唐明,薛萌,丁磊,曹萌,王立新
(東南大學醫學院病原生物與免疫學系,江蘇南京 210009)
細胞自噬DRibbles(DRips in Blebs)是高度保守的細胞生物學行為,其分子機制從酵母細胞到哺乳動物細胞十分相似。在自噬過程中,待降解的胞漿組分及細胞器被包裹在具有雙層膜結構自噬小體(autophagy)中,最終與溶酶體融合形成自噬溶酶體,實現胞內物質的降解,從而維持細胞自穩。
DRibbles是從腫瘤細胞培養上清提取的具有雙層膜結構的自噬小體,其中含有阻斷蛋白酶體降解途徑而殘留的廢蛋白(defective ribosome products,DRips)。我們前期實驗證明,DRibbles作為腫瘤抗原載體能被DC攝取并通過交叉提呈途徑誘導T細胞應答,它是具有潛在價值的腫瘤疫苗載體[1]。
近來研究發現,p62作為多種信號傳導途徑中的支架蛋白,能通過C末端泛素相關結構域(ubiquitinassociated domains,UBA)與泛素化靶蛋白結合,并通過LRS(LC3 recognition sequence,LRS)結構域與LC3結合,然后由LC3介導將泛素化靶蛋白包裹入自噬小體,最后自噬小體與溶酶體融合完成蛋白的降解。因此,p62在兩種蛋白降解途徑(蛋白酶體降解途徑和自噬降解途徑)之間發揮著重要的橋梁作用[2]。
本研究擬構建乙型肝炎表面抗原(HBsAg)、泛素-HBsAg以及p62真核表達質粒,并轉染HepG2細胞,提取轉染細胞的DRibbles并檢測其中HBsAg含量,探討過表達p62蛋白能否提高自噬小體中泛素化蛋白(HBsAg)的含量,為優化DRibbles腫瘤疫苗提供新的思路。
pIRES2-EGFP質粒由東南大學趙春杰教授贈送;pIRES2-EGFP-p62質粒和pCMV-HBsAg質粒由美國波特蘭Franz癌癥研究中心Hong-Ming Hu教授贈送;大腸桿菌DH5α為本實驗室保存。小鼠泛素表達基因上游引物(Ub-f):5'-CTAGC TAGCA TGCAG ATCTT CGTGA AGAC CCT-3'(含NheⅠ酶切位點),下游引物(Ub-r):5'-CCGCT CGAGC GCACC TCTCA GGCGA AGGA-3'(含XhoⅠ酶切位點);HBsAg-f:5'-CCGCT CGAGA TGGAG AACAT CGCAT CAGG-3'(含 XhoⅠ酶切位點),HBsAg-r:5'-CCCGA ATTCT TAAAT GTAT A CCCAA AGACA AA-3'(含EcoRⅠ酶切位點)均由上海生工生物工程技術服務有限公司合成。總RNA提取試劑盒及PCR試劑盒購自Promega公司;反轉錄試劑盒購自Transgen公司;限制性內切酶、T4連接酶購自MBI公司;質粒抽提試劑盒購自OMEGA公司;RPMI 1640培養液、Opti-MEM培養液、LipofectamineTM2000脂質體、新生牛血清購自Invitrogen公司;HBsAg ELISA診斷試劑盒購自上??迫A生物技術有限公司。HepG2細胞株由本實驗室保存。
按照圖1A示意圖構建重組質粒,步驟如下:以pCMV-HBsAg作為模板、HBs-f和HBs-r為上下游引物進行PCR,擴增產物經XhoⅠ與EcoRⅠ雙酶切獲得HBsAg編碼DNA片段,插入pIRES2-EGFP質粒構建pIRES2-EGFP-HBsAg重組質粒,以PCR法、酶切進行鑒定,陽性克隆進行DNA測序鑒定。獲取BALB/c小鼠骨骼肌組織,加3 ml Lysis Buffer后用勻漿器將組織磨碎,按總RNA提取試劑盒說明書提取總RNA,逆轉錄后以Ub-f和Ub-r為引物進行PCR擴增小鼠泛素編碼基因,純化PCR產物并經NheⅠ與XhoⅠ雙酶切后插入pIRES2-EGFP-HBsAg質粒構建Ub-HBsAg融合表達質粒,以PCR法、酶切法進行鑒定,陽性克隆進行DNA測序鑒定。
