例子(2):檢索關于催化劑對Diels-Alder[4+2]環加成反應的影響。

先選擇Diels-Alder作為關鍵詞,可以檢索到非常多的文獻,大約有3萬多,這時你沒法去重,所以,你需要輸入第二個關鍵詞環加成(Cycloaddition)來過濾,使之變成只有8千多條,其實這還是很多,我們可以用第三個關鍵詞來限定并去重后,即催化劑(Catalyst),實際剩下約1700條。最后可以用實際需要研究的反應物或產物來進一步過濾。

參考文獻:

[1]路雅祺.CA 網絡版SciFinder Scholar數據庫檢索方法[J].情報探索,2006,(10):73-75.

[2]李桂影.SciFinder Scholar數據庫及其檢索利用[J].醫學信息學雜志,2007,28(1):24-25.

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