將處于對數生長期的HepG2細胞轉種細胞培養皿,待細胞融合度達到70%時進行細胞轉染。設3組、每組2塊細胞培養皿:(1)pIRES2-EGFP-HBsAg質粒單獨轉染組,(2)pIRES2-EGFP-Ub-HBsAg質粒單獨轉染組,(3)pIRES2-EGFP-Ub-HBsAg和pIRES2-EGFP-p62共轉染組。將pIRES2-EGFP-HBsAg重組質粒(36 μg)、pIRES2-EGFP-Ub-HBsAg 重組質粒(36 μg)以及 pIRES2-EGFP-Ub-HBsAg重組質粒(36 μg)和pIRES2-EGFP-p62重組質粒(18 μg)的混合液分別溶于3個盛有3 ml Opti-MEM的離心管中,再分別向3個離心管中加入已經室溫孵育5 min的LipofectamineTM2000脂質體的Opti-MEM稀釋液3.06 ml,混勻后室溫放置20 min。按前述分組分別向每個培養皿中滴加3.33 ml質粒-脂質體混合液,混勻后置37℃、5%CO2細胞培養箱中,約6 h后換成正常培養基培養24 h。
轉染24 h后分別更換2種不同的細胞培養液:正常培養基和含萬珂 (100 μmol·L-1)、雷帕霉素(10 μmol·L-1)、氯化銨(2 mmol·L-1)培養液,繼續培養16 h后收集細胞培養液并提取DRibbles[1]。采用常規ELISA法檢測各組DRibbles中HBsAg水平。
采用PCR法從pCMV-HBsAg質粒上擴增HBsAg基因編碼片段,電泳結果顯示PCR產物大約為700 bp,與理論值吻合(圖1B)。采用RT-PCR法從BALB/c小鼠骨骼肌細胞中擴增小鼠泛素蛋白編碼基因,電泳結果顯示PCR產物大約為250 bp,與理論值吻合(圖1C)。
采用 XhoⅠ、EcoRⅠ雙酶切法鑒定 pIRES2-EGFP-HBsAg重組質粒,電泳結果顯示,酶切產物大約為680 bp,與理論值相符(圖1D);采用 NheⅠ、EcoRⅠ對pIRES2-EGFP-Ub-HBsAg重組質粒進行雙酶切法鑒定,酶切產物位于910 bp位置,與理論值相符(圖1E)。對 pIRES2-EGFP-HBsAg和 pIRES2-EGFP-Ub-HBsAg質粒分別進行DNA測序,結果顯示HBsAg和Ub-HBsAg編碼基因序列正確、讀碼框架準確(圖1F、G)。
熒光顯微鏡觀察轉染細胞發現,3組轉染細胞均可見綠色熒光,轉染率大約為15%(圖2),各組間無明顯差異。提示轉染細胞能表達靶蛋白,相同的轉染率為后續組間比較DRibbles中HBsAg含量奠定了基礎。







圖1 pIRES2-EGFP-HBsAg和pIRES2-EGFP-Ub-HBsAg重組質粒的構建與鑒定Fig 1 Construction of HBsAg and Ub-HBsAg expressing vectors

圖2 熒光顯微鏡觀察轉染細胞 ×200Fig 2 Fluorescence images of transfected HepG2 cells ×200
轉染24 h后,3組轉染細胞分別更換正常培養液和含萬珂(100 μmol·L-1)、雷帕霉素(10 μmol·L-1)以及氯化銨(2 mmol·L-1)的培養液,繼續16 h后提取細胞培養上清中的DRibbles,然后采用ELISA法檢測HBsAg的含量。結果顯示,pIRES2-EGFP-Ub-HBsAg單獨轉染細胞 DRibbles中HBsAg含量明顯低于pIRES2-EGFP-HBsAg單獨轉染細胞DRibbles,萬珂、雷帕霉素和氯化銨處理pIRES2-EGFP-Ub-HBsAg轉染細胞后,DRibbles中HBsAg顯著增高。提取Ub-HBsAg和p62表達質粒共轉染HepG2細胞的DRibbles,檢測發現:其中HBsAg含量與pIRES2-EGFP-Ub-HBsAg轉染細胞沒有明顯差異,但經藥物處理后DRibbles中HBsAg的含量顯著提高,而且明顯高于藥物處理的pIRES2-EGFP-Ub-HBsAg單獨轉染組。提示蛋白酶體阻斷劑(萬珂)能阻斷蛋白酶體對泛素化蛋白(HBsAg)的降解,過表達p62能提高自噬小體中泛素化蛋白(Ub-HBsAg)的含量。見圖3。

圖3 對HepG2細胞DRibbles中HBsAg含量的檢測Fig 3 Test of HBsAg in DRibbles extracted from HepG2 cell line
根據細胞內降解時間的長短,可將腫瘤細胞產生的蛋白分為長壽蛋白(long-lived proteins)和短壽蛋白(short-lived proteins)兩大類[3-8]。長壽蛋白為細胞內穩定蛋白,其平均半衰期達3 000 min,占總蛋白的70%,其主要通過自噬等途徑被降解成游離氨基酸,進入新蛋白的合成循環或以外排體(exosome)形式排出胞外[7-8];短壽蛋白的平均半衰期僅為 10 min,約占總蛋白的30%,主要為一些錯誤編碼、錯誤翻譯等產生的DRips以及某些天然短壽的非結構蛋白(short-lived proteins,SLiPs)等[5,9-12],短壽蛋白的降解主要通過泛素-蛋白酶體(ubiquitin-proteasome)途徑。
抗原交叉提呈在腫瘤免疫、腫瘤疫苗設計等方面具有重要作用[13]。我們前期研究證實,提取含有短壽蛋白的腫瘤細胞自噬小體DRibbles作為腫瘤抗原的有效載體,可被DC等APC細胞攝取加工,通過交叉提呈的方式誘導免疫應答[14-15]。但如何更多地募集腫瘤細胞的短壽蛋白或泛素化蛋白以及如何優化DRibbles腫瘤疫苗有待進一步研究。
p62作為支架蛋白在多種信號傳導途徑中發揮作用,包含PB1結構域、鋅指結構域(zinc finger,Zinc)、TBS結構域(TRAF6 binding site)、LIR結構域(LC3-interacting region,LIR)和泛素相關結構域(ubiquitin-associated domains,UBA)等5 個結構域(圖 4)[16],近來研究[17-18]發現,p62 蛋白通過 LIR 與 UBA 分別與自噬小體的跨膜蛋白LC3和泛素化蛋白的泛素結合,被認為在兩種蛋白降解途徑(蛋白酶體降解途徑和自噬降解途徑)之間發揮著重要的橋梁作用[2]。p62通過“泛素-p62-LC3-自噬小體途徑”參與了泛素化蛋白的細胞自噬降解,腫瘤細胞(作為抗原供者細胞)內“泛素-p62-LC3-自噬小體途徑”是否影響自噬小體內泛素化蛋白的含量尚不清楚,能否利用p62分子機制優化DRbbles中腫瘤抗原,以促進交叉提呈也有待深入研究。

圖4 p62功能及其結構域示意圖Fig 4 Domain organization of p62
已知,原發性肝癌與HBV感染密切相關,且尚未發現人肝癌細胞的特異性抗原。以HBsAg為模式抗原,將為探討“p62能否增加肝癌細胞DRibbles中腫瘤抗原含量”起到示范和標記作用,為此,本實驗分別建立表達“HBsAg”和“短壽HBsAg”的肝癌細胞模型。實驗結果顯示,從表達Ub-HBsAg轉染細胞中提取DRibbles,其中HBsAg含量很低(圖3)。萬珂是一種蛋白酶體抑制劑,可以抑制蛋白酶體對泛素化蛋白的降解。細胞經萬珂作用后蛋白酶體被抑制,泛素化的蛋白不能經蛋白酶體途徑降解,變成了“長壽蛋白”而由自噬途徑在溶酶體中降解。雷帕霉素是自噬誘導劑,氯化銨可提高溶酶體中的pH值,抑制溶酶體活性,自噬小體無法在溶酶體中降解,轉而被排出胞外成為DRibbles。加入萬珂、雷帕霉素和氯化銨處理轉染細胞,結果顯示,pIRES2-EGFP-Ub-HBsAg轉染細胞DRibbles中HBsAg含量顯著增高,提示蛋白酶體抑制劑成功阻斷了蛋白酶體對Ub-HBsAg的降解。
隨后將pIRES2-EGFP-Ub-HBsAg和pIRES2-EGFP-p62共轉染HepG2細胞,提取DRibbles并檢測HB-sAg發現,與pIRES2-EGFP-Ub-HBsAg單獨轉染細胞一樣,DRibbles中 HBsAg含量都處于較低水平,提示Ub-HBsAg主要通過蛋白酶體途徑降解,即使過表達的p62也不會募集到更多的泛素化蛋白;但經藥物處理后,DRibbles中 HBsAg顯著增高并明顯高于pIRES2-EGFP-Ub-HBsAg單獨轉染細胞,提示當泛素化蛋白通過自噬途徑降解時,p62蛋白能將更多的Ub-HBsAg募集到自噬小體中。
總之,阻斷蛋白酶體途徑降解,p62能將更多的短壽蛋白募集到DRibbles中,這為提高DRibbles疫苗中的抗原含量提供了新的技術途徑。
[1]LI Y,WANG L X,YANG G,et al.Efficient cross-presentation depends on autophagy in tumor cells[J].Cancer Res,2008,68(17):6889-6895.
[2]MOSCAT J,DIAZ-MECO M T.p62 at the crossroads of autophagy,apoptosis,and cancer [J].Cell,2009,137(6):1001-1004.
[3]YEWDELL J W,ANTON L C,BENNINK J R.Defective ribosomal products(DRiPs):a major source of antigenic peptides for MHC class I molecules?[J].J Immunol,1996,157(5):1823-1826.
[4]SCHUBERT U,ANTON L C,GIBBS J,et al.Rapid degradation of a large fraction of newly synthesized proteins by proteasomes[J].Nature,2000,404(6779):770-774.
[5]YEWDELL J W.Immunology.Hide and seek in the peptidome[J].Science,2003,301(5638):1334-1335.
[6]YEWDELL J W.Plumbing the sources of endogenous MHC class Ⅰ peptide ligands[J].Curr Opin Immunol,2007,19(1):79-86.
[7]KOMATSU M,WAGURI S,CHIBA T,et al.Loss of autophagy in the central nervous system causes neurodegeneration in mice[J].Nature,2006,441(7095):880-884.
[8]HARA T,NAKAMURA K,MATSUI M,et al.Suppression of basal autophagy in neural cells causes neurodegenerative disease in mice[J].Nature,2006,441(7095):885-889.
[9]PRINCIOTTA M F,FINZI D,QIAN S B,et al.Quantitating protein synthesis,degradation,and endogenous antigen processing[J].Immunity,2003,18(3):343-354.
[10]YEWDELL J.To DRiP or not to DRiP:generating peptide ligands for MHC classⅠmolecules from biosynthesized proteins[J].Mol Immunol,2002,39(3-4):139-146.
[11]YEWDELL J W,NICCHITTA C V.The DRiP hypothesis decennial:support,controversy,refinement and extension[J].Trends Immunol,2006,27(8):368-373.
[12]QIAN S B,PRINCIOTTA M F,BENNINK J R,et al.Characterization of rapidly degraded polypeptides in mammalian cells reveals a novel layer of nascent protein quality control[J].J Biol Chem,2006,281(1):392-400.
[13]VYAS J M,van der VEEN A G,PLOEGH H L.The known unknowns of antigen processing and presentation[J].Nat Rev Immunol,2008,8(8):607-618.
[14]LI Y,WANG L X,PANG P,et al.Cross-presentation of tumor associated antigens through tumor-derived autophagosomes[J].Autophagy,2009,5(4):576-577.
[15]WANG L X,LI R,YANG G,et al.Interleukin-7-dependent expansion and persistence of melanoma-specific T cells in lymphodepleted mice lead to tumor regression and editing[J].Cancer Res,2005,65(22):10569-10577.
[16]MATHEW R,KARP C M,BEAUDOIN B,et al.Autophagy suppresses tumorigenesis through elimination of p62 [J].Cell,2009,137(6):1062-1075.
[17]丁磊,曹萌,王立新.細胞自噬參與蛋白降解及抗原遞呈的研究進展[J].國際免疫學雜志,2009,32(3):180-183.
[18]ICHIMURA Y,KOMINAMI E,TANAKA K,et al.Selective turnover of p62/A170/SQSTM1 by autophagy[J].Autophagy,2008,4(8):1063-1066.